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基于网络药理学、分子对接和实验验证探讨朱茯苓用于失眠的作用机制 被引量:18
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作者 周扬 郭冷秋 +3 位作者 刘逊 谈如蓝 钟其新 曾峰 《天然产物研究与开发》 CAS CSCD 2021年第1期114-126,共13页
为探讨朱茯苓治疗失眠的可能作用机制,通过TCMSP、BAT-MAN、TCMID和STITCH数据库以及文献挖掘筛选朱茯苓的活性成分及潜在靶点,利用TTD、OMIM、GeneCards和CTD数据库获取失眠类疾病的相关靶点,采用Cytoscape软件和String数据库构建活性... 为探讨朱茯苓治疗失眠的可能作用机制,通过TCMSP、BAT-MAN、TCMID和STITCH数据库以及文献挖掘筛选朱茯苓的活性成分及潜在靶点,利用TTD、OMIM、GeneCards和CTD数据库获取失眠类疾病的相关靶点,采用Cytoscape软件和String数据库构建活性成分-靶点网络和靶点蛋白相互作用网络,通过BioGPS数据库进行靶点的器官定位,基于David数据库进行GO功能和KEGG通路的富集分析,利用Autodock_vina软件进行活性成分和核心靶点的分子对接验证,最后通过免疫印迹法(Western blot)验证朱茯苓对γ-氨基丁酸(GABA)的两种受体蛋白α1亚基基因GABRA1和γ2亚基基因GABRG2的影响。最终筛选得到朱茯苓活性成分33种,潜在靶点267个,与失眠的交集靶点36个,多作用于脑、心脏等器官;分子对接结果显示GABRA1、GABRG2两个靶点能够与活性成分自发结合并借助氢键等分子间作用力形成较为稳定的构象;富集分析共获得189个GO条目和24条KEGG通路,主要涉及GABA信号通路、5-羟色胺(5-HT)信号通路等;Western blot实验证明朱茯苓能够增强小鼠脑内GABRA1和GABRG2蛋白的表达。通过网络药理学、分子对接和Western blot实验验证,发现朱茯苓可能通过多成分、多靶点、多途径的协同作用发挥镇静安神的作用,为深入进行朱茯苓治疗失眠的作用机制研究提供新思路和新方法。 展开更多
关键词 朱茯苓 失眠 网络药理学 分子对接 Γ-氨基丁酸受体
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Sprague-Dawley大鼠胃肠道微生物区系的研究
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作者 王艺 陈仁金 +3 位作者 陈全刚 胡安康 韩旭峰 郑葵阳 《家畜生态学报》 北大核心 2023年第4期53-60,共8页
为了揭示Sprague-Dawley大鼠胃肠道微生物群落组成情况,探究大鼠胃肠道不同区域的菌群差异,该研究采用16S rRNA基因序列技术,对Sprague-Dawley大鼠的胃、十二指肠、空肠、回肠、盲肠、结肠和直肠的肠腔内容物进行基因组测序和微生物组... 为了揭示Sprague-Dawley大鼠胃肠道微生物群落组成情况,探究大鼠胃肠道不同区域的菌群差异,该研究采用16S rRNA基因序列技术,对Sprague-Dawley大鼠的胃、十二指肠、空肠、回肠、盲肠、结肠和直肠的肠腔内容物进行基因组测序和微生物组成分析。结果表明:Sprague-Dawley大鼠不同胃肠道区域的细菌群落组成不同;大肠样本的物种丰富度和多样性高于小肠样本;厚壁菌门是各肠道段的优势菌门,乳酸杆菌属是各肠道段的优势菌属;与小肠相比,大鼠大肠微生物菌群更稳定、多样。研究结果揭示了Sprague-Dawley大鼠的胃肠道微生物群落组成信息,为其作为动物模型的相关研究提供了理论依据。 展开更多
关键词 胃肠道微生物 基因组测序 乳酸杆菌 SPRAGUE-DAWLEY大鼠
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分枝结构特异性内切酶-1(FEN1)突变体N266D表达纯化及功能分析 被引量:1
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作者 邱秀芹 史崔颖 +4 位作者 孙洪芳 王晓晓 杜佳慧 郭志刚 刘松柏 《生物学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第4期34-37,48,共5页
人源分枝结构特异性内切酶-1(Flap endonuclease 1,FEN1)作为DNA复制及DNA修复过程中重要的参与者,在维护基因组稳定和完整性方面具有不可替代的作用。尽管FEN1在很多肿瘤细胞中的表达都发生异常,但FEN1基因体细胞突变或遗传突变事件在... 人源分枝结构特异性内切酶-1(Flap endonuclease 1,FEN1)作为DNA复制及DNA修复过程中重要的参与者,在维护基因组稳定和完整性方面具有不可替代的作用。尽管FEN1在很多肿瘤细胞中的表达都发生异常,但FEN1基因体细胞突变或遗传突变事件在人体细胞中却很少发生,发表的文献报道较少。前期在白血病患者骨髓细胞中发现了FEN1基因的一种N266D杂合突变体,基于此,成功构建了FEN1-N266D在原核及真核中的表达重组质粒,纯化了原核FEN1-WT、FEN1-N266D蛋白;通过TAMRA标记的DNA底物,检测了FEN、GEN和EXO的3种酶活性,结果发现N266D突变体的FEN、GEN及EXO活性基本不变;RTCA方法检测发现N266D蛋白过表达使细胞增殖能力受到抑制。通过以上对FEN1突变体N266D蛋白的核酸酶活性及对细胞增殖能力影响的分析,为进一步探讨FEN1突变体N266D在肿瘤发生进展中的潜在功能奠定了基础。 展开更多
关键词 FEN1 基因突变体 核酸酶活性 细胞增殖
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FANCJ基因在成人急性髓系白血病中的突变图谱 被引量:3
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作者 刘松柏 储小玲 +3 位作者 撖荣 杜佳慧 邱桥成 薛胜利 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期348-353,共6页
目的:检测分析急性髓系白血病(acute myeloid leukemia, AML)患者FANCJ基因突变情况,为研究FANCJ突变类型的AML疾病致病机理奠定基础,同时为其疾病防治提供指导。方法:在FANCJ基因蛋白编码区设计引物,采用PCR扩增及sanger测序法检测222... 目的:检测分析急性髓系白血病(acute myeloid leukemia, AML)患者FANCJ基因突变情况,为研究FANCJ突变类型的AML疾病致病机理奠定基础,同时为其疾病防治提供指导。方法:在FANCJ基因蛋白编码区设计引物,采用PCR扩增及sanger测序法检测222例初诊AML患者骨髓细胞中FANCJ基因编码区突变情况,同时检测AML患者黏膜上皮组织FANCJ基因突变情况;采用NCBI Blast在线生物信息学软件分析FANCJ基因突变在不同物种中的进化保守性。结果:测序分析显示,FANCJ基因在蛋白编码区的11个位点出现突变,分别为exon5:c.G430A:p.A144T,exon6:c.A587G:p.N196S,exon9:c.C1255T:p.R419W,exon10:c.G1442A:p.G481D,exon11:c.C1609G:p.L537V,exon16:c.C2360T:p.P787L,exon17:c.C2440T:p.R814C,exon19:c.C2608T:p.H870Y,exon19:c.A2686G:p.I896V,exon19:c.C2830G:p.Q944E,exon20:c.G3412A:p.D1138N,其中A144T、N196S、R814C、I896V及Q944E突变存在复现性;另外,A144、R419、G381、L537、P787、H870、Q944及D1138位点在不同物种中高度保守。结论:在222例AML患者中发现26名患者中存在FANCJ突变,并且突变位点在不同物种中相对保守,功能重要,这为接下来研究FANCJ突变类型的AML疾病致病机理奠定基础,同时为疾病防治提供指导。 展开更多
关键词 FANCJ 基因突变 协同突变基因 进化保守性
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FLT3及FLT3-ITD突变体在HEK293T细胞的表达和纯化
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作者 杨凡 杜佳慧 +7 位作者 吴洁 袁濮玉 苏倩 撖荣 邱桥成 薛胜利 刘松柏 孙中文 《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第3期242-246,共5页
目的构建fms相关酪氨酸激酶3(FLT3)及FLT3-内部串联重复序列(FLT3-ITD)突变体的真核表达载体,在HEK293T细胞中稳定表达并通过免疫沉淀技术对蛋白进行纯化。方法从正常人及FLT3-ITD阳性急性髓系白血病患者骨髓干细胞中提取RNA,反转录为cD... 目的构建fms相关酪氨酸激酶3(FLT3)及FLT3-内部串联重复序列(FLT3-ITD)突变体的真核表达载体,在HEK293T细胞中稳定表达并通过免疫沉淀技术对蛋白进行纯化。方法从正常人及FLT3-ITD阳性急性髓系白血病患者骨髓干细胞中提取RNA,反转录为cDNA,使用带有流感病毒血凝素(HA)标签序列的特异性引物,采用PCR扩增出人FLT3及FLT3-ITD突变体编码区全长并克隆到CD530A-T2A-GFP载体上。重组的FLT3及突变体FLT3-ITD表达质粒,通过脂质体polyJ et转染到HEK293T细胞进行表达。使用HA抗体结合微珠沉淀带HA标签的FLT3及FLT3-ITD突变体蛋白。然后,通过HA肽段将蛋白竞争洗脱下来,洗脱下来的蛋白经银染染色。结果 FLT3及FLT3-ITD突变体全长编码序列成功构建到CD530A-T2A-GFP载体上,Western blot法及聚丙烯酰胺凝胶银染法成功检测到FLT3及FLT3-ITD突变体蛋白的表达、纯化。结论在HEK293T细胞中成功表达并纯化FLT3及FLT3-ITD突变体蛋白。 展开更多
关键词 FMS样的酪氨酸激酶3 突变体 蛋白纯化 FMS样的酪氨酸激酶3-内部串联重复
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FLT3-ITD插入长度对32D细胞增殖、凋亡及靶向抑制剂敏感性的影响
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作者 刘松柏 董豪杰 +3 位作者 王隽 邱桥成 薛胜利 李凌 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第4期1034-1038,共5页
目的:研究FLT3-ITD突变体ITD插入长度对细胞增殖能力、凋亡及靶向抑制剂敏感性的影响,为临床分级治疗FLT3-ITD突变型急性髓系白血病提供数据参考。方法:从先前解析出的ITD序列中挑选3个位置相同或相邻的不同大小的ITD序列,构建FLT3-ITD... 目的:研究FLT3-ITD突变体ITD插入长度对细胞增殖能力、凋亡及靶向抑制剂敏感性的影响,为临床分级治疗FLT3-ITD突变型急性髓系白血病提供数据参考。方法:从先前解析出的ITD序列中挑选3个位置相同或相邻的不同大小的ITD序列,构建FLT3-ITD真核表达质粒;利用慢病毒包被系统建立FLT3-ITD稳定表达32D细胞株;检测FLT3-ITD细胞株细胞增殖情况,经靶向抑制剂AC220处理后的其增殖抑制及凋亡情况。结果:成功构建了ITD1、ITD2和ITD3三株FLT3-ITD稳定表达32D细胞株;ITD1、ITD2和ITD3细胞株在无IL3因子培养基生长条件下48 h后的增殖倍数分别是2.3、3.7和4.3倍;在FLT3小分子抑制剂AC220加药条件下,ITD1、ITD2和ITD3细胞株增殖抑制IC50值分别是0.183、0.446和0.836 nmol/L,凋亡率分别是88.6%、34.2%和16.1%。结论:插入ITD长度长的FLT3-ITD突变体表达细胞在增殖能力和耐受靶向抑制剂AC220的能力方面均增强。 展开更多
关键词 FLT3-ITD 急性髓系白血病 插入长度 细胞增殖 凋亡
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泛素-蛋白酶体系统在家族性心肌病发生发展中的作用进展
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作者 朱奕潼 曹明强 《中国心血管杂志》 2020年第6期599-602,共4页
泛素-蛋白酶体系统(UPS)可介导错误折叠和受损蛋白质的选择性降解,在许多信号通路中发挥着重要作用。肥厚型心肌病和扩张型心肌病是两种最常见的家族遗传性心肌病,主要为常染色体显性遗传,由编码心肌细胞成分的基因突变引起。本综述对... 泛素-蛋白酶体系统(UPS)可介导错误折叠和受损蛋白质的选择性降解,在许多信号通路中发挥着重要作用。肥厚型心肌病和扩张型心肌病是两种最常见的家族遗传性心肌病,主要为常染色体显性遗传,由编码心肌细胞成分的基因突变引起。本综述对遗传性心肌病中UPS损伤机制及治疗方案的研究进展进行了文献复习。 展开更多
关键词 泛素-蛋白酶体系统 心肌病 肥厚型 心肌病 扩张型 基因突变
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