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CT影像组学模型预测靶向药物治疗表皮生长因子受体基因突变非小细胞肺癌患者预后
被引量：
6
1
作者
胡奎
张娴
+3 位作者
白彪胜
王紫君
蔡茜
刘玉林
《中国医学影像技术》
CSCD
北大核心
2022年第10期1491-1496,共6页
目的探讨基于增强CT构建的影像组学模型评估靶向药物治疗表皮生长因子受体(EGFR)基因突变非小细胞肺癌(NSCLC)后患者预后的可行性。方法回顾性分析86例接受靶向治疗的EGFR基因突变NSCLC患者,按7∶3比例将其随机归入训练集[n=59,16例无...
目的探讨基于增强CT构建的影像组学模型评估靶向药物治疗表皮生长因子受体(EGFR)基因突变非小细胞肺癌(NSCLC)后患者预后的可行性。方法回顾性分析86例接受靶向治疗的EGFR基因突变NSCLC患者,按7∶3比例将其随机归入训练集[n=59,16例无进展生存期(PFS)≤6个月、43例PFS>6个月]和测试集(n=27,8例PFS≤6个月、19例PFS>6个月)。采用Itksnap软件于治疗前肺窗CT增强图像中勾画病变三维ROI,以开源pyradiomics包提取396个特征,以主成分分析(PCA)对特征进行降维,获得23个新的维度特征。根据训练集23个维度特征构建逻辑回归模型,观察其评估训练集和测试集患者预后的价值。结果以维度特征构建的逻辑回归模型评估训练集、测试集患者预后(PFS≥6个月)的曲线下面积(AUC)分别为0.923、0.849;训练集和预测集的校准曲线与理想模型的对角线均较为接近。影像组学评分瀑布图显示,训练集的阴性预测率为92.30%、阳性预测率为91.30%,测试集分别为100%、86.36%;决策曲线显示,训练集和测试集在0.20~0.90阈概率范围内有很好的净获益。结论基于CT增强图像的逻辑回归模型可用于预测靶向药物治疗EGFR基因突变NSCLC后患者预后。
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关键词
癌
非小细胞肺
ErbB受体
体层摄影术
X线计算机
分子靶向治疗
影像组学
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职称材料
并行采集技术对颅脑MRI影像组学特征稳定性的影响
被引量：
3
2
作者
李宁
张彪
+2 位作者
王紫君
张娴
胡奎
《放射学实践》
CSCD
北大核心
2023年第4期514-521,共8页
目的:探讨集成并行采集技术(iPAT)对颅脑磁共振影像组学特征稳定性的影响。方法:采用3.0T磁共振对自制体模和6例健康志愿者(被试组)行颅脑横轴面扫描,扫描序列包括T 1WI(S1)、T 1-FLAIR(S2)、T 2-FLAIR(S3)和T 2WI(S4),各序列分别采用...
目的:探讨集成并行采集技术(iPAT)对颅脑磁共振影像组学特征稳定性的影响。方法:采用3.0T磁共振对自制体模和6例健康志愿者(被试组)行颅脑横轴面扫描,扫描序列包括T 1WI(S1)、T 1-FLAIR(S2)、T 2-FLAIR(S3)和T 2WI(S4),各序列分别采用不同缩减因子(R)的2种并行采集技术(GRAPPA和mSENSE)进行扫描。其中体模组4个序列使用的GRAPPA和mSENSE技术均分别采用了6种R值(R=none,2,3,4,5,6),共获得48组图像;被试组4个序列使用的GRAPPA和mSENSE技术均分别采用了3种R值(R=none,2,3),共获得24组图像。基于各组图像,提取4个体模ROI(P-ROI)或4个脑实质ROI(V-ROI)的影像组学特征。计算每个序列图像上每个P-ROI和V-ROI中提取的组学特征在6种(R=none,2,3,4,5,6)和3种缩减因子(R=none,2,3)之间的变异系数(CV=特征均值/标准差),基于CV值对特征的稳定性进行分级(分为十分稳定、稳定、一般和不稳定共4级)。首先,通过CV评价使用不同数量的加速因子对GRAPPA和mSENSE两种并行采集技术提取的组学特征稳定性的影响;然后,采用χ^(2)检验分析两种并行采集技术对不同序列和不同ROI之间组学特征稳定性影响的差异。结果:iPAT及缩减因子的不同组合对影像组学特征稳定性的影响显著。体模数据中,6种R(none,2,3,4,5,6)时,mSENSE和GRAPPA图像上提取的极稳定特征的占比均低于5%,mSENSE图像的特征稳定性较GRAPPA更差;同时包含3个R值(R=none,2,3)的mSNESE和GRAPPA共6组图像时,4个序列之间(χ^(2)=257.807,P<0.001)及4个P-ROI之间(χ^(2)=87.379,P<0.001)特征稳定性的差异均有统计学意义,FLAIR序列(S2和S3组)能提供更多极稳定的特征;与3组图像(R=none,2,3)相比,6组图像(R=none,2,3,4,5,6)时仅在4个P-ROI之间观察到特征稳定性的差异有统计学意义(χ^(2)=25.115,P<0.05)。在被试组中(R=none、2、3),仅在4个V-ROI之间发现特征稳定性的差异有统计学意义(χ^(2)=46.642,P<0.001)。结论:集成并行采集技术及缩减因子对磁共振影像组学特征稳定性有显著影响,基于GRAPPA提取的组学特征的稳定性要高于mSENSE。组学分析时应尽可能使用并行采集技术及缩减因子(R=2、3)相同的图像,以提高特征的稳定性。
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关键词
并行采集
影像组学
纹理特征
稳定性
变异系数
磁共振成像
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职称材料
题名
CT影像组学模型预测靶向药物治疗表皮生长因子受体基因突变非小细胞肺癌患者预后
被引量：
6
1
作者
胡奎
张娴
白彪胜
王紫君
蔡茜
刘玉林
机构
华中科技大学同济医学院附属肿瘤
医院
湖北省肿瘤
医院
放射科
芜湖市繁昌区人民医院影像中心
中南民族大学生物医学工程学院
华中科技大学同济医学院附属肿瘤
医院
胸部肿瘤内科
出处
《中国医学影像技术》
CSCD
北大核心
2022年第10期1491-1496,共6页
基金
湖北省卫生健康委员会重点支持项目(WJ2019Z015)。
文摘
目的探讨基于增强CT构建的影像组学模型评估靶向药物治疗表皮生长因子受体(EGFR)基因突变非小细胞肺癌(NSCLC)后患者预后的可行性。方法回顾性分析86例接受靶向治疗的EGFR基因突变NSCLC患者,按7∶3比例将其随机归入训练集[n=59,16例无进展生存期(PFS)≤6个月、43例PFS>6个月]和测试集(n=27,8例PFS≤6个月、19例PFS>6个月)。采用Itksnap软件于治疗前肺窗CT增强图像中勾画病变三维ROI,以开源pyradiomics包提取396个特征,以主成分分析(PCA)对特征进行降维,获得23个新的维度特征。根据训练集23个维度特征构建逻辑回归模型,观察其评估训练集和测试集患者预后的价值。结果以维度特征构建的逻辑回归模型评估训练集、测试集患者预后(PFS≥6个月)的曲线下面积(AUC)分别为0.923、0.849;训练集和预测集的校准曲线与理想模型的对角线均较为接近。影像组学评分瀑布图显示,训练集的阴性预测率为92.30%、阳性预测率为91.30%,测试集分别为100%、86.36%;决策曲线显示,训练集和测试集在0.20~0.90阈概率范围内有很好的净获益。结论基于CT增强图像的逻辑回归模型可用于预测靶向药物治疗EGFR基因突变NSCLC后患者预后。
关键词
癌
非小细胞肺
ErbB受体
体层摄影术
X线计算机
分子靶向治疗
影像组学
Keywords
carcinoma,non-small-cell lung
ErbB receptors
tomography,X-ray computed
molecular targeted therapy
radiomics
分类号
R734.2 [医药卫生—肿瘤]
R814.42 [医药卫生—影像医学与核医学]
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职称材料
题名
并行采集技术对颅脑MRI影像组学特征稳定性的影响
被引量：
3
2
作者
李宁
张彪
王紫君
张娴
胡奎
机构
华中科技大学同济医学院附属湖北肿瘤
医院
放射科
芜湖市繁昌区人民医院影像中心
出处
《放射学实践》
CSCD
北大核心
2023年第4期514-521,共8页
文摘
目的:探讨集成并行采集技术(iPAT)对颅脑磁共振影像组学特征稳定性的影响。方法:采用3.0T磁共振对自制体模和6例健康志愿者(被试组)行颅脑横轴面扫描,扫描序列包括T 1WI(S1)、T 1-FLAIR(S2)、T 2-FLAIR(S3)和T 2WI(S4),各序列分别采用不同缩减因子(R)的2种并行采集技术(GRAPPA和mSENSE)进行扫描。其中体模组4个序列使用的GRAPPA和mSENSE技术均分别采用了6种R值(R=none,2,3,4,5,6),共获得48组图像;被试组4个序列使用的GRAPPA和mSENSE技术均分别采用了3种R值(R=none,2,3),共获得24组图像。基于各组图像,提取4个体模ROI(P-ROI)或4个脑实质ROI(V-ROI)的影像组学特征。计算每个序列图像上每个P-ROI和V-ROI中提取的组学特征在6种(R=none,2,3,4,5,6)和3种缩减因子(R=none,2,3)之间的变异系数(CV=特征均值/标准差),基于CV值对特征的稳定性进行分级(分为十分稳定、稳定、一般和不稳定共4级)。首先,通过CV评价使用不同数量的加速因子对GRAPPA和mSENSE两种并行采集技术提取的组学特征稳定性的影响;然后,采用χ^(2)检验分析两种并行采集技术对不同序列和不同ROI之间组学特征稳定性影响的差异。结果:iPAT及缩减因子的不同组合对影像组学特征稳定性的影响显著。体模数据中,6种R(none,2,3,4,5,6)时,mSENSE和GRAPPA图像上提取的极稳定特征的占比均低于5%,mSENSE图像的特征稳定性较GRAPPA更差;同时包含3个R值(R=none,2,3)的mSNESE和GRAPPA共6组图像时,4个序列之间(χ^(2)=257.807,P<0.001)及4个P-ROI之间(χ^(2)=87.379,P<0.001)特征稳定性的差异均有统计学意义,FLAIR序列(S2和S3组)能提供更多极稳定的特征;与3组图像(R=none,2,3)相比,6组图像(R=none,2,3,4,5,6)时仅在4个P-ROI之间观察到特征稳定性的差异有统计学意义(χ^(2)=25.115,P<0.05)。在被试组中(R=none、2、3),仅在4个V-ROI之间发现特征稳定性的差异有统计学意义(χ^(2)=46.642,P<0.001)。结论:集成并行采集技术及缩减因子对磁共振影像组学特征稳定性有显著影响,基于GRAPPA提取的组学特征的稳定性要高于mSENSE。组学分析时应尽可能使用并行采集技术及缩减因子(R=2、3)相同的图像,以提高特征的稳定性。
关键词
并行采集
影像组学
纹理特征
稳定性
变异系数
磁共振成像
Keywords
Parallel acquisition
Radiomics
Texture features
Coefficient of variation
Robustness
Magnetic resonance imaging
分类号
R445.2 [医药卫生—影像医学与核医学]
R735.7 [医药卫生—肿瘤]
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被引量
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CT影像组学模型预测靶向药物治疗表皮生长因子受体基因突变非小细胞肺癌患者预后
胡奎
张娴
白彪胜
王紫君
蔡茜
刘玉林
《中国医学影像技术》
CSCD
北大核心
2022
6
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下载PDF
职称材料
2
并行采集技术对颅脑MRI影像组学特征稳定性的影响
李宁
张彪
王紫君
张娴
胡奎
《放射学实践》
CSCD
北大核心
2023
3
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