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scRNA-seq和Bulk RNA-seq联合分析揭示MTRNR2L1介导COPD进展中PANoptosis下调
1
作者
戈艳蕾
孙思怡
+9 位作者
任泓沁
姚雪鑫
赵倩
李文强
陈伟彬
白静
喻昌利
董爱英
刘铁军
付爱双
《南京医科大学学报(自然科学版)》
北大核心
2025年第6期786-797,共12页
目的:探讨慢性阻塞性肺疾病(chronic obstructive pulmonary disease,COPD)发展过程中MT-RNR2样蛋白1(MT-RNR2 like protein 1,MTRNR2L1)介导的泛凋亡(PANoptosis)调控机制,为寻找COPD发病机制提供新思路。方法:通过基因表达综合数据库(...
目的:探讨慢性阻塞性肺疾病(chronic obstructive pulmonary disease,COPD)发展过程中MT-RNR2样蛋白1(MT-RNR2 like protein 1,MTRNR2L1)介导的泛凋亡(PANoptosis)调控机制,为寻找COPD发病机制提供新思路。方法:通过基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)中COPD患者的批量RNA测序(Bulk RNA sequencing,Bulk RNA-seq)数据和单细胞RNA测序(single cell RNA sequencing,sc RNA-Seq)数据探究COPD患者肺组织中细胞构成,并分析细胞参与疾病发生的相关通路。在烟雾/脂多糖(lipopolysaccharide,LPS)暴露的小鼠中模拟PANoptosis,评估MTRNR2L1和PANoptosis蛋白表达情况,明确其在COPD发生发展中的作用。结果:Bulk RNA-seq显示COPD患者T细胞反应相关基因的表达变化。sc RNA-Seq证实与对照组相比,COPD组的CD8^(+)T细胞数减少,上皮细胞数增加;MTRNR2L1在COPD患者的免疫细胞和上皮细胞中表达水平上调;COPD患者肺组织、CD8^(+)T细胞和上皮细胞中的PANoptosis相关基因表达水平降低。暴露于烟雾/LPS的小鼠肺表现出肺泡损伤、PANoptosis蛋白表达上调,MTRNR2L1过表达显著抑制细胞PANoptosis并下调ZBP1、Caspase-3、GSDMD和MLKL的水平。结论:CD8^(+)T细胞与上皮细胞的差异表达基因分别在泛凋亡相关通路富集,提示PANoptosis参与COPD的发生发展,COPD发病过程中PANoptosis与PANoptosis蛋白表达增高相关,MTRNR2L1对PANoptosis有抑制作用,调节PANoptosis可能为减轻肺损伤和改善肺通气功能提供新的治疗机会。
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关键词
慢性阻塞性肺疾病
肺损伤
PANoptosis
单细胞RNA测序
批量RNA测序
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职称材料
题名
scRNA-seq和Bulk RNA-seq联合分析揭示MTRNR2L1介导COPD进展中PANoptosis下调
1
作者
戈艳蕾
孙思怡
任泓沁
姚雪鑫
赵倩
李文强
陈伟彬
白静
喻昌利
董爱英
刘铁军
付爱双
机构
华北理工大学附属
医院
呼吸
与危重症
医学科
自贡市第一人民医院呼吸与危重症医学科
华北理工大学附属
医院
CT室
华北理工大学附属
医院
重症
医学科
华北理工大学附属
医院
微生物室
华北理工大学附属
医院
麻醉科
出处
《南京医科大学学报(自然科学版)》
北大核心
2025年第6期786-797,共12页
基金
唐山市人才资助项目(C202303026)。
文摘
目的:探讨慢性阻塞性肺疾病(chronic obstructive pulmonary disease,COPD)发展过程中MT-RNR2样蛋白1(MT-RNR2 like protein 1,MTRNR2L1)介导的泛凋亡(PANoptosis)调控机制,为寻找COPD发病机制提供新思路。方法:通过基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)中COPD患者的批量RNA测序(Bulk RNA sequencing,Bulk RNA-seq)数据和单细胞RNA测序(single cell RNA sequencing,sc RNA-Seq)数据探究COPD患者肺组织中细胞构成,并分析细胞参与疾病发生的相关通路。在烟雾/脂多糖(lipopolysaccharide,LPS)暴露的小鼠中模拟PANoptosis,评估MTRNR2L1和PANoptosis蛋白表达情况,明确其在COPD发生发展中的作用。结果:Bulk RNA-seq显示COPD患者T细胞反应相关基因的表达变化。sc RNA-Seq证实与对照组相比,COPD组的CD8^(+)T细胞数减少,上皮细胞数增加;MTRNR2L1在COPD患者的免疫细胞和上皮细胞中表达水平上调;COPD患者肺组织、CD8^(+)T细胞和上皮细胞中的PANoptosis相关基因表达水平降低。暴露于烟雾/LPS的小鼠肺表现出肺泡损伤、PANoptosis蛋白表达上调,MTRNR2L1过表达显著抑制细胞PANoptosis并下调ZBP1、Caspase-3、GSDMD和MLKL的水平。结论:CD8^(+)T细胞与上皮细胞的差异表达基因分别在泛凋亡相关通路富集,提示PANoptosis参与COPD的发生发展,COPD发病过程中PANoptosis与PANoptosis蛋白表达增高相关,MTRNR2L1对PANoptosis有抑制作用,调节PANoptosis可能为减轻肺损伤和改善肺通气功能提供新的治疗机会。
关键词
慢性阻塞性肺疾病
肺损伤
PANoptosis
单细胞RNA测序
批量RNA测序
Keywords
chronic obstructive pulmonary disease
lung damage
PANoptosis
single-cell RNA-seq
Bulk RNA-seq
分类号
R563.9 [医药卫生—呼吸系统]
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题名
作者
出处
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1
scRNA-seq和Bulk RNA-seq联合分析揭示MTRNR2L1介导COPD进展中PANoptosis下调
戈艳蕾
孙思怡
任泓沁
姚雪鑫
赵倩
李文强
陈伟彬
白静
喻昌利
董爱英
刘铁军
付爱双
《南京医科大学学报(自然科学版)》
北大核心
2025
0
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