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题名抗冻蛋白冰结合位点特征及其研究综述
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作者
杨如意
廖丽
胥义
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机构
上海理工大学健康科学与工程学院
自然资源部极地科学研究重点实验室
上海交通大学海洋学院
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出处
《极地研究》
北大核心
2025年第1期137-148,共12页
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基金
国家自然科学基金(52076140)
国家自然科学基金(41976224)
国家重点研发计划(2022YFC2807501)资助。
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文摘
冰结合位点(Ice-binding site,IBS)是抗冻蛋白(Antifreeze proteins,AFPs)与冰晶冰面结合、发挥抗冻作用的关键部分,对揭示AFPs调控冰晶成核的作用和机制十分重要。本文首先介绍了几种AFPs与冰结合机制及其IBS;其次,分别选取了动物、植物和微生物来源的AFPs,并对其IBS氨基酸序列及结构特征进行分析。结果表明,大多数AFPs的IBS都存在一个或多个重复的氨基酸序列与冰晶结合,而且这些氨基酸通常具有疏水性或者亲水性弱、侧链短等特点,使IBS相对疏水和平坦。一般而言,相同类型AFPs的IBS结构类似。AFP I的IBS氨基酸序列为TAA(A),Ca^(2+)依赖型AFP II的IBS均为DTTLTE,昆虫AFPs的IBS一般由TXT序列构成。微生物来源的AFPs可能因种属间差异大,IBS氨基酸序列、结构特征无明显规律。最后,归纳了2种IBS鉴定方法。氨基酸定点突变是IBS鉴定的主要方法,而分子模拟是对氨基酸定点突变的辅助验证。本文总结了不同类型AFPs的IBS规律,为AFPs IBS的比较研究及抗冻机制解析提供参考。
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关键词
抗冻蛋白
冰结合位点
氨基酸突变
分子模拟
热滞活性
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Keywords
antifreeze protein
ice-binding site
amino acid mutation
molecular simulation
thermal hysteresis activity
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分类号
Q51
[生物学—生物化学]
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