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基于生物信息学分析VCAN作为结直肠癌顺铂耐药关键靶点研究
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作者 李静娴 陈辉广 +3 位作者 吴建泽 王德权 陈志芬 吴清明 《安徽医科大学学报》 北大核心 2025年第4期624-633,共10页
目的预测并验证结直肠癌(CRC)顺铂(DDP)耐药的关键靶点,为临床精准医学治疗提供更多方案。方法通过基因表达综合数据库(GEO)筛选出正常肠黏膜和CRC之间差异表达基因(DEGs);采用STRING数据库和Cytoscape软件挖掘关键基因;采用基因本体联... 目的预测并验证结直肠癌(CRC)顺铂(DDP)耐药的关键靶点,为临床精准医学治疗提供更多方案。方法通过基因表达综合数据库(GEO)筛选出正常肠黏膜和CRC之间差异表达基因(DEGs);采用STRING数据库和Cytoscape软件挖掘关键基因;采用基因本体联合数据库(GO)与京都基因与基因组百科全书(KEGG)对DEGs进行富集分析;利用高通量转录组测序鉴定、qRT-PCR、Western blot筛选、验证关键靶点;将多能蛋白聚糖(VCAN)基因过表达载体转染至人回盲部结直肠腺癌细胞(HCT8)细胞系,CCK-8检测细胞活力;流式细胞术测定细胞凋亡与细胞周期;qRT-PCR与Western blot检测基因mRNA和蛋白水平。结果通过GEO数据库筛选出了118个上调的DEGs和146个下调的DEGs。DEGs主要富集于细胞外基质分解、细胞外基质和磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶(PI3K-AKT)信号通路。基于蛋白质相互作用网络分析,鉴定出20个枢纽基因。通过对比CRC细胞系HCT8亲本株与DDP耐药株的转录组测序结果,进一步筛选出VCAN基因。在CRC组织中,VCAN基因的表达水平高于正常肠黏膜组织;相对于VCAN低表达患者,VCAN高表达的患者总生存期(OS)与无复发生存时间(RFS)更短。在CRC细胞系中,过表达VCAN基因促进了细胞的增殖(P<0.05),提高了细胞对DDP的耐药性,减少了DDP诱导的凋亡(P<0.05)与G_(0)/G_(1)期阻滞(P<0.05);上调VCAN基因激活AKT-雷帕霉素靶蛋白1(mTOR)信号通路。结论基于生物信息学和转录组测序筛选出CRC DDP耐药靶基因VCAN,VCAN基因可能通过调控AKT-mTOR通路促进CRC发展与对DDP的耐药性。 展开更多
关键词 VCAN 顺铂 生物信息学 转录组测序 AKT-mTOR信号通路 化疗耐药
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miR-23c靶向八聚体结合转录因子1调控肝癌细胞增殖、迁移与凋亡
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作者 夏盼盼 章威 +1 位作者 李思思 王红玲 《华中科技大学学报(医学版)》 北大核心 2025年第3期363-369,共7页
目的研究miR-23c及其靶基因OCT1(octamer-binding transcription factor 1)对肝细胞肝癌增殖、迁移及凋亡的影响。方法本研究运用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术,检测正常肝脏细胞系LO2与肝细胞癌细胞系(涵盖Huh7、HepG2、Hep-3B、SK-HEP... 目的研究miR-23c及其靶基因OCT1(octamer-binding transcription factor 1)对肝细胞肝癌增殖、迁移及凋亡的影响。方法本研究运用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术,检测正常肝脏细胞系LO2与肝细胞癌细胞系(涵盖Huh7、HepG2、Hep-3B、SK-HEP1、HCCLM3以及MHCC97H)内miR-23c的表达水平。设计了miR-23c模拟物,在肝癌细胞系Huh7中,运用CCK-8检测法、细胞迁移实验以及流式细胞分析技术,对细胞的增殖状况、迁移能力和凋亡水平予以测定。通过预测网站预测及双荧光素酶报告基因实验验证了miR-23c与OCT1的靶向关系,并通过Western blot分析miR-23c过表达对OCT1蛋白表达水平的影响。通过回复实验研究miR-23c靶向OCT1对肝细胞癌细胞增殖、迁移及凋亡的影响。结果相较于肝脏正常细胞系LO2,miR-23c于肝癌细胞系中的表达呈现明显下调。在与NC组进行对比时发现,转染miR-23c模拟物的Huh7细胞,其增殖能力与迁移能力均有所降低,细胞凋亡现象则明显增强。miR-23c和OCT1在分子层面上存在相互作用。miR-23c过表达后,Huh7细胞中的OCT1蛋白表达减少。转染miR-23c模拟物能够抑制Huh7细胞的增殖及迁移,促进其凋亡,而这些现象能够被过表达OCT1逆转。结论miR-23c能够下调OCT1,从而抑制肝癌细胞的增殖和迁移、促进凋亡。 展开更多
关键词 肝细胞癌 miR-23c 八聚体结合转录因子1 增殖 迁移 凋亡
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钡条结肠传输试验在慢性便秘患者中的临床应用 被引量:6
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作者 孔浩 王晓兵 《华中科技大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2018年第6期720-724,共5页
目的探讨改良后的钡条结肠传输试验在慢性便秘患者治疗中的应用。方法对112名排除器质性疾病和药物因素的慢性便秘患者的结肠传输时间和直肠肛管压力进行研究,进一步了解改进后的结肠传输试验在便秘患者中的应用,同时了解其与直肠肛管... 目的探讨改良后的钡条结肠传输试验在慢性便秘患者治疗中的应用。方法对112名排除器质性疾病和药物因素的慢性便秘患者的结肠传输时间和直肠肛管压力进行研究,进一步了解改进后的结肠传输试验在便秘患者中的应用,同时了解其与直肠肛管测压在反映出口梗阻型便秘检查中的差异。结果 (1)功能性便秘(FC)和便秘型肠易激综合征(IBS-C)患者各时间点钡条排除率较健康志愿者均明显降低。FC患者60和72h钡条排除率明显高于IBS-C患者(均P<0.05),其余时间点差异无统计学意义。与健康志愿者比较,FC与IBS-C患者右半结肠传输时间(RCTT)、左半结肠传输时间(LCTT)、直肠乙状结肠传输时间(RSCTT)和总结肠传输时间(CTT)明显延长,提示其结肠传输较正常者明显减慢。与FC患者比较,IBS-C患者RCTT明显延长,差异有统计学意义(P<0.05)。(2)对76例FC患者和36例IBS-C患者直肠肛管测压结果进行了比较,其中FC和IBS-C患者排便时肛门括约肌无松弛者分别为34和14例,差异无统计学意义(P>0.05)。(3)排便时肛门内括约肌无松弛导致结肠传输减慢,差异主要在直肠乙状结肠;RSCTT或CTT异常者多存在排便时肛门内括约肌无松弛。结论 FC和IBS-C患者结肠传输较正常人群均明显减慢;排便时肛门内括约肌无松弛导致直肠乙状结肠传输减慢;钡条结肠传输试验和直肠肛管测压对于诊断出口梗阻型便秘结果一致。 展开更多
关键词 钡条结肠传输试验 钡条排除率 结肠传输时间 直肠肛管测压
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基于数据挖掘分析ABAT基因在肝细胞癌中的表达及意义 被引量:2
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作者 张玉鹏 王帆 +4 位作者 陈鹏飞 刘适 刘岚 常莹 赵秋 《临床肝胆病杂志》 CAS 北大核心 2019年第3期553-558,共6页
目的 利用数据库分析基因ABAT在肝细胞癌中的表达以及意义。方法 利用Oncomine数据库及GEPIA分析ABAT在肝细胞癌组织中的表达情况;利用GEPIA做ABATmRNA与肝细胞癌患者生存期以及与病理分期程度的相关性分析;经MethHC数据库分析ABAT基因... 目的 利用数据库分析基因ABAT在肝细胞癌中的表达以及意义。方法 利用Oncomine数据库及GEPIA分析ABAT在肝细胞癌组织中的表达情况;利用GEPIA做ABATmRNA与肝细胞癌患者生存期以及与病理分期程度的相关性分析;经MethHC数据库分析ABAT基因启动子区甲基化水平;String数据库分析与ABAT蛋白相互作用的蛋白网络;通过TheHumanProteinAtlas分析ABAT蛋白在肝细胞癌组织中的表达情况以及ABAT在蛋白水平上对患者预后的影响。结果 mRNA水平上,ABAT在肝细胞癌组织中较正常肝组织显著低表达,其mRNA水平低者预后较差(log-rank,P=0.0021),ABATmRNA水平越低者病理分期恶性程度越高(P=0.00234)。ABAT蛋白在肝细胞癌组织中也较正常肝组织表达降低,蛋白表达水平低的患者预后较差(log-rank,P=2.14×10-3)。肝细胞癌中ABAT基因启动子区甲基化水平较正常肝组织显著升高(P<0.005)。与ABAT相互作用的蛋白有ALDH1A3、ALDH9A1、ALDH3A2、GAD1、GAD2等,可能参与细胞凋亡、氧化还原及神经递质分泌等细胞功能。结论 通过肿瘤基因数据库信息挖掘发现,无论在mRNA水平或是蛋白水平上,ABAT在肝细胞癌组织中呈低表达,且与患者生存期有关。目前采用数据库挖掘分析数据可为临床上肝细胞癌的诊断以及预后评估提供参考,将为后续的肿瘤研究提供重要的理论依据。 展开更多
关键词 肝细胞 4-氨基丁酸转氨酶 数据库 遗传学 基因
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Hippo通路在原发性肝癌发生发展中的作用 被引量:4
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作者 洪莹晖 王纯 +6 位作者 叶明亮 罗杰 刘佳良 任超 蓝偲瑜 赵秋 常莹 《临床肝胆病杂志》 CAS 北大核心 2020年第5期1171-1174,共4页
原发性肝癌在全球范围内发病率持续上升,发病年龄趋于年轻化,并且总体预后不良。Hippo通路作为最经典的感知细胞极性和密度、机械信号转导并促进细胞增殖、器官发育的调节器,能够促进包括原发性肝癌在内多种癌症的发生发展。YAP作为Hipp... 原发性肝癌在全球范围内发病率持续上升,发病年龄趋于年轻化,并且总体预后不良。Hippo通路作为最经典的感知细胞极性和密度、机械信号转导并促进细胞增殖、器官发育的调节器,能够促进包括原发性肝癌在内多种癌症的发生发展。YAP作为Hippo通路的经典核效应器在原发性肝癌中显著上调,并且促进原发性肝癌耐药的发生。原发性肝癌中Hippo信号通路的失调与肝癌的发生发展相联系,Hippo信号通路作为原发性肝癌发生的早期事件,影响原发性肝癌耐药的发生机制,这对于探索新的原发性肝癌临床治疗策略具有重要意义。 展开更多
关键词 肝肿瘤 信号传导 Hippo通路
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沉默促癌基因Yap1联合丹参酮ⅡA对肝癌细胞Huh-7的影响 被引量:4
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作者 洪莹晖 叶明亮 +6 位作者 罗杰 王纯 刘佳良 任超 蓝偲瑜 赵秋 常莹 《临床肝胆病杂志》 CAS 北大核心 2021年第2期348-353,共6页
目的研究基因Yap1与丹参酮ⅡA对肝癌细胞Huh-7增殖、迁移侵袭的影响。方法选用武汉大学中南医院10对人肝细胞癌及癌旁组织标本,收集时间2019年6月1日—2019年12月1日。实时荧光定量法和蛋白质印迹法用于检测基因Yap1的表达以及表型相关... 目的研究基因Yap1与丹参酮ⅡA对肝癌细胞Huh-7增殖、迁移侵袭的影响。方法选用武汉大学中南医院10对人肝细胞癌及癌旁组织标本,收集时间2019年6月1日—2019年12月1日。实时荧光定量法和蛋白质印迹法用于检测基因Yap1的表达以及表型相关分子的变化。采用MTT细胞增殖检测试剂检测不同浓度丹参酮ⅡA处理后细胞的增殖抑制率。蛋白质印迹实验检测不同干预下细胞凋亡、迁移相关标志物表达变化。流式细胞检测和Transwell实验分别检测细胞凋亡和细胞迁移以及侵袭。计量资料两组间比较采用t检验;计数资料两组间比较采用χ^2检验。结果10对人肝癌组织标本中有8对Yap1的表达明显高于癌旁组织。相对于人正常肝上皮细胞L02,Yap1在肝癌细胞株Huh-7和HCCL-M3中表达增高。si-Yap1-3转染细胞蛋白水平沉默效率达87.004%。MTT结果显示丹参酮ⅡA能够有效抑制Huh-7细胞增殖,其半数抑制浓度为8.683μmol/L。si-Yap1-3与丹参酮ⅡA联合处理Huh-7肝癌细胞,下游增殖迁移标志物E-钙粘蛋白表达增加,波形蛋白表达降低。Transwell实验结果示,相较于si-NC组,丹参酮ⅡA联合si-Yap1-3处理组细胞迁移、侵袭能力明显降低(43.19±2.88 vs 132.20±10.03,t=8.527,P=0.001;53.95±4.20 vs 179.10±11.11,t=4.484,P=0.011)。si-Yap1-3与丹参酮ⅡA联合处理组细胞凋亡相关标志物Bax表达增加,Bcl-2蛋白表达降低,且联合处理组细胞早期凋亡率为25.98%,高于si-NC组的9.21%(χ^2=4.078,P<0.05)。结论沉默促癌基因Yap1联合丹参酮ⅡA能够促进肝癌细胞Huh-7凋亡,并抑制其迁移侵袭,为临床用药提供一定的指导意义。 展开更多
关键词 肝细胞 基因沉默 丹参酮
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