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题名驴SCD1基因克隆及组织表达规律研究
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作者
黄飞
祁业辉
刘桂芹
王长法
周苗苗
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机构
聊城大学农学与农业工程学院毛驴高效繁育与生态饲养研究院
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出处
《西北农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第6期989-996,共8页
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基金
国家重点研发计划(2022YFD1600103)
山东省自然科学基金(ZR2023MC149)
聊城大学畜牧学学科开放课题(319462207-9)。
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文摘
旨在克隆驴硬脂酰辅酶A去饱和酶(Stearoyl-CoA desaturase-1,SCD1)基因并进行生物信息学分析、检测其在驴不同组织中的表达。设计SCD1基因引物,PCR克隆得到其CDS序列,然后对SCD1基因编码产物进行生物信息学预测,同时使用qRT-PCR检测驴心、肝、脾、肺、肾、肌肉、脂肪、乳腺内SCD1基因mRNA相对表达量。结果显示,驴SCD1基因CDS长1080 bp,可编码359个氨基酸,SCD1蛋白质分子质量为41.61 ku,等电点为9.32,不稳定指数为44.16,疏水性总平均值为-0.157,属于不稳定碱性亲水蛋白;SCD1蛋白二级结构主要由α-螺旋(51.25%)和无规则卷曲(42.62%)构成。SCD1基因在所检测驴组织中均有表达,其中在肝脏中表达量最高,脂肪、乳腺和肺脏中次之,心脏和肌肉中最低(P<0.05),提示SCD1在驴肝脏、脂肪和乳腺等组织不饱和脂肪酸的合成过程中发挥重要作用。
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关键词
SCD1
驴
基因克隆
生物信息学分析
组织表达
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Keywords
SCD1
Donkey
Gene cloning
Bioinformatics analysis
Tissue expression
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分类号
S822.2
[农业科学—畜牧学]
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