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甘薯抗病基因同源序列的克隆与分析
被引量：
7
1
作者
王钰
王荣富
何国浩
《南京农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第3期81-86,共6页
对根据紫花苜蓿（Medicago truncatula）NBS区域的保守序列等设计的16对简并引物进行优化，筛选出6对简并引物，以甘薯的基因组DNA为模板进行PCR扩增，克隆甘薯抗病基因同源序列（RGA）。结果克隆出342个不同的甘薯RGA，这342个甘薯RGA...
对根据紫花苜蓿（Medicago truncatula）NBS区域的保守序列等设计的16对简并引物进行优化，筛选出6对简并引物，以甘薯的基因组DNA为模板进行PCR扩增，克隆甘薯抗病基因同源序列（RGA）。结果克隆出342个不同的甘薯RGA，这342个甘薯RGA和已知的抗病基因历、N、RGCl等具有高度同源性（Evalue〈e×10^-20）。根据抗病基因同源序列的相似性，利用Cluxtalw软件将其分为22个不同的类群。这些甘薯的抗病基因同源序列已提交GenBank（编号：DQ903322至DQ903664）。在342个甘薯RGA中，除7个是TIR外，其余属于DOD—TIR类型。用Blastx和DNAman软件对342个甘薯RGA进行列队比较，发现有9个含有抗线虫病RGC1序列的RGA，它们与RGC1的同源件为50％～100％．
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关键词
甘薯
简并引物
抗病基因同源序列(RGA)
克隆
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题名
甘薯抗病基因同源序列的克隆与分析
被引量：
7
1
作者
王钰
王荣富
何国浩
机构
安徽农业
大学
生命科学
学院
安徽
大学
生命科学
学院
/安徽省生态
环境
与生物技术重点实验室
美国tuskegee大学农学、自然与环境学院
出处
《南京农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第3期81-86,共6页
文摘
对根据紫花苜蓿（Medicago truncatula）NBS区域的保守序列等设计的16对简并引物进行优化，筛选出6对简并引物，以甘薯的基因组DNA为模板进行PCR扩增，克隆甘薯抗病基因同源序列（RGA）。结果克隆出342个不同的甘薯RGA，这342个甘薯RGA和已知的抗病基因历、N、RGCl等具有高度同源性（Evalue〈e×10^-20）。根据抗病基因同源序列的相似性，利用Cluxtalw软件将其分为22个不同的类群。这些甘薯的抗病基因同源序列已提交GenBank（编号：DQ903322至DQ903664）。在342个甘薯RGA中，除7个是TIR外，其余属于DOD—TIR类型。用Blastx和DNAman软件对342个甘薯RGA进行列队比较，发现有9个含有抗线虫病RGC1序列的RGA，它们与RGC1的同源件为50％～100％．
关键词
甘薯
简并引物
抗病基因同源序列(RGA)
克隆
Keywords
sweetpotato
degenerate primer
resistance gene analog （RGA）
cloning
分类号
Q785 [生物学—分子生物学]
S435.311 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
甘薯抗病基因同源序列的克隆与分析
王钰
王荣富
何国浩
《南京农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008
7
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