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基于线粒体DNA的12S rRNA基因序列推断中国及北美部分滑蜥属物种的生物地理和亲缘关系(英文)
被引量：
2
1
作者
庆宁
林弘都
+3 位作者
仝冉冉
张小奇
卢文华
LAZELL James
《华南师范大学学报（自然科学版）》
CAS
北大核心
2013年第6期129-139,共11页
许多东亚和北美的生物类群之间呈现较近的亲缘关系,格雷分布即指这种生物洲际间断分布的现象.本文通过线粒体DNA(mtDNA)12S rRNA基因序列分析,证明北美的滑蜥属Scincella(Squamata:Scincidae)物种Sc.lateralis与中国的滑蜥属南滑蜥种组...
许多东亚和北美的生物类群之间呈现较近的亲缘关系,格雷分布即指这种生物洲际间断分布的现象.本文通过线粒体DNA(mtDNA)12S rRNA基因序列分析,证明北美的滑蜥属Scincella(Squamata:Scincidae)物种Sc.lateralis与中国的滑蜥属南滑蜥种组呈现典型的格雷分布.南滑蜥种组包括宁波滑蜥Sc.modesta,秦岭滑蜥Sc.tsinlingensis,南滑蜥Sc.reevesii,和一个采自广东鼎湖山自然保护区的未命名种Scincella indet..这个鼎湖山未命名种并不具备滑蜥属所特有的鉴别性特征"睑窗",但显示它与Sc.modesta,Sc.tsinlingensis都是由Sc.reevesii演化而来的近缘种.证实了之前认为亚洲的蜓蜥属Sphenomorphus与滑蜥属Scincella是复系的观点,目前美洲物种Sp.cherriei应隶属于滑蜥属Scincella,具睑窗或不具睑窗的物种分别出现在系统树的不同分支中.研究结果支持前人将Kaestlea travancorica从滑蜥属中划分出去的观点.根据分子钟估算,北美的滑蜥从它们的中国祖先分化出来的时间可追溯到第三纪中新世,约7.3-21.6百万年前,当时白令陆桥还露出海平面而且气候湿润.该研究为洲际分布的物种的系统发育和生物地理研究提供了理论依据.
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关键词
Scincella
Sphenomorphus
格雷分布
遗传距离
分化时间
12S
RRNA基因序列
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职称材料
Goniurosaurus indet．的有效性及中国睑虎属(Squamata：Sauria：Eublepharidae)种间的亲缘关系
被引量：
5
2
作者
张洁
庆宁
+4 位作者
易祖盛
王英勇
江晓汕
卢文华
James Lazell
《华南师范大学学报（自然科学版）》
CAS
北大核心
2014年第2期92-98,共7页
了解我国睑虎属Goniurosaurus(Squamata:Sauria:Eublepharidae)种间的亲缘关系以及广东新纪录的睑虎属未定种Goniurosaurus indet.的有效性,对睑虎属10个种的线粒体DNA基因片段比较和遗传变异分析.获得12S rRNA(385 bp)和16S rRNA(477 ...
了解我国睑虎属Goniurosaurus(Squamata:Sauria:Eublepharidae)种间的亲缘关系以及广东新纪录的睑虎属未定种Goniurosaurus indet.的有效性,对睑虎属10个种的线粒体DNA基因片段比较和遗传变异分析.获得12S rRNA(385 bp)和16S rRNA(477 bp)总长度为862 bp的联合序列,共有核苷酸变异位点388个,简约信息位点269个.选取大壁虎Gekko gecko为外类群,采用贝叶斯演绎法(BI)、最大似然法(ML)、最大简约法(MP)、邻接法(NJ)对两个基因联合序列的分析均显示相同结果,即广东睑虎属未定种Goniurosaurus indet.与英德睑虎G.yingdeensis以及凭祥睑虎G.luii与蛛纹睑虎G.araneus两两种间的亲缘关系较近;且分布区相邻的Goniurosaurus indet.与G.yingdeensis之间的遗传分化(遗传距离=0.044-0.046)相似于分类地位已经明确的G.luii与G.araneus种间的遗传差异(遗传距离=0.051).结合形态学研究结果,认为Goniurosaurus indet.和G.yingdeensis之间已发生显著的遗传差异,前者可能为睑虎属新种.同时,系统发育分析表明海南睑虎G.hainanensis与睑虎属其它物种之间的遗传分化较大,系统发育地位最为特殊.系统发育分析进一步表明具4条背部横纹是祖征,具5条背部横纹为衍征.该文首次提出宽阔的河流可能是造成睑虎种群分化和新种形成的重要地理屏障.这一"河流隔离"观点对全球睑虎属物种的亲缘地理分布格局的解释具有重要的理论意义.
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关键词
睑虎属
线粒体DNA
地理亲缘关系
河流隔离
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职称材料
题名
基于线粒体DNA的12S rRNA基因序列推断中国及北美部分滑蜥属物种的生物地理和亲缘关系(英文)
被引量：
2
1
作者
庆宁
林弘都
仝冉冉
张小奇
卢文华
LAZELL James
机构
华南师范大学生命科学学院
树人医护管理专科学校
美国罗德岛州生物保护所
出处
《华南师范大学学报（自然科学版）》
CAS
北大核心
2013年第6期129-139,共11页
基金
广东省自然科学基金项目(06025054)
美国Falconwood Foundation资助项目
文摘
许多东亚和北美的生物类群之间呈现较近的亲缘关系,格雷分布即指这种生物洲际间断分布的现象.本文通过线粒体DNA(mtDNA)12S rRNA基因序列分析,证明北美的滑蜥属Scincella(Squamata:Scincidae)物种Sc.lateralis与中国的滑蜥属南滑蜥种组呈现典型的格雷分布.南滑蜥种组包括宁波滑蜥Sc.modesta,秦岭滑蜥Sc.tsinlingensis,南滑蜥Sc.reevesii,和一个采自广东鼎湖山自然保护区的未命名种Scincella indet..这个鼎湖山未命名种并不具备滑蜥属所特有的鉴别性特征"睑窗",但显示它与Sc.modesta,Sc.tsinlingensis都是由Sc.reevesii演化而来的近缘种.证实了之前认为亚洲的蜓蜥属Sphenomorphus与滑蜥属Scincella是复系的观点,目前美洲物种Sp.cherriei应隶属于滑蜥属Scincella,具睑窗或不具睑窗的物种分别出现在系统树的不同分支中.研究结果支持前人将Kaestlea travancorica从滑蜥属中划分出去的观点.根据分子钟估算,北美的滑蜥从它们的中国祖先分化出来的时间可追溯到第三纪中新世,约7.3-21.6百万年前,当时白令陆桥还露出海平面而且气候湿润.该研究为洲际分布的物种的系统发育和生物地理研究提供了理论依据.
关键词
Scincella
Sphenomorphus
格雷分布
遗传距离
分化时间
12S
RRNA基因序列
Keywords
Scincella
Sphenomorphus
Grayian distribution
genetic distance
separation time
12S rRNA gene sequences
分类号
Q349 [生物学—遗传学]
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职称材料
题名
Goniurosaurus indet．的有效性及中国睑虎属(Squamata：Sauria：Eublepharidae)种间的亲缘关系
被引量：
5
2
作者
张洁
庆宁
易祖盛
王英勇
江晓汕
卢文华
James Lazell
机构
华南师范大学生命科学学院
广州大学生命科学学院
中山大学生命科学学院
生物
博物馆
华南农业大学生命科学学院
美国罗德岛州生物保护所
出处
《华南师范大学学报（自然科学版）》
CAS
北大核心
2014年第2期92-98,共7页
基金
广东省自然科学基金项目(06025054)
美国the Falconwood Foundation项目
文摘
了解我国睑虎属Goniurosaurus(Squamata:Sauria:Eublepharidae)种间的亲缘关系以及广东新纪录的睑虎属未定种Goniurosaurus indet.的有效性,对睑虎属10个种的线粒体DNA基因片段比较和遗传变异分析.获得12S rRNA(385 bp)和16S rRNA(477 bp)总长度为862 bp的联合序列,共有核苷酸变异位点388个,简约信息位点269个.选取大壁虎Gekko gecko为外类群,采用贝叶斯演绎法(BI)、最大似然法(ML)、最大简约法(MP)、邻接法(NJ)对两个基因联合序列的分析均显示相同结果,即广东睑虎属未定种Goniurosaurus indet.与英德睑虎G.yingdeensis以及凭祥睑虎G.luii与蛛纹睑虎G.araneus两两种间的亲缘关系较近;且分布区相邻的Goniurosaurus indet.与G.yingdeensis之间的遗传分化(遗传距离=0.044-0.046)相似于分类地位已经明确的G.luii与G.araneus种间的遗传差异(遗传距离=0.051).结合形态学研究结果,认为Goniurosaurus indet.和G.yingdeensis之间已发生显著的遗传差异,前者可能为睑虎属新种.同时,系统发育分析表明海南睑虎G.hainanensis与睑虎属其它物种之间的遗传分化较大,系统发育地位最为特殊.系统发育分析进一步表明具4条背部横纹是祖征,具5条背部横纹为衍征.该文首次提出宽阔的河流可能是造成睑虎种群分化和新种形成的重要地理屏障.这一"河流隔离"观点对全球睑虎属物种的亲缘地理分布格局的解释具有重要的理论意义.
关键词
睑虎属
线粒体DNA
地理亲缘关系
河流隔离
Keywords
leopard gecko
mtDNA
phylogeography
separation by river
分类号
Q958.2 [生物学—动物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于线粒体DNA的12S rRNA基因序列推断中国及北美部分滑蜥属物种的生物地理和亲缘关系(英文)
庆宁
林弘都
仝冉冉
张小奇
卢文华
LAZELL James
《华南师范大学学报（自然科学版）》
CAS
北大核心
2013
2
在线阅读
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职称材料
2
Goniurosaurus indet．的有效性及中国睑虎属(Squamata：Sauria：Eublepharidae)种间的亲缘关系
张洁
庆宁
易祖盛
王英勇
江晓汕
卢文华
James Lazell
《华南师范大学学报（自然科学版）》
CAS
北大核心
2014
5
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