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PD-1与单克隆抗体残基特异性结合机制的计算丙氨酸扫描研究
被引量：
3
1
作者
温炜
黄达锭
+1 位作者
鲍劲霄
张增辉
《高等学校化学学报》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2021年第7期2161-2169,共9页
通过分子动力学模拟检测了2种程序性细胞死亡蛋白(PD-1)/单克隆抗体(Pembrolizumab和Nivolumab)复合物,并使用高效的计算丙氨酸扫描方法预测了单抗与PD-1的结合热点,将它们与对PD-1/PD-L1结合重要的热点残基进行对比分析.结果显示,Pembr...
通过分子动力学模拟检测了2种程序性细胞死亡蛋白(PD-1)/单克隆抗体(Pembrolizumab和Nivolumab)复合物,并使用高效的计算丙氨酸扫描方法预测了单抗与PD-1的结合热点,将它们与对PD-1/PD-L1结合重要的热点残基进行对比分析.结果显示,Pembrolizumab以类似于PD-L1的方式与PD-1结合,而Nivolumab则以不同的方式与PD-1结合.2个PD-1/mAb复合物中共有的热点只有_(PD-1)K131.同时发现,与_(PD-1)K131结合的单抗的关键残基通常都受范德华(vdW)能量控制.2种单克隆抗体上热点的自由能贡献都以vdW能量为主,这表明在下一代PD-1新抗体的设计中需要提高静电型热点残基的数量.
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关键词
程序性细胞死亡蛋白
丙氨酸扫描计算
单克隆抗体
分子力学广义波恩表面积
相互作用熵
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职称材料
可逆循环伏安法电流函数的一种新算法
2
作者
丁明照
杜守明
《厦门大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
1990年第3期313-317,共5页
提出可逆过程循环伏安曲线的积分形式精确解,用Gauss-Legendre 求积公式解出正反向循环伏安曲线,讨论各种因素对伏安曲线、峰电流、峰电位的影响。同时对某些用于半积分电流公式验算。
关键词
循环伏安曲线
电流函数
半积分电流
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职称材料
题名
PD-1与单克隆抗体残基特异性结合机制的计算丙氨酸扫描研究
被引量：
3
1
作者
温炜
黄达锭
鲍劲霄
张增辉
机构
华东师范
大学
化学
与分子工程学院
上海
纽约大学
计算
化学
联合研究中心
美国纽约大学化学系
出处
《高等学校化学学报》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2021年第7期2161-2169,共9页
基金
国家重点研发计划项目(批准号:2016YFA0501700)
国家自然科学基金重大研究计划培育项目(批准号:91753103)
国家自然科学基金重点项目(批准号:21933010)资助.
文摘
通过分子动力学模拟检测了2种程序性细胞死亡蛋白(PD-1)/单克隆抗体(Pembrolizumab和Nivolumab)复合物,并使用高效的计算丙氨酸扫描方法预测了单抗与PD-1的结合热点,将它们与对PD-1/PD-L1结合重要的热点残基进行对比分析.结果显示,Pembrolizumab以类似于PD-L1的方式与PD-1结合,而Nivolumab则以不同的方式与PD-1结合.2个PD-1/mAb复合物中共有的热点只有_(PD-1)K131.同时发现,与_(PD-1)K131结合的单抗的关键残基通常都受范德华(vdW)能量控制.2种单克隆抗体上热点的自由能贡献都以vdW能量为主,这表明在下一代PD-1新抗体的设计中需要提高静电型热点残基的数量.
关键词
程序性细胞死亡蛋白
丙氨酸扫描计算
单克隆抗体
分子力学广义波恩表面积
相互作用熵
Keywords
PD-1
Computational alanine scanning
Monoclonal antibodies
MM/GBSA
Interaction entropy
分类号
O643 [理学—物理化学]
O642 [理学—物理化学]
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职称材料
题名
可逆循环伏安法电流函数的一种新算法
2
作者
丁明照
杜守明
机构
厦门
大学
化学系
美国纽约大学化学系
出处
《厦门大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
1990年第3期313-317,共5页
基金
国家自然科学基金
文摘
提出可逆过程循环伏安曲线的积分形式精确解,用Gauss-Legendre 求积公式解出正反向循环伏安曲线,讨论各种因素对伏安曲线、峰电流、峰电位的影响。同时对某些用于半积分电流公式验算。
关键词
循环伏安曲线
电流函数
半积分电流
Keywords
Cyclic voltammograms, Current function. Semiintegral current
分类号
O646 [理学—物理化学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
PD-1与单克隆抗体残基特异性结合机制的计算丙氨酸扫描研究
温炜
黄达锭
鲍劲霄
张增辉
《高等学校化学学报》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2021
3
在线阅读
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职称材料
2
可逆循环伏安法电流函数的一种新算法
丁明照
杜守明
《厦门大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
1990
0
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职称材料
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