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用水合物储存氧气的计算化学模拟研究
1
作者
曾军
杜奇石
+1 位作者
谢能中
黄日波
《广西科学》
CAS
2014年第6期652-655,共4页
【目的】用水合物在常温常压下能够储存氧气，在清洁能源、军事、航天、环境和生态保护等方面都有重大潜在应用，本文主要探讨水合物储氧的最佳比例和稳定性。【方法】在由20个水分子组成的正十二面体水合物512结构单元中分别放置1～3...
【目的】用水合物在常温常压下能够储存氧气，在清洁能源、军事、航天、环境和生态保护等方面都有重大潜在应用，本文主要探讨水合物储氧的最佳比例和稳定性。【方法】在由20个水分子组成的正十二面体水合物512结构单元中分别放置1～3个氧分子，用量子化学方法优化氧分子簇（O2，2O2，3O2）与水合物512结构单元的作用结构，并计算水合物稳定能。【结果】在边长为2．82的水合物512结构单元中放置1个和2个氧分子时得到吸引的稳定能；当储存3个氧分子时水合物单元与氧分子簇间的稳定能转为排斥。【结论】当边长为2．82时，在水合物512结构单元中最多可以存储2个氧分子。氧分子从水合物512结构单元中逃逸的势垒高达~200 kJ／mol，远高于氢分子的逃逸势垒~80 kJ／mol。
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关键词
水合物储氧
清洁能源
量子化学
逃逸势垒
储存密度
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职称材料
多聚唾液酸转移酶ST8SiaⅡ的结构和功能域
被引量：
1
2
作者
廖思明
卢波
+6 位作者
彭立新
黄纪民
陈东
Frederic A.Troy
黄日波
周国平
无
《广西科学》
CAS
2017年第1期120-126,共7页
ST8SiaⅡ(STX)和ST8SiaⅣ(PST)是两个来源于哺乳动物细胞的、具有高度同源性的多聚唾液酸酶,它们已经被克隆,基因序列也已被测定。这两个酶能催化神经细胞黏附分子(NCAM)的多聚唾液酸化。NCAM是多聚唾液酸(polySlA)的主要载体。在NCAM...
ST8SiaⅡ(STX)和ST8SiaⅣ(PST)是两个来源于哺乳动物细胞的、具有高度同源性的多聚唾液酸酶,它们已经被克隆,基因序列也已被测定。这两个酶能催化神经细胞黏附分子(NCAM)的多聚唾液酸化。NCAM是多聚唾液酸(polySlA)的主要载体。在NCAM多聚唾液酸化过程中,STX和PST能将活化的胞苷-磷酸-乙酰神经氨酸(CMP-Neu5Ac)传送到NCAM糖蛋白受体的N-和O-型寡聚糖链上,从而合成α-2,8-多唾液酸聚糖(polySA)。近来我们使用Phyre 2软件构建了多聚唾液酸ST8SiaⅡ酶的三维结构模型,给出了该酶中多聚唾液酸转移酶结构域(PSTD)和多聚碱性氨基酸区域(PBR)两个功能域的结构特征,认为在这两个区域中有几个氨基酸残基在引起多聚唾液酸化过程中起到了关键作用。我们的研究结果为研究ST8SiaⅡ酶催化NCAM多聚唾液酸化的分子机制提供了新的结构信息,也为和该酶所联系的肿瘤细胞转移的抑制机制和抑制物/药物的研究和设计,提供更有价值的理论依据。
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关键词
肿瘤转移
多聚唾液酸(polySia)
多聚唾液酸转移酶结构域(PSTD)
多聚碱性氨基酸区域(PBR)
多聚唾液酸转移酶Ⅳ(PST)
神经细胞黏附分子(NCAM)
多聚唾液酸化
蛋白质三维结构
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职称材料
题名
用水合物储存氧气的计算化学模拟研究
1
作者
曾军
杜奇石
谢能中
黄日波
机构
广西
科学
院
广西锦翰环保公司
美国戈登生命科学研究所
出处
《广西科学》
CAS
2014年第6期652-655,共4页
基金
国家自然科学基金项目(31370716和31360207)资助
文摘
【目的】用水合物在常温常压下能够储存氧气，在清洁能源、军事、航天、环境和生态保护等方面都有重大潜在应用，本文主要探讨水合物储氧的最佳比例和稳定性。【方法】在由20个水分子组成的正十二面体水合物512结构单元中分别放置1～3个氧分子，用量子化学方法优化氧分子簇（O2，2O2，3O2）与水合物512结构单元的作用结构，并计算水合物稳定能。【结果】在边长为2．82的水合物512结构单元中放置1个和2个氧分子时得到吸引的稳定能；当储存3个氧分子时水合物单元与氧分子簇间的稳定能转为排斥。【结论】当边长为2．82时，在水合物512结构单元中最多可以存储2个氧分子。氧分子从水合物512结构单元中逃逸的势垒高达~200 kJ／mol，远高于氢分子的逃逸势垒~80 kJ／mol。
关键词
水合物储氧
清洁能源
量子化学
逃逸势垒
储存密度
Keywords
oxygen-hydrate clathrate
clean energy
quantum chemistry
escaping barrier
storing density
分类号
TQ013.2 [化学工程]
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职称材料
题名
多聚唾液酸转移酶ST8SiaⅡ的结构和功能域
被引量：
1
2
作者
廖思明
卢波
彭立新
黄纪民
陈东
Frederic A.Troy
黄日波
周国平
无
机构
广西
科学
院国家非粮生物质能源工程技术
研究
中心
广西大学
美国
加利福里亚大学生物化学和分子生物系
美国戈登生命科学研究所
出处
《广西科学》
CAS
2017年第1期120-126,共7页
基金
国家自然科学基金项目(31560251)
广西自然科学基金项目(2015GXNSFAA139053)
+1 种基金
广西科学与技术开发计划项目(14123001-19,15104001-6)
广西科学院基本科研项目(15YJ22SW02)资助
文摘
ST8SiaⅡ(STX)和ST8SiaⅣ(PST)是两个来源于哺乳动物细胞的、具有高度同源性的多聚唾液酸酶,它们已经被克隆,基因序列也已被测定。这两个酶能催化神经细胞黏附分子(NCAM)的多聚唾液酸化。NCAM是多聚唾液酸(polySlA)的主要载体。在NCAM多聚唾液酸化过程中,STX和PST能将活化的胞苷-磷酸-乙酰神经氨酸(CMP-Neu5Ac)传送到NCAM糖蛋白受体的N-和O-型寡聚糖链上,从而合成α-2,8-多唾液酸聚糖(polySA)。近来我们使用Phyre 2软件构建了多聚唾液酸ST8SiaⅡ酶的三维结构模型,给出了该酶中多聚唾液酸转移酶结构域(PSTD)和多聚碱性氨基酸区域(PBR)两个功能域的结构特征,认为在这两个区域中有几个氨基酸残基在引起多聚唾液酸化过程中起到了关键作用。我们的研究结果为研究ST8SiaⅡ酶催化NCAM多聚唾液酸化的分子机制提供了新的结构信息,也为和该酶所联系的肿瘤细胞转移的抑制机制和抑制物/药物的研究和设计,提供更有价值的理论依据。
关键词
肿瘤转移
多聚唾液酸(polySia)
多聚唾液酸转移酶结构域(PSTD)
多聚碱性氨基酸区域(PBR)
多聚唾液酸转移酶Ⅳ(PST)
神经细胞黏附分子(NCAM)
多聚唾液酸化
蛋白质三维结构
Keywords
tumor metastasis
polysialic acid（polySia）
polysialyltransferase domain（PSTD）
polybasic region（PBR）
ST8SiaⅣ（PST）
neural cell adhesion molecules（NCAM）
polysialylation
protein 3Dstructure
分类号
Q555 [生物学—生物化学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
用水合物储存氧气的计算化学模拟研究
曾军
杜奇石
谢能中
黄日波
《广西科学》
CAS
2014
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
多聚唾液酸转移酶ST8SiaⅡ的结构和功能域
廖思明
卢波
彭立新
黄纪民
陈东
Frederic A.Troy
黄日波
周国平
无
《广西科学》
CAS
2017
1
在线阅读
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职称材料
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