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肝细胞癌组织CC趋化因子配体23(CCL23)表达的生物信息学分析及意义 被引量:7
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作者 陆进 杨月 +6 位作者 俞鹏 陶恒 卢兴浩 王黎源 刘冬播 陈云帆 陈传好 《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第10期903-909,共7页
目的探讨CC趋化因子配体23(CCL23)在肝细胞癌(HCC)组织中的表达及其对患者生存预后的临床意义.方法分别利用GEPIA、HCCDB、MetaScape、TOMER、TISIDB,Kaplan-Meier Plotter等在线数据库分析CCL23在HCC组织的表达水平、表达基因及其基因... 目的探讨CC趋化因子配体23(CCL23)在肝细胞癌(HCC)组织中的表达及其对患者生存预后的临床意义.方法分别利用GEPIA、HCCDB、MetaScape、TOMER、TISIDB,Kaplan-Meier Plotter等在线数据库分析CCL23在HCC组织的表达水平、表达基因及其基因本体(GO)功能注释和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集、肿瘤细胞纯度的相关性、免疫细胞中的表达情况和对患者生存预后意义.结果CCL23在HCC各期均低表达,并且与HCC肿瘤细胞纯度负相关,低表达CCL23的HCC患者的生存期短预后差.CCL23在HCC中共表达基因的GO功能和KEGG通路主要富集在免疫细胞活化和补体系统激活等.CCL23是HCC中最强的趋化因子,可与CC趋化因子受体1(CCR1)、CCR2、CCR7和CXC趋化因子受体6(CXCR6)等多种受体结合而发挥对免疫细胞的趋化作用,其中对效应CD8^+T细胞和巨噬细胞趋化作用最明显.结论HCC组织CCL23低表达,不利于HCC患者抗肿瘤免疫防御作用的发挥,显著缩短HCC患者的生存期. 展开更多
关键词 肝细胞癌(HCC) 趋化因子 肿瘤 受体 配体
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垂体瘤转化基因1(PTTG1)在肝细胞癌组织高表达且与预后不良相关 被引量:4
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作者 陶恒 杨月 +1 位作者 陈洁 陆进 《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第4期337-343,共7页
目的分析垂体瘤转化基因1(PTTG1)在肝细胞癌(HCC)中的表达及其临床预后意义。方法首先利用肿瘤生存(Tumorsurvival)和肝细胞癌整合分子数据库(HCCDB)分析HCC组织PTTG1及其共表达基因的表达情况;再利用cBioPortal、MetaScape和Kaplan-Mei... 目的分析垂体瘤转化基因1(PTTG1)在肝细胞癌(HCC)中的表达及其临床预后意义。方法首先利用肿瘤生存(Tumorsurvival)和肝细胞癌整合分子数据库(HCCDB)分析HCC组织PTTG1及其共表达基因的表达情况;再利用cBioPortal、MetaScape和Kaplan-Meier Plotter数据库分析PTTG1基因在HCC中共表达基因的突变、基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集情况,并分析共表达基因对HCC患者总体生存(OS)的影响;最后利用肿瘤免疫评估资源库(TIMER)数据库分析PTTG1基因在HCC免疫微环境中的表达及与免疫细胞的关系,并分析各种免疫细胞对HCC患者OS的影响。结果PTTG1基因在HCC组织中高表达,且不利于HCC患者的OS;PTTG1基因在HCC中有19个显著共表达基因,并且其共表达基因在HCC中也高表达,同样不利于HCC患者的OS;PTTG1基因及其共表达基因的GO功能主要富集在细胞分裂、有丝核分裂和蛋白激酶结合等功能上,而KEGG富集在细胞循环、p53信号通路和人类嗜T细胞病毒(HTLV)感染等通路上;PTTG1及其共表达基因在HCC中均发生一定的突变,并显著缩短HCC患者的OS和DFS;PTTG1基因在HCC免疫微环境中与各种免疫细胞的表达正相关,但各种免疫细胞的表达同样也不利于HCC患者的OS。结论PTTG1高表达不利于HCC患者的生存预后。 展开更多
关键词 垂体瘤转化基因1(PTTG1) 总体生存 肝细胞癌
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二甲双胍通过AMPK/mTOR信号通路诱导胆囊癌细胞凋亡 被引量:1
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作者 周汉旭 严华悦 +2 位作者 王胜威 刘子祥 周少波 《海南医科大学学报》 北大核心 2025年第6期415-420,共6页
目的:本研究旨在探讨二甲双胍通过AMPK/mTOR信号通路对胆囊癌细胞凋亡以及生物学功能产生影响的具体机制。方法:通过使用不同浓度梯度的二甲双胍处理胆囊癌细胞,采用CCK‑8实验法测定二甲双胍对NOZ细胞的抑制效果。实验随后被分为3组:空... 目的:本研究旨在探讨二甲双胍通过AMPK/mTOR信号通路对胆囊癌细胞凋亡以及生物学功能产生影响的具体机制。方法:通过使用不同浓度梯度的二甲双胍处理胆囊癌细胞,采用CCK‑8实验法测定二甲双胍对NOZ细胞的抑制效果。实验随后被分为3组:空白对照组、MET组以及MET+BAY‑3827组合。为了评估二甲双胍对NOZ细胞增殖的影响,进行细胞集落形成实验。本研究采用Western blot技术探讨与细胞凋亡相关的蛋白质及AMPK/mTOR信号通路的调控机制。本研究采用了流式细胞术计算胆囊癌细胞中凋亡细胞的比例。细胞划痕实验和Transwell实验被用来评估胆囊癌细胞的迁移能力。结果:二甲双胍可以通过激活AMPK/mTOR信号通路的方式,抑制胆囊癌细胞增殖和迁移,并促进细胞凋亡。CCK‑8和集落形成实验已验证了其对胆囊癌细胞抑制作用,流式细胞术检测到其具有促进胆囊癌细胞凋亡的效果,且使用BAY‑3827抑制该信号通路后,二甲双胍对凋亡相关蛋白的表达趋势的影响有逆转作用,Western blot结果显示,二甲双胍上调凋亡相关蛋白Caspase‑3和Bax以及AMPK/mTOR信号通路相关蛋白AMPK、p‑AMPK的表达,下调抗凋亡蛋白Bcl‑2和AMPK/mTOR信号通路相关蛋白mTOR、p70S6K、4E‑BP1、p‑mTOR、p‑p70S6K、p‑4E‑BP1的表达。结论:二甲双胍可通过上述机制抑制胆囊癌细胞的相关生物学活动,诱导其凋亡。 展开更多
关键词 胆囊癌 二甲双胍 信号通路 细胞凋亡
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自噬通过调节免疫系统影响系统性红斑狼疮发病的研究进展 被引量:1
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作者 马天贞 唐红辉 +5 位作者 陈璇 郭雨晴 张利平 李柏青 席进 王元元 《细胞与分子免疫学杂志》 北大核心 2025年第7期649-654,共6页
自噬是一种基本的生物体代谢过程,对机体免疫防御、物质代谢和内环境稳态发挥作用,与免疫调节密切相关。系统性红斑狼疮(SLE)是主要由免疫系统失调导致的弥散性结缔组织性疾病,由于免疫系统对机体本身物质的免疫识别紊乱而产生自身抗体... 自噬是一种基本的生物体代谢过程,对机体免疫防御、物质代谢和内环境稳态发挥作用,与免疫调节密切相关。系统性红斑狼疮(SLE)是主要由免疫系统失调导致的弥散性结缔组织性疾病,由于免疫系统对机体本身物质的免疫识别紊乱而产生自身抗体,可侵犯全身各组织器官,不同部位呈现不同的临床表现,目前其发病机制及治疗受到广泛研究。在机体正常代谢中,自噬可参与到固有免疫和适应性免疫中,调节机体的免疫反应,对维持正常的免疫功能和内环境的稳态发挥重要作用。研究发现SLE患者表现为免疫功能紊乱,自噬水平失调。而通过干预自噬也会影响免疫系统的功能,改善SLE的症状。自噬在参与固有免疫和适应性免疫中,清除代谢产物、调节免疫细胞的生存周期,并有研究发现调节自噬的药物可改善SLE的疾病进展。本文将对自噬通过调节免疫系统功能影响SLE发病的研究进展作一综述。 展开更多
关键词 系统性红斑狼疮(SLE) 自噬 Ⅰ型干扰素 中性粒细胞 综述
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LncRNA MALAT1/miR-15b-5p调控Wnt/β-catenin通路对脂多糖诱导软骨细胞损伤的影响
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作者 赵志 刘梦鲲 +2 位作者 查日飞 张汀葆 王珵 《安徽医科大学学报》 北大核心 2025年第7期1231-1240,共10页
目的探讨骨关节炎中长链非编码RNA转移相关肺腺癌转录物1(MALAT1)/微小RNA-15b-5p(miR-15b-5p)调控Wnt/β-catenin通路在脂多糖(LPS)诱导软骨损伤中的分子机制。方法以5 mg/L LPS处理ATDC5细胞形成骨关节炎细胞损伤模型,RT-qPCR检测细胞... 目的探讨骨关节炎中长链非编码RNA转移相关肺腺癌转录物1(MALAT1)/微小RNA-15b-5p(miR-15b-5p)调控Wnt/β-catenin通路在脂多糖(LPS)诱导软骨损伤中的分子机制。方法以5 mg/L LPS处理ATDC5细胞形成骨关节炎细胞损伤模型,RT-qPCR检测细胞中MALAT1和miR-15b-5p的表达。MTT、流式细胞术、茜素红染色和ELISA检测MALAT1和miR-15b-5p对LPS诱导的软骨细胞损伤的影响。双荧光素酶报告基因实验检验MALAT1和miR-15b-5p的调控关系。Western blot检测相关蛋白的表达情况。结果在LPS诱导的ATDC5细胞中,MALAT1表达降低(P<0.05)。与Control组比较,LPS组细胞活性降低,凋亡率升高,肿瘤坏死因子-α、白细胞介素-6、白细胞介素-1β水平升高,钙化结节增多,MMP13、ADAMTS5蛋白表达水平升高,CollagenⅡ、Aggrecan蛋白表达水平降低,Wnt1和β-catenin蛋白表达水平升高(P<0.05)。MALAT1过表达可消减LPS对软骨细胞活性、凋亡、炎症反应、成骨分化、细胞外基质降解和Wnt/β-catenin通路的影响(P<0.05);而miR-15b-5p过表达增强了LPS对软骨细胞的作用(P<0.05)。结论MALAT1在LPS诱导的软骨细胞中低表达,其通过靶向miR-15b-5p抑制Wnt/β-catenin通路减轻LPS诱导的软骨细胞损伤。 展开更多
关键词 MALAT1 miR-15b-5p 软骨细胞 WNT/Β-CATENIN信号通路 骨关节炎 炎症反应 成骨分化 细胞外基质
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结合生物信息学探究磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶1对胆管癌细胞生物学行为的影响及机制
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作者 严华悦 周汉旭 +3 位作者 王胜威 杨立春 刘子祥 贾建光 《海南医科大学学报》 北大核心 2025年第12期928-937,共10页
目的:本研究旨在结合生物信息学探讨磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶1(phosphoenolpyruvate carboxykinase 1,PCK1)在胆管癌细胞中的表达,及其对胆管癌细胞增殖、迁移的影响和潜在机制。方法:基于GEO数据库中胆管癌mRNA测序数据筛选差异表达基... 目的:本研究旨在结合生物信息学探讨磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶1(phosphoenolpyruvate carboxykinase 1,PCK1)在胆管癌细胞中的表达,及其对胆管癌细胞增殖、迁移的影响和潜在机制。方法:基于GEO数据库中胆管癌mRNA测序数据筛选差异表达基因。通过STRING网站及Cytoscape软件构建蛋白质-蛋白质互相作用网络(PPI网络),并筛选关键调控网络及基因。通过TCGA数据库及HPA数据库验证关键基因表达量及病理学特征。通过KEGG及GSEA富集分析探究差异基因相关功能及PCK1相关通路。细胞学实验中采用慢病毒转染胆管癌RBE细胞株以过表达PCK1,采用RT-qPCR及蛋白质印迹法验证转染效率。将实验分为阴性对照组(RBE组)、空转组(RBE-NC组)、过表达组(RBE-OE组)及PPARγ抑制剂组(RBE-OE+GW9662组)。采用集落形成实验及CCK8法检测细胞增殖能力,采用划痕愈合实验及Transwell实验检测细胞迁移能力,采用蛋白质印迹检测通路蛋白表达水平。结果:生物信息学分析显示PCK1可以作为胆管癌的关键调控基因,在癌组织中表达水平较低,可能通过PPAR通路发挥作用。细胞学实验显示:RBE细胞经转染后,PCK1 mRNA和蛋白表达水平显著升高。与阴性对照组相比,过表达PCK1抑制RBE细胞体外增殖和迁移能力,同时PPARγ、PTEN蛋白表达升高,而p-mTOR/mTOR水平降低,而抑制剂组则可逆转上述趋势。结论:PCK1可以作为胆管癌的关键调控基因,并可能通路激活PPARγ/PTEN/mTOR信号通路抑制胆管癌增殖及迁移。 展开更多
关键词 生物信息学 磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶1 胆管癌 生物学行为 机制
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PA2G4通过PI3K/AKT/p53信号通路对胆囊癌增殖、迁移及凋亡的作用机制研究
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作者 王胜威 严华悦 +4 位作者 周汉旭 杨立春 刘子祥 王畏 贾建光 《海南医科大学学报》 北大核心 2025年第8期570-577,共8页
目的:本研究旨在深入探究增殖相关蛋白2G4(proliferation-associated protein 2G4,PA2G4)通过PI3K/AKT/p53信号通路对人胆囊癌细胞GBC-SD增殖、迁移能力及凋亡过程的影响机制。方法:利用慢病毒转染技术构建PA2G4表达下调的胆囊癌细胞系... 目的:本研究旨在深入探究增殖相关蛋白2G4(proliferation-associated protein 2G4,PA2G4)通过PI3K/AKT/p53信号通路对人胆囊癌细胞GBC-SD增殖、迁移能力及凋亡过程的影响机制。方法:利用慢病毒转染技术构建PA2G4表达下调的胆囊癌细胞系。采用RT-qPCR、Western blot对转染效率进行验证。运用CCK-8法、集落形成实验评估PA2G4对于GBC-SD细胞的增殖活性。用Transwell实验、划痕愈合实验评估PA2G4对于GBC-SD细胞的迁移能力影响。通过Western blot技术检测PA2G4对PI3K/AKT/p53及其相关磷酸化蛋白的表达水平,并检测凋亡相关蛋白Caspase-3、Bcl-2及Bax的表达水平。结果:GBC-SD细胞经PA2G4敲低后,其PA2G4的mRNA及蛋白表达水平均显著下降。敲低PA2G4显著抑制了GBC-SD细胞的增殖活性和迁移能力,同时促进了细胞凋亡。此外,PA2G4敲低还伴随p-PI3K、pAKT表达水平的下调,以及p-p53表达水平的上调。结论:本研究表明,PA2G4通过下调PI3K/AKT/p53抑制胆囊癌细胞的增殖与迁移,并诱导其凋亡。 展开更多
关键词 胆囊癌 PA2G4 细胞增殖 凋亡
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CEACAM6通过调控上皮间质转化抑制鼻咽癌细胞的增殖和迁移
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作者 陶露 韦卓利 +1 位作者 王月月 项平 《南方医科大学学报》 北大核心 2025年第3期566-576,共11页
目的明确CEACAM6在鼻咽癌中的表达,探索CEACAM6对鼻咽癌细胞增殖和迁移的影响以及潜在的作用机制。方法通过GEO数据库分析CEACAM6在鼻咽癌中表达情况。TCGA数据库分析CEACAM6在头颈部癌中表达情况以及与生存预期的关系。免疫组织化学技... 目的明确CEACAM6在鼻咽癌中的表达,探索CEACAM6对鼻咽癌细胞增殖和迁移的影响以及潜在的作用机制。方法通过GEO数据库分析CEACAM6在鼻咽癌中表达情况。TCGA数据库分析CEACAM6在头颈部癌中表达情况以及与生存预期的关系。免疫组织化学技术检测CEACAM6在鼻咽癌组织中的表达情况。构建CEACAM6过表达细胞模型,分为control组(空载)和Lv-CEACAM6组(过表达);CEACAM6敲低细胞模型,分为control组(空载)、sh#1组(敲低)和sh#2组(敲低)。通过CCK-8和Edu染色检测CEACAM6对鼻咽癌细胞增殖的影响。伤口愈合和Transwell检测CEACAM6对鼻咽癌细胞侵袭迁移的影响。鬼笔环肽染色检测CEACAM6对鼻咽癌细胞骨架排列的影响。Western blotting检测CEACAM6对鼻咽癌细胞中FN1、ITGA5、ITGB1、N-cad、Vim和E-cad的蛋白表达影响以及FN1过表达对CEACAM6过表达的鼻咽癌细胞中ITGA5和ITGB1蛋白表达的影响。结果GEO数据库分析表明CEACAM6在鼻咽癌中低表达,TCGA数据库分析表明CEACAM6在头颈部癌中低表达,CEACAM6低表达与预后不良有关。免疫组织化学技术检测结果显示CEACAM6在鼻咽癌组织中低表达。CCK-8和Edu检测结果显示CEACAM6可抑制鼻咽癌细胞的增殖能力(P<0.05)。伤口愈合和Transwell检测结果显示CEACAM6可抑制鼻咽癌细胞侵袭和迁移能力(P<0.05)。鬼笔环肽染色结果显示上调CEACAM6表达后肌动蛋白荧光表达降低。Westen blotting检测结果表明上调CEACAM6表达后FN1、ITGA5、ITGB1下调,E-cad上调,N-cad和Vim下调(P<0.05),FN1过表达可缓解CEACAM6对ITGA5和ITGB1表达的抑制作用(P<0.05)。结论CEACAM6可能通过调控FN1、ITGA5、ITGB1蛋白表达影响上皮间质转化从而抑制鼻咽癌的侵袭和迁移。 展开更多
关键词 CEACAM6 鼻咽癌 迁移 上皮间质转化
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罗格列酮通过抑制肠系膜脂肪组织炎症改善三硝基苯磺酸(TNBS)诱导的小鼠结肠炎
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作者 张朝阳 王娟 +7 位作者 邵志林 王畏 王炼 解巧丽 周昌旻 葛思堂 左芦根 钱军 《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第9期787-793,共7页
目的探讨过氧化物酶体增殖物激活受体γ(PPARγ)激动剂罗格列酮(rosiglitazone)对2,4,6-三硝基苯磺酸(TNBS诱导的结肠炎小鼠的治疗作用及可能机制。方法选取雄性BALB/c小鼠20只建立TNBS结肠炎模型,造模成功后随机分为罗格列酮处理组及... 目的探讨过氧化物酶体增殖物激活受体γ(PPARγ)激动剂罗格列酮(rosiglitazone)对2,4,6-三硝基苯磺酸(TNBS诱导的结肠炎小鼠的治疗作用及可能机制。方法选取雄性BALB/c小鼠20只建立TNBS结肠炎模型,造模成功后随机分为罗格列酮处理组及模型组,每组10只。罗格列酮处理组给予罗格列酮灌胃(0. 2 m L,[20 mg/(kg·d)]),模型组给予生理盐水(0. 2 m L/d)灌胃。处理6周后,处死所有小鼠。采用炎症性肠病疾病活动度指数(DAI)及HE染色结合Spencer结肠炎组织学评分评估两组小鼠肠道炎症程度及组织学改变,ELISA检测肠黏膜白细胞介素1β(IL-1β)、肿瘤坏死因子α(TNF-α)、IL-10水平及肠系膜脂肪组织IL-6、单核细胞趋化蛋白1(MCP-1)水平;脂肪组织HE染色后200倍光镜下拍照依据比例尺计算脂肪细胞直径;免疫组织化学染色法检测小鼠肠系膜脂肪组织F4/80阳性巨噬细胞浸润数量、脂肪细胞成熟标志物外周蛋白(peripherin)、脂连蛋白(adiponectin)及瘦素(leptin)水平。Western blot法检测小鼠肠系膜脂肪组织核因子κB(NF-κB)和信号通路中的NF-κBp65、磷酸化的NF-κBp65(p-NF-κBp65)、磷酸化的NF-κB抑制蛋白(p-IκB)及磷酸化的IκB激酶(p-IKK)的蛋白水平。结果罗格列酮处理后第5及6周,小鼠DAI评分显著低于模型组。同时,处理组小鼠肠黏膜IL-1β及TNF-α水平显著低于模型组,而IL-10水平显著高于模型组。与模型组小鼠相比,罗格列酮处理组小鼠肠系膜脂肪细胞直径及脂肪细胞成熟标志物perilipin水平均显著高于模型组。同时,罗格列酮处理组小鼠肠系膜脂肪组织巨噬细胞浸润数量及炎症介质IL-6、MCP-1水平均显著低于模型组。罗格列酮治疗显著促进处理组小鼠肠系膜脂肪细胞adiponectin的表达,而抑制leptin的水平。罗格列酮处理组小鼠肠系膜脂肪组织NF-κBp65、p-NF-κBp65、p-IKK及p-IκB蛋白水平均显著低于模型组。结论罗格列酮可显著抑制TNBS模型小鼠肠道炎症,可能与抑制肠系膜脂肪组织NF-κBp65通路有关。 展开更多
关键词 罗格列酮 三硝基苯磺酸(TNBS) 结肠炎 肠系膜脂肪组织 炎症 过氧化物酶体增殖物激活受体γ(PPARγ)
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基于JAK/STAT信号通路探讨PRELID1表达在胃癌恶性生物学行为中的作用
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作者 夏勇生 赵萌 +3 位作者 杨一群 马珍丽 桑梦倩 陈德利 《临床与实验病理学杂志》 CAS 北大核心 2024年第2期164-171,共8页
目的探讨相关进化和淋巴兴趣域蛋白1(PRELID1)在胃癌组织中的表达及对预后的影响,并分析其影响胃癌细胞增殖和侵袭能力的机制。方法利用TCGA数据库和111例胃癌患者的临床数据分析PRELID1在胃癌组织中的表达,并分析PRELID1表达与临床病... 目的探讨相关进化和淋巴兴趣域蛋白1(PRELID1)在胃癌组织中的表达及对预后的影响,并分析其影响胃癌细胞增殖和侵袭能力的机制。方法利用TCGA数据库和111例胃癌患者的临床数据分析PRELID1在胃癌组织中的表达,并分析PRELID1表达与临床病理特征的关系及对预后的影响。生物信息学技术预测PRELID1的生物学功能,并进一步采用体外和体内实验验证。体外实验检测慢病毒调控胃癌细胞系(MGC803)中PRELID1的表达,并观察其对胃癌细胞增殖、迁移和侵袭的影响。利用裸鼠皮下成瘤体内实验观察PRELID1表达对胃癌组织生长的影响。结果PRELID1在胃癌组织中的表达显著高于癌旁组织(P<0.001)且与Ki67增殖指数呈正相关(P<0.001)。Cox回归模型分析显示,PRELID1高表达是影响胃癌患者根治术后5年生存率的独立危险因素(HR=2.336;95%CI=1.354~4.029)。基因富集结果显示,PRELID1的功能与细胞增殖和JAK/STAT信号有关。CCK-8和Transwell实验发现上调PRELID1表达可促进胃癌细胞的增殖(P=0.016)、迁移(P=0.016)和侵袭(P=0.025),下调其表达则抑制胃癌细胞的增殖(P=0.026)、迁移(P=0.048)和侵袭(P=0.029);裸鼠皮下成瘤实验发现上调PRELID1表达可促进胃癌组织的生长(P=0.047),下调其表达结果相反(P=0.005)。Western blot法检测结果显示,上调PRELID1表达可促进胃癌细胞和胃癌组织中JAK和STAT蛋白的表达(P均<0.05),下调则抑制(P均<0.05)。结论PRELID1在胃癌组织中呈高表达且与预后不良相关,其可能通过上调JAK/STAT信号调控胃癌细胞的增殖、迁移和侵袭。 展开更多
关键词 胃肿瘤 相关进化和淋巴兴趣域蛋白1 增殖 侵袭 JAK/STAT信号
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单细胞转录组测序技术在脊髓损伤免疫微环境研究中的应用进展
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作者 张楠 闫华筝 +5 位作者 高建雄 张霖 赵成辰 包芊慧 胡建国 吕合作 《细胞与分子免疫学杂志》 CSCD 北大核心 2024年第12期1133-1137,共5页
脊髓损伤(SCI)是一个涉及多种细胞相互作用的复杂病理生理过程,传统的测序方法只能检测受损局部细胞群体的平均基因表达水平,难以体现其异质性,因此需要新技术揭示细胞间的异质性和复杂的细胞间相互作用。单细胞转录组测序(scRNA-seq)... 脊髓损伤(SCI)是一个涉及多种细胞相互作用的复杂病理生理过程,传统的测序方法只能检测受损局部细胞群体的平均基因表达水平,难以体现其异质性,因此需要新技术揭示细胞间的异质性和复杂的细胞间相互作用。单细胞转录组测序(scRNA-seq)技术通过一系列测序技术实现高分辨检测单个细胞水平表达谱,以提供有关细胞异质性和功能、潜在分子机制、细胞命运转变和参与疾病发展的细胞间相互作用的信息,为基础和转化研究提供有价值的基因表达数据,有利于从中找出针对性治疗的干预靶点。本综述讨论了有关scRNA-seq技术及其在SCI后损伤局部免疫微环境中的多方面应用,将有助于更全面了解SCI免疫微环境的病理生理过程。 展开更多
关键词 单细胞转录组测序技术(scRNA-seq) 脊髓损伤免疫微环境 中性粒细胞 小胶质细胞 单核/巨噬细胞 星形胶质细胞 细胞间相互作用 综述
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鼻咽癌基因表达谱的免疫细胞浸润特征分析及临床意义 被引量:6
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作者 杨月 张培培 +1 位作者 张浩轩 陆进 《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第12期1069-1075,共7页
目的分析鼻咽癌(NPC)基因表达谱的免疫细胞浸润特征及临床意义。方法首先从基因表达数据集(GEO)下载NPC基因表达谱数据,并利用肿瘤免疫细胞浸润分析软件CIBERSORT的R软件包分析NPC中22种免疫细胞的浸润情况;其次,利用GEO2R筛选差异基因... 目的分析鼻咽癌(NPC)基因表达谱的免疫细胞浸润特征及临床意义。方法首先从基因表达数据集(GEO)下载NPC基因表达谱数据,并利用肿瘤免疫细胞浸润分析软件CIBERSORT的R软件包分析NPC中22种免疫细胞的浸润情况;其次,利用GEO2R筛选差异基因,并通过R Studio对差异基因进行基因本体论(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析;然后再分别利用STRING数据库绘制蛋白质相互作用(PPI)网络图以及Cytoscape软件的Degree算法筛选关键基因;最后分析关键基因在NPC中的表达和临床意义以及与免疫细胞之间的关系。结果NPC中M0型巨噬细胞、M1型巨噬细胞和γδT细胞等表达水平虽有增高,但差异不显著;而B记忆细胞和静息CD4+T记忆细胞表达减少,且差异显著。NPC中单核细胞与嗜酸性粒细胞(r=0.99)、浆细胞与调节性T细胞(r=0.88)、活化的肥大细胞与活化的树突状细胞(r=0.75)等呈正相关,而M1型巨噬细胞与B记忆细胞(r=-0.71)和活化的CD4+T记忆细胞(r=-0.63)呈负相关。此外,NPC差异基因的GO主要富集在与纤毛运动有关的功能上,KEGG主要富集在与细胞色素P450有关的通路上;卷曲螺旋结构域39(CCDC39)是NPC的关键基因,在NPC中高表达,且有利于患者的预后,而B记忆细胞的低表达不利于患者的预后。结论NPC微环境中分布大量免疫细胞,不同类型免疫细胞的表达有差异,但以B记忆细胞对NPC患者的预后影响最显著。 展开更多
关键词 鼻咽癌 免疫浸润 肿瘤 微环境 基因
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绿茶多酚抑制肠道JAK2/STAT3信号通路保护三硝基苯磺酸诱导的小鼠结肠炎肠黏膜屏障 被引量:21
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作者 席进 葛思堂 +3 位作者 左芦根 朱玉可 王炼 解巧丽 《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第3期237-241,共5页
目的探讨绿茶多酚(GTP)对2,4,6-三硝基苯磺酸(TNBS)诱导的结肠炎小鼠的治疗作用及可能机制。方法建立TNBS结肠炎模型,将造模成功的小鼠随机分为模型组和GTP处理组,每组10只。GTP处理组小鼠每日给予0.2 mL GTP灌胃(100 mg/kg),模型组每... 目的探讨绿茶多酚(GTP)对2,4,6-三硝基苯磺酸(TNBS)诱导的结肠炎小鼠的治疗作用及可能机制。方法建立TNBS结肠炎模型,将造模成功的小鼠随机分为模型组和GTP处理组,每组10只。GTP处理组小鼠每日给予0.2 mL GTP灌胃(100 mg/kg),模型组每日给予0.2 mL生理盐水灌胃。处理4周后处死小鼠,采用HE染色评估疾病活动度,采用ELISA检测小鼠结肠黏膜组织匀浆白细胞介素10(IL-10)、IL-6、肿瘤坏死因子α(TNF-α),免疫荧光染色检测肠黏膜屏障紧密连接蛋白1(ZO-1)及密封蛋白1(claudin-1)的表达,Western blot法检测肠黏膜ZO-1、claudin-1、磷酸化的Janus激酶2(p-JAK2)、磷酸化的信号转导子与转录激活子3(p-STAT3)的蛋白水平。结果在GTP处理的第3周及第4周,小鼠疾病活动指数均显著低于模型组小鼠。GTP处理组小鼠的结肠炎症评分及肠黏膜IL-6、TNF-α水平显著低于TNBS组,而IL-10显著高于TNBS组。与TNBS组小鼠相比,GTP处理显著提高小鼠claudin-1、ZO-1的表达水平,且小鼠肠黏膜p-JAK2及p-STAT3表达水平显著降低。结论GTP通过抑制肠道JAK2/STAT3信号通路发挥抗炎及肠黏膜屏障结构保护作用。 展开更多
关键词 绿茶多酚(GTP) 药物治疗 克罗恩病(Crohn病) 肠屏障功能 炎症
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二烯丙基二硫对AD模型小鼠学习记忆能力和海马突触的影响 被引量:4
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作者 柴继侠 李徽徽 +5 位作者 王元元 柴强 贺文欣 周艳梅 胡小冬 王震寰 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第10期1417-1422,共6页
目的探讨二烯丙基二硫(DADS)对阿尔茨海默病(AD)小鼠学习记忆能力及海马突触的影响。方法侧脑室立体定位术注射凝集态Aβ1-42制备AD模型小鼠,随机分成四组AD模型组,低中高DADS剂量组,分别灌服0、10、50和100 mg/kg/d的DADS。1个月后各... 目的探讨二烯丙基二硫(DADS)对阿尔茨海默病(AD)小鼠学习记忆能力及海马突触的影响。方法侧脑室立体定位术注射凝集态Aβ1-42制备AD模型小鼠,随机分成四组AD模型组,低中高DADS剂量组,分别灌服0、10、50和100 mg/kg/d的DADS。1个月后各组小鼠进行Morris水迷宫检测学习记忆能力、银染和电镜检测海马CA1区树突棘和突触的结构、蛋白印迹和RT-PCR检测海马内PSD95和SYP蛋白和基因的表达。结果与AD模型组相比,水迷宫检测显示中高剂量DADS组小鼠学习记忆能力增强,银染和电镜检测显示海马CA1区树突棘和突触增多,蛋白印迹和RT-PCR检测显示海马PSD95和SYP表达增多。结论随着DADS剂量的增加,AD小鼠的学习记忆能力得到改善,海马内树突棘和突触增多。 展开更多
关键词 二烯丙基二硫 阿尔茨海默病 突触 学习记忆能力 海马突触
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pBiFC-VN173-Olig2和pBiFC-VC155-Id4真核表达质粒的构建及其在活细胞内的相互作用 被引量:2
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作者 郭术俊 赵保明 +2 位作者 唐洁 胡建国 吕合作 《华中科技大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2011年第2期137-141,共5页
目的构建pBiFC-VN173-Olig2和pBiFC-VC155-Id4真核表达质粒,利用双分子荧光互补(BiFC)技术,在活细胞内直接观察Olig2与Id4的相互作用。方法利用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR),以新生大鼠脊髓RNA为模板,扩增Olig2和Id4基因,分别定向克隆到p... 目的构建pBiFC-VN173-Olig2和pBiFC-VC155-Id4真核表达质粒,利用双分子荧光互补(BiFC)技术,在活细胞内直接观察Olig2与Id4的相互作用。方法利用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR),以新生大鼠脊髓RNA为模板,扩增Olig2和Id4基因,分别定向克隆到pBiFC-VN173和pBiFC-VC155载体中,获得pBiFC-VN173-Olig2和pBiFC-VC155-Id4真核表达质粒。对此2种质粒进行酶切鉴定、测序;用脂质体方法共转染pBiFC-VN173-Olig2和pBiFC-VC155-Id4质粒到人结肠癌细胞系SW-1116细胞中,在荧光显微镜下观察Olig2与Id4之间的相互作用。结果通过酶切鉴定和测序表明成功构建了pBiFC-VN173-Olig2和pBiFC-VC155-Id4真核表达质粒;该质粒能够有效地共同转染到靶细胞,Olig2和Id4在靶细胞中能够高效表达,并可以相互结合出现BiFC荧光信号,且该信号主要分布于胞质中。结论成功构建了用于BiFC技术的真核表达载体,并在活细胞内检测到Olig2和Id4分子的相互结合。 展开更多
关键词 OLIG2 DNA结合抑制因子4 重组质粒 转染 细胞定位 双分子荧光互补技术
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兔膝关节解剖学特点及在动物模型的意义 被引量:3
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作者 陈士文 路屹 +3 位作者 陈传好 邵正仁 单增强 李成 《中国临床解剖学杂志》 CSCD 北大核心 2012年第1期100-102,共3页
目的研究兔膝关节血管分布及关节囊附着,为兔膝关节动物模型建立提供解剖学基础。方法将20只新西兰大白兔麻醉后,4%多聚甲醛灌注固定。解剖分离兔膝关节的动脉来源及分支、暴露兔膝关节囊的附着点。测量各动脉起始处及其在水平方向上和... 目的研究兔膝关节血管分布及关节囊附着,为兔膝关节动物模型建立提供解剖学基础。方法将20只新西兰大白兔麻醉后,4%多聚甲醛灌注固定。解剖分离兔膝关节的动脉来源及分支、暴露兔膝关节囊的附着点。测量各动脉起始处及其在水平方向上和关节囊附着点距髌骨下极的距离。结果分布兔膝关节的各动脉距髌骨下极的距离上、下和左、右约为20 mm和5 mm,关节囊的上、下端和左、右侧的附着点距髌骨下极约为10 mm和4.5 mm。结论在制备兔膝关节模型时,髌骨下极可设为参考的基准点,并通过距其距离判断手术安全范围。 展开更多
关键词 兔膝关节 动脉 关节囊
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前臂后群伸肌的神经分布及意义 被引量:3
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作者 陈士文 周晓 +4 位作者 王文艳 王震寰 刘宏升 廖亚平 刘冬播 《中国临床解剖学杂志》 CSCD 北大核心 2013年第1期22-24,共3页
目的探讨前臂后群肌内的桡神经走行及分布,为临床自体骨骼肌移植提供解剖学基础。方法在5具新鲜成人尸体标本上,完整取下桡侧腕长伸肌、指伸肌、拇长展肌和拇长伸肌,观测肌外神经来源,并采用改良Sihler’s肌内神经染色法观察肌内神经的... 目的探讨前臂后群肌内的桡神经走行及分布,为临床自体骨骼肌移植提供解剖学基础。方法在5具新鲜成人尸体标本上,完整取下桡侧腕长伸肌、指伸肌、拇长展肌和拇长伸肌,观测肌外神经来源,并采用改良Sihler’s肌内神经染色法观察肌内神经的分支、分布。结果采用Sihler’s染色后的肌肉标本,呈透明或半透明状态,肌内神经分支被染成紫黑色,其在肌肉内的分布及走行清晰可见。结论根据染色结果可将桡侧腕长伸肌、指伸肌、拇长展肌和拇长伸肌分为不同的肌亚部,为临床肌移植设计有指导意义。 展开更多
关键词 前臂后群肌肉 Sihler’s染色法 肌内神经 肌亚部
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大鼠pLenti6.3-Olig1-RFP慢病毒表达载体的构建与包装 被引量:1
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作者 席进 陈月娟 +3 位作者 张楠 张敬星 胡建国 吕合作 《华中科技大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2015年第2期176-179,共4页
目的构建大鼠少突胶质细胞转录因子1(Olig1)的慢病毒表达载体,并进行鉴定和包装。方法采用聚合酶链反应(PCR),分别以大鼠pEGFP-N3-Olig1表达质粒和pDsRed-monomer-N1为模板,扩增获得大鼠Olig1片段和红色荧光蛋白(RFP)片段。将两者进行PC... 目的构建大鼠少突胶质细胞转录因子1(Olig1)的慢病毒表达载体,并进行鉴定和包装。方法采用聚合酶链反应(PCR),分别以大鼠pEGFP-N3-Olig1表达质粒和pDsRed-monomer-N1为模板,扩增获得大鼠Olig1片段和红色荧光蛋白(RFP)片段。将两者进行PCR拼接获得Olig1-RFP片段,并与pLenti6.3-MCS-DEST载体连接,构建获得pLenti6.3-Olig1-RFP慢病毒表达载体,并进行酶切鉴定、测序。然后,将其与包装质粒混合后共转染HEK293T细胞进行包装获得慢病毒颗粒。结果通过酶切鉴定、测序,证明pLenti6.3-Olig1-RFP慢病毒表达载体构建成功,且能够被高效地包装为病毒颗粒。结论成功建立大鼠pLenti6.3-Olig1-RFP慢病毒表达系统,为进一步研究Olig1的生物学作用提供了实验基础。 展开更多
关键词 少突胶质细胞转录因子1 慢病毒表达载体 包装 聚合酶链反应 大鼠
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miR-129-1-3p通过靶向抑制WEE1蛋白激酶表达逆转HNE1/CDDP人鼻咽癌细胞顺铂耐药 被引量:2
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作者 张浩轩 陆进 +1 位作者 蒋成义 卢伟 《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第11期1014-1019,共6页
目的探讨miR-129-1-3p对人鼻咽癌耐药细胞HNE1/顺铂(CDDP)敏感性的影响及相关作用机制。方法培养人鼻咽癌HNE1细胞及耐CDDP的HNE1/CDDP细胞,噻唑蓝(MTT)法检测HNE1/CDDP细胞对于CDDP的耐药指数;采用反转录PCR检测miR-129-1-3p和WEE1蛋... 目的探讨miR-129-1-3p对人鼻咽癌耐药细胞HNE1/顺铂(CDDP)敏感性的影响及相关作用机制。方法培养人鼻咽癌HNE1细胞及耐CDDP的HNE1/CDDP细胞,噻唑蓝(MTT)法检测HNE1/CDDP细胞对于CDDP的耐药指数;采用反转录PCR检测miR-129-1-3p和WEE1蛋白激酶在两种细胞的表达水平。采用脂质体法将miR-129-1-3p模拟物(miR-129-1-3p mimics)和阴性对照RNA(miR-NC)转染HNE1/CDDP细胞,并设立对照组。MTT法检测转染后HNE1/CDDP细胞对CDDP的半数抑制浓度(IC50)变化,Western blot法检测转染后各组细胞WEE1蛋白水平,双荧光素酶实验评价miR-129-1-3p对WEE1的靶向调控作用。结果HNE1/CDDP细胞对于CDDP的耐药指数为5.29。HNE1细胞中的miR-129-1-3p水平高于耐CDDP的HNE1/CDDP细胞,WEE1 mRNA水平低于耐CDDP的HNE1/CDDP细胞,miR-129-1-3p水平与WEE1 mRNA水平呈负相关(r=-0.9784)。与其余两组相比,miR-129-1-3p mimics转染后,HNE1/CDDP细胞对CDDP的IC50明显降低,WEE1的蛋白水平也明显降低。双荧光素酶实验结果显示miR-129-1-3p靶向调控WEE1的3'非翻译区(3'-UTR)。结论miR-129-1-3p通过靶向抑制WEE1表达逆转HNE1/CDDP鼻咽癌细胞CDDP耐药。 展开更多
关键词 miR-129-1-3p WEE1蛋白激酶 鼻咽癌细胞 顺铂(CDDP) 耐药
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高表达CAMSAP2通过上调TGF-β信号促进胃癌细胞的侵袭和转移 被引量:4
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作者 左芦根 王炼 +7 位作者 杨子 李骏杰 王文锋 李静 王月月 宋雪 张小凤 耿志军 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第9期1460-1468,共9页
目的阐明钙调蛋白调控的光谱相关蛋白2(CAMSAP2)在胃癌中的表达及其对疾病进展和预后的影响,并分析可能的机制。方法利用公共癌症数据初步分析CAMSAP2的表达和胃癌进展及预后的关系,另纳入2013年10月~2017年10月在我院完成胃癌根治术的... 目的阐明钙调蛋白调控的光谱相关蛋白2(CAMSAP2)在胃癌中的表达及其对疾病进展和预后的影响,并分析可能的机制。方法利用公共癌症数据初步分析CAMSAP2的表达和胃癌进展及预后的关系,另纳入2013年10月~2017年10月在我院完成胃癌根治术的106例患者进行验证。利用生物信息学预测CAMSAP2的生物学功能。采用CAMSAP2过表达质粒、特异性干扰分别处理胃癌细胞系(MGC803)分为CAMSAP2上调组、CAMSAP2下调组,将未经处理的MGC803设为空白对照组,体外观察CAMSAP2对胃癌细胞上皮-间质转化(EMT)和侵袭的影响,并建立裸鼠胃原位种植瘤模型进行在体验证,同时分析CAMSAP2调控胃癌的分子机制。结果CAMSAP2在胃癌组织中的表达显著高于癌旁组织(P<0.05),并和外周血CEA、CA19-9水平正相关(P<0.001)。Cox回归分析显示CAMSAP2高表达是影响胃癌患者术后5年生存率的独立危险因素(HR:2.969;95%CI:1.031-8.548)。富集分析提示CAMSAP2的作用可能与EMT和TGF-β信号有关。免疫印迹、划痕和Transwell实验发现:体外上调CAMSAP2可促进胃癌细胞表达Vimentin和N-cadherin,同时抑制E-cadherin的表达,并促进胃癌细胞迁移和侵袭(P<0.05);下调CAMSAP2则结果相反(P<0.05)。在体上调CAMSAP2可促进裸鼠胃原位种植瘤的转移(P<0.05),促进胃癌组织中Vimentin和N-cadherin的表达,同时抑制E-cadherin的表达(P<0.05);下调CAMSAP2则结果相反(P<0.05)。体内外实验中,上调CAMSAP2可升高胃癌组织或胃癌细胞中TGF-β和p-Smad2/3的水平(P<0.05),而下调CAMSAP2则结果相反(P<0.05)。结论CAMSAP2在胃癌中高表达并和肿瘤恶性进展以及预后不良相关,其可能通过上调TGF-β信号参与了胃癌的EMT过程。 展开更多
关键词 胃癌 CAMSAP2 TGF-Β 预后 上皮-间质转化
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