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细胞间通信预测方法研究进展
1
作者
任丽萍
潘贤润
+3 位作者
刘天元
杨煜
宁琳
张杨
《电子科技大学学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2023年第5期667-674,共8页
基于配体-受体(L-R)互作的细胞间通信是细胞相互协同完成复杂生命活动的重要方式。随着单细胞测序技术的快速发展,在单细胞水平上系统地解析细胞间通信网络及功能迅速成为细胞生物学研究的热点。生物信息学家已开发了大量细胞间信号通...
基于配体-受体(L-R)互作的细胞间通信是细胞相互协同完成复杂生命活动的重要方式。随着单细胞测序技术的快速发展,在单细胞水平上系统地解析细胞间通信网络及功能迅速成为细胞生物学研究的热点。生物信息学家已开发了大量细胞间信号通信预测的方法及平台,为细胞间信号通信研究提供了重要技术支撑。该文简要阐述了细胞间通信的基本生物学过程;并系统比较了目前较具代表性的细胞间通信预测相关数据库、算法以及评测分析研究;最后系统总结了细胞间通信预测方法的发展趋势,并展望了其未来的研究方向。
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关键词
数据库
细胞间通信
配体
受体
单细胞测序
空间转录组
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题名
细胞间通信预测方法研究进展
1
作者
任丽萍
潘贤润
刘天元
杨煜
宁琳
张杨
机构
成都东软
学院
健康医疗科技
学院
成都中医药
大学
医学
技术
学院
筑波大学科学与技术学院
成都中医药
大学
中医药创新研究院/交叉学科研究院
出处
《电子科技大学学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2023年第5期667-674,共8页
基金
国家自然科学基金(62202069)
四川省自然科学基金(2022NSFSC1610,2023NSFSC0678,2023NSFSC0569)
广东省基础与应用基础研究基金联合基金青年基金(2019A1515110701)。
文摘
基于配体-受体(L-R)互作的细胞间通信是细胞相互协同完成复杂生命活动的重要方式。随着单细胞测序技术的快速发展,在单细胞水平上系统地解析细胞间通信网络及功能迅速成为细胞生物学研究的热点。生物信息学家已开发了大量细胞间信号通信预测的方法及平台,为细胞间信号通信研究提供了重要技术支撑。该文简要阐述了细胞间通信的基本生物学过程;并系统比较了目前较具代表性的细胞间通信预测相关数据库、算法以及评测分析研究;最后系统总结了细胞间通信预测方法的发展趋势,并展望了其未来的研究方向。
关键词
数据库
细胞间通信
配体
受体
单细胞测序
空间转录组
Keywords
database
intercellular communication
ligand
receptor
single cell sequencing
spatial transcriptomics
分类号
TP391 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]
Q811.4 [生物学—生物工程]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
细胞间通信预测方法研究进展
任丽萍
潘贤润
刘天元
杨煜
宁琳
张杨
《电子科技大学学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2023
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