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长链非编码RNA的保守性及其在非模式生物长链非编码RNA筛选中的应用 被引量:1
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作者 姜贵先 罗溪 +2 位作者 张露露 刘青 肖良 《第二军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第10期1304-1310,共7页
长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)的保守性表现在一级结构、空间结构、转录位置、剪接模式及组织分布等方面,是目前lncRNA研究的热点和难点。不断深入的lncRNA保守性研究可应用于参考基因组相对匮乏的非模式生物lncRNA的筛选过... 长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)的保守性表现在一级结构、空间结构、转录位置、剪接模式及组织分布等方面,是目前lncRNA研究的热点和难点。不断深入的lncRNA保守性研究可应用于参考基因组相对匮乏的非模式生物lncRNA的筛选过程,并且极大地提升了非模式生物lncRNA数据库建立的完整性和准确性。借助针对开放阅读框长度、密码子分布与出现频率、功能性结构域等保守信息开发而来的lncRNA筛选工具或流程如CPC、PLAR(pipeline for lncRNA annotation from RNA-seq data)等,已成为目前非模式生物lncRNA的筛选及其参考数据库构建的新策略。本文就lncRNA的保守性及其在非模式生物lncRNA筛选中的应用作一综述,并简要介绍了一种运用其保守性的筛选方法——PLAR。 展开更多
关键词 长链非编码RNA 保守性 非模式生物 筛选
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ABO血型与胃癌发生风险的病例-对照研究及meta分析 被引量:14
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作者 王在标 尹慢慢 +3 位作者 蔡慧 李勃 赵昕 马立业 《第二军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第5期560-565,共6页
目的通过病例一对照研究及meta分析探讨ABO血型系统与胃癌发生风险的关系。方法收集第二军医大学长海医院930例胃癌患者及8426例非胃癌患者进行病例一对照研究;检索PubMed数据库,检索起始时间不限,截止时间为2013年12月31日。将笔者... 目的通过病例一对照研究及meta分析探讨ABO血型系统与胃癌发生风险的关系。方法收集第二军医大学长海医院930例胃癌患者及8426例非胃癌患者进行病例一对照研究;检索PubMed数据库,检索起始时间不限,截止时间为2013年12月31日。将笔者所做病例一对照研究一并纳入分析,由2名研究者独立筛取文献并提取数据,采用纽卡斯尔-渥太华量表(NOS)进行文献质量评价,采用Meta—Analyst3.13软件进行meta分析。结果病例对照研究提示:血型A是胃癌发生的可能危险因素(OR=1.58,95%CI为1.37~1.81);meta分析结果显示:血型A较非A血型人群胃癌发生风险有所增加(0R=1.28,95%CI为1.01~1.62),血型O发生胃癌风险低于非O血型人群(OR=0.84,95%CI为0.73~0.96),但亚组分析发现结果在国内外人群中存在差异。结论ABO血型系统与胃癌发生风险存在关联,血型A是胃癌发生的可能危险因素之一。 展开更多
关键词 胃肿瘤 ABO血型系统 META分析 病例对照研究 危险因素
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心脏过表达人源PRKAG2(G100S)转基因小鼠模型的建立 被引量:1
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作者 陈挺 刘杰 +3 位作者 肖良 鲍礼智 余云华 郑兴 《第二军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第3期273-278,共6页
目的建立心脏过表达人源PRKAG2(G100S)的转基因小鼠模型,为进一步研究该人源基因点突变对小鼠心脏发育、形态和功能维持的作用奠定基础。方法克隆人源基因PRKAG2并构建点突变质粒,将人源PRKAG2(G100S)插入α肌球蛋白重链(α-MHC)启动子... 目的建立心脏过表达人源PRKAG2(G100S)的转基因小鼠模型,为进一步研究该人源基因点突变对小鼠心脏发育、形态和功能维持的作用奠定基础。方法克隆人源基因PRKAG2并构建点突变质粒,将人源PRKAG2(G100S)插入α肌球蛋白重链(α-MHC)启动子下游,构建转基因表达载体。选用C57BL/6J小鼠为遗传背景,通过显微注射法建立人源PRKAG2(G100S)转基因小鼠模型,利用特异引物PCR法鉴定转基因小鼠的基因型。采用实时荧光定量PCR(qPCR)和蛋白质印迹法检测人源PRKAG2(G100S)的表达。结果经过回交繁育后建立了2个品系的心脏特异表达人源PRKAG2(G100S)的转基因小鼠品系F2代,并通过qPCR、蛋白质印迹法检测,确认了转基因小鼠心脏组织中人源PRKAG2(G100S)在mRNA和蛋白水平存在过表达,且该突变能在转基因小鼠中稳定传代。结论本研究成功建立了心脏特异表达人源PRKAG2(G100S)转基因小鼠模型,人源PRKAG2(G100S)基因在心脏组织的过度表达在小鼠心脏发育和功能维持中的作用需要进一步深入研究与探讨。 展开更多
关键词 PRKAG2 受精卵原核注射 转基因小鼠 心脏病
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兰尼碱受体1结构及其通道门控机制的研究进展
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作者 顾嘉伟 邓宇晨 +1 位作者 徐拯 肖良 《第二军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第7期873-878,共6页
兰尼碱受体(ryanodine receptor,RyR)是位于肌浆网膜上的细胞内Ca2+释放通道,在骨骼肌和心肌兴奋收缩偶联等生理过程中发挥重要作用。随着单粒子冷冻电镜技术的应用以及数据分析能力的提高,近期来自中国、美国以及德国的3个课题组分... 兰尼碱受体(ryanodine receptor,RyR)是位于肌浆网膜上的细胞内Ca2+释放通道,在骨骼肌和心肌兴奋收缩偶联等生理过程中发挥重要作用。随着单粒子冷冻电镜技术的应用以及数据分析能力的提高,近期来自中国、美国以及德国的3个课题组分别获得了整体分辨率为3.8(1=10-10 m)、4.8和6.1的高清晰RyR1结构图片,相关研究同时发表于2015年第1期的Nature上,是近年来RyR结构及其门控研究的重要进展。RyR1为相对分子质量〉2 200 000的同源四聚体离子通道,主要包括由NTD、SPRY、P1、P2、B-sol以及C-sol等结构域组成的胞质区和由S1~S6、VSL以及CTD等结构域组成的通道区。Ca2+作为RyR1门控的主要影响因子,能够与胞质区EF-hand亚结构域结合,引起通道构象的变化并最终导致通道的开放。 展开更多
关键词 兰尼碱受体 通道 冷冻电镜 结构
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