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题名用文献轮廓挖掘大肠癌转移芯片表达谱
被引量：19
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作者
黄仲曦
孙青
丁彦青
姚开泰
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机构
第一军医大学病理教研室肿瘤研究所
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出处
《第一军医大学学报》
CSCD
北大核心
2003年第11期1195-1197,共3页
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文摘
目的寻找新的大肠癌转移相关基因。方法根据大肠癌转移芯片的表达谱,采用基于文献轮廓的数据挖掘方法,从Medline文献数据库中提取基因的相关文献并分析词的频率,再基于重复发生和共发生的过滤标准提取功能相关的词,最后基于词的发生频率对基因进行功能聚类,进一步结合文献及已有的分子生物学检测结果进行分析。结果发现两个新的可能与大肠癌转移相关的基因TIAM1和NM23H1。
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关键词
大肠癌
肿瘤转移
基因芯片
信息存储
信息检索
基因表达谱
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Keywords
colorectal cancer
neoplasm metastasis
microarray
information storage and retrieval
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分类号
R735.34
[医药卫生—肿瘤]
R394
[医药卫生—医学遗传学]
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题名用文献轮廓挖掘鼻咽癌微阵列表达数据
被引量：2
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作者
黄仲曦
姚开泰
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机构
第一军医大学病理教研室肿瘤研究所
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出处
《第一军医大学学报》
CSCD
北大核心
2004年第7期798-801,共4页
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基金
广东省"十五"专项基金(A1080201)~~
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文摘
目的 探索鼻咽癌异常信号通路。方法 根据鼻咽癌微阵列表达谱,采用基于文献轮廓的数据挖掘方法,从Medline文献数据库中提取与基因相关的文献并分析词的频率,再根据重复发生和共发生的过滤标准提取功能相关的词,最后根据词的发生频率对基因进行功能聚类。结果 基因表达谱的112个差异表达基因聚成16组功能类别:4组暗示EBV感染、6组显示鼻咽癌变过程、2组参与能量代谢、1组提示蛋白的异常磷酸化、2组与其它疾病相关、1组与肌肉组织活性相关。肿瘤发生发展过程中常见的P53和Rb信号通路的异常在本研究中则未发现。结论 鼻咽癌的发生发展可能由特殊的信号通路引起。
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关键词
鼻咽癌
信号通路
微阵列
数据挖掘
生物信息学
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Keywords
nasopharyngeal carcinoma
signal
microarray
data-mining
bioinformation
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分类号
R739.63
[医药卫生—肿瘤]
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