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日本血吸虫一个新钙结合蛋白全长编码区的克隆与功能预测
被引量：
6
1
作者
彭鸿娟
陈晓光
王珣章
《中国人兽共患病杂志》
CSCD
北大核心
2002年第2期47-49,共3页
目的 对用表达序列标签 (ExpressionSequenceTag ,EST)策略从日本血吸虫尾蚴cDNA文库中筛选出的新基因进行功能预测。方法 用NCBI站点的BLASTx及BLASTn程序对所获得的新基因序列进行同源性搜索 ;用NCBIBLAST站点的blasttwosequence程...
目的 对用表达序列标签 (ExpressionSequenceTag ,EST)策略从日本血吸虫尾蚴cDNA文库中筛选出的新基因进行功能预测。方法 用NCBI站点的BLASTx及BLASTn程序对所获得的新基因序列进行同源性搜索 ;用NCBIBLAST站点的blasttwosequence程序对同源性高的基因进行核苷酸及氨基酸水平的同源性比较 ;利用motifscaninaProteinsequence对cDNA序列所编码的蛋白质进行结构域搜索。结果 发现一个与曼氏血吸虫尾蚴期特异性 8kDa钙结合蛋白 (Sm8)基因高度同源的日本血吸虫新基因 ,cDNA序列与氨基酸水平的同一性均为 82 % ;蛋白结构域搜索结果显示 ,该cDAN序列所编码的蛋白质具有 2个EF手钙结合位点。结论 用EST策略筛选新基因是一个可行的方法 ,所筛到的日本血吸虫新基因编码一种钙结合蛋白 ,全长编码序列与Sm8基因高度同源 ,对该基因的期特异性及免疫保护性的探讨具有重要的意义。
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关键词
日本血吸虫
基因功能预测
钙结合蛋白
全长编码序列
免疫保护
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职称材料
题名
日本血吸虫一个新钙结合蛋白全长编码区的克隆与功能预测
被引量：
6
1
作者
彭鸿娟
陈晓光
王珣章
机构
中山
大学
生物防治国家重点实验室
第一军医大学热带军队卫生学系寄生虫学教研室
出处
《中国人兽共患病杂志》
CSCD
北大核心
2002年第2期47-49,共3页
基金
WHO/TDR研究基金资助 (IDNO A0 0 690A0 0 191)
文摘
目的 对用表达序列标签 (ExpressionSequenceTag ,EST)策略从日本血吸虫尾蚴cDNA文库中筛选出的新基因进行功能预测。方法 用NCBI站点的BLASTx及BLASTn程序对所获得的新基因序列进行同源性搜索 ;用NCBIBLAST站点的blasttwosequence程序对同源性高的基因进行核苷酸及氨基酸水平的同源性比较 ;利用motifscaninaProteinsequence对cDNA序列所编码的蛋白质进行结构域搜索。结果 发现一个与曼氏血吸虫尾蚴期特异性 8kDa钙结合蛋白 (Sm8)基因高度同源的日本血吸虫新基因 ,cDNA序列与氨基酸水平的同一性均为 82 % ;蛋白结构域搜索结果显示 ,该cDAN序列所编码的蛋白质具有 2个EF手钙结合位点。结论 用EST策略筛选新基因是一个可行的方法 ,所筛到的日本血吸虫新基因编码一种钙结合蛋白 ,全长编码序列与Sm8基因高度同源 ,对该基因的期特异性及免疫保护性的探讨具有重要的意义。
关键词
日本血吸虫
基因功能预测
钙结合蛋白
全长编码序列
免疫保护
Keywords
Schistosoma japonicum
Gene function prediction
Calcium-binding protein
分类号
R383.24 [医药卫生—医学寄生虫学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
日本血吸虫一个新钙结合蛋白全长编码区的克隆与功能预测
彭鸿娟
陈晓光
王珣章
《中国人兽共患病杂志》
CSCD
北大核心
2002
6
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