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基于PCA和BP神经网络的O—糖基化位点的预测和模式分析
被引量：
3
1
作者
王楚正
谭晓风
+1 位作者
陈延伟
何伟
《中南林业科技大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第9期61-65,75,共6页
糖基化是真核细胞中最常见的翻译后蛋白质修饰过程之一。传统的神经网络方法已被应用预测蛋白质糖基化位点,预测的准确性主要依赖于特征向量的维数(蛋白质序列的长度),并随着蛋白质序列长度的增加而提高,但网络的结构变得越来越复杂,增...
糖基化是真核细胞中最常见的翻译后蛋白质修饰过程之一。传统的神经网络方法已被应用预测蛋白质糖基化位点,预测的准确性主要依赖于特征向量的维数(蛋白质序列的长度),并随着蛋白质序列长度的增加而提高,但网络的结构变得越来越复杂,增加了计算运行成本。为了解决这一问题,提出了主成分分析和BP神经网络相结合的新方法对O—糖基化位点进行预测和分析,用PCA提取主成分构造子空间以降低输入的蛋白质序列的维数,再用BP神经网络预测一个特定的蛋白质序列是否被糖基化。实验表明,提出的新方法能大大缩短计算时间,并能提高预测的准确性。
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关键词
O—糖基化
模式分析
主成分分析
BP神经网络
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题名
基于PCA和BP神经网络的O—糖基化位点的预测和模式分析
被引量：
3
1
作者
王楚正
谭晓风
陈延伟
何伟
机构
中南林业科技
大学
计算机与
信息
工程
学院
立命馆大学信息工程学院
中南林业科技
大学
林
学院
出处
《中南林业科技大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第9期61-65,75,共6页
基金
日本国文部省教育
科技
+2 种基金
文化
运动项目(19300080)
湖南省研究生创新基金(CX2009B159)
文摘
糖基化是真核细胞中最常见的翻译后蛋白质修饰过程之一。传统的神经网络方法已被应用预测蛋白质糖基化位点,预测的准确性主要依赖于特征向量的维数(蛋白质序列的长度),并随着蛋白质序列长度的增加而提高,但网络的结构变得越来越复杂,增加了计算运行成本。为了解决这一问题,提出了主成分分析和BP神经网络相结合的新方法对O—糖基化位点进行预测和分析,用PCA提取主成分构造子空间以降低输入的蛋白质序列的维数,再用BP神经网络预测一个特定的蛋白质序列是否被糖基化。实验表明,提出的新方法能大大缩短计算时间,并能提高预测的准确性。
关键词
O—糖基化
模式分析
主成分分析
BP神经网络
Keywords
O-glycosylation
pattern analysis
principal component analysis
back propagation neural network
分类号
TP183 [自动化与计算机技术—控制理论与控制工程]
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作者
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被引量
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1
基于PCA和BP神经网络的O—糖基化位点的预测和模式分析
王楚正
谭晓风
陈延伟
何伟
《中南林业科技大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010
3
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