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基于宏基因组技术探究不同剂量榄香烯对大鼠粪便病毒的影响
1
作者 张毅 马力天 +3 位作者 杨雨晨 马瑞 陈晶 郑瑾 《世界中医药》 CAS 北大核心 2024年第6期773-779,共7页
目的:探讨不同剂量的榄香烯乳状注射液(EEI)对大鼠粪便病毒的影响。方法:清洁级健康雄性斯泼累格·多雷(SD)大鼠18只,随机分为低剂量榄香烯乳状注射液组[L-EEI,20 mg/(kg·d)]、高剂量榄香烯乳状注射液组[H-EEI,40 mg/(kg·... 目的:探讨不同剂量的榄香烯乳状注射液(EEI)对大鼠粪便病毒的影响。方法:清洁级健康雄性斯泼累格·多雷(SD)大鼠18只,随机分为低剂量榄香烯乳状注射液组[L-EEI,20 mg/(kg·d)]、高剂量榄香烯乳状注射液组[H-EEI,40 mg/(kg·d)]和对照组(等量生理盐水),每组6只。连续给药14 d取新鲜粪便进行宏基因组测序,之后对所测得的病毒进行生信分析。结果:维恩图分析表明对照组、L-EEI和H-EEI组所独有的病毒种类数目分别是6种、6种和10种,在种水平上,3组所共有的病毒数目为77种;PCA表明,L-EEI组的数据与其他组明显分开(属水平P=0.036,种水平P=0.012);NMDS分析表明,L-EEI与H-EEI组的数据聚集程度更高(属水平Stress=0.093,种水平Stress=0.129);多组间比较结果显示共有10种病毒存在极其显著的差异,不同剂量EEI对病毒的影响大致可分为3类:1)病毒丰度与EEI的剂量正相关或者负相关;2)与对照组比较,L-EEI导致病毒丰度升高而H-EEI对病毒丰度无显著影响;3)与对照组比较,L-EEI导致病毒丰度降低而H-EEI对病毒丰度无显著影响;结论:不同剂量的EEI会导致大鼠粪便中病毒组成和结构的改变,不同病毒对不同剂量的EEI敏感性也不同。 展开更多
关键词 宏基因组 病毒 榄香烯 肿瘤 微生物群 中药 生信分析 肠道微生物群
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基于网络药理学研究二仙汤加减方治疗脊髓损伤的作用机制 被引量：2
2
作者 李二亮 晏荣保 +5 位作者 闫康 赵宁侠 黄汝芹 马琼 赵海恩 廖博 《世界中医药》 CAS 2022年第18期2529-2534,共6页
目的:基于网络药理学等方法探讨二仙汤加减方治疗脊髓损伤(SCI)的有效性及相关机制。方法:在动物层面验证方剂的有效性,然后通过网络药理学方法进行化合物、靶点预测和网络分析,根据中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和UniProt数... 目的:基于网络药理学等方法探讨二仙汤加减方治疗脊髓损伤(SCI)的有效性及相关机制。方法:在动物层面验证方剂的有效性,然后通过网络药理学方法进行化合物、靶点预测和网络分析,根据中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和UniProt数据库选择方剂的化学成分和靶标,并从GeneCard和Drugbank数据库中收集SCI的治疗靶标。使用String数据库分析蛋白质-蛋白质相互作用。然后利用Cytoscape_v3.7.1构建网络,利用Metascape数据库进行基因本体富集分析和京都基因和基因组百科全书富集分析。结果:动物实验显示二仙汤加减可明显缓解脊髓损伤,增加大鼠后肢行为学评分。网络药理学研究结果表明二仙汤加减方剂中18味中药共检索到5353个基因,去重筛选后共获得319个基因,共检索到SCI靶基因3237个基因,去重后共获得2638个基因,二者共表达基因216个。方剂中的川芎、当归、丹参、香附、延胡索、淫羊藿、郁金等关键活性成分可能通过AKT1、MAPK3、NFKBIA、FOS、PIK3CG等关键基因介导cAMP、PI3K/AKT、MAPK、TNF等信号通路,起到治疗SCI的作用。结论:二仙汤加减对SCI治疗效果显著,网络药理学研究表明了多靶点、多组分二仙汤加减可能通过cAMP信号通路、PI3K/AKT信号通路发挥治疗SCI的作用。 展开更多
关键词 脊髓损伤 二仙汤加减 网络药理学 中药 富集分析 PI3K/AKT信号通路 cAMP信号通路
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