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多花黄精PLT基因家族的鉴定与表达分析
被引量：
1
1
作者
朱田圆
李小利
+7 位作者
张慧
班景洁
李丹
罗彬彬
朱建明
林玉玲
杜迎刚
赖钟雄
《福建农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第6期678-685,共8页
【目的】PLT(Plethora)属于AP2/ERF型转录因子,在植物生长发育及抗胁迫等过程中发挥重要作用。本文旨在探究多花黄精PLT(Polygonatum cyrtonema Hua PLT,PcPLT)基因在根状茎器官生长发育中及盐胁迫下的调控作用,为深入研究PcPLT基因的...
【目的】PLT(Plethora)属于AP2/ERF型转录因子,在植物生长发育及抗胁迫等过程中发挥重要作用。本文旨在探究多花黄精PLT(Polygonatum cyrtonema Hua PLT,PcPLT)基因在根状茎器官生长发育中及盐胁迫下的调控作用,为深入研究PcPLT基因的功能提供理论依据。【方法】基于多花黄精转录组数据库进行PcPLT基因家族鉴定及生物信息学分析,通过qRT-PCR技术检测其在多花黄精不同组织部位及不同浓度NaCl处理下的相对表达量,利用RT-PCR技术构建PcPLT2-2、PcPLT2-7基因融合表达载体,观察其荧光信号验证亚细胞定位。【结果】共鉴定获得15个PcPLT家族成员,该家族无内含子结构,蛋白编码长度为159~601个氨基酸,均为亲水蛋白;进化树分析显示PcPLT与百合科石刁柏(Asparagus officinalis L.)亲缘关系最近;亚细胞定位预测及验证结果显示PcPLT2-2定位于细胞质、细胞核中,PcPLT2-7定位于细胞核中。qRT-PCR结果显示PcPLT2-3和PcPLT2-7在根状茎中表达最高,PcPLT1-3、PcPLT1-4、PcPLT2-7响应盐胁迫调控。【结论】PcPLT不仅具有组织特异性还能提高抗逆性,提示可能作为器官发育调节因子参与多花黄精根状茎膨大的形态建成,为深入研究PLT调控植物根状茎器官生长发育的生物学功能和多花黄精遗传改良奠定基础。
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关键词
多花黄精
PLT
基因家族
表达分析
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职称材料
多花黄精ACY1基因家族鉴定及其表达分析
2
作者
张慧
罗彬彬
+6 位作者
朱田圆
班景洁
张春渝
李小利
朱建明
林玉玲
赖钟雄
《福建农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第6期666-677,共12页
【目的】筛选鉴定多花黄精中氨基酰化酶(aminoacylase 1,ACY1)基因,为多花黄精抗逆基因功能研究奠定基础。【方法】基于多花黄精转录组数据,对多花黄精氨基酰化酶(PcACY1)基因家族进行鉴定,分析基本理化性质、基因结构、保守基序、进化...
【目的】筛选鉴定多花黄精中氨基酰化酶(aminoacylase 1,ACY1)基因,为多花黄精抗逆基因功能研究奠定基础。【方法】基于多花黄精转录组数据,对多花黄精氨基酰化酶(PcACY1)基因家族进行鉴定,分析基本理化性质、基因结构、保守基序、进化关系等,并采用qRT-PCR验证ACY1家族成员在不同组织器官中和盐胁迫处理下的表达模式。【结果】多花黄精ACY1家族有2个成员,均为亲水蛋白,具有信号肽,无跨膜结构,亚细胞定位预测结果显示2个成员均定位于细胞质中。与植物其他物种ACY1构建进化树发现,其进化特性可分为2类。植物ACY1启动子顺式作用元件预测结果显示,ACY1存在多种激素、胁迫和生长发育相关的响应元件。qRT-PCR分析结果显示,PcACY1成员在多花黄精不同组织器官中的表达水平差异较大且受盐胁迫诱导。【结论】PcACY1在多花黄精生长发育和抵御逆境过程中可能发挥重要作用,这为进一步研究多花黄精ACY1的功能及遗传改良等奠定基础。
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关键词
多花黄精
ACY1
家族鉴定
表达分析
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职称材料
题名
多花黄精PLT基因家族的鉴定与表达分析
被引量：
1
1
作者
朱田圆
李小利
张慧
班景洁
李丹
罗彬彬
朱建明
林玉玲
杜迎刚
赖钟雄
机构
福建
农林大学园艺植物生物工程研究所
福建金湖源生态农业有限公司
潍坊科技学院/山东省高校设施园艺实验室
出处
《福建农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第6期678-685,共8页
基金
福建农林大学横向科技项目(KH200373A)
福建省高原学科建设项目(102/71201801101)。
文摘
【目的】PLT(Plethora)属于AP2/ERF型转录因子,在植物生长发育及抗胁迫等过程中发挥重要作用。本文旨在探究多花黄精PLT(Polygonatum cyrtonema Hua PLT,PcPLT)基因在根状茎器官生长发育中及盐胁迫下的调控作用,为深入研究PcPLT基因的功能提供理论依据。【方法】基于多花黄精转录组数据库进行PcPLT基因家族鉴定及生物信息学分析,通过qRT-PCR技术检测其在多花黄精不同组织部位及不同浓度NaCl处理下的相对表达量,利用RT-PCR技术构建PcPLT2-2、PcPLT2-7基因融合表达载体,观察其荧光信号验证亚细胞定位。【结果】共鉴定获得15个PcPLT家族成员,该家族无内含子结构,蛋白编码长度为159~601个氨基酸,均为亲水蛋白;进化树分析显示PcPLT与百合科石刁柏(Asparagus officinalis L.)亲缘关系最近;亚细胞定位预测及验证结果显示PcPLT2-2定位于细胞质、细胞核中,PcPLT2-7定位于细胞核中。qRT-PCR结果显示PcPLT2-3和PcPLT2-7在根状茎中表达最高,PcPLT1-3、PcPLT1-4、PcPLT2-7响应盐胁迫调控。【结论】PcPLT不仅具有组织特异性还能提高抗逆性,提示可能作为器官发育调节因子参与多花黄精根状茎膨大的形态建成,为深入研究PLT调控植物根状茎器官生长发育的生物学功能和多花黄精遗传改良奠定基础。
关键词
多花黄精
PLT
基因家族
表达分析
Keywords
Polygonatum cyrtonema Hua
PLT
gene family
expression analysis
分类号
S567.239 [农业科学—中草药栽培]
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职称材料
题名
多花黄精ACY1基因家族鉴定及其表达分析
2
作者
张慧
罗彬彬
朱田圆
班景洁
张春渝
李小利
朱建明
林玉玲
赖钟雄
机构
福建
农林大学园艺植物生物工程研究所
福建金湖源生态农业有限公司
出处
《福建农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第6期666-677,共12页
基金
福建省高原学科建设基金项目(102/71201801101)
福建农林大学横向科技项目(102/KH200373A)。
文摘
【目的】筛选鉴定多花黄精中氨基酰化酶(aminoacylase 1,ACY1)基因,为多花黄精抗逆基因功能研究奠定基础。【方法】基于多花黄精转录组数据,对多花黄精氨基酰化酶(PcACY1)基因家族进行鉴定,分析基本理化性质、基因结构、保守基序、进化关系等,并采用qRT-PCR验证ACY1家族成员在不同组织器官中和盐胁迫处理下的表达模式。【结果】多花黄精ACY1家族有2个成员,均为亲水蛋白,具有信号肽,无跨膜结构,亚细胞定位预测结果显示2个成员均定位于细胞质中。与植物其他物种ACY1构建进化树发现,其进化特性可分为2类。植物ACY1启动子顺式作用元件预测结果显示,ACY1存在多种激素、胁迫和生长发育相关的响应元件。qRT-PCR分析结果显示,PcACY1成员在多花黄精不同组织器官中的表达水平差异较大且受盐胁迫诱导。【结论】PcACY1在多花黄精生长发育和抵御逆境过程中可能发挥重要作用,这为进一步研究多花黄精ACY1的功能及遗传改良等奠定基础。
关键词
多花黄精
ACY1
家族鉴定
表达分析
Keywords
Polygonatum cyrtonema Hua
ACY1
gene family identification
expression analysis
分类号
R282 [医药卫生—中药学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
多花黄精PLT基因家族的鉴定与表达分析
朱田圆
李小利
张慧
班景洁
李丹
罗彬彬
朱建明
林玉玲
杜迎刚
赖钟雄
《福建农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
多花黄精ACY1基因家族鉴定及其表达分析
张慧
罗彬彬
朱田圆
班景洁
张春渝
李小利
朱建明
林玉玲
赖钟雄
《福建农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
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