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黄秋葵实时荧光定量PCR内参基因的克隆与筛选评价
被引量：
17
1
作者
李永平
叶新如
+4 位作者
王彬
陈敏氡
刘建汀
朱海生
温庆放
《核农学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第1期60-71,共12页
为筛选黄秋葵实时荧光定量PCR的稳定内参基因,本研究以绿白1号为试验材料,根据黄秋葵RNA-seq数据库,筛选并验证获得18SrRNA、ACT、EF-1α、TUA、TUB、GAPDH等6个内参基因ORF序列;以黄秋葵不同组织、不同发育时期果实、不同发育时期叶片...
为筛选黄秋葵实时荧光定量PCR的稳定内参基因,本研究以绿白1号为试验材料,根据黄秋葵RNA-seq数据库,筛选并验证获得18SrRNA、ACT、EF-1α、TUA、TUB、GAPDH等6个内参基因ORF序列;以黄秋葵不同组织、不同发育时期果实、不同发育时期叶片和低温、高温、干旱胁迫处理的叶片为材料,利用实时荧光定量PCR技术分析测定基因表达量,并结合GeNorm、NormFinder和BestKeeper软件评价6个内参基因的稳定性。结果表明,6个基因在不同组织、各发育阶段及不同胁迫下均有表达,但表达稳定性不尽相同,其中,EF-1α在黄秋葵果荚发育、高温胁迫下表达稳定性最好;18SrRNA在黄秋葵各组织、叶发育和干旱胁迫下表达稳定性最优;ACT在低温胁迫下表现最稳定。此外,在29个处理中,18SrRNA、EF-1α、ACT表达均较稳定,可以用于荧光定量表达分析。本研究结果为黄秋葵基因功能分析和调控机理研究提供了基础。
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关键词
黄秋葵
内参基因
胁迫
不同组织
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职称材料
题名
黄秋葵实时荧光定量PCR内参基因的克隆与筛选评价
被引量：
17
1
作者
李永平
叶新如
王彬
陈敏氡
刘建汀
朱海生
温庆放
机构
福建省蔬菜遗传育种重点实验室/福建省农业科学院作物研究所/福建省农业科学院蔬菜研究中心/福建省蔬菜工程技术研究中心
出处
《核农学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第1期60-71,共12页
基金
福建省属公益类科研院所基本科研专项(2019R1031-4)
中央引导地方科技发展专项(2018L3005)
+1 种基金
福建省农业科学院科技创新团队建设项目(STIT2017-1-2)
国家大宗蔬菜产业技术体系福州综合试验站(CARS-23-G-53)。
文摘
为筛选黄秋葵实时荧光定量PCR的稳定内参基因,本研究以绿白1号为试验材料,根据黄秋葵RNA-seq数据库,筛选并验证获得18SrRNA、ACT、EF-1α、TUA、TUB、GAPDH等6个内参基因ORF序列;以黄秋葵不同组织、不同发育时期果实、不同发育时期叶片和低温、高温、干旱胁迫处理的叶片为材料,利用实时荧光定量PCR技术分析测定基因表达量,并结合GeNorm、NormFinder和BestKeeper软件评价6个内参基因的稳定性。结果表明,6个基因在不同组织、各发育阶段及不同胁迫下均有表达,但表达稳定性不尽相同,其中,EF-1α在黄秋葵果荚发育、高温胁迫下表达稳定性最好;18SrRNA在黄秋葵各组织、叶发育和干旱胁迫下表达稳定性最优;ACT在低温胁迫下表现最稳定。此外,在29个处理中,18SrRNA、EF-1α、ACT表达均较稳定,可以用于荧光定量表达分析。本研究结果为黄秋葵基因功能分析和调控机理研究提供了基础。
关键词
黄秋葵
内参基因
胁迫
不同组织
Keywords
Hibiscus esculentus L
reference gene
stress
different tissues
分类号
S649 [农业科学—蔬菜学]
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作者
出处
发文年
被引量
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1
黄秋葵实时荧光定量PCR内参基因的克隆与筛选评价
李永平
叶新如
王彬
陈敏氡
刘建汀
朱海生
温庆放
《核农学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
17
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