基于COI基因和H3基因分析福建平潭和浙江舟山厚壳贻贝群体的遗传多样性

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作者 郑泽文 赵文博 +2 位作者 姚海燕 陈志 林岗 《福建农业科技》 2025年第7期7-13,共7页

为探究跨区域引种对厚壳贻贝群体遗传多样性的影响及区域间遗传分化程度,进而为其种质资源保护提供科学依据。采集了福建平潭和浙江舟山岛礁上附着的厚壳贻贝样本,利用线粒体COI基因和细胞核H3基因进行遗传进化分析。结果表明:厚壳贻贝H... 为探究跨区域引种对厚壳贻贝群体遗传多样性的影响及区域间遗传分化程度,进而为其种质资源保护提供科学依据。采集了福建平潭和浙江舟山岛礁上附着的厚壳贻贝样本,利用线粒体COI基因和细胞核H3基因进行遗传进化分析。结果表明:厚壳贻贝H3基因在福建平潭和浙江舟山两群体中无差异,因此不适用于遗传结构研究;两群体厚壳贻贝COI基因序列长度661 bp,序列中A+T含量为60.0%,具备可用于分析的遗传变异、符合线粒体分子标记的特性,且序列稳定可靠。因此,选择COI基因进行后续的厚壳贻贝群体遗传多样性分析。两个群体厚壳贻贝COI基因序列共检测到32个多态位点、19种单倍型,总体单倍型多样性(H_(d))为0.9373,核苷酸多样性(Pi)为0.00682,其中福建平潭群体遗传多样性(H_(d)=0.9579,P_(i)=0.00848)高于浙江舟山群体(H_(d)=0.8421,Pi=0.00404)。两个厚壳贻贝群体间的遗传分化系数Fst=0.00196(P<0.01),AMOVA分析表明两个厚壳贻贝群体中92.07%的遗传变异来自群体内;单倍型网络图和UPGMA树显示,19个单倍型中仅2个为共享单倍型,且呈现明显地理分支结构。研究结果为厚壳贻贝种质资源保护及可持续利用提供了基础。 展开更多

关键词 厚壳贻贝 COI基因 H3基因 遗传结构 种质资源

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两种工况对人工湿地模型微生物群落结构及脱氮除磷的影响

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作者 姚海燕 缪凡 林岗 《渔业研究》 2025年第3期280-293,共14页

【目的】在人工湿地系统中,植物、基质和微生物共同参与复杂的物理、化学和生物变化,其中微生物是主要的贡献者,在脱氮和除磷方面发挥着重要作用。本文旨在研究2种工况对人工湿地模型微生物群落结构的影响。【方法】本文通过构建人工湿... 【目的】在人工湿地系统中,植物、基质和微生物共同参与复杂的物理、化学和生物变化,其中微生物是主要的贡献者,在脱氮和除磷方面发挥着重要作用。本文旨在研究2种工况对人工湿地模型微生物群落结构的影响。【方法】本文通过构建人工湿地系统,分析比较预实验前(J1)、水平潜流工况(J2)和潮汐流工况(J3)对人工湿地系统基质细菌群落结构的影响。【结果】在细菌群落结构门水平上,变形菌门为所有工况的优势菌门;J3与J2相比,蓝细菌门、疣微菌门、拟杆菌门、硝化螺旋菌门、放线菌门、浮霉菌门、绿弯菌门的丰度均有上升,厚壁菌门和髌骨菌门的丰度则有所下降。在细菌群落结构属水平上,Lacunisphaera、Kapabacteriales、Novosphingobium为J1样品优势菌,芽孢杆菌属为J2、J3样品共同优势菌;J3与J2相比,Luteolibacter、新衣原体属、黄杆菌属和新鞘脂菌属为J3系统独有的优势菌属,并且硝化螺旋菌属的相对丰度从3.94%上升至5.56%,成为湿地内的第二大优势菌。【结论】J3工况的复氧能力改善了湿地内部的溶解氧(DO)含量,优势菌中脱氮和去除有机物的细菌增多;J3工况对总氮(TN)的去除率较J2工况提高了92.67%,且其亚硝态氮(NO_(2)--N)在实验期间没有被富集,始终保持在较低水平(<0.01 mg/L),表明湿地内部硝化反应良好,湿地内已构建良好的脱氮和除磷细菌群落。本研究结果为人工湿地系统的建设提供科学依据。 展开更多

关键词 人工湿地系统 水平潜流工况 潮汐流工况 微生物群落结构

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定海湾龟足肠道微生物组成及代谢组分析 被引量：1

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作者 赵文博 刘鑫 +2 位作者 林岗 姚海燕 郑泽文 《福建农业科技》 2024年第11期9-17,共9页

为了解定海湾龟足肠道微生物群落结构特点及代谢组特征,探索龟足生存环境、食性及肠道微生物组成之间的联系,使用16S rRNA高通量测序技术和非靶向代谢组学技术,对采集的龟足样品进行分析。结果表明:龟足肠道菌群在门水平上,最优势菌门... 为了解定海湾龟足肠道微生物群落结构特点及代谢组特征,探索龟足生存环境、食性及肠道微生物组成之间的联系,使用16S rRNA高通量测序技术和非靶向代谢组学技术,对采集的龟足样品进行分析。结果表明:龟足肠道菌群在门水平上,最优势菌门为变形菌门,含量为47.17%,其次为拟杆菌门,含量为40.61%;在纲水平上,最优势纲为拟杆菌纲,含量为40.59%,其次为γ变形菌纲,含量为32.62%;在属水平上,最优势属为Sediminibacterium,含量为22.77%,其次为Pseudarcicella,含量为10.97%,还存在较多未能培养和未能鉴定的菌属。龟足肠道代谢物中含量最多的为脂类及类脂物质,约占代谢物总量的31%,其次为有机酸及其衍生物,约占代谢物总含量的23%。 展开更多

关键词 定海湾 龟足 肠道微生物 代谢组

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龟足碳酸酐酶(CA)基因家族的鉴定及表达分析

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作者 宋宇欣 刘凤钰 林岗 《福建农业科技》 2025年第1期7-16,共10页

碳酸酐酶(carbonic anhydrase,CA)是一类催化二氧化碳和水生成碳酸的酶。为探究CA在龟足壳板钙化过程中的作用,利用生物信息学的方法对龟足CA基因家族成员进行鉴定,分析其编码蛋白的理化性质、亚细胞定位、二级结构、三级结构、保守基... 碳酸酐酶(carbonic anhydrase,CA)是一类催化二氧化碳和水生成碳酸的酶。为探究CA在龟足壳板钙化过程中的作用,利用生物信息学的方法对龟足CA基因家族成员进行鉴定,分析其编码蛋白的理化性质、亚细胞定位、二级结构、三级结构、保守基序、染色体定位、跨膜结构预测及进化关系,并结合转录组分析龟足CA在不同发育时期的表达模式。结果表明:在龟足基因组中鉴定出10条CA基因家族成员,其分布在6条不同的染色体上。龟足CA基因家族成员编码蛋白的基本理化性质分析表明,蛋白氨基酸数目为108~318个,蛋白相对分子质量为12.10~36.22 kDa,等电点系数范围为5.09~10.68,且均为亲水蛋白;系统发育分析显示在龟足CA蛋白中,CmCA3、CmCA4和CmCA5聚为一支,CmCA6、CmCA7、CmCA8和CmCA9聚为另一支,而CmCA1、CmCA2和CmCA10则分别单独聚为一支;转录组数据分析显示CmCA7、CmCA8、CmCA2、CmCA6和CmCA10在无节幼虫时期表达量相对较低,CmCA5、CmCA3分别在变态中期和稚体时期具有较高的表达量,CmCA4、CmCA1在无节幼虫时期具有较高的表达量,CmCA9在金星幼虫5期表达量增加,随后显著下降。综上所述,研究结果为深入解析CA基因在龟足壳板钙化过程中的调控机制提供理论基础。 展开更多

关键词 龟足 生物信息学 碳酸酐酶(CA)基因家族 表达

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东星斑循环水养殖系统的水体营养盐及微生物群落结构特征 被引量：2

5

作者 刘鑫 康建平 +4 位作者 林岗 缪凡 叶翚 饶小珍 钟传明 《福建农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第6期754-764,共11页

【目的】明确循环水养殖系统(Recirculating aquaculture system,RAS)的营养盐及微生物组成特征,为东星斑循环水养殖系统的合理利用提供理论依据和技术参考。【方法】检测东星斑循环水养殖系统进水、养殖池、养殖池出水、生物滤池、紫... 【目的】明确循环水养殖系统(Recirculating aquaculture system,RAS)的营养盐及微生物组成特征,为东星斑循环水养殖系统的合理利用提供理论依据和技术参考。【方法】检测东星斑循环水养殖系统进水、养殖池、养殖池出水、生物滤池、紫外消毒池的水质指标、水体中弧菌数量,利用高通量测序技术对水体中微生物群落进行分析。【结果】氨氮、硝酸盐氮和磷酸盐的浓度从养殖环节至消毒环节呈现先上升后下降的变化趋势,亚硝酸盐氮则相反。外源海水样品中的弧菌数量小于循环水养殖系统中各个环节样品中的弧菌数量,弧菌数量经过养殖池后明显上升,经过生物滤池处理之后明显下降。在门分类水平上,循环水养殖系统中不同环节主要的微生物门类是变形菌门Proteobacteria、拟杆菌门Bacteroidota、厚壁菌门Firmicutes。在属分类水平上,主要为假交替单胞菌属Pseudoalteromonas、发光杆菌属Photobacterium、弧菌属Vibrio、乳杆菌属Lactobacillus,Vibrio中主要为Vibrio ponticus,占Vibrio总量的66.17%。【结论】循环水养殖系统的水处理环节可以有效降低养殖池出水中氨氮、硝酸盐氮以及磷酸盐的浓度和弧菌数量,同时揭示了循环水系统不同环节微生物组成特征。 展开更多

关键词 东星斑 循环水养殖系统 高通量测序 微生物群落结构 弧菌

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鳗鲡养殖尾水处理系统水体微生物群落结构分析 被引量：2

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作者 缪凡 陈燕婷 +2 位作者 刘鑫 钟传明 林岗 《福建农业科技》 CAS 2022年第9期1-10,共10页

为了阐明鳗鲡养殖尾水处理系统的净化效果及不同单元水体微生物的组成结构变化规律,检测了各个单元的水质情况,并利用16S rRNA高通量测序技术分析了不同处理阶段水体中的微生物的群落组成。结果表明:经过净化处理的水体总磷含量、氨氮... 为了阐明鳗鲡养殖尾水处理系统的净化效果及不同单元水体微生物的组成结构变化规律,检测了各个单元的水质情况,并利用16S rRNA高通量测序技术分析了不同处理阶段水体中的微生物的群落组成。结果表明:经过净化处理的水体总磷含量、氨氮浓度均降低,水体pH上升;经过净化处理之后的水体与河水样品具有6种相同优势菌属,其中Novosphingobium、Limnohabitans、Sediminibacterium为样品中占比排名前10的菌属;化学法除磷净化处理较大改变了养殖尾水的微生物群落结构,生物法处理使水体的微生物群落结构更接近于自然水体。研究揭示了不同尾水处理阶段水体水质情况及微生物的组成动态变化规律,说明了尾水处理系统中的生态单元可以有效改善养殖尾水水体环境中的微生态平衡。 展开更多

关键词 鳗鲡 养殖尾水 微生物群落结构 高通量测序

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球等鞭金藻CRY1与COP1互作及生物信息学分析

7

作者 李欢 李龙玉 +4 位作者 钟洁 陈由强 余雪冰 何文锦 陈建楠 《福建农业科技》 CAS 2023年第12期7-14,共8页

为验证球等鞭金藻的隐花色素蛋白IgCRY1与下游蛋白IgCOP1是否互作,通过提取球等鞭金藻的总RNA反转录成cDNA为模板,扩增目的片段,构建BD-IgCRY1和AD-IgCOP1载体,共同转入AH109酵母菌株进行酵母双杂验证,并对IgCOP1蛋白进行生物信息学分... 为验证球等鞭金藻的隐花色素蛋白IgCRY1与下游蛋白IgCOP1是否互作,通过提取球等鞭金藻的总RNA反转录成cDNA为模板,扩增目的片段,构建BD-IgCRY1和AD-IgCOP1载体,共同转入AH109酵母菌株进行酵母双杂验证,并对IgCOP1蛋白进行生物信息学分析。结果显示:从球等鞭金藻中克隆到IgCRY1和IgCOP1的CDS序列分别为1560 bp和1185 bp。通过酵母双杂验证了IgCRY1蛋白和IgCOP1蛋白相互互作。对互作蛋白IgCOP1进行生物信息学分析,发现该蛋白的分子量大小为43.7 kDa,编码的氨基酸个数为394个,二级结构62.69%为不规则卷曲,是典型的亲水性蛋白。系统发育树分析显示IgCOP1蛋白聚于分支底部,与其他分支的亲缘关系较远。IgCRY1蛋白和IgCOP1蛋白相互互作的验证,为球等鞭金藻的光信号调控生物学过程提供了重要的理论基础。 展开更多

关键词 球等鞭金藻 酵母双杂 IgCRY1蛋白 IgCOP1蛋白 生物信息学分析

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裂殖壶藻SlMYB118基因的克隆及生物信息学分析

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作者 陈菁 苏永昌 +3 位作者 孙化淼 陈由强 薛婷 代容春 《渔业研究》 2023年第3期222-232,共11页

裂殖壶藻是一种含有丰富DHA的海洋微藻。本课题组前期发现裂殖壶藻的SlMYB118基因与脂肪酸的合成密切相关,是潜在的DHA合成调控的转录因子。本文通过PCR的方法克隆裂殖壶藻的SlMYB118基因的cDNA全长序列,运用生物信息学的方法对其分析... 裂殖壶藻是一种含有丰富DHA的海洋微藻。本课题组前期发现裂殖壶藻的SlMYB118基因与脂肪酸的合成密切相关,是潜在的DHA合成调控的转录因子。本文通过PCR的方法克隆裂殖壶藻的SlMYB118基因的cDNA全长序列,运用生物信息学的方法对其分析。结果预测SlMYB118蛋白质的等电点为8.75,分子量为84.81 kDa,定位于细胞核,且其具有106个潜在的磷酸化位点。SlMYB118基因的结合位点是探索转录调控机制、建立DHA合成相关转录调控网络的关键,本研究为后续确定其结合位点奠定了理论基础。 展开更多

关键词 裂殖壶藻 SlMYB118基因 克隆 生物信息学分析

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三倍体太平洋牡蛎不同组织中挥发性风味成分分析

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作者 郑泽文 周子权 +3 位作者 陈志 陈建楠 薛婷 林岗 《福建农业科技》 CAS 2024年第2期1-9,共9页

为探究太平洋牡蛎不同组织中挥发性风味成分的差异,揭示牡蛎总体风味的来源及形成机制。采用SPME-GC-MS技术结合多元统计分析的方法,对太平洋牡蛎闭壳肌、肝胰腺、鳃和性腺的挥发性风味成分进行了检测。结果表明:闭壳肌中检测到18种物质... 为探究太平洋牡蛎不同组织中挥发性风味成分的差异,揭示牡蛎总体风味的来源及形成机制。采用SPME-GC-MS技术结合多元统计分析的方法,对太平洋牡蛎闭壳肌、肝胰腺、鳃和性腺的挥发性风味成分进行了检测。结果表明:闭壳肌中检测到18种物质,肝胰腺中检测到11种物质,鳃中检测到8种物质,性腺中检测到6种物质。闭壳肌、鳃和性腺中主要成分为醛类物质,肝胰腺中主要成分为醇类物质,4个组织中共检测出28种挥发性风味成分,其中大多数化合物为醛类、酮类、醇类等;采用聚类热图分析、关键风味成分筛选以及主成分分析比较4个不同组织的挥发性风味成分,结果显示太平洋牡蛎中各组织风味差异明显,影响太平洋牡蛎风味的主要物质为醛类和酮类,太平洋牡蛎不同组织中的各种风味物质相互协调,造就了太平洋牡蛎独特的海洋鲜香风味。研究结果对指导太平洋牡蛎风味研究和产品加工利用有重要意义。 展开更多

关键词 太平洋牡蛎 固相微萃取-气相色谱-质谱 挥发性风味成分

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正交试验法优化印度洋鱿鱼甲醛清除工艺条件

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作者 张慈凤 孙化淼 +1 位作者 陈建楠 陈多 《福建农业科技》 CAS 2024年第7期69-73,共5页

印度洋鱿鱼作为重要的水产资源,其未经处理的样品中往往有较高的天然甲醛含量。为了有效降低甲醛含量,设计了正交试验优化浸烫pH值、浸烫温度、浸烫时间以及清除剂4个因素条件。结果表明:最佳工艺条件是浸烫pH为9.0,浸烫温度为80℃,浸... 印度洋鱿鱼作为重要的水产资源,其未经处理的样品中往往有较高的天然甲醛含量。为了有效降低甲醛含量,设计了正交试验优化浸烫pH值、浸烫温度、浸烫时间以及清除剂4个因素条件。结果表明:最佳工艺条件是浸烫pH为9.0,浸烫温度为80℃,浸烫时间为90 min,甲醛清除剂使用0.02%茶多酚和0.1%半胱氨酸。经此处理工艺处理后的印度洋鱿鱼产品未检测到残留甲醛含量。 展开更多

关键词 印度洋鱿鱼 甲醛清除 正交试验 方差分析

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基于转录组测序技术对调控毕加索小丑鱼(Picassoclownfish)白化体征关键基因的研究 被引量：5

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作者 何丽斌 黄镇 +1 位作者 吴水清 郑乐云 《海洋学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第2期67-76,共10页

毕加索小丑鱼(Picasso clownfish)因其皮肤中的白色斑块分布杂乱抽象而得名,同时也由于其白色斑块的形成无规律性和稀缺性,属于名贵的小丑鱼,因此,解析毕加索小丑鱼的皮肤白斑形成机制,可以为毕加索小丑鱼的人工育种提供理论依据。在本... 毕加索小丑鱼(Picasso clownfish)因其皮肤中的白色斑块分布杂乱抽象而得名,同时也由于其白色斑块的形成无规律性和稀缺性,属于名贵的小丑鱼,因此,解析毕加索小丑鱼的皮肤白斑形成机制,可以为毕加索小丑鱼的人工育种提供理论依据。在本研究中,我们对3种体色毕加索小丑鱼的背鳍和臀鳍之间的身体相同部位3种色块(黑色、黄色、白色)的皮肤进行进行了转录组测序。研究结果显示,与黄色和黑色皮肤组织相比,在白色皮肤组织中存在大量差异表达基因。其中与黑色素产生相关的信号通路(例如黑色素生成、Hedgehog信号通路和Wnt信号通路)中的基因在白色皮肤组织中呈下调表达趋势。进一步对3种颜色皮肤组织中参与黑色素生成途径的基因进行详细分析,发现上游调控基因(如ednrba和mitfa)表达量从黑色到黄色至白色皮肤组织中逐步下调,但下游参与黑色素合成的核心基因(包括tyr、tyrp1b和dct)则在白色皮肤组织中表达出现显著下调。最后,本研究通过荧光定量PCR验证了转录组数据的可靠性。本研究结果将为今后人为干扰基因表达从而达到调控小丑鱼体色提供理论依据。 展开更多

关键词 白化现象 毕加索小丑鱼 转录组测序 差异表达基因

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斑马鱼g型溶菌酶基因序列分析及其原核表达 被引量：3

12

作者 陈华 林晨韬 +1 位作者 陈曦 葛均青 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第1期229-237,共9页

【目的】实现斑马鱼g型溶菌酶在大肠杆菌中表达,以获得高纯度且具溶菌活性的融合蛋白,为探究g型溶菌酶在斑马鱼抗菌过程中的作用机制及其开发利用打下基础。【方法】通过ClustalW、ExPASy、SignalP-5.0 Server及PSIPRED等在线软件对斑马... 【目的】实现斑马鱼g型溶菌酶在大肠杆菌中表达,以获得高纯度且具溶菌活性的融合蛋白,为探究g型溶菌酶在斑马鱼抗菌过程中的作用机制及其开发利用打下基础。【方法】通过ClustalW、ExPASy、SignalP-5.0 Server及PSIPRED等在线软件对斑马鱼g型溶菌酶进行生物信息分析,经密码子优化后合成斑马鱼g型溶菌酶基因,亚克隆至pET-28a(+)表达载体并转化大肠杆菌BL21(DE3)感受态细胞,以IPTG进行诱导表达,并通过非干扰型蛋白浓度测定试剂盒和溶菌酶测定试剂盒(比浊法)测定其浓度及溶菌活性。【结果】从GenBank检索获得的斑马鱼溶菌酶基因g1(NM_001002706.1)和g2(XM_002664371.5)分别命名为Zeb-Lys-g1和Zeb-Lys-g2。Zeb-Lys-g1基因开放阅读框(ORF)长591 bp,共编码196个氨基酸残基,其编码蛋白分子量约21.6 kD;Zeb-Lys-g2的ORF长576 bp,共编码191个氨基酸残基,其编码蛋白分子量约21.1 kD;2种斑马鱼g型溶菌酶序列中均含有2个半胱氨酸残基及3个保守的催化残基位点(Glu、Asp和Asp)。Zeb-Lys-g1的N端含有17个氨基酸的信号肽,而Zeb-Lys-g2不存在典型的信号肽结构,但其三级结构均具有多个α-螺旋结构。在基于溶菌酶序列相似性构建的系统发育进化树中,Zeb-Lys-g1序列与金鱼g型溶菌酶序列的亲缘关系最近,而Zeb-Lys-g2序列与鲈形目和鲽形目鱼类的g型溶菌酶序列亲缘关系较近。将合成的斑马鱼g型溶菌酶基因(Zeb-Lys-g1和Zeb-Lys-g2)亚克隆至pET-28a(+)表达载体并转化BL21(DE3)感受态细胞,20℃下经IPTG(终浓度0.5 mmol/L)诱导16 h,可获得融合蛋白Zeb-Lys-g1和Zeb-Lys-g2,纯化后的浓度分别为1.01和1.66 mg/mL,对应的溶菌活性分别为689.68和44.39 U/mg。【结论】鱼类g型溶菌酶的基因变异较保守,经密码子优化及全基因合成方式合成的斑马鱼g型溶菌酶基因Zeb-Lys-g1和Zeb-Lys-g2可通过原核表达获得高纯度、高溶菌活性的融合蛋白,为探究斑马鱼溶菌酶的抗菌机制提供了技术支持。 展开更多

关键词 斑马鱼 g型溶菌酶 序列特征 原核表达 溶菌活性

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饵料、盐度和温度对刺巨藤壶幼虫生长发育的影响 被引量：3

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作者 林岗 饶小珍 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第21期8628-8639,共12页

刺巨藤壶(Megabalanus volcano)是沿海污损生物的优势种,也是沿岸居民常食用的海鲜之一。为探究刺巨藤壶幼虫室内培养的适宜条件,采用生态学单因子梯度实验方法,研究饵料种类及密度、盐度(18、22、26、30、34、38和42)和温度(14℃、18℃... 刺巨藤壶(Megabalanus volcano)是沿海污损生物的优势种,也是沿岸居民常食用的海鲜之一。为探究刺巨藤壶幼虫室内培养的适宜条件,采用生态学单因子梯度实验方法,研究饵料种类及密度、盐度(18、22、26、30、34、38和42)和温度(14℃、18℃、22℃、26℃、30℃和34℃)等生态因子对刺巨藤壶幼虫生长发育的影响,以Ⅵ期无节幼虫存活率、Ⅵ期无节幼虫发育时间、金星幼虫存活率、金星幼虫发育时间和金星幼虫体长等为观察指标。中肋骨条藻(Skeletonema costatum)和牟氏角毛藻(Chaetoceros muelleri)均设置5×10^(4)个/mL、10×10^(4)个/mL、20×10^(4)个/mL、40×10^(4)个/mL和80×10^(4)个/mL 5个密度梯度,亚心形扁藻(Platymonas subcordiformis)设置2.5×10^(4)个/mL、5×10^(4)个/mL、10×10^(4)个/mL、15×10^(4)个/mL和20×10^(4)个/mL 5个密度梯度。结果表明,3种微藻的低密度组刺巨藤壶幼虫均不能发育至金星幼虫,而达到一定的藻密度幼虫均能发育至金星幼虫阶段;幼虫发育时间随藻密度的提高而降低;幼虫存活率和金星幼虫的体长一般随藻密度的提高而增加。中肋骨条藻80×10^(4)个/mL组的金星幼虫存活率高达41.33%、金星幼虫体长681.43μm;牟氏角毛藻80×10^(4)个/mL组的金星幼虫存活率高达43.67%、金星幼虫体长668.39μm;中肋骨条藻和牟氏角毛藻是培养刺巨藤壶幼虫的适宜饵料,最适密度是40×10^(4)个/mL和80×10^(4)个/mL。亚心型扁藻20×10^(4)个/mL组的金星幼虫存活率最高仅14.33%、金星幼虫体长仅554.60μm,因此亚心型扁藻不是培养刺巨藤壶幼虫的适宜饵料。除18盐度组幼虫只能发育到Ⅳ期无节幼虫外,22—42各盐度组的幼虫均能发育到金星幼虫阶段,30盐度组的金星幼虫存活率最高为35.67%;幼虫发育时间各盐度组相差不大;在22和26低盐培养下,金星幼虫的体长相对较长。26—34盐度是幼虫发育的适宜盐度。14℃和34℃温度组幼虫最多发育到Ⅴ期无节幼虫,18—30℃各温度组的幼虫均能发育至金星幼虫阶段,22℃的金星幼虫存活率最高为50.67%;随着温度的提高,幼虫发育时间显著缩短;在18℃低温培养下,金星幼虫的体长相对较长。22—26℃是幼虫发育的适宜温度。总之,在合适的藻类密度、盐度和温度条件下,在室内培养刺巨藤壶无节幼虫一般在8 d可达金星幼虫阶段,金星幼虫的存活率可达35%以上。 展开更多

关键词 刺巨藤壶 饵料 盐度 温度 无节幼虫 金星幼虫

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饲料中添加裂殖壶菌对斑马鱼抗创伤弧菌感染的影响 被引量：1

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作者 陈华 张丽娟 +3 位作者 李素一 柯翎 陈叙 林晨韬 《福建农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第10期1117-1123,共7页

【目的】研究饲料中添加裂殖壶菌对鱼类抗细菌感染能力的影响,为裂殖壶菌作为饲料添加剂的应用提供理论基础。【方法】以6个月的成年斑马鱼为研究对象,以基础颗粒饲料为对照组(C组),试验组在基础饲料中添加干重3%的裂殖壶菌(S组),进行2... 【目的】研究饲料中添加裂殖壶菌对鱼类抗细菌感染能力的影响,为裂殖壶菌作为饲料添加剂的应用提供理论基础。【方法】以6个月的成年斑马鱼为研究对象,以基础颗粒饲料为对照组(C组),试验组在基础饲料中添加干重3%的裂殖壶菌(S组),进行28 d饲喂试验。28 d后以创伤弧菌Vibrio vulnificus菌株FJ03-X2对斑马鱼进行攻毒,统计免疫保护率,并收集斑马鱼的肾脏组织提取RNA,逆转录成cDNA,通过Real-time RT-PCR检测相关基因lysozyme和tnfb的表达。【结果】饲料中添加3%裂壶菌能够显著提高斑马鱼感染创伤弧菌后的存活率,相对保护率为42.8%;Real-time RT-PCR检测的结果发现S组的斑马鱼肾脏中溶菌酶Lysozyme的mRNA水平极显著高于对照组(P<0.01),而肿瘤坏死因子TNFb的m RNA水平则极显著低于对照组(P<0.01)。【结论】裂殖壶菌作为营养添加剂可以提高斑马鱼抗创伤弧菌感染的能力。 展开更多

关键词 裂殖壶菌 斑马鱼 创伤弧菌 饲料添加剂

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新型欧洲鳗鲡抗菌肽elecilin在毕赤酵母中的表达 被引量：2

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作者 张丽娟 吴唯维 +4 位作者 李素一 陈华 柯翎 陈叙 林晨韬 《福建畜牧兽医》 2021年第2期19-21,共3页

前期采用差减杂交的方法筛选到新型欧洲鳗鲡抗菌肽elecilin,其基因全长为477 bp,编码159个氨基酸,理论分子量约17.4 kDa。为了获得具活性的大量表达的抗菌肽,本研究利用毕赤酵母表达了elecilin。首先将elecilin基因克隆至酵母分泌表达载... 前期采用差减杂交的方法筛选到新型欧洲鳗鲡抗菌肽elecilin,其基因全长为477 bp,编码159个氨基酸,理论分子量约17.4 kDa。为了获得具活性的大量表达的抗菌肽,本研究利用毕赤酵母表达了elecilin。首先将elecilin基因克隆至酵母分泌表达载体pPICZaA,构建了重组分泌表达质粒pPICZaA-elecilin,电击转化毕赤酵母X-33。经Zeocin筛选和PCR鉴定,获得重组酵母菌,通过甲醇诱导,SDS-PAGE和Western blot鉴定,证实诱导后的培养基中存在与预期分子量大小相一致的蛋白,能被His-tag单克隆抗体识别,表明利用酵母成功表达了欧洲鳗鲡抗菌肽elecilin。这为进一步研究该抗菌肽的功能及作为饲料添加剂的应用奠定了基础。 展开更多

关键词 欧洲鳗鲡 抗菌肽 表达 毕赤酵母

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甘薯羽状斑驳病毒和甘薯褪绿矮化病毒检测方法的建立 被引量：1

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作者 陈涛 薛婷 +3 位作者 杨志坚 陈选阳 陈由强 陈建楠 《福建农业科技》 CAS 2023年第6期11-21,共11页

为了建立甘薯羽状斑驳病毒(Sweet potato feathery mottle virus,SPFMV)和甘薯矮化褪绿病毒(Sweet potato chlorotic stunt virus,SPCSV)的逆转录环介导等温扩增(RT-LAMP)检测方法,提高检测灵敏度,实现结果的可视化。根据SPFMV外壳蛋白... 为了建立甘薯羽状斑驳病毒(Sweet potato feathery mottle virus,SPFMV)和甘薯矮化褪绿病毒(Sweet potato chlorotic stunt virus,SPCSV)的逆转录环介导等温扩增(RT-LAMP)检测方法,提高检测灵敏度,实现结果的可视化。根据SPFMV外壳蛋白基因(CP)的核苷酸序列和SPCSV的热休克蛋白基因(Hsp 70)的核苷酸序列设计4条RT-LAMP特异性引物,采取单因素优化试验,对RT-LAMP反应体系中的多个因素包括时间、温度、BST聚合酶、Mg^(2+)、RNase抑制剂、dNTPs和Betaine浓度优化,恒温扩增60 min。经琼脂糖凝胶电泳分析,SYBR Green I可视化显色,结果表明:SPFMV的优化反应体系为:FIP/BIP 2μL、F3/B30.5μL、BST聚合酶1.0μL、dNTPs 0.6μL、MgSO 41.5μL、RNase抑制剂1.0μL、Betaine 7μL,62℃60 min。SPCSV的优化反应体系为:FIP/BIP 2μL、F3/B30.5μL、BST聚合酶1.0μL、dNTPs 0.6μL、MgSO 41.5μL、RNase抑制剂1.2μL、Betaine 7μL,64℃60 min。进一步利用SPFMV全基因组的4个片段(SPFMV-1、SPFMV-2、SPFMV-3、SPFMV-4)、SPCSV-Hsp 70和RGNNV进行特异性检验,分别建立了SPFMV和SPCSV的特异性RT-LAMP检测方法,扩增出了具有RT-LAMP的典型瀑布状条带,与凝胶电泳和SYBR Green I显色结果一致,SPFMV和SPCSV的灵敏度检测下限分别为:1×10^(-6)、1×10^(-3)ng·μL^(-1),该方法检测灵敏度高,实现了结果的可视化。对田间甘薯苗和离体组织培养甘薯苗进行检测验证,SPFMV-RT-LAMP检测方法成功率为100%,SPCSV-RT-LAMP检测方法的成功率为95%,表明研发的SPFMV和SPCSV的RT-LAMP检测方法适用于SPFMV和SPCSV的快速检测。 展开更多

关键词 甘薯 甘薯羽状斑驳病毒(SPFMV) 甘薯矮化褪绿病毒(SPCSV) 环介导等温扩增技术(RT-LAMP) 建立

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刺巨藤壶精子的发生及其超微结构 被引量：1

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作者 周欢 林岗 饶小珍 《热带海洋学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第3期98-105,共8页

采用扫描和透射电镜技术,观察刺巨藤壶(Megabalanus volcano)精子发生和精子的超微结构特征。结果显示,刺巨藤壶精子发生经历精原细胞、初级精母细胞、次级精母细胞、精细胞和精子等5个阶段。在精子形成期间,圆形或椭圆形的细胞核在微... 采用扫描和透射电镜技术,观察刺巨藤壶(Megabalanus volcano)精子发生和精子的超微结构特征。结果显示,刺巨藤壶精子发生经历精原细胞、初级精母细胞、次级精母细胞、精细胞和精子等5个阶段。在精子形成期间,圆形或椭圆形的细胞核在微管的作用下沿轴丝延长并在胞质内弯曲,核和轴丝随着精细胞的纵向伸长而延长,细胞核最终成为线状;斑块状的染色质逐渐解体,呈细小颗粒状和粗颗粒状,最后浓缩成高密度的均质物;高尔基体分泌的囊泡不断融合,形成大小不一的附属小滴前体,最后融合并延伸成一个纺锤形的附属小滴;许多小的线粒体不断融合成一个细长的线粒体,移至核的后端。精子为前部带有附属小滴的长线状,全长约58.39μm,可分为顶体、颈部、中段和尾部四部分。长锥形的顶体位于精子最前端,其后为基体;颈部由基体产生的“9+2”型轴丝和与之并行的线状核组成;顶体和颈部两者长共约6.65μm。中部长约42.95μm,纺锤形的附属小滴(长约9.33μm,最宽处约2.13μm)紧靠核和轴丝,其后为颗粒状糖原及一个细长的线粒体;尾部长约8.79μm,只有轴丝贯穿。 展开更多

关键词 刺巨藤壶 精子发生 精子 超微结构 附属小滴

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三沙湾春季浮游植物群落结构特征 被引量：10

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作者 籍辰旭 陈逍遥 +5 位作者 陈火荣 李聪 王萱 杨位迪 丁光茂 林岗 《渔业研究》 2021年第1期42-52,共11页

于2019年4月在福建省三沙湾海域24个站位进行浮游植物采样调查,对浮游植物种类组成、优势种群、细胞密度及生态学指数进行初步研究,结果表明三沙湾海域共鉴定浮游植物4门69属181种,其中硅藻门57属161种、甲藻门10属16种、蓝藻门1属3种... 于2019年4月在福建省三沙湾海域24个站位进行浮游植物采样调查,对浮游植物种类组成、优势种群、细胞密度及生态学指数进行初步研究,结果表明三沙湾海域共鉴定浮游植物4门69属181种,其中硅藻门57属161种、甲藻门10属16种、蓝藻门1属3种、金藻门1属1种;优势种有具槽帕拉藻(Paralia sulcata)、中肋骨条藻(Skeletonema costatum)、菱形海线藻(Thalassionema nitzschioides)、琼氏圆筛藻(Coscinodiscus jonesianus)和菱形藻(Nitzschia sp.);浮游植物细胞密度为中层>底层>表层,水平分布中各站位有较大差异,密度介于(9.20~38.9)×10^(6)个/m^(3)之间,平均值为22.67×10^(6)个/m^(3);不同站位丰富度指数介于0.77~1.83之间,平均值为1.24;均匀度指数介于0.35~0.74之间,平均值为0.63;多样性指数介于1.14~2.63之间,平均值为2.13,总体评价处于中等水平。 展开更多

关键词 浮游植物 群落结构 三沙湾

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患肠炎病海马的肠道细菌结构特征分析 被引量：2

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作者 闫亚楠 陈美玲 +6 位作者 吴锐琼 吴水清 罗辉玉 陈欣欣 何丽斌 郑乐云 黄镇 《福建农业科技》 2020年第12期1-8,共8页

肠炎病是海马人工养殖过程中常见病害,主要是细菌感染而引起的,其传染性强、危害性高。因此,解析患肠炎病海马肠道中的细菌菌群组成对于海马肠炎病的诊断以及防治有着重要意义。采集健康和患肠炎病的膨腹海马肠道组织,采用细菌16Sr DNA... 肠炎病是海马人工养殖过程中常见病害,主要是细菌感染而引起的,其传染性强、危害性高。因此,解析患肠炎病海马肠道中的细菌菌群组成对于海马肠炎病的诊断以及防治有着重要意义。采集健康和患肠炎病的膨腹海马肠道组织,采用细菌16Sr DNA片段高通量测序和生物信息学分析手段,探究患肠炎病海马的肠道细菌结构特征。结果表明,健康和肠炎病海马之间的肠道菌群多样性和结构均存在显著差异。从属水平上来看,患病海马的肠道优势菌种为弧菌属Vibrio、漫游球菌属Vagococcus、分枝杆菌属Mycobacterium,健康海马的肠道优势菌种为玫瑰菌属Roseibium、拟杆菌目未分类Bacteroidales_unclassified、弧菌属Vibrio、嗜冷菌属Psychrobacter,健康海马和患病海马中的共有属包括弧菌属Vibrio、别弧菌属Aliivibrio、拟杆菌目未分类Bacteroidetes_unclassified、发光杆菌属Photobacterium。与健康海马肠道菌群相比,患病海马肠道中的弧菌属Vibrio、别弧属菌属Aliivibrio的含量明显高于健康海马。此外,肠炎病海马肠道中分枝杆菌属Mycobacterium、β变形菌纲未分类Bacteroidales_unclassified、黄杆菌属Tenacibaculum和希万氏菌属Shewanella为特有的细菌种属。研究结果解析肠炎病海马肠道可能的致病菌,对于海马养殖过程中的病害防治有重要的指导意义。 展开更多

关键词 海马 肠炎病 肠道 高通量测序 宏基因组学

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球等鞭金藻MYB基因家族成员全基因组鉴定和特性分析 被引量：1

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作者 韩玉莹 陈璐瑶 +2 位作者 陈由强 陈多 陈建楠 《福建农业科技》 CAS 2023年第4期22-35,共14页

为了深入理解球等鞭金藻MYB基因家族在基因调控网络中的作用机制,使用MYB_DNA-binding保守结构域在球等鞭金藻蛋白序列中筛选出60个MYB基因家族成员,并对这些基因家族成员的蛋白(一、二、三级)结构预测和分析、亚细胞结构定位、基因结... 为了深入理解球等鞭金藻MYB基因家族在基因调控网络中的作用机制,使用MYB_DNA-binding保守结构域在球等鞭金藻蛋白序列中筛选出60个MYB基因家族成员,并对这些基因家族成员的蛋白(一、二、三级)结构预测和分析、亚细胞结构定位、基因结构及保守结构域等方面进行了分析。结果表明:这些MYB基因家族成员可分为3个cluster,其中R2-MYB和R3-MYB主要集中在cluster 3中,R2R3-MYB则含有大部分家族成员,表明这些基因在球等鞭金藻中起着重要的生物学功能。不同分支的亲缘关系较远,同一分支的关系较近,这表明球等鞭金藻MYB基因家族在演化过程中形成了一些适应性的变化。通过基因组内共线性分析,研究发现球等鞭金藻全基因组内有177对片段复制基因和46对串联复制基因,其中MYB基因家族有2对复制基因,包括串联重复基因对IZ004267和IZ007345以及片段重复基因对IZ006462和IZ006102。结合染色体定位分析,IZ006462和IZ006102位于9号染色体,这也支持上述片段重复的判断。这些重复基因对的K a/K s值小于1,表明这些基因在扩张过程中受到了基因纯化选择,功能相当保守。 展开更多

关键词 球等鞭金藻 MYB基因家族 全基因组 光质 表达分析

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