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福建省马铃薯纺锤块茎类病毒快速检测及序列分析
被引量：
1
1
作者
李华伟
罗文彬
+7 位作者
纪荣昌
许泳清
张鸿
李国良
刘中华
邱永祥
邱思鑫
汤浩
《福建农业学报》
CAS
北大核心
2015年第10期984-988,共5页
为检测福建省马铃薯纺锤块茎类病毒及了解其分子变异情况,以感染马铃薯纺锤块茎类病毒的植株为试验材料,提取RNA,反转录cDNA,利用设计合成的特异性引物进行RT-PCR检测,扩增产物经回收纯化后克隆和测序。结果表明,PCR扩增出359bp的特异片...
为检测福建省马铃薯纺锤块茎类病毒及了解其分子变异情况,以感染马铃薯纺锤块茎类病毒的植株为试验材料,提取RNA,反转录cDNA,利用设计合成的特异性引物进行RT-PCR检测,扩增产物经回收纯化后克隆和测序。结果表明,PCR扩增出359bp的特异片段,将扩增产物经回收和纯化并进行克隆与测序,测序结果经BLAST比对后,该片段为PSTVd基因序列,PSTVd分离物命名为Fujian PTSTd(KM588065.1),与国内外报道的PSTVd分离物同源性达98%以上。该分离物与弱毒株系(M14814.1)、中间株系(AY492084.1)和强毒株系(U23058.1)比对,有11个核苷酸具有多态性,其中5个发生在致病区。不同国家和地区序列进化树分析表明,该分离物与我国北方及欧美国家分离物亲缘关系最近,与新西兰分离物亲缘关系最远。
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关键词
福建省
马铃薯
马铃薯纺锤块茎类病毒
RT-PCR
检测
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职称材料
题名
福建省马铃薯纺锤块茎类病毒快速检测及序列分析
被引量：
1
1
作者
李华伟
罗文彬
纪荣昌
许泳清
张鸿
李国良
刘中华
邱永祥
邱思鑫
汤浩
机构
福建省农业科学院
作物
研究
所
福建省农业科学院薯类研究中心
出处
《福建农业学报》
CAS
北大核心
2015年第10期984-988,共5页
基金
福建省科技计划项目--省属公益类科研院所基本科研专项(2015R1026-11)
福建省财政专项--福建省农业科学院科技创新团队建设项目(CXTD-1-1301)
文摘
为检测福建省马铃薯纺锤块茎类病毒及了解其分子变异情况,以感染马铃薯纺锤块茎类病毒的植株为试验材料,提取RNA,反转录cDNA,利用设计合成的特异性引物进行RT-PCR检测,扩增产物经回收纯化后克隆和测序。结果表明,PCR扩增出359bp的特异片段,将扩增产物经回收和纯化并进行克隆与测序,测序结果经BLAST比对后,该片段为PSTVd基因序列,PSTVd分离物命名为Fujian PTSTd(KM588065.1),与国内外报道的PSTVd分离物同源性达98%以上。该分离物与弱毒株系(M14814.1)、中间株系(AY492084.1)和强毒株系(U23058.1)比对,有11个核苷酸具有多态性,其中5个发生在致病区。不同国家和地区序列进化树分析表明,该分离物与我国北方及欧美国家分离物亲缘关系最近,与新西兰分离物亲缘关系最远。
关键词
福建省
马铃薯
马铃薯纺锤块茎类病毒
RT-PCR
检测
Keywords
Fujian
potato
potato spindle tuber viroid
RT-PCR
detection
分类号
S435.32 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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作者
出处
发文年
被引量
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1
福建省马铃薯纺锤块茎类病毒快速检测及序列分析
李华伟
罗文彬
纪荣昌
许泳清
张鸿
李国良
刘中华
邱永祥
邱思鑫
汤浩
《福建农业学报》
CAS
北大核心
2015
1
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