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基于EST-SSR标记的福建云霄县和尤溪县野生茶树遗传多样性分析 被引量:7
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作者 杨军 孔祥瑞 王让剑 《茶叶学报》 2022年第1期11-19,共9页
为了对福建云霄县、尤溪县野生茶树种质资源初步鉴定与筛选,以福建省茶树主要栽培品种为参照,利用EST-SSR毛细管电泳荧光标记技术进行遗传多样性与亲缘关系分析。结果表明:云霄县、尤溪县野生茶树种质资源与参照品种亲缘关系较远,云霄... 为了对福建云霄县、尤溪县野生茶树种质资源初步鉴定与筛选,以福建省茶树主要栽培品种为参照,利用EST-SSR毛细管电泳荧光标记技术进行遗传多样性与亲缘关系分析。结果表明:云霄县、尤溪县野生茶树种质资源与参照品种亲缘关系较远,云霄县野生茶树种质资源与广东省凤凰水仙等类型茶树品种资源亲缘关系最接近;尤溪县野生茶树种质资源与参照品种亲缘关系较远。福建云霄县、尤溪县野生茶树种质资源平均等位基因数、有效等位基因数、期望杂合度、Shannon多样性指数(I)分别为3.8966,3.3103、2.4550,2.2908、0.5264,0.4980、0.9463,0.8595,说明遗传多样性较为丰富。群体间Nei’s遗传距离、遗传分化指数(FST)与分子方差分析(AMOVA)结果一致表明群体间存在显著遗传分化,且群体间的遗传变异为21%。本研究对野生茶树种质资源进行鉴定分析,为福建野生茶树种质资源发掘、利用和保护以及育种工作提供一定参考。 展开更多
关键词 茶树 EST-SSR 多样性 亲缘关系
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利用荧光SSR标记鉴定茶树自然杂交后代遗传背景 被引量:6
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作者 杨军 游小妹 陈常颂 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第12期1981-1993,共13页
为研究茶树自然杂交后代遗传背景,分析不同茶树自然杂交后代遗传差异,利用24对EST-SSR标记对82个茶树自然杂交后代和34个福建主要栽培品种进行分子标记,研究茶树自然杂交后代的亲缘关系、群体遗传多样性并进行亲本模拟分析。结果表明,(1... 为研究茶树自然杂交后代遗传背景,分析不同茶树自然杂交后代遗传差异,利用24对EST-SSR标记对82个茶树自然杂交后代和34个福建主要栽培品种进行分子标记,研究茶树自然杂交后代的亲缘关系、群体遗传多样性并进行亲本模拟分析。结果表明,(1)24对SSR标记共检测到157个多态性位点,平均等位位点数为6.542个,Nei’s多样性指数平均为0.588,Shannon’s信息指数平均为1.182,平均观测杂合度和期望杂合度分别为0.577和0.591;(2)遗传距离聚类将各供试样品划分为4类,群体1主要为‘丹桂’及其自然杂交后代;群体2主要为‘丹桂’、‘黄观音’自然杂交后代与福建省乌龙茶品种;群体3主要为‘白鸡冠’及其自然杂交后代;群体4主要为福建省绿茶品种;(3)‘丹桂’、‘白鸡冠’和‘黄观音’自然杂交后代群体与福建主要栽培品种的遗传距离分别为0.079、0.117、0.107;(4)群体1亚群b内‘丹桂’自然杂交后代模拟亲本准确率为77.8%,模拟父本主要为福建乌龙茶品种,与群体2(亚群a)的遗传相似度、遗传分化系数、基因流分别为0.899、0.043、5.480;(5)AMOVA分析结果显示,有88.52%的遗传变异来自群体内部的个体间,表明遗传变异主要发生在群体内。 展开更多
关键词 茶树 亲缘关系 亲本模拟 自然杂交 遗传背景
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茶树品种‘金牡丹’自然杂交后代遗传鉴定 被引量:1
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作者 杨军 孔祥瑞 +2 位作者 郑国华 邱陈华 王让剑 《热带亚热带植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期69-80,共12页
为了对‘金牡丹’茶树自然杂交后代进行遗传鉴定,利用EST-SSR毛细管电泳荧光标记技术对65个金牡丹自然杂交后代进行研究。结果表明,28对SSR标记共扩增出192个等位片段,平均等位基因数(Na)、平均观测杂合度(Ho)及遗传多态信息量(PIC)分别... 为了对‘金牡丹’茶树自然杂交后代进行遗传鉴定,利用EST-SSR毛细管电泳荧光标记技术对65个金牡丹自然杂交后代进行研究。结果表明,28对SSR标记共扩增出192个等位片段,平均等位基因数(Na)、平均观测杂合度(Ho)及遗传多态信息量(PIC)分别为6.86、0.540、0.532。单亲基因型已知时的累积排除概率为0.999,说明选择的28对SSR标记位点具有高度的多态性和较高的排除概率,适用于遗传分析和个体的亲子鉴定。15个‘金牡丹’自然杂交后代的遗传鉴定结果表明,MD44、JMD45、JMD47、JMD32为早生绿茶类型;JMD51、JMD53为闽北肉桂乌龙茶类型;MD2、JMD56为闽南‘铁观音’乌龙茶类型;JMD24、JMD26、JMD29、JMD55、JMD59、JMD27、JMD61为‘黄棪’乌龙茶类型。 展开更多
关键词 茶树 自然杂交 EST-SSR 遗传鉴定 模拟分析
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94个茶树种质资源遗传多样性与亲缘关系分析 被引量:9
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作者 杨军 王让剑 +2 位作者 孔祥瑞 郑国华 邱陈华 《茶叶学报》 2018年第4期186-192,共7页
为实现茶树种质资源的系统分类,利用17对SSR对94个茶树种质资源进行亲缘关系、遗传多样性与群体结构分析。结果表明:6个自然杂交后代群体的亲缘关系分为3种类型,第1种茗科1号(金观音)、金牡丹、悦茗香和白鸡冠的自然杂交后代群体与其亲... 为实现茶树种质资源的系统分类,利用17对SSR对94个茶树种质资源进行亲缘关系、遗传多样性与群体结构分析。结果表明:6个自然杂交后代群体的亲缘关系分为3种类型,第1种茗科1号(金观音)、金牡丹、悦茗香和白鸡冠的自然杂交后代群体与其亲本关系密切;第2种福云6号自然杂交后代群体分别与福云6号和乌龙茶资源亲缘关系较近;第3种紫玫瑰自然杂交后代群体未与紫玫瑰聚类在一起;武夷山茶树种质资源群体遗传多态性最高,分别与肉桂和矮脚乌龙亲缘关系较近。群体结构分析表明,94个茶树种质资源分为3类群,分别为闽南高香资源类群属性、闽北乌龙茶种质资源类群属性、乌龙茶与绿茶种质资源混合类群属性。 展开更多
关键词 自然杂交种 EST-SSR 遗传关系 遗传多样性
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基于EST-SSR荧光标记和毛细管电泳检测技术分析邵武碎铜茶群体遗传多样性与亲缘关系研究 被引量:5
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作者 杨军 孔祥瑞 +3 位作者 王让剑 邱丽玲 郑国华 邱陈华 《茶叶学报》 2019年第4期137-143,共7页
利用EST-SSR毛细管电泳荧光标记技术对29个邵武碎铜茶种质资源进行研究。结果表明:邵武碎铜茶种质资源观测等位基因数为4.94,有效等位基因数为2.93;观测杂合度和期望杂合度平均值分别为0.58和0.59;Shannon多样性指数为1.1298,遗传多样... 利用EST-SSR毛细管电泳荧光标记技术对29个邵武碎铜茶种质资源进行研究。结果表明:邵武碎铜茶种质资源观测等位基因数为4.94,有效等位基因数为2.93;观测杂合度和期望杂合度平均值分别为0.58和0.59;Shannon多样性指数为1.1298,遗传多样性丰富。邵武碎铜茶种质资源与参照品种未聚类在一起,初步说明碎铜茶种质资源具有一定的地域性。碎铜茶种质资源主要分为3个群体,每个群体的资源特点需要进一步鉴定与观察。 展开更多
关键词 茶树 碎铜茶 EST-SSR 亲缘关系 遗传多样性
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瑞香、白鸡冠等18个杂交创新种质主要性状及遗传多样性分析
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作者 钟秋生 杨军 +3 位作者 林郑和 单睿阳 黄婷 陈常颂 《茶叶学报》 2024年第2期27-37,共11页
【目的】对瑞香、白鸡冠等品种茶树自然杂交后代进一步筛选与鉴定,为茶树种质资源发掘、利用和后期育种工作提供一定参考。【方法】对瑞香、白鸡冠品种茶树自然杂交后代18个新品系新梢及成熟叶片的农艺性状进行调查,并利用EST-SSR毛细... 【目的】对瑞香、白鸡冠等品种茶树自然杂交后代进一步筛选与鉴定,为茶树种质资源发掘、利用和后期育种工作提供一定参考。【方法】对瑞香、白鸡冠品种茶树自然杂交后代18个新品系新梢及成熟叶片的农艺性状进行调查,并利用EST-SSR毛细管电泳荧光标记技术进行遗传多样性与亲缘关系分析。【结果】(1)18个杂交后代新品系均为灌木型,树姿为半开张或者开张。BJG10、RX6为小叶种外,其余16个新品系均为中叶种;新品系RX3、RX4、RX7为早生种,一芽一叶期均比对照(‘黄棪’)早7 d以上;瑞香、白鸡冠F1代大部分新品系叶片叶形为长椭圆形,RX2、RX3、RX6、RX7为椭圆形。(2)20对SSR标记共检测到150个多态性位点,平均等位位点数为7.500个,Shannon’s信息指数平均为1.356,平均观测杂合度和期望杂合度分别为0.634和0.632。(3)相似系数聚类显示,新品系BJG6~BJG10相互间亲缘关系较近,且与‘茗科1号’(金观音)亲缘关系较近;新品系RX5、RX7亲缘关系较近,且与母本(‘瑞香’)聚类在一起,说明RX5、RX7遗传信息受母本遗传背景影响较大。【结论】本研究认为,瑞香、白鸡冠等18个杂交后代具有较近的亲缘关系,各新品系具有丰富的遗传多样性。 展开更多
关键词 茶树 杂交创新种质 农艺性状 EST-SSR 遗传多样性
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