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基于重测序的南方高蛋白大豆品种福豆234的遗传变异
被引量：
2
1
作者
张玉梅
萧涵
+2 位作者
蓝新隆
夏春英
林国强
《福建农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第6期652-661,共10页
【目的】揭示南方高蛋白大豆遗传变异提供理论参考。【方法】通过高通量测序技术对南方高蛋白大豆品种福豆234进行全基因组重测序。【结果】共获得64 757 037条Clean reads,测序深度为17×,基因组覆盖度分别达98.08%(1×)和96.2...
【目的】揭示南方高蛋白大豆遗传变异提供理论参考。【方法】通过高通量测序技术对南方高蛋白大豆品种福豆234进行全基因组重测序。【结果】共获得64 757 037条Clean reads,测序深度为17×,基因组覆盖度分别达98.08%(1×)和96.25%(5×)。共鉴定出1 478 393个单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism, SNP)位点和356 739个小片段插入缺失(Small insertion-deletion, Small InDel)位点。其中共鉴定出14 323个非同义SNP突变的基因,4 186个Small Indel的突变基因位于编码区(Coding sequence, CDS)。通过COG(Clusters of orthologous groups of proteins)分析发现信号传导机制、转录、碳水化合物转输和代谢等和KEGG(Kyoto encyclopedia of genes and genomes)分析发现碳代谢、淀粉和蔗糖代谢、氨基酸生物合成、植物激素信号传导、内质网蛋白质加工等通路与福豆234遗传变异相关。此外,本研究以大豆籽粒蛋白质含量数量性状基因座(Quantitative trait locus, QTL)的两个主要区段内的候选基因进行分析,发现有65个基因发生SNP或Small InDel水平的变异,其中,SNP变异类型达10种,Small InDel变异类型达7种。【结论】本研究初步揭示南方高蛋白大豆的遗传变异规律,为高蛋白大豆品种选育和分子标记的开发提供数据支持和理论依据。
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关键词
福豆234
全基因组重测序
单核苷酸多态性
小片段插入缺失
变异
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职称材料
大豆鲜籽粒可溶性糖含量的主基因+多基因遗传分析
被引量：
6
2
作者
张玉梅
蓝新隆
+3 位作者
滕振勇
陆佩兰
林国强
胡润芳
《大豆科学》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第5期520-525,共6页
为明确大豆鲜籽粒可溶性糖含量的遗传规律,应用数量性状主基因+多基因混合遗传模型联合分析方法,检测闽豆7号、福豆234及其杂交后代F_(1)和F_(2)群体鲜籽粒的可溶性糖含量。结果表明:大豆鲜籽粒可溶性糖含量遗传规律符合2MG-EA模型,鲜...
为明确大豆鲜籽粒可溶性糖含量的遗传规律,应用数量性状主基因+多基因混合遗传模型联合分析方法,检测闽豆7号、福豆234及其杂交后代F_(1)和F_(2)群体鲜籽粒的可溶性糖含量。结果表明:大豆鲜籽粒可溶性糖含量遗传规律符合2MG-EA模型,鲜籽粒可溶性糖含量受两对等加性主基因控制,加性效应来自母本闽豆7号,主基因遗传率为72.86%。综上说明在鲜食大豆育种过程中应选择可溶性糖含量相对较高的品种为双亲,且对可溶性糖含量的定向选择宜在早世代进行。
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关键词
大豆
鲜籽粒
可溶性糖含量
主基因+多基因
遗传分析
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职称材料
题名
基于重测序的南方高蛋白大豆品种福豆234的遗传变异
被引量：
2
1
作者
张玉梅
萧涵
蓝新隆
夏春英
林国强
机构
福建省农业科学院作物研究所/福建省特色旱作物品种选育工程技术研究中心/福建省蔬菜遗传育种重点实验室
出处
《福建农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第6期652-661,共10页
基金
福建省科技厅区域发展项目(2023N3001)
福建省科技计划公益类专项(2022R1031006)
福建省财政专项(CXTD2021011-2)。
文摘
【目的】揭示南方高蛋白大豆遗传变异提供理论参考。【方法】通过高通量测序技术对南方高蛋白大豆品种福豆234进行全基因组重测序。【结果】共获得64 757 037条Clean reads,测序深度为17×,基因组覆盖度分别达98.08%(1×)和96.25%(5×)。共鉴定出1 478 393个单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism, SNP)位点和356 739个小片段插入缺失(Small insertion-deletion, Small InDel)位点。其中共鉴定出14 323个非同义SNP突变的基因,4 186个Small Indel的突变基因位于编码区(Coding sequence, CDS)。通过COG(Clusters of orthologous groups of proteins)分析发现信号传导机制、转录、碳水化合物转输和代谢等和KEGG(Kyoto encyclopedia of genes and genomes)分析发现碳代谢、淀粉和蔗糖代谢、氨基酸生物合成、植物激素信号传导、内质网蛋白质加工等通路与福豆234遗传变异相关。此外,本研究以大豆籽粒蛋白质含量数量性状基因座(Quantitative trait locus, QTL)的两个主要区段内的候选基因进行分析,发现有65个基因发生SNP或Small InDel水平的变异,其中,SNP变异类型达10种,Small InDel变异类型达7种。【结论】本研究初步揭示南方高蛋白大豆的遗传变异规律,为高蛋白大豆品种选育和分子标记的开发提供数据支持和理论依据。
关键词
福豆234
全基因组重测序
单核苷酸多态性
小片段插入缺失
变异
Keywords
Fudou 234
whole genome re-sequencing
single nucleotide polymorphism
small InDel
variation
分类号
S565.1 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
大豆鲜籽粒可溶性糖含量的主基因+多基因遗传分析
被引量：
6
2
作者
张玉梅
蓝新隆
滕振勇
陆佩兰
林国强
胡润芳
机构
福建省农业科学院作物研究所/福建省特色旱作物品种选育工程技术研究中心/福建省蔬菜遗传育种重点实验室
福建省
种子总站
出处
《大豆科学》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第5期520-525,共6页
基金
福建省自然科学基金(2020J011372)
福建省蔬菜遗传育种重点实验室开放基金(FJVRC2020-02)
福建省财政专项—福建省农科院特色旱地作物科技创新团队建设项目(CXTD2021011-2)。
文摘
为明确大豆鲜籽粒可溶性糖含量的遗传规律,应用数量性状主基因+多基因混合遗传模型联合分析方法,检测闽豆7号、福豆234及其杂交后代F_(1)和F_(2)群体鲜籽粒的可溶性糖含量。结果表明:大豆鲜籽粒可溶性糖含量遗传规律符合2MG-EA模型,鲜籽粒可溶性糖含量受两对等加性主基因控制,加性效应来自母本闽豆7号,主基因遗传率为72.86%。综上说明在鲜食大豆育种过程中应选择可溶性糖含量相对较高的品种为双亲,且对可溶性糖含量的定向选择宜在早世代进行。
关键词
大豆
鲜籽粒
可溶性糖含量
主基因+多基因
遗传分析
Keywords
soybean
fresh seeds
soluble sugar content
major-gene plus polygenes
genetic analysis
分类号
S565.1 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于重测序的南方高蛋白大豆品种福豆234的遗传变异
张玉梅
萧涵
蓝新隆
夏春英
林国强
《福建农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
2
在线阅读
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职称材料
2
大豆鲜籽粒可溶性糖含量的主基因+多基因遗传分析
张玉梅
蓝新隆
滕振勇
陆佩兰
林国强
胡润芳
《大豆科学》
CAS
CSCD
北大核心
2022
6
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职称材料
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