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2020—2023年福建省鼠及环境中钩端螺旋体调查及病原特征分析
1
作者 刘维俊 韩腾伟 +6 位作者 杨劲松 肖方震 吴生根 曾志伟 刘菁 黄玲琼 徐国英 《中国人兽共患病学报》 北大核心 2025年第8期866-872,共7页
目的探究福建省鼠和环境中钩端螺旋体(简称钩体)携带状况及分离株病原特征,为钩体病防控提供数据支持。方法选取福建省9地市19个县区作为调查点,捕鼠后采集鼠肾标本进行钩体分离培养和核酸检测,并采集水样用于钩体分离培养。分离株经血... 目的探究福建省鼠和环境中钩端螺旋体(简称钩体)携带状况及分离株病原特征,为钩体病防控提供数据支持。方法选取福建省9地市19个县区作为调查点,捕鼠后采集鼠肾标本进行钩体分离培养和核酸检测,并采集水样用于钩体分离培养。分离株经血清凝集试验、16S rRNA扩增和多位点序列分析确定其血清群、基因种和ST型,并通过Mega6.0和BioNu⁃merics软件构建系统进化树及进行UPGMA聚类分析。结果共捕获鼠标本723只,优势鼠种为黄毛鼠,占35.82%(259/723),而后依次是褐家鼠(20.06%,145/723)、黄胸鼠(19.64%,142/723)和针毛鼠(13.97%,101/723)。检测到钩体阳性样本144份,占19.92%(144/723),野栖鼠钩体阳性率高于家栖鼠(χ^(2)=8.48,P<0.05),成年鼠高于幼年鼠(χ^(2)=14.19,P<0.05)。不同鼠种阳性率不同(χ^(2)=46.11,P<0.05),不同地区钩体阳性率也存在差异(χ^(2)=32.113,P<0.05)。从440份鼠标本中共分离获得10株分离株,分离率2.27%(10/440)。基因种鉴定显示10株分离株中,L.borgpetersenii占7株,L.interrogans占3株。MLST分型将10株分离株分为3个ST型,分别为ST1、ST16和ST143。31份水样标本中共分离获得5株分离株,分离率16.13%,均为非致病钩体L.mtsangambouensis。结论虽未在水体中分离获得致病性钩体,但福建省各地区鼠类普遍感染致病性钩体,不同地区鼠类携带钩体型别存在差异,应加强环境和鼠类动物中的钩体监测工作。 展开更多
关键词 钩端螺旋体 鼠类 感染率 基因种 MLST
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2011-2023年福建省登革热流行特征与时空聚集性分析
2
作者 詹美蓉 章灿明 +5 位作者 蔡少健 谢忠杭 吴生根 陈武 欧剑鸣 叶雯婧 《中国人兽共患病学报》 北大核心 2025年第2期200-207,共8页
目的 分析福建省登革热的流行特征与时空聚集性特征,为登革热防控提供科学依据。方法 运用描述流行病学、空间自相关分析和时空扫描法对2011-2023年福建省登革热病例进行分析。结果 2011-2023年,福建省共报告登革热病例3586例,其中本地... 目的 分析福建省登革热的流行特征与时空聚集性特征,为登革热防控提供科学依据。方法 运用描述流行病学、空间自相关分析和时空扫描法对2011-2023年福建省登革热病例进行分析。结果 2011-2023年,福建省共报告登革热病例3586例,其中本地病例2360例,境外输入病例1134例,境内输入病例92例。全省10个地市均有病例报告,88个县区中有81个县区报告了病例。输入病例全年均有,但本地病例的发生具有明显的季节性,本地病例与境内输入主要集中在8-10月份,境外输入以6-10月居多。境外输入病例来源国以东南亚国家为主,但有从东南亚国家向南亚、非洲、美洲等地区蔓延的趋势。福建省登革热分布存在时空聚集性(Moran’s I值介于0.14~0.66,P<0.05),高-高聚集区主要分布在福州、泉州、莆田,时空扫描共探测到3个聚集区,包含1个主要聚集区及2个次要聚集区,主要分布在福州、泉州、莆田、漳州与厦门,聚集时间为7月底至10月份。结论 福建省登革热分布存在明显的时空聚集性,聚集时间为7月底至10月份,高发地区为福州、泉州、莆田、漳州与厦门。对于高聚集区,可在每年本地病例出现之前,提前开展爱国卫生运动、防蚊灭蚊、加强疫情监测、医务人员培训等相关措施,减少因输入造成的登革热本地传播。 展开更多
关键词 登革热 流行特征 时空聚集性
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福建省急性出血性结膜炎流行特征及其暴发的影响因素分析
3
作者 何文祥 李林丰 +2 位作者 朱颖 翁育伟 陈炜 《中国人兽共患病学报》 北大核心 2025年第7期742-748,共7页
目的了解福建地区急性出血性结膜炎(Acute hemorrhagic conjunctivitis,AHC)流行情况及疫情暴发的相关影响因素,为制定有效的疫情防控策略提供参考。方法对福建省AHC流行情况进行描述性统计学分析,对2023年暴发的AHC临床病例标本进行病... 目的了解福建地区急性出血性结膜炎(Acute hemorrhagic conjunctivitis,AHC)流行情况及疫情暴发的相关影响因素,为制定有效的疫情防控策略提供参考。方法对福建省AHC流行情况进行描述性统计学分析,对2023年暴发的AHC临床病例标本进行病原检测、VP1区核苷酸全长序列测定、基因型别鉴定和分析。结果2023年9月份为福建省AHC发病高峰,当月发病人数占全年发病人数的86.39%(5205/6025);发病率处于前3位的地区分别为三明(118.57/10万)、龙岩(53.83/10万)和漳州(16.02/10万);龙岩市AHC发病率在2011—2022年持续12年处于首位。2023年福建省AHC暴发高峰期采集的62例AHC结膜拭子样本经荧光PCR鉴定结果均为CVA24v,测序共获得60条VP1区完整序列,核苷酸同源性为98.7%~100%,氨基酸同源性为98.4%~100%,与广东省中山市2023年毒株的核苷酸同源性最高为99.0%~100%。2023年福建省毒株属于GⅣ基因型,L16I可能为2023年毒株序列特有的氨基酸变异。结论导致AHC流行的病原为CVA24v,其所属的GⅣ基因型是我国现阶段流行的优势型别。今后福建省AHC防控应当聚焦于重点城市,并在每年的9月份之前加强全省AHC监测预警,同时及时跟踪了解相关病原基因变异情况。 展开更多
关键词 急性出血性结膜炎 CVA24v 流行概况 基因型分析
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福建省新型冠状病毒感染多源监测数据解析及其对疫情防控的启示
4
作者 陈武 叶雯婧 +8 位作者 林嘉威 张炎华 黄富林 林琦 邓艳琴 郑奎城 翁育伟 欧剑鸣 吴生根 《中国人兽共患病学报》 北大核心 2025年第9期975-981,共7页
目的基于多维度监测数据,分析我国2022年12月7日(第49周)进一步优化落实新型冠状病毒感染疫情防控措施后,2022年第49周至2023年第5周福建省新型冠状病毒感染流行特征,动态评估人群感染水平及变化趋势,为疫情风险预警、医疗资源调配及社... 目的基于多维度监测数据,分析我国2022年12月7日(第49周)进一步优化落实新型冠状病毒感染疫情防控措施后,2022年第49周至2023年第5周福建省新型冠状病毒感染流行特征,动态评估人群感染水平及变化趋势,为疫情风险预警、医疗资源调配及社会经济影响评价提供科学依据。方法构建多源数据监测体系:具体包括①医疗机构发热门诊(诊室)监测,按周收集全省医疗机构发热门诊就诊人次数及新型冠状病毒核酸和抗原检测阳性数,二级及以上医院住院病例数与重症病例数;②人群核酸检测监测,从全省核酸检测系统,按周获取人群新型冠状病毒核酸单管检测人次数及阳性率;③哨点医院监测,按周收集18家哨点医院流感样病例(ILI)就诊比例,新型冠状病毒与流感病毒核酸检测数据;④新型冠状病毒变异监测,按周系统收集本土及输入性病例基因组序列数据。按周绘制相应线图;采用时间序列分析和分子流行病学方法,结合SEIAR改进模型模拟疫情传播。结果2022年第49周至2023年第5周期间,福建省新型冠状病毒感染疫情呈现三阶段流行特征:①感染高峰阶段(2022年第52周):全省医疗机构发热门诊就诊量达峰值606893人次,人群新型冠状病毒核酸单管阳性率49.2%,哨点医院监测新型冠状病毒阳性率63.8%;②医疗负荷高峰阶段(2023年第2周):住院病例数峰值274460例,重症病例峰值28487例;③疫情回落阶段(2023年第4-5周):发热门诊就诊量较峰值下降96.3%,单管核酸阳性率降至6.3%,哨点医院新型冠状病毒核酸检测阳性率为6.4%。测序508例本土病例均为奥密克戎变异株,以BA.5.2及其亚分支为主(67.4%);测序56例输入性病例,BA.5.2及其亚分支占比50.0%,发现XBB、BQ等重点关注变异株9株(16.1%)。模型预测感染高峰在2022年第52周,住院高峰滞后约10.6天。结论多源数据监测结果表明,福建新型冠状病毒感染疫情发生发展呈现感染高峰、医疗负荷高峰和疫情回落3个阶段,疫情期间病例以BA.5.2为优势株。输入病例存在重点变异株。多源监测数据与模型结合为防控提供重要参考,后续应完善监测体系。 展开更多
关键词 新型冠状病毒感染 监测 预警
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福建省首例人感染H7N9禽流感病例实验室诊断和病毒序列分析 被引量：15
5
作者 翁育伟 张拥军 +8 位作者 谢剑锋 黄萌 陈炜 张炎华 何文祥 吴冰珊 王金章 郑奎城 严延生 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第6期543-546,共4页
目的应用real-time RT-PCR和病毒序列测定等方法对福建省首例人感染H7N9禽流感病例开展实验室诊断。方法采集人感染H7N9禽流感病例呼吸道标本并提取RNA,分别采用甲乙型流感通用引物和探针、季节性流感(包括H3N2、H1N1、H1N1pdm)特异性... 目的应用real-time RT-PCR和病毒序列测定等方法对福建省首例人感染H7N9禽流感病例开展实验室诊断。方法采集人感染H7N9禽流感病例呼吸道标本并提取RNA,分别采用甲乙型流感通用引物和探针、季节性流感(包括H3N2、H1N1、H1N1pdm)特异性引物和探针以及H7N9特异性引物和探针进行real-time RT-PCR检测。利用自行设计的引物扩增病毒基因组节段,测定并分析病毒基因序列。结果 real-time RT-PCR结果表明,应用甲型通用引物扩增结果阳性,乙型及季节性流感(包括H3N2、H1N1以及H1N1pdm)扩增结果均为阴性,特异性H7N9亚型流感病毒扩增结果阳性。序列测定获得的病毒4个节段的序列与已公布的人感染H7N9禽流感病毒序列高度一致。结论病例呼吸道标本中存在人感染H7N9禽流感病毒,病毒的基因与近期国内流行的人感染H7N9禽流感病毒高度类似。 展开更多
关键词 禽流感 H7N9亚型 实验室诊断 序列分析
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福建省首例输入性基孔肯雅热病例的调查与实验室诊断(英文) 被引量：8
6
作者 黄萌 叶雯婧 +7 位作者 李锋平 郑友限 张拥军 洪思让 郑奎城 严延生 欧剑鸣 翁育伟 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第3期216-219,共4页
目的通过实验室诊断及流行病学调查证实福建省首例输入性基孔肯雅热病例。方法调查病例的流行病学史及临床表现,采用病毒核酸检测、测序等方法进行实验室诊断。结果该病例临床表现符合基孔肯雅热特征,荧光PCR、RT-PCR和测序均证实为基... 目的通过实验室诊断及流行病学调查证实福建省首例输入性基孔肯雅热病例。方法调查病例的流行病学史及临床表现,采用病毒核酸检测、测序等方法进行实验室诊断。结果该病例临床表现符合基孔肯雅热特征,荧光PCR、RT-PCR和测序均证实为基孔肯雅病毒感染。流行病学调查表明,该病例的感染地点在东南亚一带,与扩增的部分病毒序列比对的结果一致。结论证实福建省首例输入性基孔肯雅热病例,在流行季节亟需加强对重点人群的监测。 展开更多
关键词 基孔肯雅病毒 流行病学调查 分子诊断 序列分析
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2019—2022年福建省登革热流行病学及本地流行病毒株分子特征分析
7
作者 俞婷婷 阚乃鹏 +1 位作者 林琦 王金章 《中国人兽共患病学报》 北大核心 2025年第4期427-433,共7页
目的了解2019—2022年福建省登革热(DF)流行病学特征及本地流行登革病毒(DENV)的病原学特征,为DF的科学防控提供依据。方法对2019—2022年福建省DF输入病例和本地病例的流行病学特征进行统计分析;对各地区本地流行及部分输入的DENV毒株... 目的了解2019—2022年福建省登革热(DF)流行病学特征及本地流行登革病毒(DENV)的病原学特征,为DF的科学防控提供依据。方法对2019—2022年福建省DF输入病例和本地病例的流行病学特征进行统计分析;对各地区本地流行及部分输入的DENV毒株进行E基因扩增及测序,应用MEGA 6.0软件进行同源性和系统进化分析。结果2019—2022年福建省共报告DF病例1661例,其中输入病例699例,本地病例962例;输入病例主要集中在6—10月,本地病例发病高峰在8—10月;全省10个地市均有输入病例,除龙岩市外各地均有本地病例报告,输入病例中男女性别比(4.07∶1)高于本地病例(0.95∶1),输入病例年龄中位数(43岁)小于本地病例年龄中位数(46岁);输入病例主要来自柬埔寨(474例,67.81%)。本地流行毒株主要为DENV1和DENV4,DENV1 E基因进化树显示各地DENV1型本地流行株均为基因Ⅰ型,可能来源于柬埔寨等东南亚国家或境内其他省份;莆田首次出现DENV4型本地流行,DENV4 E基因进化树显示2株莆田DENV4型本地流行株为基因Ⅱ型,可能来源于新加坡。结论福建省面临DF输入引发本地暴发流行的风险较高,且本地流行区域呈一定程度扩散趋势。需要加强多部门合作,进一步完善监测系统,以及时发现病例并溯源,为DF的科学防控提供依据。 展开更多
关键词 登革热 登革病毒 流行病学特征 E基因 基因进化树
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福建省69株嗜肺军团菌全基因组进化特征分析
8
作者 毛郡杰 金瑞 +3 位作者 梁雪晨 邓玉航 高亚东 李曲文 《中国人兽共患病学报》 北大核心 2025年第7期691-696,共6页
目的通过全面的基因组学分析,了解福建省嗜肺军团菌的遗传多样性、进化特征、潜在的致病力以及可能的耐药机制,为福建省军团菌病防控提供基础数据。方法收集2019—2024年福建省环境来源嗜肺军团菌69株,采用血清凝集的方法检测菌株的血... 目的通过全面的基因组学分析,了解福建省嗜肺军团菌的遗传多样性、进化特征、潜在的致病力以及可能的耐药机制,为福建省军团菌病防控提供基础数据。方法收集2019—2024年福建省环境来源嗜肺军团菌69株,采用血清凝集的方法检测菌株的血清型。对菌株进行全基因组测序和组装;利用VFDB、MEGARes、IslandViewer4、PHASTEST、CRISPRCas‑Finder等开源软件及VRprofile2在线网站预测毒力基因、耐药基因和可移动遗传元件,同时基于单核苷酸多态性(SNP)构建最大似然系统发育树。结果69株菌株血清型以LP1型和LP5型为主,分别检出23株(33.33%)和15株(18.84%)。全基因组测序分析显示,69株嗜肺军团菌基因组大小在3.26~3.81 Mb,GC含量在38.0%~38.3%,ST1880为优势ST型。69株菌均携带mip、iraA、htpB、LPG_RS03055、lspM等与致病力密切相关的毒力基因,多药耐药基因lpeAB的携带率为23.2%(16/69),并且携带多种可移动遗传元件,包括基因组岛、插入序列、噬菌体、CRISPR/Cas等。结论福建省69株环境来源嗜肺军团菌均具有潜在的致病力,并且优势克隆群ST1880的lpeAB携带率较高,显示出其潜在的公共卫生风险,未来的研究和监测工作应重点关注这一克隆群,以便更好地了解和控制其传播。 展开更多
关键词 嗜肺军团菌 全基因组测序 耐药基因 可移动遗传元件
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福建省3例输入性白喉棒状杆菌感染病例流行病学和病原学分析
9
作者 李曲文 梁雪晨 +3 位作者 高亚东 翁顺太 高源 邵祝军 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期590-594,598,共6页
目的对福建省发现的3例输入性白喉病例进行流行病学和病原学分析。方法对3例疑似皮肤白喉患者进行流行病学调查,采集患者皮肤破损的分泌物样品,进行白喉棒状杆菌分离培养。对纯培养的疑似白喉棒状杆菌进行生化鉴定和质谱分析,检测白喉... 目的对福建省发现的3例输入性白喉病例进行流行病学和病原学分析。方法对3例疑似皮肤白喉患者进行流行病学调查,采集患者皮肤破损的分泌物样品,进行白喉棒状杆菌分离培养。对纯培养的疑似白喉棒状杆菌进行生化鉴定和质谱分析,检测白喉棒状杆菌(Diphtheria toxin repressor,dtxR)、(Toxin A,toxA)、(Toxin B,toxB)等毒力相关基因,进行MLST序列分型。结果3例病例有典型的皮肤白喉临床表现,皮肤破损部位均分离到白喉棒状杆菌。2例病例分离到的2株白喉棒状杆菌毒力基因检测结果为dtxR(+)、toxA(-)、toxB(-),MLST型别均为ST-703;1例病例分离的白喉棒状杆菌菌株毒力基因检测结果为dtxR(+)、toxA(+)、toxB(+),MLST型别为ST-248。结论福建省存在白喉输入性风险,非毒原菌亦可引起皮肤白喉。 展开更多
关键词 白喉棒状杆菌 毒力基因 皮肤白喉
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福建省零售新鲜食用菌分离单核细胞增生李斯特菌全基因组测序及耐药分析
10
作者 刘雪杰 陈伟伟 +2 位作者 林共德 张智芳 张天佑 《中国人兽共患病学报》 CSCD 北大核心 2024年第12期1152-1158,共7页
目的了解福建省新鲜食用菌中单核细胞增生李斯特菌(Listeria monocytogenes,Lm)的血清群、ST型、毒力基因、耐药特征等情况。方法对福建省零售环节新鲜食用菌中分离的Lm进行全基因组测序,使用BioNumeric7.6软件对测序数据进行拼接组装,... 目的了解福建省新鲜食用菌中单核细胞增生李斯特菌(Listeria monocytogenes,Lm)的血清群、ST型、毒力基因、耐药特征等情况。方法对福建省零售环节新鲜食用菌中分离的Lm进行全基因组测序,使用BioNumeric7.6软件对测序数据进行拼接组装,进一步分析其血清群、ST型、毒力基因、耐药特征等。结果10株Lm共3种血清群(6株为IIb,3株为IIa,1株为IIc),5种ST型(4株ST5,3株ST8,余3株为ST87、ST9、ST429),以CC5、CC8为优势克隆群。Lm均携带LIPI-1上的6种毒力基因actA、hly、mpl、plcA、plcB、prfA及内化素基因inlA、inlB、inlC、inlE、inlF、inlH、inlJ、inlK,部分携带inlD、inlG、inlL基因。10株Lm均不携带LIPI-3上的基因,2株携带LIPI-4上的部分基因。Lm对头孢西丁的耐药率为100%,对苯唑西林、克林霉素耐药率各为30%。5株Lm对2种及以上抗生素耐药,1株ST87型Lm耐药谱为OXA-CLI-CIP-FOX,2株ST8型Lm耐药谱为CLI-FOX,2株ST5型Lm耐药谱为OXA-FOX。对耐药基因进行预测,发现10株Lm均携带fosX、mprF、norB、sul、Lmo0919抗生素耐药基因。经cgMLST分析,10株Lm聚集在5个不同的进化分支上,每个不同的分支包含1种ST型。本研究中的3株ST8型Lm无等位基因差异,4株ST5型Lm也无等位基因差异,属于同一个克隆,说明同一ST型的Lm可持续存在于不同的新鲜食用菌中。结论福建省零售环节新鲜食用菌中的Lm分离株具有食源性感染人的潜在风险,且耐药情况不容乐观,尤其高毒力多重耐药株的出现,对食品安全及公共卫生的影响应引起警惕。 展开更多
关键词 新鲜食用菌 单核细胞增生李斯特菌 全基因组测序
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福建省36株人源猪链球菌分离株病原学特征分析 被引量：2
11
作者 梁雪晨 高亚东 李曲文 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期161-165,170,共6页
目的了解福建省2005-2023年猪链球菌菌株病原学和基因组特征,分析18年间分离株进化特征,为人感染猪链球菌病防控提供参考依据。方法对36株福建地区分离自人的猪链球菌菌株进行全基因组测序、药物敏感性测试,检测血清型分布、耐药表型和... 目的了解福建省2005-2023年猪链球菌菌株病原学和基因组特征,分析18年间分离株进化特征,为人感染猪链球菌病防控提供参考依据。方法对36株福建地区分离自人的猪链球菌菌株进行全基因组测序、药物敏感性测试,检测血清型分布、耐药表型和基因分型,分析菌株之间的遗传多态性。结果福建省36株人感染猪链球菌分离株以血清2型(97.2%)为主,其次是5型(2.8%);全基因组测序结果显示36株分离株有5种不同的序列类型,以ST1型(58.3%)和ST7型(30.6%)最为常见;药物敏感性测试显示对大环内酯类、四环素和氨基糖苷类药物具有高水平的耐药性。存在多重耐药情况,7重耐药菌株(2.8%),5重耐药菌株(5.6%),4重耐药菌株(47.2%),3重耐药菌株(27.8%);对四环素(100%)、红霉素(83.3%)、克林霉素(83.3%)及复方新诺明(55.6%)耐药率高。分离株携带19种抗生素耐药基因,对8类抗生素产生耐药性,耐药基因分型与观察到的表型直接相关。结论应继续加强对福建地区人感染猪链球菌疫情的监测,针对不同地区的不同优势毒力基因型进行预防;限制抗生素的使用,同时加强对耐药相关可移动元件的监测,以减少潜在的抗微生物药物耐药性。 展开更多
关键词 猪链球菌 血清型 抗生素耐药
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2008-2022年福建省O1群霍乱弧菌人源株基因组特征研究
12
作者 柯自立 张小玄 +5 位作者 徐海滨 高亚东 罗朝晨 黄梦颖 邱玉锋 杨劲松 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第8期708-715,共8页
目的了解福建省O1群霍乱弧菌人源株基因组特征,为深入开展霍乱分子流行病学研究提供依据。方法收集2008-2022年福建省霍乱病例和带菌者来源O1群霍乱弧菌16株,肉汤稀释法检测抗生素最小抑菌浓度(MIC)。运用二代测序技术得到全基因组序列... 目的了解福建省O1群霍乱弧菌人源株基因组特征,为深入开展霍乱分子流行病学研究提供依据。方法收集2008-2022年福建省霍乱病例和带菌者来源O1群霍乱弧菌16株,肉汤稀释法检测抗生素最小抑菌浓度(MIC)。运用二代测序技术得到全基因组序列;利用snippy、Roary、Prokka等开源软件及NCBI、BacWGSTdb等在线分析网站进行核心基因组多位点序列分型(cgMLST)、核心基因组单核苷酸多态性分析(cgSNP)、毒力基因和耐药基因预测、泛基因组多样性的分析。结果福建省霍乱弧菌分为5个ST(sequence type)型别,其中新发现的ST182和ST1480型是当前我国优势克隆群ST75型的进化分支,并与2010年和2013年的台湾株高度同源。产毒株和非产毒株均不同程度地携带各种毒力因子并发生变异;预测出7大类13个耐药基因,其中黏菌素类、四环素类耐药基因携带情况与耐药表型一致。泛基因组学分析发现霍乱弧菌拥有1个开放的泛基因组,Roary聚类分析表现出比cgMLST更高的分辨率。结论福建省O1群霍乱弧菌人源株的基因组结构和功能具有多态性,新发的ST1480型克隆群具有流行潜力,需加强对此类菌株的监测。 展开更多
关键词 霍乱弧菌 全基因组测序 生物信息学分析 核心基因组多位点序列分型 泛基因组
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2015-2018年福建省食源性疾病沙门氏菌监测情况分析 被引量：62
13
作者 刘雪杰 陈伟伟 +3 位作者 傅祎欣 叶玲清 李闽真 马群飞 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第3期223-228,共6页
目的研究2015-2018年福建省哨点医院食源性疾病沙门氏菌感染情况、血清型分布、耐药特征、病因性食品来源,以了解福建省重要食源性疾病的发生情况。方法对10家哨点医院分离的707株沙门氏菌进行血清学分型,依据CLSI推荐的药敏试验抗生素... 目的研究2015-2018年福建省哨点医院食源性疾病沙门氏菌感染情况、血清型分布、耐药特征、病因性食品来源,以了解福建省重要食源性疾病的发生情况。方法对10家哨点医院分离的707株沙门氏菌进行血清学分型,依据CLSI推荐的药敏试验抗生素选择原则、选取14种抗生素进行药敏试验,并对病因性食品进行统计分析。结果707株沙门氏菌主要是鼠伤寒沙门氏菌(57.85%)、其次是肠炎沙门氏菌(15.42%),共涵盖43个血清型;病因性食品以粮食及其制品为主(22.21%),其次是乳与乳制品(16.31%);在对14种抗生素的药敏试验中,沙门氏菌对氨苄西林耐药率最高(73.39%),其次是四环素(68.53%)、头孢唑林(54.65%)。对亚胺培南耐药率最低(1.72%),多重耐药菌逐年增多。结论继续加强食源性疾病监测,提高食品安全隐患的早期识别、预警与防控能力。同时加强食品监管力度,从源头预防控制食源性感染。临床应结合药敏结果,制定合理用药方案,以降低抗生素耐药性影响。 展开更多
关键词 食源性疾病 沙门氏菌 血清分型 病因性食品 耐药
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福建省新型冠状病毒肺炎流行病学特征分析 被引量：45
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作者 欧剑鸣 叶雯婧 +15 位作者 郑奎城 李晓庆 林修全 卢晓丽 谢忠杭 吴生根 陈彩粼 黄峥强 詹美蓉 齐孝旗 蔡少键 林嘉威 陈武 邓艳琴 王灵岚 洪荣涛 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第5期366-371,共6页
目的描述和分析福建省新型冠状病毒肺炎病例的流行病学特征,为防控提供依据。方法选取经中国疾病预防控制信息系统网络直报的福建省新型冠状病毒肺炎病例,回顾性描述该省疫情概况、疾病的三间分布以及聚集性疫情特征。结果截至2020年2... 目的描述和分析福建省新型冠状病毒肺炎病例的流行病学特征,为防控提供依据。方法选取经中国疾病预防控制信息系统网络直报的福建省新型冠状病毒肺炎病例,回顾性描述该省疫情概况、疾病的三间分布以及聚集性疫情特征。结果截至2020年2月21日24时,累计报告病例298例,死亡1例,病死率0.3%。其中确诊病例293例(98.3%),现有疑似病例2例(0.7%),无症状感染者3例(1.0%)。确诊病例中,病情严重程度以普通型肺炎为主199例(67.9%),男女比例1.22∶1,年龄以25~54岁居多(199例,67.9%)。流行曲线表现为单峰流行,确诊病例最早发病时间为1月2日,61.8%病例集中在1月21日-30日间发病。除平潭综合实验区外,其余9个设区市均报告确诊病例,主要分布在福州(71例,24.2%)、莆田(55例,18.8%)、泉州(46例,15.7%)。27个(30.7%)县(市、区)无确诊病例报告。累计报告聚集性疫情50起,涉及病例177例。结论福建省新冠肺炎病例主要为输入性病例,输入性病例以中青年为主,而本地病例则以中老年为主,除平潭外的各地市均有确诊病例报告。输入性病例流行曲线与人员返闽等相吻合,本地病例流行较输入病例晚一周。各设区市均报告聚集性疫情,以家庭性聚集为主。 展开更多
关键词 新型冠状病毒肺炎 流行病学特征 描述性分析
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福建省2011年病毒性脑炎暴发病原Echo30分子流行病学分析 被引量：22
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作者 杨秀惠 严延生 +6 位作者 翁育伟 何爱华 张红榕 陈炜 许江阳 林其财 周勇 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第3期265-269,共5页
目的了解福建省2011年病毒性脑炎暴发的病原特点及福建省近10年Echo30分子流行病学特征。方法应用细胞培养法获得病毒株,微量血清中和试验或RT-PCR序列分析鉴定Echo30血清型,提取病毒RNA核酸,逆转录为cD-NA,分段扩增VP1基因序列全长,测... 目的了解福建省2011年病毒性脑炎暴发的病原特点及福建省近10年Echo30分子流行病学特征。方法应用细胞培养法获得病毒株,微量血清中和试验或RT-PCR序列分析鉴定Echo30血清型,提取病毒RNA核酸,逆转录为cD-NA,分段扩增VP1基因序列全长,测定并分析扩增产物的序列。结果 2011年4月1日-6月2日,从福建省4个县(市)区病毒性脑炎病例标本中分离的病毒经鉴定均为Echo30;VP1基因序列分析显示,泉州市安溪和德化两地流行株高度同源(核苷酸与氨基酸序列同源性分别为99.0%和99.6%),同福安和厦门流行株(核苷酸与氨基酸序列同源性分别为98.5%和100%)核苷酸差异约9%,3个位点氨基酸出现了变异。近10年福建省Echo30分子流行病学分析显示,2011年泉州流行株并非由2005年当地流行株进化而来,而与2008年河南省分离株(HQ625646-Henan/04/2008)同源性最高;近10年福建省Echo30存在多基因型、多谱系的同时传播,并在2006年发现了两株第III新基因型病毒。结论造成2011年福建省病毒性脑炎暴发的病原为Echo30,且至少存在两条不同传播链病毒同时流行。Echo30福建株呈多基因型、多谱系分布流行特点。 展开更多
关键词 病毒性脑炎 ECHO30 VP1基因 分子流行病学
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福建省2008-2017年人间布鲁氏菌病流行特征及分离株MLVA分型研究 被引量：28
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作者 韩腾伟 林代华 +4 位作者 刘菁 刘维俊 肖方震 陈志平 邓艳琴 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期382-388,共7页
目的探讨福建省人间布鲁氏菌病流行特征,并对其分离株进行分子分型,为制定预防控制策略提供依据。方法收集中国疾病预防控制信息系统中2008-2017年福建省布鲁氏菌病报告数据,进行流行特征分析;采用传统生物学鉴定和BCSP31-PCR、AMOS-PCR... 目的探讨福建省人间布鲁氏菌病流行特征,并对其分离株进行分子分型,为制定预防控制策略提供依据。方法收集中国疾病预防控制信息系统中2008-2017年福建省布鲁氏菌病报告数据,进行流行特征分析;采用传统生物学鉴定和BCSP31-PCR、AMOS-PCR、MLVA-16进行布鲁氏菌分离株分子鉴定和分型,并进行聚类分析。结果福建省2008-2017年布鲁氏菌病发病呈逐年上升趋势,年均发病率0.11/10万;疫情波及福建省80%的县区,呈高度散发态势;发病高峰为4-8月;40～64岁发病数占62.7%,60～64岁组发病率最高(0.27/10万);男女比为2.50∶1,农牧民占50.7%。40株布鲁氏菌分离株分子检测结果与传统分型基本相符,为2个种(羊种和猪种)和2个生物型(羊3型和猪3型),其中羊种布鲁氏菌占绝大多数(87.5%);MLVA-16分型将其分为羊种和猪种2个种群,35株羊种菌分为28种基因型,5株猪种菌分为4种基因型,其中26种基因型为单分离株,6种基因型为共享基因型(共14株,35.0%)。同国内147株布鲁氏菌进行聚类分析显示,福建省菌株与广东和内蒙古地区存在4种共享基因型,均为羊种菌,其他部分菌株与外省菌株存在着较近的遗传距离,主要集中在panel 2B上,仅存在1～3个位点的差异。结论福建省布鲁氏菌病流行强度逐年增高,建议相关部门加强传染源的管控、对疫情高发地区的重点人群采取必要防控措施,控制其发生与流行。福建省布鲁氏菌MLVA-16分型显示高度基因多态性,提示MLVA-16可用于遗传多样性分析和分子流行病学溯源调查,可以提高布鲁氏菌病监测能力。 展开更多
关键词 布鲁氏菌病 流行特征 多位点可变数目串联重复序列分析(MLVA-16) 福建省
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福建省2009-2014年登革热流行特征分析 被引量：13
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作者 陈炜 王金章 +5 位作者 张拥军 陈宏彬 吴生根 翁育伟 郑奎城 严延生 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第6期589-591,共3页
目的了解福建省登革热流行特征,为制定防治对策提供依据。方法收集2009—2014年福建省登革热病例资料,建立数据库并分析。结果 2009-2014年福建省共报告登革热病例477例,其中输入性病例200例,本地病例277例,输入性病例全年均有报告,主... 目的了解福建省登革热流行特征,为制定防治对策提供依据。方法收集2009—2014年福建省登革热病例资料,建立数据库并分析。结果 2009-2014年福建省共报告登革热病例477例,其中输入性病例200例,本地病例277例,输入性病例全年均有报告,主要集中在6-10月份;年龄以20~49岁为主,男女比例为1.78∶1,病例主要分布于泉州（63/200）、福州（57/200）、莆田（39/200）。输入来源地遍布东南亚、南亚、非洲、大洋洲、南美洲、拉丁美洲等地区,其中以东南亚地区为主要来源,国内输入地包括广东省、云南省和海南省。本地病例发病主要集中于莆田和南平市（269/277）,发病时间集中在9-10月份,10~69岁间各年龄组之间差距不大,男女比例为0.71∶1。所有病例职业分布以商业服务、家务及待业、农民、学生为主。结论福建省登革热流行仍以输入性病例为主,但输入引起本地暴发的风险较高,需重点加强入境旅客的登革热检疫工作。应加强全省登革热的监测和防蚊、灭蚊工作,防止登革热疫情的暴发。 展开更多
关键词 登革热 输入性病例 本地病例 暴发
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2012-2017年福建省人间布鲁氏菌病血清学监测结果分析 被引量：12
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作者 林代华 韩腾伟 +4 位作者 王加熊 刘菁 肖方震 刘维俊 邓艳琴 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第9期847-851,864,共6页
目的分析福建省人间布鲁氏菌病流行趋势,为制定有效科学的防控措施提供依据。方法根据《全国布鲁氏菌病监测工作方案》和《福建省布鲁氏菌病防控项目实施方案》的要求,在福建省布病重点地区开展监测,对各年度上报数据进行汇总与分析。结... 目的分析福建省人间布鲁氏菌病流行趋势,为制定有效科学的防控措施提供依据。方法根据《全国布鲁氏菌病监测工作方案》和《福建省布鲁氏菌病防控项目实施方案》的要求,在福建省布病重点地区开展监测,对各年度上报数据进行汇总与分析。结果 2012-2017年间,在福建省8个设区市22个监测点共检测布病高危人群血清标本6 713份,检出阳性64份(SAT法),阳性率为0.95%;各类布病职业人群中,以肉类加工和饲养放牧人员阳性率最高,但差异无统计学意义(χ^2=9.972, P>0.05);年龄分布看,30~50年龄组检出最多,但差异无统计学意义(χ^2=11.033, P>0.05);性别分布看,男女性别比为1.66∶1,差异无统计学意义(χ^2=0.642, P>0.05)。在哨点医院开展主动搜索,共检测人群血清1 815份,发现病例62例,阳性率为3.42%。结论 2012-2017年间,福建省闽南沿海地区疫情较重,并有向内陆闽北山区扩散趋势。 展开更多
关键词 布鲁氏菌病 人间 监测 血清学
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2016—2019年福建省结核病耐药监测结果分析 被引量：21
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作者 林建 林淑芳 +4 位作者 戴志松 赵永 周银发 张添林 魏淑贞 《中国防痨杂志》 CAS CSCD 2021年第9期924-928,共5页
目的了解2016—2019年福建省结核病耐药监测点分离的MTB的耐药情况,分析耐药变化趋势,为结核病防控工作提供依据。方法收集2016—2019年全省9个耐药监测点培养阳性的分枝杆菌临床分离株,采用对硝基苯甲酸/噻吩-2-羧酸肼(PNB/TCH)生长试... 目的了解2016—2019年福建省结核病耐药监测点分离的MTB的耐药情况,分析耐药变化趋势,为结核病防控工作提供依据。方法收集2016—2019年全省9个耐药监测点培养阳性的分枝杆菌临床分离株,采用对硝基苯甲酸/噻吩-2-羧酸肼(PNB/TCH)生长试验法进行菌种初步鉴定。对MTB菌株进行异烟肼(INH)、利福平(RFP)、链霉素(Sm)、乙胺丁醇(EMB)、卡那霉素(Km)、氧氟沙星(Ofx)、卷曲霉素(Cm)、丙硫异烟胺(Pto)、对氨基水杨酸(PAS)共9种抗结核药品的敏感性试验,描述耐药谱和耐药水平。结果 1434株MTB菌株中有1261株分离自初治患者,173株分离自复治患者。总耐药率为19.04%(273/1434),单耐药率为11.65%(167/1434),多耐药率为3.56%(51/1434),耐多药率为3.84%(55/1434)。复治患者的总耐药率(28.90%,50/173)和耐多药率(12.14%,21/173)均明显高于初治患者[总耐药率为17.68%(223/1261),耐多药率为2.70%(34/1261)],差异均有统计学意义(χ^(2)=12.419,P=0.000;χ^(2)=36.775,P=0.000)。耐药谱有42种,耐药菌株对9种抗结核药品的任一耐药率依次为:Sm(9.90%,142/1434)>INH(8.30%,119/1434)>RFP(5.93%,85/1434)>Ofx(3.63%,52/1434)>EMB(2.30%,33/1434)>Km(0.98%,14/1434)>Cm(0.77%,11/1434)、PAS(0.77%,11/1434)>Pto(0.63%,9/1434)。2016—2019各年度的总耐药率分别为17.69%(66/373)、22.34%(63/282)、20.31%(78/384)、16.71%(66/395),差异无统计学意义(χ^(2)_(趋势)=0.248,P=0.619)。结论福建省耐药处于较低水平,耐药呈复杂性和多样性,应重视患者的耐药筛查,加强耐药患者的治疗管理。 展开更多
关键词 分枝杆菌 结核 抗药性 监测 福建
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COI基因DNA条形码技术在福建省蜱类鉴定中的应用 被引量：10
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作者 周淑姮 肖方震 +3 位作者 刘维俊 刘菁 韩腾伟 邓艳琴 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第1期25-31,共7页
目的探讨基于线粒体细胞色素C氧化酶亚基I(COI)基因的DNA条形码技术应用于福建省蜱类鉴定的可行性。方法蜱标本经形态学鉴定后提取基因组DNA,PCR扩增COI基因片段,并进行测序和比对,用Kimura-2-parameter模型计算种内及种间遗传距离,以... 目的探讨基于线粒体细胞色素C氧化酶亚基I(COI)基因的DNA条形码技术应用于福建省蜱类鉴定的可行性。方法蜱标本经形态学鉴定后提取基因组DNA,PCR扩增COI基因片段,并进行测序和比对,用Kimura-2-parameter模型计算种内及种间遗传距离,以邻接法构建系统发育树。结果经形态学鉴定,97只蜱隶属于5属12种,遗传距离计算结果显示,种间遗传距离(14.65%~26.79%)显著大于种内遗传距离(0~7.14%);BLAST同源性比对发现GenBank数据库中尚无越原血蜱(Haemophysalis Yeni)与基刺硬蜱(Ixodes spinicoxalis)的COI基因序列,褐黄血蜱(H.flava)、台岛血蜱(H.formosensis)、豪猪血蜱(H.hystricis)、粒形硬蜱(I.granulatus)、微小扇头蜱(Rhipicephalus microplus)与血红扇头蜱(R.sanguineus)的形态学鉴定与DNA条形码鉴定结果一致,但是,龟形花蜱(Amblyomma testudinarium)、台湾革蜱(Dermacentor taiwanensis)、中华硬蜱(I.sinensis)的形态学鉴定与COI基因DNA条形码鉴定结果不一致;系统发育树显示,同一物种的不同个体均形成高支持率的单系,种间分支很明显。结论COI基因DNA条形码测定是一种快速准确的蜱类鉴定新兴技术,但现阶段,COI基因DNA条形码技术尚不能完全脱离传统的形态学鉴定而独立进行,两者应有机结合。 展开更多
关键词 COI基因 蜱类 DNA条形码技术 分子鉴定 系统发育 福建
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