福建省首例输入性基孔肯雅热病例的调查与实验室诊断(英文) 被引量：7

1

作者 黄萌 叶雯婧 +7 位作者 李锋平 郑友限 张拥军 洪思让 郑奎城 严延生 欧剑鸣 翁育伟 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第3期216-219,共4页

目的通过实验室诊断及流行病学调查证实福建省首例输入性基孔肯雅热病例。方法调查病例的流行病学史及临床表现,采用病毒核酸检测、测序等方法进行实验室诊断。结果该病例临床表现符合基孔肯雅热特征,荧光PCR、RT-PCR和测序均证实为基... 目的通过实验室诊断及流行病学调查证实福建省首例输入性基孔肯雅热病例。方法调查病例的流行病学史及临床表现,采用病毒核酸检测、测序等方法进行实验室诊断。结果该病例临床表现符合基孔肯雅热特征,荧光PCR、RT-PCR和测序均证实为基孔肯雅病毒感染。流行病学调查表明,该病例的感染地点在东南亚一带,与扩增的部分病毒序列比对的结果一致。结论证实福建省首例输入性基孔肯雅热病例,在流行季节亟需加强对重点人群的监测。 展开更多

关键词 基孔肯雅病毒 流行病学调查 分子诊断 序列分析

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福建省36株人源猪链球菌分离株病原学特征分析 被引量：2

2

作者 梁雪晨 高亚东 李曲文 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期161-165,170,共6页

目的了解福建省2005-2023年猪链球菌菌株病原学和基因组特征,分析18年间分离株进化特征,为人感染猪链球菌病防控提供参考依据。方法对36株福建地区分离自人的猪链球菌菌株进行全基因组测序、药物敏感性测试,检测血清型分布、耐药表型和... 目的了解福建省2005-2023年猪链球菌菌株病原学和基因组特征,分析18年间分离株进化特征,为人感染猪链球菌病防控提供参考依据。方法对36株福建地区分离自人的猪链球菌菌株进行全基因组测序、药物敏感性测试,检测血清型分布、耐药表型和基因分型,分析菌株之间的遗传多态性。结果福建省36株人感染猪链球菌分离株以血清2型(97.2%)为主,其次是5型(2.8%);全基因组测序结果显示36株分离株有5种不同的序列类型,以ST1型(58.3%)和ST7型(30.6%)最为常见;药物敏感性测试显示对大环内酯类、四环素和氨基糖苷类药物具有高水平的耐药性。存在多重耐药情况,7重耐药菌株(2.8%),5重耐药菌株(5.6%),4重耐药菌株(47.2%),3重耐药菌株(27.8%);对四环素(100%)、红霉素(83.3%)、克林霉素(83.3%)及复方新诺明(55.6%)耐药率高。分离株携带19种抗生素耐药基因,对8类抗生素产生耐药性,耐药基因分型与观察到的表型直接相关。结论应继续加强对福建地区人感染猪链球菌疫情的监测,针对不同地区的不同优势毒力基因型进行预防;限制抗生素的使用,同时加强对耐药相关可移动元件的监测,以减少潜在的抗微生物药物耐药性。 展开更多

关键词 猪链球菌 血清型 抗生素耐药

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福建省2004-2010年登革病毒E蛋白基因序列分析(英文) 被引量：11

3

作者 黄萌 张拥军 +3 位作者 林梅清 王金章 严延生 翁育伟 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第10期973-977,共5页

通过登革病毒包膜蛋白基因序列测定与进化分析,确定2004 2010年间福建省登革病毒的主要来源地。方法提取登革病毒分离株的RNA,扩增病毒外膜蛋白基因,扩增产物经TA克隆后提取质粒并测序,应用相关专业软件做序列分析。结果在测定的12株登... 通过登革病毒包膜蛋白基因序列测定与进化分析,确定2004 2010年间福建省登革病毒的主要来源地。方法提取登革病毒分离株的RNA,扩增病毒外膜蛋白基因,扩增产物经TA克隆后提取质粒并测序,应用相关专业软件做序列分析。结果在测定的12株登革病毒外膜蛋白基因核酸序列中,1、2型病毒的序列长度均为1 485bp,3型为1 479bp。BLAST比对与序列进化树均表明,2004-2010年期间,福建省所分离的登革病毒分离株与东南亚一带流行的毒株一致性最高,福建省与东南亚流行的毒株间具有高度的同源性。结论2004-2010年福建省流行的登革病毒应当是由东南亚一带输入,应加强对该地区入境人员的监测工作。 展开更多

关键词 登革热 包膜蛋白 进化树 贝叶斯 MRBAYES

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气相色谱-质谱联用法检测母乳脂肪中反式脂肪酸 被引量：11

4

作者 林麒 李国波 +2 位作者 葛品 许榕仙 林国斌 《色谱》 CAS CSCD 北大核心 2016年第5期520-527,共8页

建立了母乳中反式脂肪酸（TFAs）的气相色谱-质谱（GC-MS）检测方法,并应用于母乳脂肪中TFAs的检测。母乳用氨水水解,乙醚和石油醚提取脂肪,提取的脂肪加入C21∶0内标,用三氟化硼甲醇溶液在80℃水浴中冷凝回流15 min进行甲酯化,正己烷提... 建立了母乳中反式脂肪酸（TFAs）的气相色谱-质谱（GC-MS）检测方法,并应用于母乳脂肪中TFAs的检测。母乳用氨水水解,乙醚和石油醚提取脂肪,提取的脂肪加入C21∶0内标,用三氟化硼甲醇溶液在80℃水浴中冷凝回流15 min进行甲酯化,正己烷提取,上清液用GC-MS分析,内标法定量。在低、中、高加标水平上验证方法的准确度与精密度,结果显示该方法可用于母乳中18种TFAs及其同分异构体的检测,其中12种TFAs在母乳脂肪中的方法检出限为4.0-47.1 mg/kg,回收率为80%-113%,RSD为2.9%-14.5%（n=6）。TFAs在部分母乳脂样品中检出,含量为9.54-6.9 mg/kg。该方法定性、定量准确,可有效用于母乳中TFAs的检测,但仍存在脂肪酸本底干扰等问题,可结合银离子固相萃取柱预分离技术进一步完善。 展开更多

关键词 气相色谱-质谱 反式脂肪酸 母乳 脂肪

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某养老机构新型冠状病毒肺炎聚集性疫情流行病学特征分析 被引量：6

5

作者 翁顺太 郑巧珍 +7 位作者 林杰 陈敏红 阮宏锦 邱玉锋 陈建辉 谢芳钦 李曲文 郑奎城 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第5期392-395,共4页

目的对某养老机构发生一起新型冠状病毒肺炎(COVID-19)聚集性疫情进行回顾性流行病学调查和分析。方法采用"新型冠状病毒肺炎防控方案(第三版)"推荐的个案调查表和依照"新型冠状病毒肺炎聚集性疫情流行病学调查指南(试... 目的对某养老机构发生一起新型冠状病毒肺炎(COVID-19)聚集性疫情进行回顾性流行病学调查和分析。方法采用"新型冠状病毒肺炎防控方案(第三版)"推荐的个案调查表和依照"新型冠状病毒肺炎聚集性疫情流行病学调查指南(试行第一版)"进行。结果某养老机构有8名护理人员和住院老人感染新冠肺炎,年龄中位为59岁,男、女比例1∶7。于末次暴露后4~15 d确诊。排查出225名密切接触者,无三代院内续发传播;不排除无症状感染存在传染的可能性;病亡1例。结论本次聚集性疫情的感染来源于新冠肺炎确诊病例。建议防控策略应关注养老机构、监管场所等重点部门、重点人群的管控与监测。 展开更多

关键词 新型冠状病毒肺炎 聚集性疫情 养老机构 流行病学调查

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多重套式RT-PCR检测患者凝血块中登革病毒RNA(英文) 被引量：3

6

作者 张拥军 黄萌 +2 位作者 翁育伟 郑友限 王金章 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第8期832-836,共5页

目的建立简便、灵敏、适合于全部血清型登革病毒核酸检测的多重套式RT-PCR体系,检测临床样品中登革病毒RNA,作为实验室辅助诊断的依据。方法利用登革病毒标准株核酸,建立多重RT-PCR检测方法。提取患者凝血块总RNA,分别用一步法RT-PCR及... 目的建立简便、灵敏、适合于全部血清型登革病毒核酸检测的多重套式RT-PCR体系,检测临床样品中登革病毒RNA,作为实验室辅助诊断的依据。方法利用登革病毒标准株核酸,建立多重RT-PCR检测方法。提取患者凝血块总RNA,分别用一步法RT-PCR及多重套式RT-PCR检测。结果通过对检测体系进行优化,多重RT-PCR能够同时检测4种血清型登革病毒核酸。采用多重套式RT-PCR方法,从8例登革热患者凝血块中有4例检测到病毒RNA,而其它核酸检测方法仅检出1例阳性。结论多重套式RT-PCR的方法能够从临床凝血块样品中检测到登革病毒核酸,并同时进行血清学分型,简化了登革病毒核酸检测步骤,有利于对临床样品开展病毒核酸检测。 展开更多

关键词 登革病毒 多重套式RT-PCR 核酸检测

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2012年1株南美洲输入登革1型病毒的基因组特征(英文) 被引量：1

7

作者 张拥军 王金章 +2 位作者 黄萌 吴生根 翁育伟 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第7期665-670,共6页

目的分析2012年1株从南美洲输入登革1型病毒的基因组特征,探索登革病毒的传播规律。方法测定DF1203毒株的全长基因组序列,分析该毒株与97株南美洲登革1型毒株的遗传联系,同时比较该毒株与全球最相似毒株的遗传联系。结果 DF1203毒株的... 目的分析2012年1株从南美洲输入登革1型病毒的基因组特征,探索登革病毒的传播规律。方法测定DF1203毒株的全长基因组序列,分析该毒株与97株南美洲登革1型毒株的遗传联系,同时比较该毒株与全球最相似毒株的遗传联系。结果 DF1203毒株的基因组全长10 735个核苷酸,编码区全长10 179个核苷酸。种系发生分析显示,该毒株与南美洲登革1型毒株存在一定差异,BLAST分析表明DF1203与东南亚毒株存在密切遗传联系,尤其与近年柬埔寨毒株在种系发生树上处于同一分支。结论虽然DF1203的患者来自南美洲苏里南,毒株遗传背景分析却显示与东南亚毒株存在亲密遗传关系。由此表明连续有效的登革病毒监测,尤其是检测分离株的部分或全部基因组序列,对于研究登革病毒传播路径、遗传进化,具有重要意义。 展开更多

关键词 登革病毒 基因组序列 种系发生分析

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高通量测序平台测定混合病毒样品基因组序列(英文)

8

作者 张拥军 陈炜 +5 位作者 翁育伟 谢剑锋 何文祥 吴冰珊 郑奎城 严延生 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第9期884-888,共5页

目的建立RNA病毒基因组的从头测序方法,验证高通量测序平台同时测定不同RNA病毒基因组序列的能力。方法选取日常监测工作中分离的一株EV71毒株和一株季节性流感病毒,提取病毒RNA,制备测序文库,按标准步骤在GS-Junior完成测序反应,分析... 目的建立RNA病毒基因组的从头测序方法,验证高通量测序平台同时测定不同RNA病毒基因组序列的能力。方法选取日常监测工作中分离的一株EV71毒株和一株季节性流感病毒,提取病毒RNA,制备测序文库,按标准步骤在GS-Junior完成测序反应,分析数据。结果共得到超过14万序列片段,总计46.9M碱基,平均读长334bp。初步拼接可以得到914个片段(contig),而以相应参考毒株基因组为标准,一次反应得到EV71全长基因组的99.84%及流感病毒的96.7%。结论高通量测序仪能够同时快速、准确地从头测定多株RNA病毒基因组序列,适合应用于多个病原生物学领域。 展开更多

关键词 高通量测序 肠道病毒71型 流感病毒 基因组

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福州市流行性感冒与气象因素滞后效应分析 被引量：7

9

作者 郑月燕 祝寒松 +5 位作者 叶雯婧 杨林 陈彩粼 吴生根 陈敏红 陈武 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第12期1154-1159,共6页

目的探讨福州市气象因素对流行性感冒的滞后影响,为预警预测提供理论依据。方法对2010年1月-2018年12月福州市日均气压、日均相对湿度、日均气温等气象因素与日流行性感冒发病数进行相关性和滞后性分析。结果福州市共报告流行性感冒7207... 目的探讨福州市气象因素对流行性感冒的滞后影响,为预警预测提供理论依据。方法对2010年1月-2018年12月福州市日均气压、日均相对湿度、日均气温等气象因素与日流行性感冒发病数进行相关性和滞后性分析。结果福州市共报告流行性感冒7207例,男女性别比1.25∶1,4~岁组和0~岁组占比居前,依次为37.82%和29.91%。日均气温与流行性感冒发病呈负相关(r<0),其余呈现正相关(r>0),且存在滞后相关性。气温3℃,滞后7 d时的流感发病风险最高(RR=1.51,95%CI:0.51~4.51),日均气压982 hPa,滞后6 d时的发病风险最高(RR=2.08,95%CI:0.81~5.37)。风速9 m/s,滞后14 d时的发病风险最高(RR=3.43,95%CI:1.28~6.63);滞后1 d后,日累计降雨量越大,保护效应越显著,滞后10 d的保护效应最强,但240 mm,滞后0 d的风险性最高(RR=2.22,95%CI:0.39~12.72)。结论日均气压、日均气温、日均风速和日累计降雨量等气象因素影响福州市流行性感冒发病,且具有一定的滞后性,可以纳入流感预测,为预警预测提供理论依据。 展开更多

关键词 气象因素 流行性感冒 分布滞后非线性模型 滞后性

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固相萃取-在线凝胶渗透色谱-气相色谱-串联质谱法测定水中31种有机氯农药 被引量：13

10

作者 陈海玲 林麒 +3 位作者 王翠玲 陈华峰 华永有 刘丽菁 《理化检验（化学分册）》 CAS CSCD 北大核心 2021年第5期450-458,共9页

建立了固相萃取(SPE)-在线凝胶渗透色谱(GPC)-气相色谱-串联质谱法(GC-MS/M S)测定水中31种有机氯农药(OCPs)含量的方法,并用于福建各地水样的分析。水样以10mL·min^(-1)速率过SPE柱,吹氮10min除去水分,用5mL二氯甲烷以1.0mL·... 建立了固相萃取(SPE)-在线凝胶渗透色谱(GPC)-气相色谱-串联质谱法(GC-MS/M S)测定水中31种有机氯农药(OCPs)含量的方法,并用于福建各地水样的分析。水样以10mL·min^(-1)速率过SPE柱,吹氮10min除去水分,用5mL二氯甲烷以1.0mL·min^(-1)速率过柱洗脱目标物,样品瓶隔夜沥干,用5mL二氯甲烷分2次洗涤,洗涤液合并至洗脱液中,吹氮至0.5mL,供在线GPC净化和GC-MS/M S分析。在线GPC净化中采用GLNpak EV-200色谱柱和体积比为3∶7的丙酮-环己烷混合液;气相色谱以SH-Rxi-5Sil MS型毛细管色谱柱为固定相,在程序升温下进行色谱分离;串联质谱以电子轰击离子(EI)源电离,在多反应监测模式下检测;以基质匹配混合标准溶液系列制作工作曲线,外标法定量。结果显示:水中31种OCPs的质量浓度和其对应的峰面积均在一定范围内呈线性关系,检出限为0.3~8.3ng·L^(-1)。对实际水样进行3个浓度水平的加标回收试验,31种OCPs的回收率为67.0%~123%,测定值的相对标准偏差(n=6)为3.9%~20%。用此方法分析福建省11个地区枯水期的水样(包括海水、地表水和工业废水),结果显示:福建省枯水期各水体中OCPs的检出量为5.2~125.6ng·L^(-1),宁德三都澳(海水)检出OCPs的种类较多(11种),与福建省2006年以前文献报道的数据相比,OCPs检出量较低,且均低于中国或权威组织机构标准规定的限值。 展开更多

关键词 固相萃取 在线凝胶渗透色谱 气相色谱-串联质谱法 有机氯农药 水

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全球西尼罗病毒毒株基因组种系发生分析（英文）

11

作者 游丽斌 王金章 +2 位作者 陈炜 黄萌 张拥军 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第6期511-518,共8页

目的分析世界各地西尼罗病毒(WNV)的基因组特征,探索该病毒在不同地域及宿主间的传播规律。方法根据目前所有WNV全长基因组编码序列,利用BioEdit和MEGA软件,分析不同来源毒株之间的遗传联系。结果根据种系发生分析结果,全球WNV共存在4... 目的分析世界各地西尼罗病毒(WNV)的基因组特征,探索该病毒在不同地域及宿主间的传播规律。方法根据目前所有WNV全长基因组编码序列,利用BioEdit和MEGA软件,分析不同来源毒株之间的遗传联系。结果根据种系发生分析结果,全球WNV共存在4种谱系流行。其中主要的谱系1毒株在6大洲广泛流行,并按地域划分为不同的分支或簇。而谱系2-4毒株较少,主要在非洲和东欧流行。以部分分类明确的毒株为参考,进一步对不同地域、宿主的WNV毒株进行分析,证明部分WNV毒株分布具有一定地方性。结论从基因组水平证明全球WNV毒株具有明显的遗传多样性,对病毒基因组分析有助于追溯其它地区新发和再发WNV病毒的进化以及传播路径。 展开更多

关键词 西尼罗病毒 基因组序列 种系发生分析

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