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2011-2023年福建省登革热流行特征与时空聚集性分析
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作者 詹美蓉 章灿明 +5 位作者 蔡少健 谢忠杭 吴生根 陈武 欧剑鸣 叶雯婧 《中国人兽共患病学报》 北大核心 2025年第2期200-207,共8页
目的 分析福建省登革热的流行特征与时空聚集性特征,为登革热防控提供科学依据。方法 运用描述流行病学、空间自相关分析和时空扫描法对2011-2023年福建省登革热病例进行分析。结果 2011-2023年,福建省共报告登革热病例3586例,其中本地... 目的 分析福建省登革热的流行特征与时空聚集性特征,为登革热防控提供科学依据。方法 运用描述流行病学、空间自相关分析和时空扫描法对2011-2023年福建省登革热病例进行分析。结果 2011-2023年,福建省共报告登革热病例3586例,其中本地病例2360例,境外输入病例1134例,境内输入病例92例。全省10个地市均有病例报告,88个县区中有81个县区报告了病例。输入病例全年均有,但本地病例的发生具有明显的季节性,本地病例与境内输入主要集中在8-10月份,境外输入以6-10月居多。境外输入病例来源国以东南亚国家为主,但有从东南亚国家向南亚、非洲、美洲等地区蔓延的趋势。福建省登革热分布存在时空聚集性(Moran’s I值介于0.14~0.66,P<0.05),高-高聚集区主要分布在福州、泉州、莆田,时空扫描共探测到3个聚集区,包含1个主要聚集区及2个次要聚集区,主要分布在福州、泉州、莆田、漳州与厦门,聚集时间为7月底至10月份。结论 福建省登革热分布存在明显的时空聚集性,聚集时间为7月底至10月份,高发地区为福州、泉州、莆田、漳州与厦门。对于高聚集区,可在每年本地病例出现之前,提前开展爱国卫生运动、防蚊灭蚊、加强疫情监测、医务人员培训等相关措施,减少因输入造成的登革热本地传播。 展开更多
关键词 登革热 流行特征 时空聚集性
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福建省急性出血性结膜炎流行特征及其暴发的影响因素分析
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作者 何文祥 李林丰 +2 位作者 朱颖 翁育伟 陈炜 《中国人兽共患病学报》 北大核心 2025年第7期742-748,共7页
目的了解福建地区急性出血性结膜炎(Acute hemorrhagic conjunctivitis,AHC)流行情况及疫情暴发的相关影响因素,为制定有效的疫情防控策略提供参考。方法对福建省AHC流行情况进行描述性统计学分析,对2023年暴发的AHC临床病例标本进行病... 目的了解福建地区急性出血性结膜炎(Acute hemorrhagic conjunctivitis,AHC)流行情况及疫情暴发的相关影响因素,为制定有效的疫情防控策略提供参考。方法对福建省AHC流行情况进行描述性统计学分析,对2023年暴发的AHC临床病例标本进行病原检测、VP1区核苷酸全长序列测定、基因型别鉴定和分析。结果2023年9月份为福建省AHC发病高峰,当月发病人数占全年发病人数的86.39%(5205/6025);发病率处于前3位的地区分别为三明(118.57/10万)、龙岩(53.83/10万)和漳州(16.02/10万);龙岩市AHC发病率在2011—2022年持续12年处于首位。2023年福建省AHC暴发高峰期采集的62例AHC结膜拭子样本经荧光PCR鉴定结果均为CVA24v,测序共获得60条VP1区完整序列,核苷酸同源性为98.7%~100%,氨基酸同源性为98.4%~100%,与广东省中山市2023年毒株的核苷酸同源性最高为99.0%~100%。2023年福建省毒株属于GⅣ基因型,L16I可能为2023年毒株序列特有的氨基酸变异。结论导致AHC流行的病原为CVA24v,其所属的GⅣ基因型是我国现阶段流行的优势型别。今后福建省AHC防控应当聚焦于重点城市,并在每年的9月份之前加强全省AHC监测预警,同时及时跟踪了解相关病原基因变异情况。 展开更多
关键词 急性出血性结膜炎 CVA24v 流行概况 基因型分析
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福建省首例人感染H7N9禽流感病例实验室诊断和病毒序列分析 被引量:15
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作者 翁育伟 张拥军 +8 位作者 谢剑锋 黄萌 陈炜 张炎华 何文祥 吴冰珊 王金章 郑奎城 严延生 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第6期543-546,共4页
目的应用real-time RT-PCR和病毒序列测定等方法对福建省首例人感染H7N9禽流感病例开展实验室诊断。方法采集人感染H7N9禽流感病例呼吸道标本并提取RNA,分别采用甲乙型流感通用引物和探针、季节性流感(包括H3N2、H1N1、H1N1pdm)特异性... 目的应用real-time RT-PCR和病毒序列测定等方法对福建省首例人感染H7N9禽流感病例开展实验室诊断。方法采集人感染H7N9禽流感病例呼吸道标本并提取RNA,分别采用甲乙型流感通用引物和探针、季节性流感(包括H3N2、H1N1、H1N1pdm)特异性引物和探针以及H7N9特异性引物和探针进行real-time RT-PCR检测。利用自行设计的引物扩增病毒基因组节段,测定并分析病毒基因序列。结果 real-time RT-PCR结果表明,应用甲型通用引物扩增结果阳性,乙型及季节性流感(包括H3N2、H1N1以及H1N1pdm)扩增结果均为阴性,特异性H7N9亚型流感病毒扩增结果阳性。序列测定获得的病毒4个节段的序列与已公布的人感染H7N9禽流感病毒序列高度一致。结论病例呼吸道标本中存在人感染H7N9禽流感病毒,病毒的基因与近期国内流行的人感染H7N9禽流感病毒高度类似。 展开更多
关键词 禽流感 H7N9亚型 实验室诊断 序列分析
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福建省首例输入性基孔肯雅热病例的调查与实验室诊断(英文) 被引量:7
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作者 黄萌 叶雯婧 +7 位作者 李锋平 郑友限 张拥军 洪思让 郑奎城 严延生 欧剑鸣 翁育伟 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第3期216-219,共4页
目的通过实验室诊断及流行病学调查证实福建省首例输入性基孔肯雅热病例。方法调查病例的流行病学史及临床表现,采用病毒核酸检测、测序等方法进行实验室诊断。结果该病例临床表现符合基孔肯雅热特征,荧光PCR、RT-PCR和测序均证实为基... 目的通过实验室诊断及流行病学调查证实福建省首例输入性基孔肯雅热病例。方法调查病例的流行病学史及临床表现,采用病毒核酸检测、测序等方法进行实验室诊断。结果该病例临床表现符合基孔肯雅热特征,荧光PCR、RT-PCR和测序均证实为基孔肯雅病毒感染。流行病学调查表明,该病例的感染地点在东南亚一带,与扩增的部分病毒序列比对的结果一致。结论证实福建省首例输入性基孔肯雅热病例,在流行季节亟需加强对重点人群的监测。 展开更多
关键词 基孔肯雅病毒 流行病学调查 分子诊断 序列分析
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2019—2022年福建省登革热流行病学及本地流行病毒株分子特征分析
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作者 俞婷婷 阚乃鹏 +1 位作者 林琦 王金章 《中国人兽共患病学报》 北大核心 2025年第4期427-433,共7页
目的了解2019—2022年福建省登革热(DF)流行病学特征及本地流行登革病毒(DENV)的病原学特征,为DF的科学防控提供依据。方法对2019—2022年福建省DF输入病例和本地病例的流行病学特征进行统计分析;对各地区本地流行及部分输入的DENV毒株... 目的了解2019—2022年福建省登革热(DF)流行病学特征及本地流行登革病毒(DENV)的病原学特征,为DF的科学防控提供依据。方法对2019—2022年福建省DF输入病例和本地病例的流行病学特征进行统计分析;对各地区本地流行及部分输入的DENV毒株进行E基因扩增及测序,应用MEGA 6.0软件进行同源性和系统进化分析。结果2019—2022年福建省共报告DF病例1661例,其中输入病例699例,本地病例962例;输入病例主要集中在6—10月,本地病例发病高峰在8—10月;全省10个地市均有输入病例,除龙岩市外各地均有本地病例报告,输入病例中男女性别比(4.07∶1)高于本地病例(0.95∶1),输入病例年龄中位数(43岁)小于本地病例年龄中位数(46岁);输入病例主要来自柬埔寨(474例,67.81%)。本地流行毒株主要为DENV1和DENV4,DENV1 E基因进化树显示各地DENV1型本地流行株均为基因Ⅰ型,可能来源于柬埔寨等东南亚国家或境内其他省份;莆田首次出现DENV4型本地流行,DENV4 E基因进化树显示2株莆田DENV4型本地流行株为基因Ⅱ型,可能来源于新加坡。结论福建省面临DF输入引发本地暴发流行的风险较高,且本地流行区域呈一定程度扩散趋势。需要加强多部门合作,进一步完善监测系统,以及时发现病例并溯源,为DF的科学防控提供依据。 展开更多
关键词 登革热 登革病毒 流行病学特征 E基因 基因进化树
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福建省69株嗜肺军团菌全基因组进化特征分析
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作者 毛郡杰 金瑞 +3 位作者 梁雪晨 邓玉航 高亚东 李曲文 《中国人兽共患病学报》 北大核心 2025年第7期691-696,共6页
目的通过全面的基因组学分析,了解福建省嗜肺军团菌的遗传多样性、进化特征、潜在的致病力以及可能的耐药机制,为福建省军团菌病防控提供基础数据。方法收集2019—2024年福建省环境来源嗜肺军团菌69株,采用血清凝集的方法检测菌株的血... 目的通过全面的基因组学分析,了解福建省嗜肺军团菌的遗传多样性、进化特征、潜在的致病力以及可能的耐药机制,为福建省军团菌病防控提供基础数据。方法收集2019—2024年福建省环境来源嗜肺军团菌69株,采用血清凝集的方法检测菌株的血清型。对菌株进行全基因组测序和组装;利用VFDB、MEGARes、IslandViewer4、PHASTEST、CRISPRCas‑Finder等开源软件及VRprofile2在线网站预测毒力基因、耐药基因和可移动遗传元件,同时基于单核苷酸多态性(SNP)构建最大似然系统发育树。结果69株菌株血清型以LP1型和LP5型为主,分别检出23株(33.33%)和15株(18.84%)。全基因组测序分析显示,69株嗜肺军团菌基因组大小在3.26~3.81 Mb,GC含量在38.0%~38.3%,ST1880为优势ST型。69株菌均携带mip、iraA、htpB、LPG_RS03055、lspM等与致病力密切相关的毒力基因,多药耐药基因lpeAB的携带率为23.2%(16/69),并且携带多种可移动遗传元件,包括基因组岛、插入序列、噬菌体、CRISPR/Cas等。结论福建省69株环境来源嗜肺军团菌均具有潜在的致病力,并且优势克隆群ST1880的lpeAB携带率较高,显示出其潜在的公共卫生风险,未来的研究和监测工作应重点关注这一克隆群,以便更好地了解和控制其传播。 展开更多
关键词 嗜肺军团菌 全基因组测序 耐药基因 可移动遗传元件
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福建省2008-2017年人间布鲁氏菌病流行特征及分离株MLVA分型研究 被引量:28
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作者 韩腾伟 林代华 +4 位作者 刘菁 刘维俊 肖方震 陈志平 邓艳琴 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期382-388,共7页
目的探讨福建省人间布鲁氏菌病流行特征,并对其分离株进行分子分型,为制定预防控制策略提供依据。方法收集中国疾病预防控制信息系统中2008-2017年福建省布鲁氏菌病报告数据,进行流行特征分析;采用传统生物学鉴定和BCSP31-PCR、AMOS-PCR... 目的探讨福建省人间布鲁氏菌病流行特征,并对其分离株进行分子分型,为制定预防控制策略提供依据。方法收集中国疾病预防控制信息系统中2008-2017年福建省布鲁氏菌病报告数据,进行流行特征分析;采用传统生物学鉴定和BCSP31-PCR、AMOS-PCR、MLVA-16进行布鲁氏菌分离株分子鉴定和分型,并进行聚类分析。结果福建省2008-2017年布鲁氏菌病发病呈逐年上升趋势,年均发病率0.11/10万;疫情波及福建省80%的县区,呈高度散发态势;发病高峰为4-8月;40~64岁发病数占62.7%,60~64岁组发病率最高(0.27/10万);男女比为2.50∶1,农牧民占50.7%。40株布鲁氏菌分离株分子检测结果与传统分型基本相符,为2个种(羊种和猪种)和2个生物型(羊3型和猪3型),其中羊种布鲁氏菌占绝大多数(87.5%);MLVA-16分型将其分为羊种和猪种2个种群,35株羊种菌分为28种基因型,5株猪种菌分为4种基因型,其中26种基因型为单分离株,6种基因型为共享基因型(共14株,35.0%)。同国内147株布鲁氏菌进行聚类分析显示,福建省菌株与广东和内蒙古地区存在4种共享基因型,均为羊种菌,其他部分菌株与外省菌株存在着较近的遗传距离,主要集中在panel 2B上,仅存在1~3个位点的差异。结论福建省布鲁氏菌病流行强度逐年增高,建议相关部门加强传染源的管控、对疫情高发地区的重点人群采取必要防控措施,控制其发生与流行。福建省布鲁氏菌MLVA-16分型显示高度基因多态性,提示MLVA-16可用于遗传多样性分析和分子流行病学溯源调查,可以提高布鲁氏菌病监测能力。 展开更多
关键词 布鲁氏菌病 流行特征 多位点可变数目串联重复序列分析(MLVA-16) 福建省
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福建省MSM哨点监测HIV新近感染影响因素及分子流行特征研究 被引量:11
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作者 吴守丽 白玛央宗 +6 位作者 张春阳 林勋 卢晓丽 王征桦 谢美榕 颜苹苹 陈亮 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第5期451-457,共7页
目的了解福建省MSM人群HIV新近感染状况,探讨其分子流行特征和相关影响因素,为制定艾滋病防治策略提供科学依据。方法对福建省2019年MSM哨点监测人群HIV抗体阳性样本采用HIV-1限制性抗原亲和力酶联免疫法(简称LAg-Avidity EIA)进行新近... 目的了解福建省MSM人群HIV新近感染状况,探讨其分子流行特征和相关影响因素,为制定艾滋病防治策略提供科学依据。方法对福建省2019年MSM哨点监测人群HIV抗体阳性样本采用HIV-1限制性抗原亲和力酶联免疫法(简称LAg-Avidity EIA)进行新近感染检测,用多因素Logistic回归分析其影响因素,通过RT-PCR扩增pol和gag区,利用系统进化树和HIV db Program软件对序列进行基因亚型和耐药突变分析。结果福建省2019年哨点监测MSM人群863人,其中总的HIV抗体阳性率为12.17%(105/863),HIV新近感染率为11.97%;Logistic回归分析显示,样本来源和最近6个月内同性肛交安全套使用频率是新近感染的影响因素;基因亚型以CRF07_BC(47.61%)和CRF01_AE(38.10%)为主,其次为CRF55-01B(9.52%)、B亚型(4.76%);HIV-1耐药率为6.67%(1/15),其中15例对蛋白酶类抑制剂、核苷类逆转录抑制剂均敏感;1例对非核苷类逆转录酶抑制剂efavirenz(EFV)和nevirapine(NVP)产生高度耐药,1例为潜在耐药。结论福建省2019年哨点监测MSM人群HIV新近感染率处于较高水平,多种亚型并存,发现原发耐药株传播,应加强对HIV新近感染者的分子流行特征变化趋势以及原发耐药传播的动态监测,及时调整防控策略,有效控制福建省艾滋病感染与传播。 展开更多
关键词 HIV 新近感染 影响因素 亚型 耐药
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福建省MSM人群中HIV-1感染者原发性耐药基因突变研究 被引量:12
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作者 谢关榕 严延生 +3 位作者 颜苹苹 吴守丽 陈舸 张春阳 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第1期27-29,42,共4页
目的研究我省男男性行为者(MSM)中未经抗病毒治疗的人类免疫缺陷病毒(HIV)感染者的原发性基因耐药性突变发生情况,为该人群的抗病毒治疗药物选择提供依据。方法采集福建省尚未接受抗病毒治疗的MSM HIV-1感染者的外周静脉抗凝全血,分离血... 目的研究我省男男性行为者(MSM)中未经抗病毒治疗的人类免疫缺陷病毒(HIV)感染者的原发性基因耐药性突变发生情况,为该人群的抗病毒治疗药物选择提供依据。方法采集福建省尚未接受抗病毒治疗的MSM HIV-1感染者的外周静脉抗凝全血,分离血浆,提取血浆中HIV RNA,用RT-PCR方法扩增HIV pol区蛋白酶基因全序列与部分逆转录酶序列。所得扩增片段进行序列测定后,数据运用Contig Express拼接编辑校正后上传至斯坦福大学HIV耐药数据库进行比对,同时运用Bio-Edit和Mega等软件进行系统发生分析。结果获得50份HIV-1分离株完整的PR和RT基因序列,其中60%(30/50)为01_AE重组亚型,18%(9/50)为B亚型,20%(10/50)为07_BC重组亚型,1例08_BC重组亚型。耐药分析显示,1例发生PI(蛋白酶抑制剂)药物的主要耐药突变M46I,造成对NFV中度耐药。10例样本出现NNRTIs和NRTIS的耐药相关突变,仅1例解释为对NNRTIs的潜在低水平耐药,由V179E引起。结论福建省MSM HIV-1感染者的原发性耐药突变发生率低,有利于今后该人群抗病毒治疗工作的开展,但需加强监控该人群耐药毒株的传播。 展开更多
关键词 人类免疫缺陷病毒 男男性行为者 耐药 基因突变
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福建省动物宿主感染巴贝虫调查研究 被引量:4
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作者 肖方震 林代华 +3 位作者 刘维俊 韩腾伟 周淑姮 邓艳琴 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第9期789-792,799,共5页
目的了解福建省动物宿主感染巴贝虫状况。方法 2014-2016年本中心在福建各地捕鼠,笼日法捕鼠,采集鼠心脏血,同时采集牛、羊和狗的血液样本,采用PCR扩增巴贝虫18SrRNA基因,感染率的比较采用χ2检验或Fisher’s确切概率法。结果调查共布... 目的了解福建省动物宿主感染巴贝虫状况。方法 2014-2016年本中心在福建各地捕鼠,笼日法捕鼠,采集鼠心脏血,同时采集牛、羊和狗的血液样本,采用PCR扩增巴贝虫18SrRNA基因,感染率的比较采用χ2检验或Fisher’s确切概率法。结果调查共布放鼠笼5 917笼次,捕鼠381只,鼠密度为6.44%。全省鼠类巴贝虫的感染率7.61%。家栖鼠中仅3只感染巴贝虫,感染率为1.68%。野鼠中26只感染巴贝虫,感染率为12.87%。野鼠感染率远高于家鼠,差异存在统计学意义(P<0.05)。地区分布看,闽中地区感染率最高,其次为闽东,闽南地区感染率最低,差异存在统计学意义(P<0.05)。其他动物,牛的血样未检出巴贝虫,狗和羊的血样中各1只检出巴贝虫,感染率分别为1.79%和0.55%。鼠类的巴贝虫感染率高于其他动物的感染率,差异存在统计学意义(P<0.05)。序列分析显示鼠类感染的均为田鼠巴贝虫。而犬中检出的巴贝虫为犬巴贝虫。结论福建省巴贝虫宿主动物中鼠类尤其是野鼠,感染率最高,可能是我省巴贝虫最重要的宿主。 展开更多
关键词 巴贝虫 宿主动物 调查 福建
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福建省北部地区鼠类钩端螺旋体感染状况及分离株分子特征研究 被引量:3
11
作者 刘维俊 王加熊 +4 位作者 肖方震 韩腾伟 刘菁 曾志伟 徐国英 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第9期807-812,共6页
目的了解福建省北部地区鼠类钩端螺旋体(钩体)感染状况及分子特征。方法对捕获的鼠类进行信息登记,采集鼠肾进行PCR检测,确定其感染状况。EMJH培养基用于鼠肾标本的钩端螺旋体菌株分离。应用MAT方法对分离株进行血清群鉴定。分别采用16S... 目的了解福建省北部地区鼠类钩端螺旋体(钩体)感染状况及分子特征。方法对捕获的鼠类进行信息登记,采集鼠肾进行PCR检测,确定其感染状况。EMJH培养基用于鼠肾标本的钩端螺旋体菌株分离。应用MAT方法对分离株进行血清群鉴定。分别采用16S rRNA、MLST和PFGE的方法对分离株进行分子分型。结果共捕获鼠类227只,检出感染钩端螺旋体的鼠类27只,检出率为11.89%,野栖鼠检出率高于家栖鼠,雄性鼠检出率高于雌性鼠。共分离到4株钩端螺旋体分离株,分离率为1.76%(4/227)。血清学分群显示4株分离株均为黄疸出血群。基因种分型显示4株分离株均为Leptospira interrogans。MLST分型将4株分离株分为2个ST型,PC29、PC30为ST1型,JY19、JY37为ST17型。4株分离株呈现2种PFGE带型,其中,PC29、PC30与黄疸出血群参考株带型一致,JY19、JY37与波摩那群带型具有较高相似度,聚类关系相对较近。结论福建省北部地区的鼠类中存在钩端螺旋体感染。黄疸出血群和Leptospira interrogans分别为福建省北部地区钩端螺旋体的优势血清群和优势基因种,具有不止一种的ST型和PFGE带型,且ST型与PFGE带型呈现地域差异。 展开更多
关键词 钩端螺旋体 鼠类 血清群 基因种 MLST PFGE
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福建省3例输入性白喉棒状杆菌感染病例流行病学和病原学分析
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作者 李曲文 梁雪晨 +3 位作者 高亚东 翁顺太 高源 邵祝军 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期590-594,598,共6页
目的对福建省发现的3例输入性白喉病例进行流行病学和病原学分析。方法对3例疑似皮肤白喉患者进行流行病学调查,采集患者皮肤破损的分泌物样品,进行白喉棒状杆菌分离培养。对纯培养的疑似白喉棒状杆菌进行生化鉴定和质谱分析,检测白喉... 目的对福建省发现的3例输入性白喉病例进行流行病学和病原学分析。方法对3例疑似皮肤白喉患者进行流行病学调查,采集患者皮肤破损的分泌物样品,进行白喉棒状杆菌分离培养。对纯培养的疑似白喉棒状杆菌进行生化鉴定和质谱分析,检测白喉棒状杆菌(Diphtheria toxin repressor,dtxR)、(Toxin A,toxA)、(Toxin B,toxB)等毒力相关基因,进行MLST序列分型。结果3例病例有典型的皮肤白喉临床表现,皮肤破损部位均分离到白喉棒状杆菌。2例病例分离到的2株白喉棒状杆菌毒力基因检测结果为dtxR(+)、toxA(-)、toxB(-),MLST型别均为ST-703;1例病例分离的白喉棒状杆菌菌株毒力基因检测结果为dtxR(+)、toxA(+)、toxB(+),MLST型别为ST-248。结论福建省存在白喉输入性风险,非毒原菌亦可引起皮肤白喉。 展开更多
关键词 白喉棒状杆菌 毒力基因 皮肤白喉
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福建省零售新鲜食用菌分离单核细胞增生李斯特菌全基因组测序及耐药分析
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作者 刘雪杰 陈伟伟 +2 位作者 林共德 张智芳 张天佑 《中国人兽共患病学报》 CSCD 北大核心 2024年第12期1152-1158,共7页
目的了解福建省新鲜食用菌中单核细胞增生李斯特菌(Listeria monocytogenes,Lm)的血清群、ST型、毒力基因、耐药特征等情况。方法对福建省零售环节新鲜食用菌中分离的Lm进行全基因组测序,使用BioNumeric7.6软件对测序数据进行拼接组装,... 目的了解福建省新鲜食用菌中单核细胞增生李斯特菌(Listeria monocytogenes,Lm)的血清群、ST型、毒力基因、耐药特征等情况。方法对福建省零售环节新鲜食用菌中分离的Lm进行全基因组测序,使用BioNumeric7.6软件对测序数据进行拼接组装,进一步分析其血清群、ST型、毒力基因、耐药特征等。结果10株Lm共3种血清群(6株为IIb,3株为IIa,1株为IIc),5种ST型(4株ST5,3株ST8,余3株为ST87、ST9、ST429),以CC5、CC8为优势克隆群。Lm均携带LIPI-1上的6种毒力基因actA、hly、mpl、plcA、plcB、prfA及内化素基因inlA、inlB、inlC、inlE、inlF、inlH、inlJ、inlK,部分携带inlD、inlG、inlL基因。10株Lm均不携带LIPI-3上的基因,2株携带LIPI-4上的部分基因。Lm对头孢西丁的耐药率为100%,对苯唑西林、克林霉素耐药率各为30%。5株Lm对2种及以上抗生素耐药,1株ST87型Lm耐药谱为OXA-CLI-CIP-FOX,2株ST8型Lm耐药谱为CLI-FOX,2株ST5型Lm耐药谱为OXA-FOX。对耐药基因进行预测,发现10株Lm均携带fosX、mprF、norB、sul、Lmo0919抗生素耐药基因。经cgMLST分析,10株Lm聚集在5个不同的进化分支上,每个不同的分支包含1种ST型。本研究中的3株ST8型Lm无等位基因差异,4株ST5型Lm也无等位基因差异,属于同一个克隆,说明同一ST型的Lm可持续存在于不同的新鲜食用菌中。结论福建省零售环节新鲜食用菌中的Lm分离株具有食源性感染人的潜在风险,且耐药情况不容乐观,尤其高毒力多重耐药株的出现,对食品安全及公共卫生的影响应引起警惕。 展开更多
关键词 新鲜食用菌 单核细胞增生李斯特菌 全基因组测序
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福建省非典型 O1群埃尔托型霍乱弧菌的研究
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作者 陈爱平 郑恩惠 +5 位作者 李曲文 徐海滨 杨劲松 王灵岚 郑金凤 严延生 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第8期787-792,共6页
目的探索非典型O1群埃尔托型霍乱弧菌在福建省1962-2005年霍乱菌株中的存在及其意义。方法选择1962-2005年代表性霍乱菌株69株(稻叶21、小川48),运用PCR技术进行ctxB、tcpA、rstR、hlyA各毒力因子的古典型(Cl)和埃尔托型(El)基因的扩增... 目的探索非典型O1群埃尔托型霍乱弧菌在福建省1962-2005年霍乱菌株中的存在及其意义。方法选择1962-2005年代表性霍乱菌株69株(稻叶21、小川48),运用PCR技术进行ctxB、tcpA、rstR、hlyA各毒力因子的古典型(Cl)和埃尔托型(El)基因的扩增;同时对部分菌株的ctxB和rstR基因的序列进行测定和比对;分析福建省O1群埃尔托型霍乱弧菌(EVC)中非典型菌株出现的时间和存在意义。结果 1962年福建省分离的O1群EVC菌株中携带有ctxB-Cl、tcpA-Cl、hlyA-Cl基因;rstR-Cl基因仅在1994-2000年的霍乱菌株中检出。序列比对结果发现ctxB基因出现新的204位碱基突变位点(T→G);同时报道两种新的ctxB基因型别(10和11),且发现存在于同一个菌株中;ctxB基因型11的115位碱基为C,表现为古典型ctxB位点特征,203位碱基为T,表现为埃尔托型ctxB位点特征。结论福建省在1962年的O1群EVC菌株中就出现杂合有ctxB-Cl、tcpA-Cl、hlyA-Cl基因的非典型EVC菌株,是迄今为止报道出现非典型EVC最早的年代;1994年以后出现整合有rstR-Cl基因的非典型EVC菌株。另外,在福建省O1群EVC中存在国内外未曾报道的新的ctxB碱基突变位点和ctxB基因型别;同时在同一菌株中存在不同的ctxB基因型别杂合形式;ctxB序列也存在不同生物型别的特异位点组合形式。福建省O1群EVC表现为独特的地方性分子特征。 展开更多
关键词 霍乱弧菌 毒力基因 等位基因 序列分析
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福建省36株人源猪链球菌分离株病原学特征分析 被引量:2
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作者 梁雪晨 高亚东 李曲文 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期161-165,170,共6页
目的了解福建省2005-2023年猪链球菌菌株病原学和基因组特征,分析18年间分离株进化特征,为人感染猪链球菌病防控提供参考依据。方法对36株福建地区分离自人的猪链球菌菌株进行全基因组测序、药物敏感性测试,检测血清型分布、耐药表型和... 目的了解福建省2005-2023年猪链球菌菌株病原学和基因组特征,分析18年间分离株进化特征,为人感染猪链球菌病防控提供参考依据。方法对36株福建地区分离自人的猪链球菌菌株进行全基因组测序、药物敏感性测试,检测血清型分布、耐药表型和基因分型,分析菌株之间的遗传多态性。结果福建省36株人感染猪链球菌分离株以血清2型(97.2%)为主,其次是5型(2.8%);全基因组测序结果显示36株分离株有5种不同的序列类型,以ST1型(58.3%)和ST7型(30.6%)最为常见;药物敏感性测试显示对大环内酯类、四环素和氨基糖苷类药物具有高水平的耐药性。存在多重耐药情况,7重耐药菌株(2.8%),5重耐药菌株(5.6%),4重耐药菌株(47.2%),3重耐药菌株(27.8%);对四环素(100%)、红霉素(83.3%)、克林霉素(83.3%)及复方新诺明(55.6%)耐药率高。分离株携带19种抗生素耐药基因,对8类抗生素产生耐药性,耐药基因分型与观察到的表型直接相关。结论应继续加强对福建地区人感染猪链球菌疫情的监测,针对不同地区的不同优势毒力基因型进行预防;限制抗生素的使用,同时加强对耐药相关可移动元件的监测,以减少潜在的抗微生物药物耐药性。 展开更多
关键词 猪链球菌 血清型 抗生素耐药
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2015-2018年福建省食源性疾病沙门氏菌监测情况分析 被引量:62
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作者 刘雪杰 陈伟伟 +3 位作者 傅祎欣 叶玲清 李闽真 马群飞 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第3期223-228,共6页
目的研究2015-2018年福建省哨点医院食源性疾病沙门氏菌感染情况、血清型分布、耐药特征、病因性食品来源,以了解福建省重要食源性疾病的发生情况。方法对10家哨点医院分离的707株沙门氏菌进行血清学分型,依据CLSI推荐的药敏试验抗生素... 目的研究2015-2018年福建省哨点医院食源性疾病沙门氏菌感染情况、血清型分布、耐药特征、病因性食品来源,以了解福建省重要食源性疾病的发生情况。方法对10家哨点医院分离的707株沙门氏菌进行血清学分型,依据CLSI推荐的药敏试验抗生素选择原则、选取14种抗生素进行药敏试验,并对病因性食品进行统计分析。结果707株沙门氏菌主要是鼠伤寒沙门氏菌(57.85%)、其次是肠炎沙门氏菌(15.42%),共涵盖43个血清型;病因性食品以粮食及其制品为主(22.21%),其次是乳与乳制品(16.31%);在对14种抗生素的药敏试验中,沙门氏菌对氨苄西林耐药率最高(73.39%),其次是四环素(68.53%)、头孢唑林(54.65%)。对亚胺培南耐药率最低(1.72%),多重耐药菌逐年增多。结论继续加强食源性疾病监测,提高食品安全隐患的早期识别、预警与防控能力。同时加强食品监管力度,从源头预防控制食源性感染。临床应结合药敏结果,制定合理用药方案,以降低抗生素耐药性影响。 展开更多
关键词 食源性疾病 沙门氏菌 血清分型 病因性食品 耐药
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福建省新型冠状病毒肺炎流行病学特征分析 被引量:45
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作者 欧剑鸣 叶雯婧 +15 位作者 郑奎城 李晓庆 林修全 卢晓丽 谢忠杭 吴生根 陈彩粼 黄峥强 詹美蓉 齐孝旗 蔡少键 林嘉威 陈武 邓艳琴 王灵岚 洪荣涛 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第5期366-371,共6页
目的描述和分析福建省新型冠状病毒肺炎病例的流行病学特征,为防控提供依据。方法选取经中国疾病预防控制信息系统网络直报的福建省新型冠状病毒肺炎病例,回顾性描述该省疫情概况、疾病的三间分布以及聚集性疫情特征。结果截至2020年2... 目的描述和分析福建省新型冠状病毒肺炎病例的流行病学特征,为防控提供依据。方法选取经中国疾病预防控制信息系统网络直报的福建省新型冠状病毒肺炎病例,回顾性描述该省疫情概况、疾病的三间分布以及聚集性疫情特征。结果截至2020年2月21日24时,累计报告病例298例,死亡1例,病死率0.3%。其中确诊病例293例(98.3%),现有疑似病例2例(0.7%),无症状感染者3例(1.0%)。确诊病例中,病情严重程度以普通型肺炎为主199例(67.9%),男女比例1.22∶1,年龄以25~54岁居多(199例,67.9%)。流行曲线表现为单峰流行,确诊病例最早发病时间为1月2日,61.8%病例集中在1月21日-30日间发病。除平潭综合实验区外,其余9个设区市均报告确诊病例,主要分布在福州(71例,24.2%)、莆田(55例,18.8%)、泉州(46例,15.7%)。27个(30.7%)县(市、区)无确诊病例报告。累计报告聚集性疫情50起,涉及病例177例。结论福建省新冠肺炎病例主要为输入性病例,输入性病例以中青年为主,而本地病例则以中老年为主,除平潭外的各地市均有确诊病例报告。输入性病例流行曲线与人员返闽等相吻合,本地病例流行较输入病例晚一周。各设区市均报告聚集性疫情,以家庭性聚集为主。 展开更多
关键词 新型冠状病毒肺炎 流行病学特征 描述性分析
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福建省2011年病毒性脑炎暴发病原Echo30分子流行病学分析 被引量:22
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作者 杨秀惠 严延生 +6 位作者 翁育伟 何爱华 张红榕 陈炜 许江阳 林其财 周勇 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第3期265-269,共5页
目的了解福建省2011年病毒性脑炎暴发的病原特点及福建省近10年Echo30分子流行病学特征。方法应用细胞培养法获得病毒株,微量血清中和试验或RT-PCR序列分析鉴定Echo30血清型,提取病毒RNA核酸,逆转录为cD-NA,分段扩增VP1基因序列全长,测... 目的了解福建省2011年病毒性脑炎暴发的病原特点及福建省近10年Echo30分子流行病学特征。方法应用细胞培养法获得病毒株,微量血清中和试验或RT-PCR序列分析鉴定Echo30血清型,提取病毒RNA核酸,逆转录为cD-NA,分段扩增VP1基因序列全长,测定并分析扩增产物的序列。结果 2011年4月1日-6月2日,从福建省4个县(市)区病毒性脑炎病例标本中分离的病毒经鉴定均为Echo30;VP1基因序列分析显示,泉州市安溪和德化两地流行株高度同源(核苷酸与氨基酸序列同源性分别为99.0%和99.6%),同福安和厦门流行株(核苷酸与氨基酸序列同源性分别为98.5%和100%)核苷酸差异约9%,3个位点氨基酸出现了变异。近10年福建省Echo30分子流行病学分析显示,2011年泉州流行株并非由2005年当地流行株进化而来,而与2008年河南省分离株(HQ625646-Henan/04/2008)同源性最高;近10年福建省Echo30存在多基因型、多谱系的同时传播,并在2006年发现了两株第III新基因型病毒。结论造成2011年福建省病毒性脑炎暴发的病原为Echo30,且至少存在两条不同传播链病毒同时流行。Echo30福建株呈多基因型、多谱系分布流行特点。 展开更多
关键词 病毒性脑炎 ECHO30 VP1基因 分子流行病学
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福建省2009-2014年登革热流行特征分析 被引量:13
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作者 陈炜 王金章 +5 位作者 张拥军 陈宏彬 吴生根 翁育伟 郑奎城 严延生 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第6期589-591,共3页
目的了解福建省登革热流行特征,为制定防治对策提供依据。方法收集2009—2014年福建省登革热病例资料,建立数据库并分析。结果 2009-2014年福建省共报告登革热病例477例,其中输入性病例200例,本地病例277例,输入性病例全年均有报告,主... 目的了解福建省登革热流行特征,为制定防治对策提供依据。方法收集2009—2014年福建省登革热病例资料,建立数据库并分析。结果 2009-2014年福建省共报告登革热病例477例,其中输入性病例200例,本地病例277例,输入性病例全年均有报告,主要集中在6-10月份;年龄以20~49岁为主,男女比例为1.78∶1,病例主要分布于泉州(63/200)、福州(57/200)、莆田(39/200)。输入来源地遍布东南亚、南亚、非洲、大洋洲、南美洲、拉丁美洲等地区,其中以东南亚地区为主要来源,国内输入地包括广东省、云南省和海南省。本地病例发病主要集中于莆田和南平市(269/277),发病时间集中在9-10月份,10~69岁间各年龄组之间差距不大,男女比例为0.71∶1。所有病例职业分布以商业服务、家务及待业、农民、学生为主。结论福建省登革热流行仍以输入性病例为主,但输入引起本地暴发的风险较高,需重点加强入境旅客的登革热检疫工作。应加强全省登革热的监测和防蚊、灭蚊工作,防止登革热疫情的暴发。 展开更多
关键词 登革热 输入性病例 本地病例 暴发
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2012-2017年福建省人间布鲁氏菌病血清学监测结果分析 被引量:12
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作者 林代华 韩腾伟 +4 位作者 王加熊 刘菁 肖方震 刘维俊 邓艳琴 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第9期847-851,864,共6页
目的分析福建省人间布鲁氏菌病流行趋势,为制定有效科学的防控措施提供依据。方法根据《全国布鲁氏菌病监测工作方案》和《福建省布鲁氏菌病防控项目实施方案》的要求,在福建省布病重点地区开展监测,对各年度上报数据进行汇总与分析。结... 目的分析福建省人间布鲁氏菌病流行趋势,为制定有效科学的防控措施提供依据。方法根据《全国布鲁氏菌病监测工作方案》和《福建省布鲁氏菌病防控项目实施方案》的要求,在福建省布病重点地区开展监测,对各年度上报数据进行汇总与分析。结果 2012-2017年间,在福建省8个设区市22个监测点共检测布病高危人群血清标本6 713份,检出阳性64份(SAT法),阳性率为0.95%;各类布病职业人群中,以肉类加工和饲养放牧人员阳性率最高,但差异无统计学意义(χ^2=9.972, P>0.05);年龄分布看,30~50年龄组检出最多,但差异无统计学意义(χ^2=11.033, P>0.05);性别分布看,男女性别比为1.66∶1,差异无统计学意义(χ^2=0.642, P>0.05)。在哨点医院开展主动搜索,共检测人群血清1 815份,发现病例62例,阳性率为3.42%。结论 2012-2017年间,福建省闽南沿海地区疫情较重,并有向内陆闽北山区扩散趋势。 展开更多
关键词 布鲁氏菌病 人间 监测 血清学
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