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单核增生李斯特氏菌适体的筛选与结构分析
被引量:
5
1
作者
陈敏
江树勋
+5 位作者
邵碧英
高如承
陈文炳
陈彬
李寿崧
缪婷玉
《食品科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2009年第19期197-199,共3页
为获得与单核增生李斯特氏菌特异性结合的适体,对体外合成长度为78个碱基的随机ssDNA文库,采用SELEX技术,以单核增生李斯特氏菌为靶标进行10轮筛选。将筛选到的适体群进行克隆、测序,用Macaw2.05和DNAMAN软件对每一适体的保守序列和二...
为获得与单核增生李斯特氏菌特异性结合的适体,对体外合成长度为78个碱基的随机ssDNA文库,采用SELEX技术,以单核增生李斯特氏菌为靶标进行10轮筛选。将筛选到的适体群进行克隆、测序,用Macaw2.05和DNAMAN软件对每一适体的保守序列和二级结构进行分析。一级结构分析获得6个保守序列:TTTTTTT、TGCTCTT、CGGGGGT、GTTTTT、XTGTT、XTTGT,其中2号和12号、7号和9号、158、159和160号适体序列完全一致。二级结构分析表明,茎环状和口袋状等结构可能是适体与单核增生李斯特氏菌结合的结构基础,其一级和二级结构与亲和力密切相关。
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关键词
SELEX
单核增生李斯特氏菌
适体
一级结构
二级结构
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职称材料
题名
单核增生李斯特氏菌适体的筛选与结构分析
被引量:
5
1
作者
陈敏
江树勋
邵碧英
高如承
陈文炳
陈彬
李寿崧
缪婷玉
机构
福建出入境检验检疫局、福建省检验检疫技术研究重点实验室
福建
师范大学生命科学学院
出处
《食品科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2009年第19期197-199,共3页
基金
国家质检总局科技计划项目(2008IK164)
福建省科技攻关计划重点项目(2008Y0001)
福建检验检疫局科技计划项目(FK2006-13)
文摘
为获得与单核增生李斯特氏菌特异性结合的适体,对体外合成长度为78个碱基的随机ssDNA文库,采用SELEX技术,以单核增生李斯特氏菌为靶标进行10轮筛选。将筛选到的适体群进行克隆、测序,用Macaw2.05和DNAMAN软件对每一适体的保守序列和二级结构进行分析。一级结构分析获得6个保守序列:TTTTTTT、TGCTCTT、CGGGGGT、GTTTTT、XTGTT、XTTGT,其中2号和12号、7号和9号、158、159和160号适体序列完全一致。二级结构分析表明,茎环状和口袋状等结构可能是适体与单核增生李斯特氏菌结合的结构基础,其一级和二级结构与亲和力密切相关。
关键词
SELEX
单核增生李斯特氏菌
适体
一级结构
二级结构
Keywords
SELEX
Listeria monocytogenes
aptamer
primary structure
secondary structure
分类号
Q789 [生物学—分子生物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
单核增生李斯特氏菌适体的筛选与结构分析
陈敏
江树勋
邵碧英
高如承
陈文炳
陈彬
李寿崧
缪婷玉
《食品科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2009
5
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