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利用SMART技术构建烟草茎全长cDNA文库 被引量:4
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作者 蔡铁城 曾建斌 +4 位作者 陈顺辉 陈华 贺小彦 张冲 庄伟建 《福建农林大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2012年第1期53-57,共5页
以烟草不同生长时期茎混合为材料,采用SMART(switching mechanism at5'end of RNA transcript)技术构建了茎全长cDNA文库.原始文库的库容为5.64×106个独立克隆,重组率达99%以上,插入片段集中在0.75-2.0 kb之间,平均长度约为1.2... 以烟草不同生长时期茎混合为材料,采用SMART(switching mechanism at5'end of RNA transcript)技术构建了茎全长cDNA文库.原始文库的库容为5.64×106个独立克隆,重组率达99%以上,插入片段集中在0.75-2.0 kb之间,平均长度约为1.2 kb.随机挑取部分克隆进行测序,并进行生物信息学分析,37.5%的序列烟草已有报道,62.5%为烟草未报道的基因,45.8%是未知功能的基因,表明所构建文库达到了用于目的基因分离筛选和新基因克隆的建库要求. 展开更多
关键词 烟草 SMART技术 CDNA文库
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青枯菌诱导的花生根全长cDNA文库的构建 被引量:3
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作者 张冲 曾建斌 +3 位作者 陈华 姜宝杰 贺小彦 庄伟建 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2013年第10期1941-1946,共6页
以优质抗青枯病花生品种闽花8号为材料,在苗期利用灌根法接种花生青枯菌,分不同时期取根,利用改良的CTAB-LiCl法提取接种和非接种的混合RNA,采用SMART(Switching Mechanism At 5'end of RNATranscript)技术合成双链cDNA,经SfiⅠ酶切... 以优质抗青枯病花生品种闽花8号为材料,在苗期利用灌根法接种花生青枯菌,分不同时期取根,利用改良的CTAB-LiCl法提取接种和非接种的混合RNA,采用SMART(Switching Mechanism At 5'end of RNATranscript)技术合成双链cDNA,经SfiⅠ酶切后胶回收纯化双链cDNA,连接到质粒载体pDNR-LIB上,电击转化大肠杆菌DH5α感受态细胞,成功构建了青枯菌诱导的处理和对照混合全长cDNA文库.经鉴定,初级文库库容为1.78×10 cfu/mL,重组率达到99%以上,插入片段集中在750~2 500 bp之间,平均长度约为1 300 bp,经扩增后的文库滴度为2.97×109 cfu/mL.随机挑取部分克隆测序,利用生物信息学软件进行初步分析获得一些EST数据.说明得到了高质量的全长cDNA文库,这为筛选和克隆青枯菌诱导的胁迫相关基因提供了资源基础. 展开更多
关键词 花生 青枯病 SMART技术 CDNA文库
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龙眼采后果肉劣变的差异表达蛋白分析
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作者 王晓艳 潘德灼 +4 位作者 钟灿钰 黄榕辉 黄春梅 梁文裕 陈伟 《热带亚热带植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第4期391-398,共8页
为探索龙眼(Dimocarpus longan)果肉常温劣变过程中蛋白质的变化,采用蛋白质组学的方法,在‘福眼’龙眼果肉常温劣变过程中发现共有24个2倍差异表达蛋白,其中21个蛋白被成功鉴定。这些蛋白参与了应激反应与防御(56%)、能量与碳代谢(19%... 为探索龙眼(Dimocarpus longan)果肉常温劣变过程中蛋白质的变化,采用蛋白质组学的方法,在‘福眼’龙眼果肉常温劣变过程中发现共有24个2倍差异表达蛋白,其中21个蛋白被成功鉴定。这些蛋白参与了应激反应与防御(56%)、能量与碳代谢(19%)、初级代谢(5%)、蛋白转运(5%)和细胞骨架(5%)等细胞代谢活动。大多数与抗氧化作用密切相关的蛋白质都下调表达,说明龙眼采后果肉的抗氧化能力有所下降,不能有效地缓解ROS积累引起的毒性作用,从而使果肉劣变。此外,与能量代谢相关的蛋白全部下调表达,表明龙眼果实采后果肉劣变可能与能量供应不足有关。这些结果为龙眼采后保鲜技术研究提供科学依据。 展开更多
关键词 龙眼 果肉 劣变 双向电泳 差异蛋白 质谱
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