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利用生物信息学手段获得两个对硫磷水解酶
被引量：
1
1
作者
林毅
洪雪梅
关雄
《江西农业大学学报》
CAS
CSCD
2004年第1期6-9,共4页
以黄杆菌(Flavobacterium)对硫磷水解酶(parathionhydrolase)的序列(AAA24930.1)对芽孢杆菌的基因组进行BLASTP,从Bacillushalodurans中发现两个对硫磷水解酶类似蛋白PTEa和PTEb,长度分别为679和331个氨基酸。利用conserveddomainsearch...
以黄杆菌(Flavobacterium)对硫磷水解酶(parathionhydrolase)的序列(AAA24930.1)对芽孢杆菌的基因组进行BLASTP,从Bacillushalodurans中发现两个对硫磷水解酶类似蛋白PTEa和PTEb,长度分别为679和331个氨基酸。利用conserveddomainsearch和motifscan软件分析的结果证实它们具有对硫磷水解酶的结构特征。PTEa和PTEb的对硫磷水解酶上游标志区分别是"GVCACHEHL"和"GFTYSHEHI",与标准的"G-x-T-L-x-H-E-H-[LIV]"大致吻合。PTEb的对硫磷水解酶下游标志区"AVARAHHETKAPIHSH"也与典型的"A-x-A-x-A-x(4)-G-x-P-[LIVM]-x(2)-H"基本一致,而PTEa中缺乏明显的下游标志区。PTEb序列对枯草杆菌基因组TBLASTN的结果表明枯草杆菌也可能存在对硫磷水解酶类似蛋白。
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关键词
生物信息学
对硫磷水解酶
农药降解
枯草杆菌
基因组
黄杆菌
芽孢杆菌
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职称材料
苏云金芽孢杆菌杀虫蛋白基因定位研究进展
2
作者
伍赠玲
邱君志
+2 位作者
张新艳
李训波
关雄
《福建农林大学学报（自然科学版）》
CSCD
北大核心
2004年第1期75-79,共5页
苏云金芽孢杆菌是目前应用最广泛的杀虫微生物,其活性成分主要是杀虫晶体蛋白、营养期杀虫蛋白和几丁质酶等,本文对编码这些蛋白的基因的定位作一综述,有助于进一步研究基因结构、功能、表达和调控.
关键词
苏云金芽孢杆菌
营养期杀虫蛋白
基因定位
杀虫晶体蛋白
杀虫微生物
几丁质酶
调控
研究进展
表达
活性成分
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职称材料
题名
利用生物信息学手段获得两个对硫磷水解酶
被引量：
1
1
作者
林毅
洪雪梅
关雄
机构
华侨
大学
生物
工程与技术系
华侨
大学
信息学院
福建农林大学生物农药研究中心
出处
《江西农业大学学报》
CAS
CSCD
2004年第1期6-9,共4页
基金
国家863项目(2002AA245011)
福建省青年科技人才创新项目(2003J024)
文摘
以黄杆菌(Flavobacterium)对硫磷水解酶(parathionhydrolase)的序列(AAA24930.1)对芽孢杆菌的基因组进行BLASTP,从Bacillushalodurans中发现两个对硫磷水解酶类似蛋白PTEa和PTEb,长度分别为679和331个氨基酸。利用conserveddomainsearch和motifscan软件分析的结果证实它们具有对硫磷水解酶的结构特征。PTEa和PTEb的对硫磷水解酶上游标志区分别是"GVCACHEHL"和"GFTYSHEHI",与标准的"G-x-T-L-x-H-E-H-[LIV]"大致吻合。PTEb的对硫磷水解酶下游标志区"AVARAHHETKAPIHSH"也与典型的"A-x-A-x-A-x(4)-G-x-P-[LIVM]-x(2)-H"基本一致,而PTEa中缺乏明显的下游标志区。PTEb序列对枯草杆菌基因组TBLASTN的结果表明枯草杆菌也可能存在对硫磷水解酶类似蛋白。
关键词
生物信息学
对硫磷水解酶
农药降解
枯草杆菌
基因组
黄杆菌
芽孢杆菌
Keywords
Bacillus halodurans
parathion hydrolase
bioinformatics
pesticide degradation
分类号
Q811.4 [生物学—生物工程]
Q814 [生物学—生物工程]
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职称材料
题名
苏云金芽孢杆菌杀虫蛋白基因定位研究进展
2
作者
伍赠玲
邱君志
张新艳
李训波
关雄
机构
福建农林大学生物农药研究中心
出处
《福建农林大学学报（自然科学版）》
CSCD
北大核心
2004年第1期75-79,共5页
基金
863"(2002AA245011)
福建省科技厅重大资助项目(2002N004
2001Z026).
文摘
苏云金芽孢杆菌是目前应用最广泛的杀虫微生物,其活性成分主要是杀虫晶体蛋白、营养期杀虫蛋白和几丁质酶等,本文对编码这些蛋白的基因的定位作一综述,有助于进一步研究基因结构、功能、表达和调控.
关键词
苏云金芽孢杆菌
营养期杀虫蛋白
基因定位
杀虫晶体蛋白
杀虫微生物
几丁质酶
调控
研究进展
表达
活性成分
Keywords
Bacillus thuringiensis
insecticidal crystal protein
vegetative insecticidal protein
chitinase
gene localization
分类号
S476.11 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
S482.39 [农业科学—农药学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
利用生物信息学手段获得两个对硫磷水解酶
林毅
洪雪梅
关雄
《江西农业大学学报》
CAS
CSCD
2004
1
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职称材料
2
苏云金芽孢杆菌杀虫蛋白基因定位研究进展
伍赠玲
邱君志
张新艳
李训波
关雄
《福建农林大学学报（自然科学版）》
CSCD
北大核心
2004
0
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