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一株重组H6N8亚型禽流感病毒的遗传进化分析
1
作者
黄佳承
彭燕妮
+7 位作者
郑航煜
庄明智
张春萍
王洋
曾显成
石文军
赵聪慧
马树杰
《中国预防兽医学报》
北大核心
2025年第5期443-451,共9页
为了解H6N8亚型禽流感病毒(AIV)的分布特征,本研究统计分析了NCBI和GISAID数据库中400株H6N8亚型AIV的宿主、分离年份和地理分布特征,结果显示,H6N8亚型AIV在全球范围内持续流行,主要在野鸟和家禽中分离到,中国南方分布较多。为进一步...
为了解H6N8亚型禽流感病毒(AIV)的分布特征,本研究统计分析了NCBI和GISAID数据库中400株H6N8亚型AIV的宿主、分离年份和地理分布特征,结果显示,H6N8亚型AIV在全球范围内持续流行,主要在野鸟和家禽中分离到,中国南方分布较多。为进一步探究福建省H6N8亚型AIV的遗传进化特征,本研究于2023年在活禽市场采集285份家禽泄殖腔拭子样品,经接种鸡胚,37℃培养48 h后分离到1株AIV,经RT-PCR和测序分析鉴定为H6N8亚型AIV,并对其进行了全基因组测序、遗传进化分析和关键位点氨基酸序列分析。序列分析结果显示,该病毒HA蛋白裂解位点氨基酸序列为PQIETR↓GLF,无连续碱基氨基酸,符合低致病性AIV(LPAIV)的分子特征。HA蛋白^(138)S为结合人源受体(SAα-2,6 Gal)特征,但其226Q和228G显示该病毒为结合禽源受体(SAα-2,3 Gal)的分子特征。该病毒PB2 A^(588)V、PB1 I^(368)V、PA K^(185)R和S^(409)N、NP V^(286)A和M^(437)T、M1 N^(30)D和T^(215)A、NS1 P^(42)S氨基酸突变可增强AIV对哺乳动物的致病性。遗传进化分析结果显示,该病毒8个基因节段均属于欧亚分支,其中HA、PB1和NP基因属于H6亚型AIV的ST2835-1ike分支,NS基因属于ST339-like分支。NA和M基因与鸡源H3N8亚型AIV亲缘关系近,PB2、PB1、PA、HA、NP和NS基因与家禽及环境中分离的H6N6 AIV亲缘关系近,提示该病毒可能是由H6N6和H3N8亚型AIV重组而来。本研究为了解H6N8亚型AIV的遗传进化提供了参考。
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关键词
禽流感病毒
H6N8亚型AIV
三间分布
遗传进化
关键氨基酸
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职称材料
题名
一株重组H6N8亚型禽流感病毒的遗传进化分析
1
作者
黄佳承
彭燕妮
郑航煜
庄明智
张春萍
王洋
曾显成
石文军
赵聪慧
马树杰
机构
福建农林大学动物科学学院/福建省“一带一路”畜禽重大疫病防控联合实验室
青岛海关技术中心
出处
《中国预防兽医学报》
北大核心
2025年第5期443-451,共9页
基金
国家重点研发计划(2021YFD1800205)
福建农林大学大学生创新创业训练计划项目(X202310389199、X202410389210)
海关总署科研项目(2024HK027、2024HK036)。
文摘
为了解H6N8亚型禽流感病毒(AIV)的分布特征,本研究统计分析了NCBI和GISAID数据库中400株H6N8亚型AIV的宿主、分离年份和地理分布特征,结果显示,H6N8亚型AIV在全球范围内持续流行,主要在野鸟和家禽中分离到,中国南方分布较多。为进一步探究福建省H6N8亚型AIV的遗传进化特征,本研究于2023年在活禽市场采集285份家禽泄殖腔拭子样品,经接种鸡胚,37℃培养48 h后分离到1株AIV,经RT-PCR和测序分析鉴定为H6N8亚型AIV,并对其进行了全基因组测序、遗传进化分析和关键位点氨基酸序列分析。序列分析结果显示,该病毒HA蛋白裂解位点氨基酸序列为PQIETR↓GLF,无连续碱基氨基酸,符合低致病性AIV(LPAIV)的分子特征。HA蛋白^(138)S为结合人源受体(SAα-2,6 Gal)特征,但其226Q和228G显示该病毒为结合禽源受体(SAα-2,3 Gal)的分子特征。该病毒PB2 A^(588)V、PB1 I^(368)V、PA K^(185)R和S^(409)N、NP V^(286)A和M^(437)T、M1 N^(30)D和T^(215)A、NS1 P^(42)S氨基酸突变可增强AIV对哺乳动物的致病性。遗传进化分析结果显示,该病毒8个基因节段均属于欧亚分支,其中HA、PB1和NP基因属于H6亚型AIV的ST2835-1ike分支,NS基因属于ST339-like分支。NA和M基因与鸡源H3N8亚型AIV亲缘关系近,PB2、PB1、PA、HA、NP和NS基因与家禽及环境中分离的H6N6 AIV亲缘关系近,提示该病毒可能是由H6N6和H3N8亚型AIV重组而来。本研究为了解H6N8亚型AIV的遗传进化提供了参考。
关键词
禽流感病毒
H6N8亚型AIV
三间分布
遗传进化
关键氨基酸
Keywords
avian influenza virus
H6N8
three-dimensional distribution
genetic evolution
key amino acids
分类号
S852.65 [农业科学—基础兽医学]
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题名
作者
出处
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1
一株重组H6N8亚型禽流感病毒的遗传进化分析
黄佳承
彭燕妮
郑航煜
庄明智
张春萍
王洋
曾显成
石文军
赵聪慧
马树杰
《中国预防兽医学报》
北大核心
2025
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