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果蔗Hsp90基因的电子克隆及序列分析
被引量：
4
1
作者
林生
潘大仁
+3 位作者
周以飞
陈观水
张绪璋
张燕云
《热带作物学报》
CSCD
2009年第12期1824-1830,共7页
以克隆到的果蔗HSP90基因片段作为探针,利用电子克隆和序列拼接方法获得一个全长为2097bp的cDNA序列。通过ORF软件分析,预测得到的蛋白质具有698个氨基酸。应用生物信息学对果蔗HSP90蛋白的理化性质、二级结构、疏水性/亲水性、信号肽...
以克隆到的果蔗HSP90基因片段作为探针,利用电子克隆和序列拼接方法获得一个全长为2097bp的cDNA序列。通过ORF软件分析,预测得到的蛋白质具有698个氨基酸。应用生物信息学对果蔗HSP90蛋白的理化性质、二级结构、疏水性/亲水性、信号肽、功能结构域分析及其蛋白功能、高级结构和同源性进行了预测分析。结果表明,该蛋白的相对分子量为80.2ku,在N端有一个ATP结合位点,具有内源ATPase活性。序列分析表明,该蛋白可能具有信号转导、转录调控、胁迫应答、生长因子等功能。利用梢腐病病原Gibberella fujikuroi接种果蔗福安叶片,检测到HSP90基因的转录水平逐渐提高。
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关键词
果蔗
HSP90基因
电子克隆
生物信息学
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职称材料
题名
果蔗Hsp90基因的电子克隆及序列分析
被引量：
4
1
作者
林生
潘大仁
周以飞
陈观水
张绪璋
张燕云
机构
福建农林大学作物学院福建省作物分子与细胞生物学重点实验室
福建农林大学
作物
学院
作物
遗传育种与综合利用教育部
重点
实验室
出处
《热带作物学报》
CSCD
2009年第12期1824-1830,共7页
基金
国家自然科学基金(No.30370900)
福建省自然科学基金(No.2003N001)资助
文摘
以克隆到的果蔗HSP90基因片段作为探针,利用电子克隆和序列拼接方法获得一个全长为2097bp的cDNA序列。通过ORF软件分析,预测得到的蛋白质具有698个氨基酸。应用生物信息学对果蔗HSP90蛋白的理化性质、二级结构、疏水性/亲水性、信号肽、功能结构域分析及其蛋白功能、高级结构和同源性进行了预测分析。结果表明,该蛋白的相对分子量为80.2ku,在N端有一个ATP结合位点,具有内源ATPase活性。序列分析表明,该蛋白可能具有信号转导、转录调控、胁迫应答、生长因子等功能。利用梢腐病病原Gibberella fujikuroi接种果蔗福安叶片,检测到HSP90基因的转录水平逐渐提高。
关键词
果蔗
HSP90基因
电子克隆
生物信息学
Keywords
chewing cane
HSP90
in silico cloning
bioinformatics
分类号
Q781 [生物学—分子生物学]
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作者
出处
发文年
被引量
操作
1
果蔗Hsp90基因的电子克隆及序列分析
林生
潘大仁
周以飞
陈观水
张绪璋
张燕云
《热带作物学报》
CSCD
2009
4
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