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基于生物信息学和网络药理学探讨紫草有效成分β,β-二甲基丙烯酰阿卡宁抗结直肠癌作用机制
1
作者
林晶
江道宏
+2 位作者
高献明
许璐
谢芊芊
《中国医药科学》
2025年第8期9-15,43,共8页
目的采用基因表达数据库(GEO)、网络药理学和分子对接探讨紫草有效成分β,β-二甲基丙烯酰阿卡宁(DMAS)抗结直肠癌(CRC)作用机制。方法利用瑞士医疗器械数据库(SwissTargetPrediction)、药效团匹配与潜在识别靶标平台(Pharmmapper)、人...
目的采用基因表达数据库(GEO)、网络药理学和分子对接探讨紫草有效成分β,β-二甲基丙烯酰阿卡宁(DMAS)抗结直肠癌(CRC)作用机制。方法利用瑞士医疗器械数据库(SwissTargetPrediction)、药效团匹配与潜在识别靶标平台(Pharmmapper)、人类基因组数据库(GeneCards)、化合物靶点预测数据库(TargetNet)查找DMAS相关作用靶点。利用GEO数据库和加权基因共表达网络分析(WGCNA)进行临床相关基因分析,将两者结果连同GeneCards数据库CRC检索结果取交集。通过利用蛋白互作网络分析数据库(STRING)和Cytoscape软件,创建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,并使用Centiscape插件筛选出关键核心靶点。为进一步验证这些核心靶点的可靠性,使用受试者工作特征(ROC)曲线进行分析并导入Metascape数据库进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路和基因本体论(GO)功能富集分析。最后采用AutoDockTools和Pymol软件将DMAS与核心靶蛋白进行分子对接验证和可视化。结果通过数据库共获得355个DMAS目标,WGCNA共获得5200个CRC临床模块基因,结合GeneCards数据库,共获得99个DMAS和CRC交叉靶点。PPI网络分析筛选出15个核心靶点,并通过ROC曲线分析确定丝氨酸/苏氨酸激酶(AKT1)、蛋白质P53(TP53)、β-连环蛋白(CTNNB1)、90 kDa热休克蛋白αB1(HSP90AB1)、胰岛素样生长因子1(IGF1)、酪氨酸激酶受体2(ERBB2)、蛋白酪氨酸磷酸酶基因(PTEN)、细胞周期蛋白依赖性激酶2(CDK2)、鼠类肉瘤病毒癌基因(KRAS)、胃蛋白酶原(PGR)、过氧化物酶体增生激活受体γ(PPARG)、基因编码蛋白(SMAD4)、细胞周期调节蛋白激酶4(CDK4)、原癌基因PIK3CA、半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶(CASP9)为DMAS调控CRC的关键靶点,并对其进行的KEGG和GO富集分析,显示这些靶点主要集中在磷脂酰肌醇3-激酶-蛋白激酶B(PI3K-Akt)信号通路上。分子对接结果进一步表明,DMAS能够与15个关键靶点有效结合,形成稳定的蛋白质-配体复合物。结论本研究不仅揭示DMAS抗CRC的关键靶点和分子机制,还为未来深入探索DMAS抗CRC的药理机制提供坚实的理论基础。
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关键词
紫草
β
β-二甲基丙烯酰阿卡宁
结直肠癌
网络药理学
生物信息学
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职称材料
直肠黏膜内脱垂组织中胶原纤维变化和CD68、BFGF、VEGF的表达及意义
被引量：
3
2
作者
柯敏辉
李雪玉
许振国
《山西医科大学学报》
CAS
2022年第2期227-231,共5页
目的观察直肠黏膜内脱垂(IRP)组织中胶原纤维变化和CD68、碱性成纤维细胞生长因子(BFGF)、血管内皮生长因子(VEGF)的表达,为探索IRP的发病机制和临床治疗提供新思路。方法选取2020年6月至2021年9月于福建中医药大学附属第二人民医院因IR...
目的观察直肠黏膜内脱垂(IRP)组织中胶原纤维变化和CD68、碱性成纤维细胞生长因子(BFGF)、血管内皮生长因子(VEGF)的表达,为探索IRP的发病机制和临床治疗提供新思路。方法选取2020年6月至2021年9月于福建中医药大学附属第二人民医院因IRP行选择性痔上黏膜切除术(TST)的患者50例为IRP组,同期Ⅱ~Ⅲ期内痔(无合并IRP)行TST术患者50例为对照组。对术中截取的直肠组织进行Masson染色和免疫组化染色,观察胶原纤维的病理改变及CD68、BFGF、VEGF的表达情况。结果Masson染色显示,IRP组黏膜肌层及黏膜下组织胶原纤维比对照组显著减少(P<0.05),且胶原纤维的排列紊乱,伴间质疏松,血管扩张,数量增多。免疫组化染色显示,IRP组BFGF、VEGF、CD68的表达水平均明显高于对照组(P<0.05)。结论直肠黏膜内脱垂组织中胶原纤维减少,CD68、BFGF、VEGF的表达水平均升高,可能参与IRP的发生发展过程。
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关键词
直肠黏膜内脱垂
胶原纤维
CD68
碱性成纤维细胞生长因子
血管内皮生长因子
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职称材料
多普勒超声引导下痔动脉结扎并消痔灵注射术治疗痔病210例
被引量：
1
3
作者
叶玲
高献明
惠永峰
《中国现代普通外科进展》
CAS
2012年第7期575-575,共1页
多普勒超声引导下痔动脉结扎术近年作为新技术在国内陆续开展,而消痔灵注射术应用于临床已20多年,其技术成熟疗效好,但远期疗效欠佳。我科2010年9月—2011年9月应用多普勒超声引导下痔动脉结扎配合消痔灵注射术治疗210例痔患者，总结报...
多普勒超声引导下痔动脉结扎术近年作为新技术在国内陆续开展,而消痔灵注射术应用于临床已20多年,其技术成熟疗效好,但远期疗效欠佳。我科2010年9月—2011年9月应用多普勒超声引导下痔动脉结扎配合消痔灵注射术治疗210例痔患者，总结报道如下。
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关键词
多普勒超声引导下
痔动脉结扎术
消痔灵注射术
临床治疗
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职称材料
题名
基于生物信息学和网络药理学探讨紫草有效成分β,β-二甲基丙烯酰阿卡宁抗结直肠癌作用机制
1
作者
林晶
江道宏
高献明
许璐
谢芊芊
机构
福建中医药大学附属第二人民医院肛肠科
福建
省医学
科
学研究院
出处
《中国医药科学》
2025年第8期9-15,43,共8页
基金
福建省中医药重点学科建设项目(闽卫中医函[2024]363号)。
文摘
目的采用基因表达数据库(GEO)、网络药理学和分子对接探讨紫草有效成分β,β-二甲基丙烯酰阿卡宁(DMAS)抗结直肠癌(CRC)作用机制。方法利用瑞士医疗器械数据库(SwissTargetPrediction)、药效团匹配与潜在识别靶标平台(Pharmmapper)、人类基因组数据库(GeneCards)、化合物靶点预测数据库(TargetNet)查找DMAS相关作用靶点。利用GEO数据库和加权基因共表达网络分析(WGCNA)进行临床相关基因分析,将两者结果连同GeneCards数据库CRC检索结果取交集。通过利用蛋白互作网络分析数据库(STRING)和Cytoscape软件,创建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,并使用Centiscape插件筛选出关键核心靶点。为进一步验证这些核心靶点的可靠性,使用受试者工作特征(ROC)曲线进行分析并导入Metascape数据库进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路和基因本体论(GO)功能富集分析。最后采用AutoDockTools和Pymol软件将DMAS与核心靶蛋白进行分子对接验证和可视化。结果通过数据库共获得355个DMAS目标,WGCNA共获得5200个CRC临床模块基因,结合GeneCards数据库,共获得99个DMAS和CRC交叉靶点。PPI网络分析筛选出15个核心靶点,并通过ROC曲线分析确定丝氨酸/苏氨酸激酶(AKT1)、蛋白质P53(TP53)、β-连环蛋白(CTNNB1)、90 kDa热休克蛋白αB1(HSP90AB1)、胰岛素样生长因子1(IGF1)、酪氨酸激酶受体2(ERBB2)、蛋白酪氨酸磷酸酶基因(PTEN)、细胞周期蛋白依赖性激酶2(CDK2)、鼠类肉瘤病毒癌基因(KRAS)、胃蛋白酶原(PGR)、过氧化物酶体增生激活受体γ(PPARG)、基因编码蛋白(SMAD4)、细胞周期调节蛋白激酶4(CDK4)、原癌基因PIK3CA、半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶(CASP9)为DMAS调控CRC的关键靶点,并对其进行的KEGG和GO富集分析,显示这些靶点主要集中在磷脂酰肌醇3-激酶-蛋白激酶B(PI3K-Akt)信号通路上。分子对接结果进一步表明,DMAS能够与15个关键靶点有效结合,形成稳定的蛋白质-配体复合物。结论本研究不仅揭示DMAS抗CRC的关键靶点和分子机制,还为未来深入探索DMAS抗CRC的药理机制提供坚实的理论基础。
关键词
紫草
β
β-二甲基丙烯酰阿卡宁
结直肠癌
网络药理学
生物信息学
Keywords
Arnebiae Radix
β,β-dimethylacryloyl alkannin
Colorectal cancer
Network pharmacology
Bioinformatics
分类号
R735.3 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
直肠黏膜内脱垂组织中胶原纤维变化和CD68、BFGF、VEGF的表达及意义
被引量：
3
2
作者
柯敏辉
李雪玉
许振国
机构
福建中医药大学附属第二人民医院肛肠科
福建中医药大学附属第二人民医院
健康管理中心
出处
《山西医科大学学报》
CAS
2022年第2期227-231,共5页
基金
国家自然科学基金面上项目(81774118)
福建省科技厅引导性项目(2019Y0029)
福建中医药大学校管课题(X2019063-学科)。
文摘
目的观察直肠黏膜内脱垂(IRP)组织中胶原纤维变化和CD68、碱性成纤维细胞生长因子(BFGF)、血管内皮生长因子(VEGF)的表达,为探索IRP的发病机制和临床治疗提供新思路。方法选取2020年6月至2021年9月于福建中医药大学附属第二人民医院因IRP行选择性痔上黏膜切除术(TST)的患者50例为IRP组,同期Ⅱ~Ⅲ期内痔(无合并IRP)行TST术患者50例为对照组。对术中截取的直肠组织进行Masson染色和免疫组化染色,观察胶原纤维的病理改变及CD68、BFGF、VEGF的表达情况。结果Masson染色显示,IRP组黏膜肌层及黏膜下组织胶原纤维比对照组显著减少(P<0.05),且胶原纤维的排列紊乱,伴间质疏松,血管扩张,数量增多。免疫组化染色显示,IRP组BFGF、VEGF、CD68的表达水平均明显高于对照组(P<0.05)。结论直肠黏膜内脱垂组织中胶原纤维减少,CD68、BFGF、VEGF的表达水平均升高,可能参与IRP的发生发展过程。
关键词
直肠黏膜内脱垂
胶原纤维
CD68
碱性成纤维细胞生长因子
血管内皮生长因子
Keywords
internal rectal prolapse
collagen fibers
CD68
basic fibroblast growth factor
vascular endothelial growth factor
分类号
R657.1 [医药卫生—外科学]
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职称材料
题名
多普勒超声引导下痔动脉结扎并消痔灵注射术治疗痔病210例
被引量：
1
3
作者
叶玲
高献明
惠永峰
机构
福建中医药大学附属第二人民医院肛肠科
福建中医药大学
研究生部
出处
《中国现代普通外科进展》
CAS
2012年第7期575-575,共1页
文摘
多普勒超声引导下痔动脉结扎术近年作为新技术在国内陆续开展,而消痔灵注射术应用于临床已20多年,其技术成熟疗效好,但远期疗效欠佳。我科2010年9月—2011年9月应用多普勒超声引导下痔动脉结扎配合消痔灵注射术治疗210例痔患者，总结报道如下。
关键词
多普勒超声引导下
痔动脉结扎术
消痔灵注射术
临床治疗
分类号
R657.18 [医药卫生—外科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于生物信息学和网络药理学探讨紫草有效成分β,β-二甲基丙烯酰阿卡宁抗结直肠癌作用机制
林晶
江道宏
高献明
许璐
谢芊芊
《中国医药科学》
2025
0
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职称材料
2
直肠黏膜内脱垂组织中胶原纤维变化和CD68、BFGF、VEGF的表达及意义
柯敏辉
李雪玉
许振国
《山西医科大学学报》
CAS
2022
3
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职称材料
3
多普勒超声引导下痔动脉结扎并消痔灵注射术治疗痔病210例
叶玲
高献明
惠永峰
《中国现代普通外科进展》
CAS
2012
1
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