目的:探讨甲硫氨酸代谢相关基因在食管鳞状细胞癌(esophageal squamous cell carcinoma,ESCC)中的表达情况,研究甲硫氨酸和溶质载体家族43成员2(solute carrier family 43 member 2,SLC43A2)基因的表达对ESCC细胞迁移和侵袭的影响。方法...目的:探讨甲硫氨酸代谢相关基因在食管鳞状细胞癌(esophageal squamous cell carcinoma,ESCC)中的表达情况,研究甲硫氨酸和溶质载体家族43成员2(solute carrier family 43 member 2,SLC43A2)基因的表达对ESCC细胞迁移和侵袭的影响。方法:利用生物信息学分析ESCC组织与邻近正常组织的甲硫氨酸代谢关键基因的表达情况,Kaplan-Meier生存曲线分析其表达在ESCC患者预后中的价值;聚类分析揭示不同表达模式对ESCC患者总体生存期和肿瘤微环境的影响;富集分析寻找ESCC中与甲硫氨酸和SLC43A2基因紧密关联的生物学进程;免疫组织化学染色检测ESCC组织和邻近正常组织中SLC43A2蛋白的表达情况;RT-qPCR和Western blot法检测干扰ESCC细胞SLC43A2效率;Transwell实验检测甲硫氨酸限制(methionine restriction)或干扰SLC43A2后ESCC细胞迁移和侵袭能力。结果:大部分甲硫氨酸代谢相关通路中的关键酶和SLC43A2基因在ESCC肿瘤组织中高表达(P<0.05),并且这些差异基因的表达对ESCC患者的预后具有显著影响(P<0.05);聚类分析显示高表达SLC43A2基因的A簇患者预后差,肿瘤微环境中免疫细胞种类和数量显著低于B簇;富集分析显示高表达SLC43A2基因组中上皮间充质转化(epithelial-mesenchymal transition,EMT)通路信号分子显著富集(P<0.01)。此外,限制甲硫氨酸或敲减SLC43A2可抑制ESCC细胞的迁移和侵袭(P<0.01)。结论:ESCC组织中甲硫氨酸代谢活跃,SLC43A2基因在ESCC组织中高表达与患者不良预后相关,SLC43A2促进ESCC细胞迁移和侵袭。展开更多
文摘目的:探讨沉默信息调节因子1(silent information regulator 1,SIRT1)基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)与汉族乳腺癌发病风险的关联。方法:纳入105例汉族乳腺癌患者及90例汉族健康对照者,采用Sequenom MassARRAY检测SIRT1基因rs3740051、rs3758391、rs12778366和rs2394443位点的基因型。利用卡方检验分析哈代-温伯格平衡(Hardy-Weinberg equilibrium,HWE),采用多因素logistic回归分析检测SNPs与乳腺癌易感性及rs3758391位点的基因型与汉族乳腺癌临床病理特征的相关性。运用SHEsis软件对所选SNP位点进行连锁不平衡分析和单倍型分析。Western blot检测rs3758391位点基因型SIRT1蛋白表达。另纳入150例汉族乳腺癌及150例汉族健康者作为对照组,采用免疫组化检测SIRT1蛋白表达;logistic回归分析SIRT1高低表达与乳腺癌临床特征的关系;Kaplan-Meier网站分析SIRT1表达与患者预后的关联。结果:4个SNP位点均符合HWE检验(P>0.05)。SIRT1 rs3758391位点的TC/TC+CC基因型相较于TT基因型显著降低乳腺癌风险(TT vs TC:OR_(adj)=0.348,95%CI:0.157~0.773,P_(adj)=0.010;TT vs TC+CC:OR_(adj)=0.381,95%CI:0.179~0.811,P_(adj)=0.012),且与早期病程(I/II期)、较小肿瘤体积和较高的SIRT1蛋白表达水平相关(P<0.05)。乳腺癌组织中,SIRT1表达显著降低,低表达的SIRT1与较大肿瘤体积、淋巴结转移和无复发生存期较短相关(P<0.05)。结论:SIRT1 rs3758391位点的TC/TC+CC基因型可能是汉族乳腺癌的保护性因素,可能通过调节SIRT1表达来降低乳腺癌风险并延缓病程。此外,SIRT1表达水平与乳腺癌临床特征及预后相关。
