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CECMAtlas 1.0:人类肿瘤相关的细胞外基质基因数据库
被引量:
1
1
作者
于淑婷
刘源
+6 位作者
徐浩
李扬
刁丽红
张怡
朱佳润
胡圣伟
李栋
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第2期207-213,共7页
细胞外基质(extracellular matrix,ECM)是细胞微环境的重要组成部分,它不仅能为细胞提供物理支持,而且还参与了多种生物学过程。近年来,已经鉴定出来数百种与癌症相关的ECM(cancer-related ECM,C-ECM)基因,其中一些已作为潜在靶标。目前...
细胞外基质(extracellular matrix,ECM)是细胞微环境的重要组成部分,它不仅能为细胞提供物理支持,而且还参与了多种生物学过程。近年来,已经鉴定出来数百种与癌症相关的ECM(cancer-related ECM,C-ECM)基因,其中一些已作为潜在靶标。目前,有关于C-ECM基因的丰富信息还散布在成千上万的出版物中,并且它们在肿瘤发生过程中的作用也未被系统的整理。本文构建了CECMAtlas数据库(http://biokb.ncpsb.org.cn/CECMAtlas/),该数据库使用文献挖掘和人工判读收集了225个C-ECM基因,以及相关生物学过程信息,该数据库将有助于研究肿瘤的发生机制和开展可能的临床应用。
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关键词
癌症
细胞外基质基因
数据库
文本挖掘
人工判读
生物学过程
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职称材料
题名
CECMAtlas 1.0:人类肿瘤相关的细胞外基质基因数据库
被引量:
1
1
作者
于淑婷
刘源
徐浩
李扬
刁丽红
张怡
朱佳润
胡圣伟
李栋
机构
石河子大学生命科学学院生物科学系动物基因工程实验室
北京
生命
组学研究所国家蛋白质
科学
中心蛋白质组学国家重点
实验室
河北
大学
生命
学院
安徽医科
大学
基础医
学院
出处
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第2期207-213,共7页
基金
国家自然科学基金(No.31871341)
精准医学国家重点课题(No.2016YFC0901905)联合资助。
文摘
细胞外基质(extracellular matrix,ECM)是细胞微环境的重要组成部分,它不仅能为细胞提供物理支持,而且还参与了多种生物学过程。近年来,已经鉴定出来数百种与癌症相关的ECM(cancer-related ECM,C-ECM)基因,其中一些已作为潜在靶标。目前,有关于C-ECM基因的丰富信息还散布在成千上万的出版物中,并且它们在肿瘤发生过程中的作用也未被系统的整理。本文构建了CECMAtlas数据库(http://biokb.ncpsb.org.cn/CECMAtlas/),该数据库使用文献挖掘和人工判读收集了225个C-ECM基因,以及相关生物学过程信息,该数据库将有助于研究肿瘤的发生机制和开展可能的临床应用。
关键词
癌症
细胞外基质基因
数据库
文本挖掘
人工判读
生物学过程
Keywords
cancer
extracellular matrix gene
database
text-mining
manual curation
biological processes
分类号
Q5 [生物学—生物化学]
Q7 [生物学—分子生物学]
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作者
出处
发文年
被引量
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1
CECMAtlas 1.0:人类肿瘤相关的细胞外基质基因数据库
于淑婷
刘源
徐浩
李扬
刁丽红
张怡
朱佳润
胡圣伟
李栋
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
1
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