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血管肉瘤相关miRNAs的生物信息学预测及分析
被引量：
2
1
作者
魏院锋
张海俊
+5 位作者
李丽
张璐
金珊
邹泓
贾薇
庞丽娟
《临床与实验病理学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第4期431-435,共5页
目的探讨血管肉瘤相关miRNAs及其靶基因在其恶性生物学行为中的作用。方法从GEO数据库中下载血管肉瘤miRNAs表达谱芯片数据,应用GEO2R筛选出差异表达的miRNAs并进行靶基因预测,对靶基因进行GO及KEGG生物功能富集分析及蛋白互作分析。结...
目的探讨血管肉瘤相关miRNAs及其靶基因在其恶性生物学行为中的作用。方法从GEO数据库中下载血管肉瘤miRNAs表达谱芯片数据,应用GEO2R筛选出差异表达的miRNAs并进行靶基因预测,对靶基因进行GO及KEGG生物功能富集分析及蛋白互作分析。结果筛选出53个差异表达的miRNAs(P<0.05,|log fold-change|≥4),其中上调者51个,下调者2个;GO功能富集分析发现差异表达miRNAs的靶基因主要参与细胞通讯、信号转导等生物学过程;KEGG信号通路富集分析发现靶基因主要参与肿瘤信号通路、代谢通路、环腺苷酸(cAMP)信号通路、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路、PI3K/AKT信号通路、Ras信号通路等重要通路;String蛋白互作分析发现,STAT3、TP53、MAPK1、SRC等在蛋白互作网络中处于核心地位。结论异常表达的miRNAs在血管肉瘤的恶性生物学行为中发挥着关键作用,为进一步探讨血管肉瘤发生、发展的具体分子机制、分子标志物的筛选及靶向药物的开发奠定基础。
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关键词
血管肉瘤
MIRNAS
生物信息学
信号通路
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题名
血管肉瘤相关miRNAs的生物信息学预测及分析
被引量：
2
1
作者
魏院锋
张海俊
李丽
张璐
金珊
邹泓
贾薇
庞丽娟
机构
石河子大学医学院第一附属医院病理科/石河子大学医学院病理系
新疆地方与民族高发病教育部重点实验室
出处
《临床与实验病理学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第4期431-435,共5页
基金
新疆生产建设兵团中青年科技创新领军人才计划(2017CB004)
石河子大学国际科技合作推进计划(GJHZ201805)。
文摘
目的探讨血管肉瘤相关miRNAs及其靶基因在其恶性生物学行为中的作用。方法从GEO数据库中下载血管肉瘤miRNAs表达谱芯片数据,应用GEO2R筛选出差异表达的miRNAs并进行靶基因预测,对靶基因进行GO及KEGG生物功能富集分析及蛋白互作分析。结果筛选出53个差异表达的miRNAs(P<0.05,|log fold-change|≥4),其中上调者51个,下调者2个;GO功能富集分析发现差异表达miRNAs的靶基因主要参与细胞通讯、信号转导等生物学过程;KEGG信号通路富集分析发现靶基因主要参与肿瘤信号通路、代谢通路、环腺苷酸(cAMP)信号通路、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路、PI3K/AKT信号通路、Ras信号通路等重要通路;String蛋白互作分析发现,STAT3、TP53、MAPK1、SRC等在蛋白互作网络中处于核心地位。结论异常表达的miRNAs在血管肉瘤的恶性生物学行为中发挥着关键作用,为进一步探讨血管肉瘤发生、发展的具体分子机制、分子标志物的筛选及靶向药物的开发奠定基础。
关键词
血管肉瘤
MIRNAS
生物信息学
信号通路
Keywords
angiosarcoma
miRNAs
bioinformatics
signaling pathway
分类号
R732.2 [医药卫生—肿瘤]
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作者
出处
发文年
被引量
操作
1
血管肉瘤相关miRNAs的生物信息学预测及分析
魏院锋
张海俊
李丽
张璐
金珊
邹泓
贾薇
庞丽娟
《临床与实验病理学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2020
2
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