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棉花种子油分含量QTL的定位及遗传效应分析
1
作者
丁树根
石玉杰
+6 位作者
阿布都克尤木·阿不都热孜克
徐麟
吴元龙
李志博
林海荣
赵曾强
聂新辉
《新疆农业科学》
北大核心
2025年第5期1084-1091,共8页
【目的】基于SSR(Simple sequence repeat,简单重复序列)标记对棉花SOC(Seed oil content,种子油分含量)进行关联分析,挖掘优异等位变异位点,解析棉花种子油分含量性状的遗传机理,为棉花高油分育种提供理论参考。【方法】利用筛选出覆...
【目的】基于SSR(Simple sequence repeat,简单重复序列)标记对棉花SOC(Seed oil content,种子油分含量)进行关联分析,挖掘优异等位变异位点,解析棉花种子油分含量性状的遗传机理,为棉花高油分育种提供理论参考。【方法】利用筛选出覆盖棉花全基因组的145对SSR标记对245份棉花材料进行多态性扫描;利用R语言绘制群体表型分布和相关关系图,采用TASSEL软件的混合线性模型进行关联分析,挖掘与SOC相关的优异等位变异位点。【结果】获得34个与SOC相关的等位变异位点(P<0.05)。表型变异解释率为1.83%~8.7%,平均值为5.70%。【结论】挖掘到34个与油分含量性状相关等位变异位点,以及棉花纤维品质和产量相关的位点9个。
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关键词
SSR
油分含量
关联分析
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职称材料
新疆陆地棉经济性状优异等位基因位点的遗传解析
被引量：
3
2
作者
雷杰杰
邵盘霞
+10 位作者
郭春平
张大伟
唐秉晖
努日曼古丽·艾尼
彭亚娟
崔天宇
张奥深
林海荣
林忠旭
尤春源
聂新辉
《棉花学报》
CSCD
北大核心
2020年第3期185-198,共14页
【目的】基于SSR(Simple sequence repeat,简单序列)标记展开对陆地棉经济性状的关联分析,挖掘优异等位变异位点,解析新疆陆地棉经济性状的遗传基础,为新疆陆地棉的遗传机理研究和高效的陆地棉分子设计育种提供理论依据。【方法】利用...
【目的】基于SSR(Simple sequence repeat,简单序列)标记展开对陆地棉经济性状的关联分析,挖掘优异等位变异位点,解析新疆陆地棉经济性状的遗传基础,为新疆陆地棉的遗传机理研究和高效的陆地棉分子设计育种提供理论依据。【方法】利用筛选出覆盖棉花全基因组的73对SSR标记对新疆156份陆地棉品种进行多态性扫描;采用R语言绘制boxplot图,利用TASSEL软件进行关联分析,挖掘与产量、纤维品质性状相关联的优异等位变异位点。【结果】通过对6个环境下新疆陆地棉品种的产量、品质相关性状进行关联分析,获得与产量性状相关的等位变异位点10个,表型变异解释率为6.69%~9.88%,平均值为8.43%;与纤维品质性状相关的等位变异位点23个,表型变异解释率为3.73%~13.22%,平均值为7.52%。其中22个QTL(Quantitative trait locus)已被报道,有10个QTL的关联性状与前人研究一致。【结论】新疆陆地棉品种的群体遗传结构简单,连锁不平衡水平低,6个环境条件下表型性状变化趋势较稳定。基于SSR的关联分析,发掘了与产量和纤维品质相关的优异等位变异基因及聚合优异等位基因位点的典型材料。
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关键词
陆地棉
新疆
产量性状
纤维品质
关联分析
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职称材料
题名
棉花种子油分含量QTL的定位及遗传效应分析
1
作者
丁树根
石玉杰
阿布都克尤木·阿不都热孜克
徐麟
吴元龙
李志博
林海荣
赵曾强
聂新辉
机构
石河子大学农学院/绿洲生态重点实验室
新疆维吾尔自治区农业科
学院
农业质量标准与检测技术研究所
新疆农垦科
学院
棉花研究所/作物种质创新与基因资源利用兵团
重点
实验室
出处
《新疆农业科学》
北大核心
2025年第5期1084-1091,共8页
基金
高产优质高油棉花种质资源的创制(NYHXGG,2023AA102-2-1)
纤饲兼用型棉花新品种分子辅助选择技术建立(2023YFD2301203-05)
+1 种基金
农作物种质资源鉴定与评价(BNZJ2023)
棉花遗传资源创新及在分子育种中的应用(2021CB028)。
文摘
【目的】基于SSR(Simple sequence repeat,简单重复序列)标记对棉花SOC(Seed oil content,种子油分含量)进行关联分析,挖掘优异等位变异位点,解析棉花种子油分含量性状的遗传机理,为棉花高油分育种提供理论参考。【方法】利用筛选出覆盖棉花全基因组的145对SSR标记对245份棉花材料进行多态性扫描;利用R语言绘制群体表型分布和相关关系图,采用TASSEL软件的混合线性模型进行关联分析,挖掘与SOC相关的优异等位变异位点。【结果】获得34个与SOC相关的等位变异位点(P<0.05)。表型变异解释率为1.83%~8.7%,平均值为5.70%。【结论】挖掘到34个与油分含量性状相关等位变异位点,以及棉花纤维品质和产量相关的位点9个。
关键词
SSR
油分含量
关联分析
Keywords
SSR
seed oil content
correlation analysis
分类号
S562 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
新疆陆地棉经济性状优异等位基因位点的遗传解析
被引量：
3
2
作者
雷杰杰
邵盘霞
郭春平
张大伟
唐秉晖
努日曼古丽·艾尼
彭亚娟
崔天宇
张奥深
林海荣
林忠旭
尤春源
聂新辉
机构
石河子大学农学院/绿洲生态重点实验室
石河子
农业科学研究院棉花所
华中农业
大学
植物科学技术
学院/
作物遗传改良国家
重点
实验室
新疆农业科
学院
经济作物研究所
出处
《棉花学报》
CSCD
北大核心
2020年第3期185-198,共14页
基金
国家自然科学基金(31760402)
石河子大学新品种培育专项(YZZX201701)
石河子大学高层次人才科研启动项目(RCSX201725)。
文摘
【目的】基于SSR(Simple sequence repeat,简单序列)标记展开对陆地棉经济性状的关联分析,挖掘优异等位变异位点,解析新疆陆地棉经济性状的遗传基础,为新疆陆地棉的遗传机理研究和高效的陆地棉分子设计育种提供理论依据。【方法】利用筛选出覆盖棉花全基因组的73对SSR标记对新疆156份陆地棉品种进行多态性扫描;采用R语言绘制boxplot图,利用TASSEL软件进行关联分析,挖掘与产量、纤维品质性状相关联的优异等位变异位点。【结果】通过对6个环境下新疆陆地棉品种的产量、品质相关性状进行关联分析,获得与产量性状相关的等位变异位点10个,表型变异解释率为6.69%~9.88%,平均值为8.43%;与纤维品质性状相关的等位变异位点23个,表型变异解释率为3.73%~13.22%,平均值为7.52%。其中22个QTL(Quantitative trait locus)已被报道,有10个QTL的关联性状与前人研究一致。【结论】新疆陆地棉品种的群体遗传结构简单,连锁不平衡水平低,6个环境条件下表型性状变化趋势较稳定。基于SSR的关联分析,发掘了与产量和纤维品质相关的优异等位变异基因及聚合优异等位基因位点的典型材料。
关键词
陆地棉
新疆
产量性状
纤维品质
关联分析
Keywords
upland cotton
Xinjiang
yield traits
fiber quality
association analysis
分类号
S562 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
棉花种子油分含量QTL的定位及遗传效应分析
丁树根
石玉杰
阿布都克尤木·阿不都热孜克
徐麟
吴元龙
李志博
林海荣
赵曾强
聂新辉
《新疆农业科学》
北大核心
2025
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
新疆陆地棉经济性状优异等位基因位点的遗传解析
雷杰杰
邵盘霞
郭春平
张大伟
唐秉晖
努日曼古丽·艾尼
彭亚娟
崔天宇
张奥深
林海荣
林忠旭
尤春源
聂新辉
《棉花学报》
CSCD
北大核心
2020
3
在线阅读
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职称材料
已选择
0
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统计分析
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