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食管鳞癌差异表达基因的筛选及其与免疫细胞浸润和预后的相关性
1
作者
王高燕
李青园
+2 位作者
杨荣芳
王永红
沈素朋
《暨南大学学报（自然科学与医学版）》
CAS
北大核心
2024年第4期337-347,共11页
目的:利用GEO数据库筛选食管鳞癌的差异表达基因(DEGs),并进一步分析这些基因与食管鳞癌中免疫细胞浸润之间的相关性,以及对预后的影响。方法:从GEO数据库筛选食管鳞状细胞癌芯片数据集GSE23400,使用R软件中的Limma包来分析DEGs。整合GS...
目的:利用GEO数据库筛选食管鳞癌的差异表达基因(DEGs),并进一步分析这些基因与食管鳞癌中免疫细胞浸润之间的相关性,以及对预后的影响。方法:从GEO数据库筛选食管鳞状细胞癌芯片数据集GSE23400,使用R软件中的Limma包来分析DEGs。整合GSE23400芯片中的两平台数据并通过GSVA包的ssGSEA算法计算每个样本免疫细胞浸润程度,并分别计算免疫浸润细胞与DEGs之间的相关性。结合GSE53624数据集分析DEGs对患者生存的影响,分析生存相关基因表达与免疫细胞浸润程度的相关性。使用GSE53622数据集验证食管鳞癌生存相关基因的表达,以及其与患者预后的关系。在38例食管鳞癌和相应癌旁非肿瘤组织中,采用免疫组织化学方法(IHC)检测EHF和CSTB的蛋白表达水平。使用RT-qPCR和Western blot检测EHF和CSTB在食管鳞癌中的mRNA和蛋白表达水平。结果:通过对104例食管鳞癌患者癌组织和正常组织的数据进行分析,共获得38个DEGs。免疫浸润研究发现免疫细胞在癌组织和正常组织中的浸润程度有所不同,38个DEGs与免疫细胞浸润程度具有相关性。在GSE53624数据集中,EHF基因表达与CD4^(+)T细胞和B细胞的浸润程度呈显著正相关,相关系数r分别为0.69和0.67(均P<0.01),CSTB基因表达与CD8^(+)T细胞和自然杀伤T细胞的浸润程度显著正相关,相关系数r分别为0.76和0.62(均P<0.01);食管癌患者中EHF和CSTB基因表达与生存时间显著相关(均P<0.05),EHF和CSTB基因高表达患者的生存时间显著高于低表达患者(中位生存期59.1 vs.24.1个月;63.1 vs.23.9个月)。在GSE53622数据集中,EHF和CSTB基因表达下调(均P<0.01),EHF和CSTB基因高表达的食管鳞癌患者比低表达患者预后好(中位生存期NA vs.29.7个月;NA vs.17.9个月,均P<0.05)。IHC结果显示,EHF和CSTB在食管鳞癌中的蛋白表达水平均低于相应癌旁组织(均P<0.05)。RT-qPCR和Western blot结果显示,EHF和CSTB在食管鳞癌细胞中的表达显著低于食管正常鳞状上皮细胞(均P<0.05)。结论:EHF和CSTB基因可能在食管鳞癌的肿瘤免疫及预后中发挥着重要作用,可以为患者免疫治疗和预后判断提供理论依据。
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关键词
食管鳞癌
EHF基因
CSTB基因
免疫细胞浸润
生存分析
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职称材料
含幽门螺杆菌特异性抗体牛奶清除幽门螺杆菌效果的临床随机试验
被引量：
4
2
作者
赵连梅
魏思思
+6 位作者
武一鹏
刘维华
赵川
胡代伦
李胜棉
王苋
单保恩
《中国免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第2期274-277,共4页
目的:比较观察抗幽门螺杆菌抗体牛奶根除幽门螺杆菌的效果。方法:用4株幽门螺杆菌(1株为标准菌株,3株为本地流行菌株)免疫奶牛,制备出抗幽门螺杆菌抗体牛奶。本次试验共筛选148例患者,C-14呼气试验阳性的患者为72例,最后符合入选标准的...
目的:比较观察抗幽门螺杆菌抗体牛奶根除幽门螺杆菌的效果。方法:用4株幽门螺杆菌(1株为标准菌株,3株为本地流行菌株)免疫奶牛,制备出抗幽门螺杆菌抗体牛奶。本次试验共筛选148例患者,C-14呼气试验阳性的患者为72例,最后符合入选标准的为39例,将符合标准的患者随机分为试验组和对照组,分别为21例和18例,试验组饮用含特异性幽门螺杆菌抗体的牛奶,对照组饮用普通牛奶,连续饮用2个月后,观察结果。结果:试验组的21名对象中,9人C-14呼气试验转为阴性,10人降低。有效清除率达42.86%,而对照组未有清除,两组清除率有统计学意义(P=0.005,P<0.05)。结论:抗幽门螺杆菌抗体牛奶具有多克隆性和很高的效价,能够有效清除胃内幽门螺杆菌。
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关键词
幽门螺杆菌
抗体牛奶
临床随机试验
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职称材料
题名
食管鳞癌差异表达基因的筛选及其与免疫细胞浸润和预后的相关性
1
作者
王高燕
李青园
杨荣芳
王永红
沈素朋
机构
河北中医药大学实验
中心
河北省中西医结合肺病重点实验室
石家庄市疾控中心
河北医科大学第四医院肿瘤研究所
出处
《暨南大学学报（自然科学与医学版）》
CAS
北大核心
2024年第4期337-347,共11页
基金
河北省重点研发计划项目(22377736D)
河北省自然科学基金项目(H2022423306,H2022206326)
+1 种基金
河北省卫健委课题项目(20221489)
河北中医学院博士基金项目(BSZ2021025)。
文摘
目的:利用GEO数据库筛选食管鳞癌的差异表达基因(DEGs),并进一步分析这些基因与食管鳞癌中免疫细胞浸润之间的相关性,以及对预后的影响。方法:从GEO数据库筛选食管鳞状细胞癌芯片数据集GSE23400,使用R软件中的Limma包来分析DEGs。整合GSE23400芯片中的两平台数据并通过GSVA包的ssGSEA算法计算每个样本免疫细胞浸润程度,并分别计算免疫浸润细胞与DEGs之间的相关性。结合GSE53624数据集分析DEGs对患者生存的影响,分析生存相关基因表达与免疫细胞浸润程度的相关性。使用GSE53622数据集验证食管鳞癌生存相关基因的表达,以及其与患者预后的关系。在38例食管鳞癌和相应癌旁非肿瘤组织中,采用免疫组织化学方法(IHC)检测EHF和CSTB的蛋白表达水平。使用RT-qPCR和Western blot检测EHF和CSTB在食管鳞癌中的mRNA和蛋白表达水平。结果:通过对104例食管鳞癌患者癌组织和正常组织的数据进行分析,共获得38个DEGs。免疫浸润研究发现免疫细胞在癌组织和正常组织中的浸润程度有所不同,38个DEGs与免疫细胞浸润程度具有相关性。在GSE53624数据集中,EHF基因表达与CD4^(+)T细胞和B细胞的浸润程度呈显著正相关,相关系数r分别为0.69和0.67(均P<0.01),CSTB基因表达与CD8^(+)T细胞和自然杀伤T细胞的浸润程度显著正相关,相关系数r分别为0.76和0.62(均P<0.01);食管癌患者中EHF和CSTB基因表达与生存时间显著相关(均P<0.05),EHF和CSTB基因高表达患者的生存时间显著高于低表达患者(中位生存期59.1 vs.24.1个月;63.1 vs.23.9个月)。在GSE53622数据集中,EHF和CSTB基因表达下调(均P<0.01),EHF和CSTB基因高表达的食管鳞癌患者比低表达患者预后好(中位生存期NA vs.29.7个月;NA vs.17.9个月,均P<0.05)。IHC结果显示,EHF和CSTB在食管鳞癌中的蛋白表达水平均低于相应癌旁组织(均P<0.05)。RT-qPCR和Western blot结果显示,EHF和CSTB在食管鳞癌细胞中的表达显著低于食管正常鳞状上皮细胞(均P<0.05)。结论:EHF和CSTB基因可能在食管鳞癌的肿瘤免疫及预后中发挥着重要作用,可以为患者免疫治疗和预后判断提供理论依据。
关键词
食管鳞癌
EHF基因
CSTB基因
免疫细胞浸润
生存分析
Keywords
esophageal squamous cell carcinoma
EHF gene
CSTB gene
immune cell infiltration
survival analysis
分类号
R735.1 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
含幽门螺杆菌特异性抗体牛奶清除幽门螺杆菌效果的临床随机试验
被引量：
4
2
作者
赵连梅
魏思思
武一鹏
刘维华
赵川
胡代伦
李胜棉
王苋
单保恩
机构
河北医科大学第四医院科研
中心
石家庄市疾控中心
河北医科大学l临床学院
出处
《中国免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第2期274-277,共4页
基金
国家自然科学基金(81502032)
河北省中医药管理局研究项目(2015130)
河北省自然科学基金(H2015206376)项目资助
文摘
目的:比较观察抗幽门螺杆菌抗体牛奶根除幽门螺杆菌的效果。方法:用4株幽门螺杆菌(1株为标准菌株,3株为本地流行菌株)免疫奶牛,制备出抗幽门螺杆菌抗体牛奶。本次试验共筛选148例患者,C-14呼气试验阳性的患者为72例,最后符合入选标准的为39例,将符合标准的患者随机分为试验组和对照组,分别为21例和18例,试验组饮用含特异性幽门螺杆菌抗体的牛奶,对照组饮用普通牛奶,连续饮用2个月后,观察结果。结果:试验组的21名对象中,9人C-14呼气试验转为阴性,10人降低。有效清除率达42.86%,而对照组未有清除,两组清除率有统计学意义(P=0.005,P<0.05)。结论:抗幽门螺杆菌抗体牛奶具有多克隆性和很高的效价,能够有效清除胃内幽门螺杆菌。
关键词
幽门螺杆菌
抗体牛奶
临床随机试验
Keywords
Helicobacter pylori
Antibody milk
Randomized clinical trial
分类号
R186 [医药卫生—流行病学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
食管鳞癌差异表达基因的筛选及其与免疫细胞浸润和预后的相关性
王高燕
李青园
杨荣芳
王永红
沈素朋
《暨南大学学报（自然科学与医学版）》
CAS
北大核心
2024
0
在线阅读
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职称材料
2
含幽门螺杆菌特异性抗体牛奶清除幽门螺杆菌效果的临床随机试验
赵连梅
魏思思
武一鹏
刘维华
赵川
胡代伦
李胜棉
王苋
单保恩
《中国免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2017
4
在线阅读
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职称材料
已选择
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引证文献
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