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冷胁迫下甘蓝型冬油菜表达蛋白及BnGSTs基因家族的鉴定与分析
被引量：
4
1
作者
马骊
白静
+10 位作者
赵玉红
孙柏林
侯献飞
方彦
王旺田
蒲媛媛
刘丽君
徐佳
陶肖蕾
孙万仓
武军艳
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第1期153-166,共14页
谷胱甘肽S-转移酶(glutathione S-transferases, GST)参与调节植物生长、发育和逆境胁迫反应的许多方面。本研究利用双向电泳和质谱技术分析‘16VHNTS309’在冷胁迫下差异表达的蛋白质,基于GO和KEGG分析鉴定出BE、APX、SOD、GST等参与...
谷胱甘肽S-转移酶(glutathione S-transferases, GST)参与调节植物生长、发育和逆境胁迫反应的许多方面。本研究利用双向电泳和质谱技术分析‘16VHNTS309’在冷胁迫下差异表达的蛋白质,基于GO和KEGG分析鉴定出BE、APX、SOD、GST等参与冷胁迫反应的蛋白质。利用q RT-PCR和生理指标鉴定到响应冷胁迫的关键蛋白质GST,采用同源克隆法克隆到‘16VHNTS309’的GST基因。该基因CDS长度为642bp,编码213个氨基酸,是一个不稳定蛋白,属于GST_N_3谷胱甘肽S-转移酶家族,与甘蓝型油菜‘ZS11’序列相似性为99.22%,与‘ZS11’和‘Vision’两者的氨基酸序列相比较发现第127位亮氨酸(L)突变为脯氨酸(P)。基因家族分析表明,在甘蓝型油菜中共鉴定到153个Bn GSTs成员,按其功能主要分为Zeta、Phi、Theta、CHQ、DHAR、Lambda和Tau这七大类型,大部分的Bn GSTs属于Phi和Tau这2种类型。系统进化将Bn GSTs分为12个亚家族,亚家族Ⅰ和Ⅷ包含了较多的成员,Bn GSTs不均匀的分布在18条染色体上, C06染色体上分布Bn GSTs基因数量最多,含有10个保守的蛋白质基序。Bn GSTs基因家族中有99对基因存在共线性关系, 131个基因来自基因复制事件,片段重复事件在Bn GSTs基因的进化中起着重要作用。冷胁迫下Bna A02g35760D、Bna C06g20450D、Bna C06g35490D、Bna A02g03230D和Bna A02g35980D在强抗寒品种中的显著高表达,是弱抗寒品种的7~12倍,并且强抗寒品种具有较高的生理酶活性。另外,在冷冻胁迫下鉴定到一些瞬时和持续表达的关键候选基因。这些结果为进一步研究Bn GSTs基因在强抗寒甘蓝型冬油菜抗寒分子调控中的作用奠定基础。
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关键词
甘蓝型冬油菜
冷胁迫
蛋白质谱
GST基因家族
表达模式
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职称材料
题名
冷胁迫下甘蓝型冬油菜表达蛋白及BnGSTs基因家族的鉴定与分析
被引量：
4
1
作者
马骊
白静
赵玉红
孙柏林
侯献飞
方彦
王旺田
蒲媛媛
刘丽君
徐佳
陶肖蕾
孙万仓
武军艳
机构
省部共建干旱生境作物学国家重点实验室/甘肃省油菜工程技术研究中心/甘肃农业大学农学院
张掖市
农业
科
学院
甘肃
亚盛
农业
研究
院有限公司
新疆
农业
科
学院
经济
作物
研究
所
出处
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第1期153-166,共14页
基金
甘肃省青年科技计划项目(21JR7RA835)
省部共建干旱生境作物学国家重点实验室(甘肃农业大学)开放基金课题(GSCS-2020-06)
财政部和农业农村部国家现代农业产业技术体系建设专项(CARS-12)资助。
文摘
谷胱甘肽S-转移酶(glutathione S-transferases, GST)参与调节植物生长、发育和逆境胁迫反应的许多方面。本研究利用双向电泳和质谱技术分析‘16VHNTS309’在冷胁迫下差异表达的蛋白质,基于GO和KEGG分析鉴定出BE、APX、SOD、GST等参与冷胁迫反应的蛋白质。利用q RT-PCR和生理指标鉴定到响应冷胁迫的关键蛋白质GST,采用同源克隆法克隆到‘16VHNTS309’的GST基因。该基因CDS长度为642bp,编码213个氨基酸,是一个不稳定蛋白,属于GST_N_3谷胱甘肽S-转移酶家族,与甘蓝型油菜‘ZS11’序列相似性为99.22%,与‘ZS11’和‘Vision’两者的氨基酸序列相比较发现第127位亮氨酸(L)突变为脯氨酸(P)。基因家族分析表明,在甘蓝型油菜中共鉴定到153个Bn GSTs成员,按其功能主要分为Zeta、Phi、Theta、CHQ、DHAR、Lambda和Tau这七大类型,大部分的Bn GSTs属于Phi和Tau这2种类型。系统进化将Bn GSTs分为12个亚家族,亚家族Ⅰ和Ⅷ包含了较多的成员,Bn GSTs不均匀的分布在18条染色体上, C06染色体上分布Bn GSTs基因数量最多,含有10个保守的蛋白质基序。Bn GSTs基因家族中有99对基因存在共线性关系, 131个基因来自基因复制事件,片段重复事件在Bn GSTs基因的进化中起着重要作用。冷胁迫下Bna A02g35760D、Bna C06g20450D、Bna C06g35490D、Bna A02g03230D和Bna A02g35980D在强抗寒品种中的显著高表达,是弱抗寒品种的7~12倍,并且强抗寒品种具有较高的生理酶活性。另外,在冷冻胁迫下鉴定到一些瞬时和持续表达的关键候选基因。这些结果为进一步研究Bn GSTs基因在强抗寒甘蓝型冬油菜抗寒分子调控中的作用奠定基础。
关键词
甘蓝型冬油菜
冷胁迫
蛋白质谱
GST基因家族
表达模式
Keywords
winter Brassica napus L.
cold stress
protein mass spectrometry
GST gene family
expression pattern
分类号
S565.4 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
冷胁迫下甘蓝型冬油菜表达蛋白及BnGSTs基因家族的鉴定与分析
马骊
白静
赵玉红
孙柏林
侯献飞
方彦
王旺田
蒲媛媛
刘丽君
徐佳
陶肖蕾
孙万仓
武军艳
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
4
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