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豌豆CBF基因家族的生物信息学及低温胁迫下的表达分析
1
作者 张楠 王旺田 +5 位作者 孙万仓 武军艳 马骊 杨刚 蒲媛媛 刘丽君 《甘肃农业大学学报》 CAS CSCD 2023年第1期101-113,共13页
【目的】为了更加全面地探究CBF基因家族在豌豆中的进化及生物学特征。【方法】通过生物信息学方法从基因家族鉴定、结构分析、蛋白基本理化性质、亚细胞定位、染色体定位、顺式作用元件、蛋白质相互作用与表达分析等方面,对豌豆PsCBF... 【目的】为了更加全面地探究CBF基因家族在豌豆中的进化及生物学特征。【方法】通过生物信息学方法从基因家族鉴定、结构分析、蛋白基本理化性质、亚细胞定位、染色体定位、顺式作用元件、蛋白质相互作用与表达分析等方面,对豌豆PsCBF基因家族进行系统鉴定和分子特征分析。【结果】在豌豆中共鉴定出21个PsCBF基因,染色体定位显示18个PsCBF基因分布在1、2、4、6与7号染色体上,其余3个未组装到染色体上(PsCBF19~PsCBF21)。21个PsCBF基因编码蛋白的氨基酸数在123(PsCBF09)~349(PsCBF11),且均属于疏水性蛋白。亚细胞定位预测显示18个PsCBF基因(85.71%)定位在细胞核上,二级结构主要以无规则延伸为主。蛋白基序显示同一类群的基因都具相似的保守基序特征且该家族成员包含1~7个保守基序;同一类群的基因也具有相似的基因结构,且该家族基因含1~2个外显子。PsCBF基因启动子区分析表明其含有多种顺势作用元件,在激素反应,组织特异表达以及逆境响应中起作用。蛋白聚类网络图显示其蛋白可能在豌豆应对非生物胁迫中起调节作用。此外,本研究发现低温胁迫后K2SiO3处理下大部分PsCBF基因的表达发生显著变化。【结论】本研究结果将为进一步分析豌豆PsCBF转录因子调控碗豆生物学过程及功能、碗豆抗寒的分子鉴定以及抗寒资源创新利用研究提供参考依据。 展开更多
关键词 豌豆 CBF基因家族 生物信息学分析 基因表达分析
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增密对不同品种胡麻干物质积累分配和产量形成的影响 被引量：2
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作者 赵永伟 王一帆 +8 位作者 吴兵 马伟明 李瑛 李文珍 刘宝文 汪国峰 崔政军 剡斌 高玉红 《中国油料作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期349-358,共10页
通过分析增密条件下胡麻干物质积累分配及与籽粒产量形成的相关关系,探讨不同品种胡麻增密后产量差异,为西北旱区胡麻高产栽培模式提供理论支撑。2017-2018年,在陇中黄土高原半干旱丘陵沟壑区,设置3个胡麻品种:定亚23号(V1)、晋亚10号(... 通过分析增密条件下胡麻干物质积累分配及与籽粒产量形成的相关关系,探讨不同品种胡麻增密后产量差异,为西北旱区胡麻高产栽培模式提供理论支撑。2017-2018年,在陇中黄土高原半干旱丘陵沟壑区,设置3个胡麻品种:定亚23号(V1)、晋亚10号(V2)、轮选3号(V3),以及3个种植密度:300(D1,传统密度:低密度)、420(D2,增密40%:中密度)和540(D3,增密80%:高密度)万株/hm^(2),研究增密条件下不同品种胡麻干物质积累分配、叶茎干物质转运率和对籽粒的贡献率、叶面积指数、产量及产量构成的差异,以期为优化试区胡麻高产高效栽培模式提供理论依据。两年种植密度均显著影响胡麻干物质积累量,盛花期,高密度干物质积累量较中、低密度分别提高50.9%、79.5%,青果期提高27.9%、38.7%,成熟期分别提高18.1%和55.6%;不同品种比较,2018年轮选3号干物质积累量较晋亚10号和定亚23号高9.6%和8.5%。2017年高密度处理的胡麻叶片干物质转运量较中、低密度分别提高35.1%、69.8%,2018年提高85.4%、229.7%,叶对籽粒的贡献率高密度处理较中、低密度分别提高40.0%和130.9%;从盛花至成熟期,轮选3号在高密度下可保持较高的LAI,较其他处理平均高出42.6%~87.2%和27.1%~53.8%。两年度下,晋亚10号在中密度下籽粒产量均高于其他处理7.8%~25.2%和7.0%~15.2%,其主要原因是提高了胡麻每公顷成株数。 展开更多
关键词 密度 胡麻 品种 干物质积累与分配 叶面积指数 产量
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低温胁迫下甘蓝型冬油菜BnYUCCA8基因差异表达及内源生长素含量变化 被引量：3
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作者 呼芳娣 刘丽君 +11 位作者 马骊 牛早霞 孙柏林 徐佳 杨雯昕 刘博 蒲媛媛 武军艳 方彦 李学才 沈金雄 孙万仓 《干旱地区农业研究》 CSCD 北大核心 2022年第3期1-10,共10页
甘蓝型冬油菜下胚轴长短与其抗寒性强弱呈负相关关系。为研究下胚轴伸长相关的BnYUCCA8基因对低温胁迫的响应,采用同源克隆技术从甘蓝型冬油菜中克隆了BnYUCCA8基因,其CDS全长1281 bp,编码426个氨基酸。生物信息学分析表明,BnYUCCA8蛋... 甘蓝型冬油菜下胚轴长短与其抗寒性强弱呈负相关关系。为研究下胚轴伸长相关的BnYUCCA8基因对低温胁迫的响应,采用同源克隆技术从甘蓝型冬油菜中克隆了BnYUCCA8基因,其CDS全长1281 bp,编码426个氨基酸。生物信息学分析表明,BnYUCCA8蛋白是一个不稳定的疏水性蛋白,与埃塞俄比亚芥和甘蓝中YUCCA8蛋白的亲缘关系最近。荧光定量PCR结果表明,BnYUCCA8在叶和根中表达量最高,花和角果中表达量相对较低,且苗期表达量高于花期。随低温胁迫加剧,BnYUCCA8表达量总体呈降低趋势,且‘天油2288’(下胚轴伸长较长的弱抗寒品种)较‘16VHNTS158’(下胚轴伸长较短的强抗寒品种)基因表达量高。内源IAA含量的测定结果表明,在低温处理24 h时,‘16VHNTS158’中IAA含量在4℃、0℃、-4℃较常温(22℃)分别降低68%、92%、97%,‘天油2288’中分别降低了77%、89%、94%,且‘16VHNTS158’较‘天油2288’IAA含量在常温、4℃、0℃、-4℃分别低19%、14%、40%、39%。对BnYUCCA8相对表达量、内源IAA含量和下胚轴长度进行相关性分析,结果表明,‘16VHNTS158’和‘天油2288’的BnYUCCA8相对表达量和生长素含量之间的相关系数分别为0.682和0.812,存在显著和极显著正相关关系,下胚轴长度与基因相对表达量之间的相关系数分别为0.54和0.41,与生长素含量之间的相关系数分别为0.427和0.591,为正相关关系。由此说明甘蓝型冬油菜BnYUCCA8可能在下胚轴长度和内源IAA含量中发挥重要调节作用。 展开更多
关键词 甘蓝型冬油菜 BnYUCCA8基因 差异表达 低温胁迫 内源IAA含量
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