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题名双硫死亡相关LncRNA的胃癌预后模型构建与验证
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作者
凤亮
曹志国
石小琪
张启坤
陈昌裕
余昌俊
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机构
安徽医科大学第一附属医院胃肠外科
皖西卫生职业学院附属医院血管外科
安徽医科大学第一附属医院放射肿瘤科
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出处
《安徽医科大学学报》
CAS
北大核心
2024年第8期1429-1439,共11页
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基金
安徽省转化医学研究院科研基金(编号:2022zhyx-C69)
安徽高等学校自然科学研究项目(编号:2022AH051174、KJ2021ZD0025、KJ2021A1363)
安徽省高校学科(专业)拔尖人才学术资助项目(编号:gxbjZD2022125)。
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文摘
目的 基于二硫化物应激导致的新型细胞死亡类型,探究与其相关的长链非编码RNA(LncRNA)在胃癌中的作用,建立双硫死亡相关的胃癌预后模型,为胃癌治疗的预后情况评估提供新的方式。方法 使用公开数据库TCGA获得胃癌与正常组织样本的转录组数据,并通过Pearson分析与LASSO-Cox回归分析挑选双硫死亡相关LncRNA。基于上述LncRNA构建出相关的胃癌预后模型,并通过功能富集分析、肿瘤微环境和免疫细胞浸润分析、药物敏感性分析、定量逆转录PCR(RT-qPCR)等进行验证。结果 本研究识别出400个双硫死亡相关的LncRNA,并筛选出其中5个构建预后模型,用于评估胃癌患者的预后情况。模型在验证中显示,高风险评分组的生存期明显短于低风险评分组(P<0.05)。此外,预后模型的预测能力(AUC=0.725)优于仅依据年龄和性别等基本特征进行预测。双硫死亡相关LncRNA在正常组织与胃癌组织中的表达水平存在显著差异(P<0.001)。结论 该研究构建的双硫死亡相关LncRNA预后模型可以用于评估胃癌患者的预后情况和肿瘤微环境,为胃癌新的免疫治疗策略提供潜在的靶点和理论基础。
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关键词
长链非编码RNA
细胞死亡
胃癌
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Keywords
long non-coding RNA
cell death
gastric cancer
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分类号
R735.2
[医药卫生—肿瘤]
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