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芒果bZIP转录因子基因的克隆、亚细胞定位及表达分析
被引量：
3
1
作者
李健
李曦
农艳丰
《江苏农业科学》
北大核心
2023年第21期29-36,共8页
碱性亮氨酸拉链(bZIP)转录因子在调控植物生长发育及抵抗非生物胁迫过程中具有重要作用。本研究通过RACE技术,获得了全长1 317 bp的芒果bZIP转录因子基因(MibZIP46)。系统进化树分析结果表明,MibZIP46与同样是漆树科的阿月浑子的bZIP亲...
碱性亮氨酸拉链(bZIP)转录因子在调控植物生长发育及抵抗非生物胁迫过程中具有重要作用。本研究通过RACE技术,获得了全长1 317 bp的芒果bZIP转录因子基因(MibZIP46)。系统进化树分析结果表明,MibZIP46与同样是漆树科的阿月浑子的bZIP亲缘关系最为接近,同源性最高,与甜橙的同源性次之。构建了原核表达重组质粒pCZN 1-MibZIP46,经0.2 mmol/L IPTG诱导,目的蛋白以包涵体的形式表达,经镍柱纯化,获得高纯度(90%)的目的蛋白并成功进行Western blotting鉴定;MibZIP46蛋白的亚细胞定位分析结果表明,融合的目的蛋白在烟草叶片细胞中定位于细胞核;实时荧光定量PCR分析结果表明,200 mmol/L NaCl、15%PEG和0.1 mmol/L ABA胁迫处理,均能不同程度诱导MibZIP46的表达。本研究为进一步挖掘利用芒果的抗逆相关基因提供了理论依据。
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关键词
芒果
碱性亮氨酸拉链(bZIP)转录因子
基因克隆
基因表达
胁迫处理
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职称材料
龙珠果NBS-LRR类抗病基因同源序列的克隆与分析
被引量：
1
2
作者
杨翠凤
滕峥
+1 位作者
廖志东
韦春
《中国南方果树》
北大核心
2024年第5期63-69,73,共8页
龙珠果Passiflora foetida L.为西番莲属的近缘野生种,具有抗逆性强、适应性广等特点,是西番莲抗病育种潜在的抗病基因资源库。根据已知植物抗病基因NBS-LRR保守结构域设计简并引物,以龙珠果为试材,克隆龙珠果基因组中NBS-LRR类抗病基...
龙珠果Passiflora foetida L.为西番莲属的近缘野生种,具有抗逆性强、适应性广等特点,是西番莲抗病育种潜在的抗病基因资源库。根据已知植物抗病基因NBS-LRR保守结构域设计简并引物,以龙珠果为试材,克隆龙珠果基因组中NBS-LRR类抗病基因同源序列(RGAs),并进行聚类分析。结果表明,获得的龙珠果NBS-LRR类抗病基因序列有TIR和non-TIR两种类型,其中TIR-NBS-LRR类型5条,编号为LRGA-1~LRGA-5;non-TIR-NBS-LRR类型7条,编号为LRGA-6~LRGA-12。聚类分析发现,LRGA-1~LRGA-5与已知的烟草抗TMV(烟草花叶病毒)基因N及亚麻抗锈病基因L6同源性较高(相似性59%~86%),LRGA-6~LRGA-12与已知拟南芥抗丁香假单胞病菌基因RPM1及水稻抗白叶枯病基因Xa-1同源性较高(相似性51%~70%),尤其是LRGA-3与LRGA-5序列,与多种植物抗TMV蛋白基因编码的氨基酸相似性极高,推测可能为西番莲属抗TMV基因。
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关键词
龙珠果
西番莲
NBS-LRR
抗病基因
同源性
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职称材料
百香果苯丙氨酸解氨酶基因PePAL克隆及表达分析
被引量：
4
3
作者
杨翠凤
滕峥
+1 位作者
韦春
刘正鲁
《河南农业科学》
北大核心
2023年第10期100-108,共9页
为探讨百香果中苯丙氨酸解氨酶(PAL)编码基因的序列结构和蛋白质功能,以台农1号百香果(Passiflora edulis Sims)为材料,以cDNA为模板对PePAL基因进行同源克隆,同时对PePAL编码蛋白质的结构及功能进行预测。结果表明,PePAL基因cDNA全长24...
为探讨百香果中苯丙氨酸解氨酶(PAL)编码基因的序列结构和蛋白质功能,以台农1号百香果(Passiflora edulis Sims)为材料,以cDNA为模板对PePAL基因进行同源克隆,同时对PePAL编码蛋白质的结构及功能进行预测。结果表明,PePAL基因cDNA全长2499 bp,含有1个完整开放阅读框(2124 bp),编码707个氨基酸,蛋白质分子质量为173.43 ku。利用ProtParam、SignalP 4.1软件及TMHMM等软件对PePAL蛋白的结构预测显示,该蛋白质是一个亲水性的非分泌型蛋白,无跨膜结构域,无信号肽。PePAL主要定位于细胞核、叶绿体、细胞质、细胞膜、线粒体、液泡等部位,其二级结构由α螺旋、延伸链、β转角及无规则卷曲组成。PePAL在不同品种百香果的同一结果枝上的表达模式均呈现花中表达量最高,其次是茎,在成熟叶中表达量最低。
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关键词
百香果
苯丙氨酸解氨酶
基因克隆
表达分析
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职称材料
题名
芒果bZIP转录因子基因的克隆、亚细胞定位及表达分析
被引量：
3
1
作者
李健
李曦
农艳丰
机构
百色学院农业与食品工程学院/广西芒果生物学重点实验室/亚热带特色农业产业学院
出处
《江苏农业科学》
北大核心
2023年第21期29-36,共8页
基金
广西自然科学基金(编号:2018GXNSFBA050026)
广西高校中青年教师科研基础能力提升项目(编号:2019KY0743、2020KY19025)。
文摘
碱性亮氨酸拉链(bZIP)转录因子在调控植物生长发育及抵抗非生物胁迫过程中具有重要作用。本研究通过RACE技术,获得了全长1 317 bp的芒果bZIP转录因子基因(MibZIP46)。系统进化树分析结果表明,MibZIP46与同样是漆树科的阿月浑子的bZIP亲缘关系最为接近,同源性最高,与甜橙的同源性次之。构建了原核表达重组质粒pCZN 1-MibZIP46,经0.2 mmol/L IPTG诱导,目的蛋白以包涵体的形式表达,经镍柱纯化,获得高纯度(90%)的目的蛋白并成功进行Western blotting鉴定;MibZIP46蛋白的亚细胞定位分析结果表明,融合的目的蛋白在烟草叶片细胞中定位于细胞核;实时荧光定量PCR分析结果表明,200 mmol/L NaCl、15%PEG和0.1 mmol/L ABA胁迫处理,均能不同程度诱导MibZIP46的表达。本研究为进一步挖掘利用芒果的抗逆相关基因提供了理论依据。
关键词
芒果
碱性亮氨酸拉链(bZIP)转录因子
基因克隆
基因表达
胁迫处理
分类号
S667.701 [农业科学—果树学]
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职称材料
题名
龙珠果NBS-LRR类抗病基因同源序列的克隆与分析
被引量：
1
2
作者
杨翠凤
滕峥
廖志东
韦春
机构
百色学院农业与食品工程学院/广西芒果生物学重点实验室/亚热带特色农业产业学院
出处
《中国南方果树》
北大核心
2024年第5期63-69,73,共8页
基金
广西自然科学基金(2022GXNSFBA035462、2023GXNSFBA026046)
广西科技基地和人才专项(2020AC20047)
广西一流学科建设项目(农业资源与环境,桂教科研[2022]1号)资助。
文摘
龙珠果Passiflora foetida L.为西番莲属的近缘野生种,具有抗逆性强、适应性广等特点,是西番莲抗病育种潜在的抗病基因资源库。根据已知植物抗病基因NBS-LRR保守结构域设计简并引物,以龙珠果为试材,克隆龙珠果基因组中NBS-LRR类抗病基因同源序列(RGAs),并进行聚类分析。结果表明,获得的龙珠果NBS-LRR类抗病基因序列有TIR和non-TIR两种类型,其中TIR-NBS-LRR类型5条,编号为LRGA-1~LRGA-5;non-TIR-NBS-LRR类型7条,编号为LRGA-6~LRGA-12。聚类分析发现,LRGA-1~LRGA-5与已知的烟草抗TMV(烟草花叶病毒)基因N及亚麻抗锈病基因L6同源性较高(相似性59%~86%),LRGA-6~LRGA-12与已知拟南芥抗丁香假单胞病菌基因RPM1及水稻抗白叶枯病基因Xa-1同源性较高(相似性51%~70%),尤其是LRGA-3与LRGA-5序列,与多种植物抗TMV蛋白基因编码的氨基酸相似性极高,推测可能为西番莲属抗TMV基因。
关键词
龙珠果
西番莲
NBS-LRR
抗病基因
同源性
Keywords
Passiflora foetida L.
Passiflora
NBS-LRR
disease resistant genes
homology
分类号
S667.9 [农业科学—果树学]
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职称材料
题名
百香果苯丙氨酸解氨酶基因PePAL克隆及表达分析
被引量：
4
3
作者
杨翠凤
滕峥
韦春
刘正鲁
机构
百色学院农业与食品工程学院/广西芒果生物学重点实验室/亚热带特色农业产业学院
出处
《河南农业科学》
北大核心
2023年第10期100-108,共9页
基金
广西自然科学基金项目(2021JJB130444,2022JJB130088)
广西科技基地和人才专项(2020AC20047)
百色市科技支撑计划项目(百科20203203)。
文摘
为探讨百香果中苯丙氨酸解氨酶(PAL)编码基因的序列结构和蛋白质功能,以台农1号百香果(Passiflora edulis Sims)为材料,以cDNA为模板对PePAL基因进行同源克隆,同时对PePAL编码蛋白质的结构及功能进行预测。结果表明,PePAL基因cDNA全长2499 bp,含有1个完整开放阅读框(2124 bp),编码707个氨基酸,蛋白质分子质量为173.43 ku。利用ProtParam、SignalP 4.1软件及TMHMM等软件对PePAL蛋白的结构预测显示,该蛋白质是一个亲水性的非分泌型蛋白,无跨膜结构域,无信号肽。PePAL主要定位于细胞核、叶绿体、细胞质、细胞膜、线粒体、液泡等部位,其二级结构由α螺旋、延伸链、β转角及无规则卷曲组成。PePAL在不同品种百香果的同一结果枝上的表达模式均呈现花中表达量最高,其次是茎,在成熟叶中表达量最低。
关键词
百香果
苯丙氨酸解氨酶
基因克隆
表达分析
Keywords
Passiflora edulis Sims
PAL
Gene cloning
Expression analysis
分类号
S667.9 [农业科学—果树学]
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作者
出处
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被引量
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1
芒果bZIP转录因子基因的克隆、亚细胞定位及表达分析
李健
李曦
农艳丰
《江苏农业科学》
北大核心
2023
3
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职称材料
2
龙珠果NBS-LRR类抗病基因同源序列的克隆与分析
杨翠凤
滕峥
廖志东
韦春
《中国南方果树》
北大核心
2024
1
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职称材料
3
百香果苯丙氨酸解氨酶基因PePAL克隆及表达分析
杨翠凤
滕峥
韦春
刘正鲁
《河南农业科学》
北大核心
2023
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