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水液相环境下氢氧根催化天冬氨酸手性对映体转变及质子的作用
被引量：
2
1
作者
乔朝阳
闫红彦
+4 位作者
孙永清
刘一司
吕路瑶
佟华
王佐成
《中山大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第1期144-153,共10页
采用色散校正密度泛函的ωB97X-D方法、微扰理论的MP2方法和自洽反应场的SMD模型方法,研究了Asp分子2种稳定构象(Asp_1和Asp_2)的标题反应。反应通道与势能面的研究发现:Asp分子经过氢氧根(水分子簇)和α-碳抽氢及α-羧羟基、β-羧羟基...
采用色散校正密度泛函的ωB97X-D方法、微扰理论的MP2方法和自洽反应场的SMD模型方法,研究了Asp分子2种稳定构象(Asp_1和Asp_2)的标题反应。反应通道与势能面的研究发现:Asp分子经过氢氧根(水分子簇)和α-碳抽氢及α-羧羟基、β-羧羟基、β-羧基和R-基旋转的一系列过渡态,实现了手性对映体转变。氢氧根抽α-氢和α-碳抽水分子的氢致Asp_1和Asp_2旋光异构的决速步内禀能垒在27.0 kJ/mol左右;水分子辅助氢氧根离子抽α-氢和α-碳抽2个水分子簇的氢致Asp_1和Asp_2旋光异构的决速步内禀能垒分别是34.0和40.0 kJ/mol左右。质子攻击中间体碳负离子的α-碳会加快Asp手性转变的进程。
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关键词
手性对映体
天冬氨酸
氢氧根
水分子
密度泛函理论
微扰理论
SMD模型
能垒
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职称材料
水环境下羟自由基致Asp分子损伤机理
被引量：
9
2
作者
马宏源
姜春旭
+4 位作者
庄严
李冰
孙永清
杨晓翠
王佐成
《吉林大学学报（理学版）》
CAS
北大核心
2019年第5期1246-1254,共9页
采用色散校正密度泛函的WB97X-D、从头算的MP2及自洽反应场理论的SMD模型等方法,研究在水气相和水液相环境下羟自由基抽取α-氢致天冬氨酸(Asp)损伤的反应机理.结果表明:水分子辅助羟自由基抽取α-氢致Asp损伤反应有2个通道a和b,在通道...
采用色散校正密度泛函的WB97X-D、从头算的MP2及自洽反应场理论的SMD模型等方法,研究在水气相和水液相环境下羟自由基抽取α-氢致天冬氨酸(Asp)损伤的反应机理.结果表明:水分子辅助羟自由基抽取α-氢致Asp损伤反应有2个通道a和b,在通道a中羟自由基水分子簇与α-氢和氨基氮通过氢键作用形成配合物损伤,在通道b中羟自由基水分子簇与α-氢和羰基氧通过氢键作用形成配合物损伤,该通道为优势通道;水气相和水液相环境下的反应活化能分别为-0.7,18.7kJ/mol;羟自由基抽取α-氢致Asp损伤的反应有1个通道,水气相和水液相环境下的反应活化能分别为8.1,29.9kJ/mol.
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关键词
天冬氨酸
损伤
羟自由基
密度泛函理论
从头算
SMD模型
活化能
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职称材料
题名
水液相环境下氢氧根催化天冬氨酸手性对映体转变及质子的作用
被引量：
2
1
作者
乔朝阳
闫红彦
孙永清
刘一司
吕路瑶
佟华
王佐成
机构
白城
师范
学院
计算机科学
学院
白城技师学院基础部
白城
师范
学院
物理
学院
出处
《中山大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第1期144-153,共10页
基金
吉林省科技发展计划自然科学基金(20130101308JC)
吉林省大学生创新项目(2019056)
文摘
采用色散校正密度泛函的ωB97X-D方法、微扰理论的MP2方法和自洽反应场的SMD模型方法,研究了Asp分子2种稳定构象(Asp_1和Asp_2)的标题反应。反应通道与势能面的研究发现:Asp分子经过氢氧根(水分子簇)和α-碳抽氢及α-羧羟基、β-羧羟基、β-羧基和R-基旋转的一系列过渡态,实现了手性对映体转变。氢氧根抽α-氢和α-碳抽水分子的氢致Asp_1和Asp_2旋光异构的决速步内禀能垒在27.0 kJ/mol左右;水分子辅助氢氧根离子抽α-氢和α-碳抽2个水分子簇的氢致Asp_1和Asp_2旋光异构的决速步内禀能垒分别是34.0和40.0 kJ/mol左右。质子攻击中间体碳负离子的α-碳会加快Asp手性转变的进程。
关键词
手性对映体
天冬氨酸
氢氧根
水分子
密度泛函理论
微扰理论
SMD模型
能垒
Keywords
chiral enantiomer
aspartic
hydroxyl
water molecule
density functional theory
perturbation theory
SMD model
energy barrier
分类号
O641.12 [理学—物理化学]
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职称材料
题名
水环境下羟自由基致Asp分子损伤机理
被引量：
9
2
作者
马宏源
姜春旭
庄严
李冰
孙永清
杨晓翠
王佐成
机构
白城
师范
学院
物理与电子信息
学院
白城
师范
学院
计算机科学
学院
白城
师范
学院
机械工程
学院
白城技师学院基础部
出处
《吉林大学学报（理学版）》
CAS
北大核心
2019年第5期1246-1254,共9页
基金
吉林省自然科学基金(批准号:20130101308JC)
文摘
采用色散校正密度泛函的WB97X-D、从头算的MP2及自洽反应场理论的SMD模型等方法,研究在水气相和水液相环境下羟自由基抽取α-氢致天冬氨酸(Asp)损伤的反应机理.结果表明:水分子辅助羟自由基抽取α-氢致Asp损伤反应有2个通道a和b,在通道a中羟自由基水分子簇与α-氢和氨基氮通过氢键作用形成配合物损伤,在通道b中羟自由基水分子簇与α-氢和羰基氧通过氢键作用形成配合物损伤,该通道为优势通道;水气相和水液相环境下的反应活化能分别为-0.7,18.7kJ/mol;羟自由基抽取α-氢致Asp损伤的反应有1个通道,水气相和水液相环境下的反应活化能分别为8.1,29.9kJ/mol.
关键词
天冬氨酸
损伤
羟自由基
密度泛函理论
从头算
SMD模型
活化能
Keywords
aspartic acid
damage
hydroxyl radical
density functional theory
ab initio
SMD model
activation energy
分类号
O641.12 [理学—物理化学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
水液相环境下氢氧根催化天冬氨酸手性对映体转变及质子的作用
乔朝阳
闫红彦
孙永清
刘一司
吕路瑶
佟华
王佐成
《中山大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2020
2
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职称材料
2
水环境下羟自由基致Asp分子损伤机理
马宏源
姜春旭
庄严
李冰
孙永清
杨晓翠
王佐成
《吉林大学学报（理学版）》
CAS
北大核心
2019
9
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