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环境胞外胞内DNA的行为归趋及生态功能研究进展
被引量：
2
1
作者
张忠云
叶茂
+4 位作者
孙明明
黄丹
张胜田
胡锋
蒋新
《生态毒理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第6期10-23,共14页
胞外DNA(extracellular DNA,extDNA)和胞内DNA(intracellular DNA,intDNA)广泛存在于陆生和水生生态环境系统中,密切参与环境-微生物和微生物种间的吸附、降解和自然转化等过程,在物质循环和基因信息传递中发挥重要的生态学作用。胞外DN...
胞外DNA(extracellular DNA,extDNA)和胞内DNA(intracellular DNA,intDNA)广泛存在于陆生和水生生态环境系统中,密切参与环境-微生物和微生物种间的吸附、降解和自然转化等过程,在物质循环和基因信息传递中发挥重要的生态学作用。胞外DNA在环境中不易受核酸酶攻击,相对稳定,可作为历史微生物基因库,与胞内DNA都可反映功能基因丰度及其对应微生物活性;同时,胞外DNA是细胞生物膜中的重要组分,在微生物细胞抵御抗生素、重金属和农药等外来污染物胁迫中发挥了重要作用。本文从ext/intDNA环境行为、extDNA在生物膜中的环境作用、物质信息传递和ext/intDNA生态学功能等角度,综述了环境ext/intDNA的行为归趋及生态功能研究进展,提出了现阶段研究不足,并对未来研究方向进行了展望。本综述可为深入理解环境ext/intDNA的生态功能作用机制提供新的科学认知。
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关键词
胞外DNA
胞内DNA
功能基因
宏基因组学
生态功能
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职称材料
多价噬菌体分离筛选及靶向灭活土壤病原菌的应用研究
2
作者
赵远超
叶茂
+11 位作者
孔令雅
万金忠
黄丹
张忠云
夏冰
张胜田
冯彦房
孙明明
武俊
胡锋
蒋新
杜良成
《土壤学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第2期420-431,共12页
农田土壤中残留和滋生多种病原菌会对人体健康和生态环境带来显著的安全隐患,开展针对性的生物修复研究十分迫切。噬菌体疗法靶向灭活土壤中病原菌的技术为修复此类污染土壤提供了全新途径。本研究以南京城郊某奶牛场牛粪堆积池周边,粪...
农田土壤中残留和滋生多种病原菌会对人体健康和生态环境带来显著的安全隐患,开展针对性的生物修复研究十分迫切。噬菌体疗法靶向灭活土壤中病原菌的技术为修复此类污染土壤提供了全新途径。本研究以南京城郊某奶牛场牛粪堆积池周边,粪肠杆菌和假单胞菌复合污染农田土壤为例,首先筛选和纯化获得两株专一型噬菌体(YSZ1和YSZ5),再人为加速其宿主谱的表达过程,获得对应的多价噬菌体(YSZ1R和YSZ5K),并进行生物学特性(形态、核酸、最佳感染复数、一步生长曲线等)鉴定,结果表明:在水相和污染土壤中不同噬菌体对于同步灭活病原菌的能力依次为YSZ5K>YSZ1R>YSZ5>YSZ1,并且施用多价噬菌体疗法有助于维护和改善修复后土壤微生物生态功能多样性与稳定性。本研究结果可为噬菌体疗法靶向灭活土壤中多种病原菌提供切实可行的修复技术。
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关键词
病原菌
土壤
噬菌体疗法
靶向灭活
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职称材料
题名
环境胞外胞内DNA的行为归趋及生态功能研究进展
被引量：
2
1
作者
张忠云
叶茂
孙明明
黄丹
张胜田
胡锋
蒋新
机构
中国
科学
院
南京
土壤
研究所
中国
科学
院大学
南京
农业大学
生态环境
部
南京
环境科学
研究所
出处
《生态毒理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第6期10-23,共14页
基金
国家重点研发计划资助项目(2018FYC1803100)
国家青年人才托举项目(2018QNRC001)
+1 种基金
国家自然科学基金面上项目(41771350)
江苏省优秀青年基金资助项目(BK20180110)。
文摘
胞外DNA(extracellular DNA,extDNA)和胞内DNA(intracellular DNA,intDNA)广泛存在于陆生和水生生态环境系统中,密切参与环境-微生物和微生物种间的吸附、降解和自然转化等过程,在物质循环和基因信息传递中发挥重要的生态学作用。胞外DNA在环境中不易受核酸酶攻击,相对稳定,可作为历史微生物基因库,与胞内DNA都可反映功能基因丰度及其对应微生物活性;同时,胞外DNA是细胞生物膜中的重要组分,在微生物细胞抵御抗生素、重金属和农药等外来污染物胁迫中发挥了重要作用。本文从ext/intDNA环境行为、extDNA在生物膜中的环境作用、物质信息传递和ext/intDNA生态学功能等角度,综述了环境ext/intDNA的行为归趋及生态功能研究进展,提出了现阶段研究不足,并对未来研究方向进行了展望。本综述可为深入理解环境ext/intDNA的生态功能作用机制提供新的科学认知。
关键词
胞外DNA
胞内DNA
功能基因
宏基因组学
生态功能
Keywords
extracellular DNA
intracellular DNA
functional gene
metagenomics
ecological function
分类号
X171.5 [环境科学与工程—环境科学]
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职称材料
题名
多价噬菌体分离筛选及靶向灭活土壤病原菌的应用研究
2
作者
赵远超
叶茂
孔令雅
万金忠
黄丹
张忠云
夏冰
张胜田
冯彦房
孙明明
武俊
胡锋
蒋新
杜良成
机构
中国
科学
院
土壤
环境
与
污染
修复重点实验室(中国
科学
院
南京
土壤
研究所
)
南京
农业大学资源与
环境科学
学院
土壤
生态
实验室
生态环境部南京环境科学研究所土壤污染防治研究中心
安徽省
环境科学
研究
院
江苏省农业
科学
院农业资源与
环境
研究所
University of Nebraska-Lincoln
出处
《土壤学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第2期420-431,共12页
基金
国家重点研发计划项目(2018FYC1803100)
国家自然科学基金面上项目(41771350)
江苏省优秀青年基金项目(BK20180110)资助~~
文摘
农田土壤中残留和滋生多种病原菌会对人体健康和生态环境带来显著的安全隐患,开展针对性的生物修复研究十分迫切。噬菌体疗法靶向灭活土壤中病原菌的技术为修复此类污染土壤提供了全新途径。本研究以南京城郊某奶牛场牛粪堆积池周边,粪肠杆菌和假单胞菌复合污染农田土壤为例,首先筛选和纯化获得两株专一型噬菌体(YSZ1和YSZ5),再人为加速其宿主谱的表达过程,获得对应的多价噬菌体(YSZ1R和YSZ5K),并进行生物学特性(形态、核酸、最佳感染复数、一步生长曲线等)鉴定,结果表明:在水相和污染土壤中不同噬菌体对于同步灭活病原菌的能力依次为YSZ5K>YSZ1R>YSZ5>YSZ1,并且施用多价噬菌体疗法有助于维护和改善修复后土壤微生物生态功能多样性与稳定性。本研究结果可为噬菌体疗法靶向灭活土壤中多种病原菌提供切实可行的修复技术。
关键词
病原菌
土壤
噬菌体疗法
靶向灭活
Keywords
Pathogenic bacteria
Soil
Phage therapy
Targeted inactivation
分类号
X53 [环境科学与工程—环境工程]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
环境胞外胞内DNA的行为归趋及生态功能研究进展
张忠云
叶茂
孙明明
黄丹
张胜田
胡锋
蒋新
《生态毒理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020
2
在线阅读
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职称材料
2
多价噬菌体分离筛选及靶向灭活土壤病原菌的应用研究
赵远超
叶茂
孔令雅
万金忠
黄丹
张忠云
夏冰
张胜田
冯彦房
孙明明
武俊
胡锋
蒋新
杜良成
《土壤学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019
0
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