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合作猪CXCL12基因克隆、生物信息学分析及组织表达研究
1
作者
杨泉
李晓
+6 位作者
闫尊强
王鹏飞
黄晓宇
高小莉
杨巧丽
滚双宝
杨姣姣
《中国畜牧兽医》
北大核心
2025年第6期2482-2493,共12页
【目的】对合作猪基质细胞衍生因子-1(stromal cell-derived factor 1,SDF-1(CXCL12))基因进行克隆及生物信息学分析,并检测其在不同组织中的表达水平,为研究CXCL12基因的功能奠定基础。【方法】以合作猪心脏组织cDNA为模板,采用PCR扩...
【目的】对合作猪基质细胞衍生因子-1(stromal cell-derived factor 1,SDF-1(CXCL12))基因进行克隆及生物信息学分析,并检测其在不同组织中的表达水平,为研究CXCL12基因的功能奠定基础。【方法】以合作猪心脏组织cDNA为模板,采用PCR扩增、克隆CXCL12基因CDS区序列并测序,对所获序列进行相似性比对及系统进化树构建。利用生物信息学软件对合作猪CXCL12蛋白进行理化性质及结构功能分析。运用实时荧光定量PCR检测CXCL12基因在合作猪各组织内的表达水平。【结果】合作猪CXCL12基因CDS区全长351 bp,编码116个氨基酸;与马的亲缘关系最近,与羚羊的亲缘关系最远。CXCL12蛋白不存在跨膜区和信号肽,但存在1个低复杂度的SCY结构域,亲水性指数为―0.347,属于亲水性蛋白,包含12个磷酸化位点;二级结构主要为无规则卷曲(54.31%)和α-螺旋(32.76%),三级结构与二级结构相一致;该蛋白主要分布于细胞核和线粒体,并与CCL21、CXCL9等蛋白存在相互作用。实时荧光定量PCR结果显示,CXCL12基因在合作猪肝脏中的表达量极显著高于其他组织(P<0.01),在肾脏和心脏中的表达量极显著低于其他组织(P<0.01)。【结论】本研究成功克隆合作猪CXCL12基因CDS区,编码116个氨基酸,主要分布在细胞核和线粒体中,是一种稳定、亲水且无跨膜结构的分泌蛋白。CXCL12基因在合作猪肝脏中的表达量最高。本研究结果可为进一步揭示CXCL12基因调控合作猪免疫机制提供参考。
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关键词
合作猪
CXCL12基因
克隆
生物信息学
表达
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职称材料
低温对合作猪脂肪组织形态、脂代谢相关基因表达和酶活性及AMPK/PGC-1α通路的影响
被引量：
2
2
作者
李瑶
贾蕊
+6 位作者
李杰
滚双宝
杨巧丽
王龙龙
张鹏霞
高小莉
黄晓宇
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第8期3418-3426,共9页
旨在探究低温对合作猪脂肪组织形态、脂代谢相关基因表达和酶活性及AMPK/PGC-1α通路的影响。本研究选择75日龄体重相近、健康状况良好的合作猪10头,常温饲养7 d后随机分为对照组((23±2)℃)和低温组((-15±2)℃),每组5头,试验...
旨在探究低温对合作猪脂肪组织形态、脂代谢相关基因表达和酶活性及AMPK/PGC-1α通路的影响。本研究选择75日龄体重相近、健康状况良好的合作猪10头,常温饲养7 d后随机分为对照组((23±2)℃)和低温组((-15±2)℃),每组5头,试验期15 d。试验结束后采集合作猪腋下和腹股沟脂肪组织,采用HE染色观察脂肪组织形态;ELISA法检测脂代谢相关酶活性;荧光定量PCR法检测脂肪棕色化产热基因和脂代谢相关基因的表达;Western blot检测AMPK/PGC-1α通路蛋白的表达。结果发现:与对照组相比,低温处理后合作猪腋下脂肪和腹股沟脂肪呈现褐色化改变,脂肪细胞数量变多且横截面积减小;腋下和腹股沟脂肪中LPL活性,IL-6 mRNA表达量及AMPK、P-AMPK和PGC-1α蛋白表达量极显著增加(P<0.01),LEP mRNA表达量及FAS活性极显著降低(P<0.01);腋下脂肪中UCP3、HSP 70 mRNA表达量显著增加(P<0.05),PPARγmRNA表达量显著降低(P<0.05),AMPK及TNF-αmRNA表达量极显著增加(P<0.01);腹股沟脂肪中AMPK及TNF-αmRNA表达量显著增加(P<0.05),UCP 3及HSP 70 mRNA表达量极显著增加(P<0.01),PPARγmRNA表达量极显著降低(P<0.01);低温处理后合作猪腹股沟脂肪中PGC-1α、ADPN、FAT mRNA表达量和HSL活性极显著增加(P<0.01),但在腋下脂肪中变化不显著(P>0.05)。综上,低温下合作猪腋下脂肪和腹股沟脂肪发生褐色化改变,且脂肪细胞数量增多,面积减小,机体产热增加,脂代谢关键基因LEP、ADPN、PPARγ、FAT及AMPK/PGC-1α通路可能参与机体脂质代谢。
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关键词
低温
脂肪组织
脂代谢
AMPK/PGC-1α
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职称材料
题名
合作猪CXCL12基因克隆、生物信息学分析及组织表达研究
1
作者
杨泉
李晓
闫尊强
王鹏飞
黄晓宇
高小莉
杨巧丽
滚双宝
杨姣姣
机构
甘肃
农业大学动物科学技术学院
甘肃
省现代养
猪
工程技术创新中心
甘肃迭部蕨麻猪科技小院
出处
《中国畜牧兽医》
北大核心
2025年第6期2482-2493,共12页
基金
甘肃农业大学畜牧学养猪产业技术创新团队项目(GAU-XKTD-2022-25)
甘肃地方猪种质资源保护及品质提升(GSLK-2021-13)
+1 种基金
岷山黑猪新品种培育及关键技术集成推广(22ZD6NA044)
甘肃迭部蕨麻猪科技小院。
文摘
【目的】对合作猪基质细胞衍生因子-1(stromal cell-derived factor 1,SDF-1(CXCL12))基因进行克隆及生物信息学分析,并检测其在不同组织中的表达水平,为研究CXCL12基因的功能奠定基础。【方法】以合作猪心脏组织cDNA为模板,采用PCR扩增、克隆CXCL12基因CDS区序列并测序,对所获序列进行相似性比对及系统进化树构建。利用生物信息学软件对合作猪CXCL12蛋白进行理化性质及结构功能分析。运用实时荧光定量PCR检测CXCL12基因在合作猪各组织内的表达水平。【结果】合作猪CXCL12基因CDS区全长351 bp,编码116个氨基酸;与马的亲缘关系最近,与羚羊的亲缘关系最远。CXCL12蛋白不存在跨膜区和信号肽,但存在1个低复杂度的SCY结构域,亲水性指数为―0.347,属于亲水性蛋白,包含12个磷酸化位点;二级结构主要为无规则卷曲(54.31%)和α-螺旋(32.76%),三级结构与二级结构相一致;该蛋白主要分布于细胞核和线粒体,并与CCL21、CXCL9等蛋白存在相互作用。实时荧光定量PCR结果显示,CXCL12基因在合作猪肝脏中的表达量极显著高于其他组织(P<0.01),在肾脏和心脏中的表达量极显著低于其他组织(P<0.01)。【结论】本研究成功克隆合作猪CXCL12基因CDS区,编码116个氨基酸,主要分布在细胞核和线粒体中,是一种稳定、亲水且无跨膜结构的分泌蛋白。CXCL12基因在合作猪肝脏中的表达量最高。本研究结果可为进一步揭示CXCL12基因调控合作猪免疫机制提供参考。
关键词
合作猪
CXCL12基因
克隆
生物信息学
表达
Keywords
Hezuo pigs
CXCL12 gene
cloning
bioinformatics
expression
分类号
S813.3 [农业科学—畜牧学]
Q78 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
低温对合作猪脂肪组织形态、脂代谢相关基因表达和酶活性及AMPK/PGC-1α通路的影响
被引量：
2
2
作者
李瑶
贾蕊
李杰
滚双宝
杨巧丽
王龙龙
张鹏霞
高小莉
黄晓宇
机构
甘肃
农业大学动物科学技术学院
甘肃
省现代养
猪
工程技术研究中心
甘肃迭部蕨麻猪科技小院
出处
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第8期3418-3426,共9页
基金
国家自然科学基金区域创新发展联合基金项目(U22A20507)
甘肃农业大学畜牧学养猪产业技术创新团队项目(GAU-XKTD-2022-25)。
文摘
旨在探究低温对合作猪脂肪组织形态、脂代谢相关基因表达和酶活性及AMPK/PGC-1α通路的影响。本研究选择75日龄体重相近、健康状况良好的合作猪10头,常温饲养7 d后随机分为对照组((23±2)℃)和低温组((-15±2)℃),每组5头,试验期15 d。试验结束后采集合作猪腋下和腹股沟脂肪组织,采用HE染色观察脂肪组织形态;ELISA法检测脂代谢相关酶活性;荧光定量PCR法检测脂肪棕色化产热基因和脂代谢相关基因的表达;Western blot检测AMPK/PGC-1α通路蛋白的表达。结果发现:与对照组相比,低温处理后合作猪腋下脂肪和腹股沟脂肪呈现褐色化改变,脂肪细胞数量变多且横截面积减小;腋下和腹股沟脂肪中LPL活性,IL-6 mRNA表达量及AMPK、P-AMPK和PGC-1α蛋白表达量极显著增加(P<0.01),LEP mRNA表达量及FAS活性极显著降低(P<0.01);腋下脂肪中UCP3、HSP 70 mRNA表达量显著增加(P<0.05),PPARγmRNA表达量显著降低(P<0.05),AMPK及TNF-αmRNA表达量极显著增加(P<0.01);腹股沟脂肪中AMPK及TNF-αmRNA表达量显著增加(P<0.05),UCP 3及HSP 70 mRNA表达量极显著增加(P<0.01),PPARγmRNA表达量极显著降低(P<0.01);低温处理后合作猪腹股沟脂肪中PGC-1α、ADPN、FAT mRNA表达量和HSL活性极显著增加(P<0.01),但在腋下脂肪中变化不显著(P>0.05)。综上,低温下合作猪腋下脂肪和腹股沟脂肪发生褐色化改变,且脂肪细胞数量增多,面积减小,机体产热增加,脂代谢关键基因LEP、ADPN、PPARγ、FAT及AMPK/PGC-1α通路可能参与机体脂质代谢。
关键词
低温
脂肪组织
脂代谢
AMPK/PGC-1α
Keywords
low temperature
adipose tissue
lipid metabolism
AMPK/PGC-1α
分类号
S828.2 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
合作猪CXCL12基因克隆、生物信息学分析及组织表达研究
杨泉
李晓
闫尊强
王鹏飞
黄晓宇
高小莉
杨巧丽
滚双宝
杨姣姣
《中国畜牧兽医》
北大核心
2025
0
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职称材料
2
低温对合作猪脂肪组织形态、脂代谢相关基因表达和酶活性及AMPK/PGC-1α通路的影响
李瑶
贾蕊
李杰
滚双宝
杨巧丽
王龙龙
张鹏霞
高小莉
黄晓宇
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
2
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