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基于图自动编码器和梯度决策树集成的lncRNA-疾病关联预测方法
1
作者
李明强
李然
+2 位作者
刘琪
杜晶颐
李慧慧
《现代电子技术》
北大核心
2025年第12期61-66,共6页
长链非编码RNA(lncRNA)的异常表达与人类疾病的发生发展密切相关。采用计算方法预测lncRNA与疾病的潜在关联可显著降低生物学实验验证的成本。针对现有机器学习方法易受噪声干扰且预测精度不足的问题,设计一种新型lncRNA-疾病关联预测模...
长链非编码RNA(lncRNA)的异常表达与人类疾病的发生发展密切相关。采用计算方法预测lncRNA与疾病的潜在关联可显著降低生物学实验验证的成本。针对现有机器学习方法易受噪声干扰且预测精度不足的问题,设计一种新型lncRNA-疾病关联预测模型LDA-GADT。首先,通过计算lncRNA和疾病的高斯关联核相似性对lncRNA功能相似性和疾病语义相似性进行补充,从而得到lncRNA和疾病的综合相似度矩阵;然后,使用图自动编码器学习lncRNA-疾病对的特征表示;最后,使用基于梯度的决策树集成算法来预测lncRNA与疾病之间的关联关系。五折交叉验证实验结果表明,在lncRNA Disease数据库上,LDA-GADT模型的AUC值为0.9424,较LDNFSGB、SDLDA、RWSF-BLP和LDAenDL模型分别提升了8.46%、6.5%、1.28%和3.14%;在MNDR数据库上的AUC值为0.982 2,较上述对比模型分别提升了4.76%、2.62%、1.93%和1.14%。此外,通过对肺癌和乳腺癌进行案例分析,进一步验证了所提模型的准确性和有效性。
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关键词
lncRNA-疾病关联
关联预测
高斯关联核相似度
图自动编码器
梯度下降
决策树
特征提取
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职称材料
麻风治愈后高分化皮肤鳞状细胞癌
2
作者
窦莉莉
肖玉强
+3 位作者
石津
冯国强
刘喜婷
李树君
《临床皮肤科杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第4期221-223,共3页
报告1例麻风治愈后高分化皮肤鳞状细胞癌。患者男,78岁。右手背感染后肉芽状增生伴疼痛1周,怀疑麻风复发皮损。皮肤科检查:右手背部一约7cm×8cm×1cm淡红色至暗红色菜花样乳头样组织增生,呈结节状或疣状突起,生长迅速易破溃并...
报告1例麻风治愈后高分化皮肤鳞状细胞癌。患者男,78岁。右手背感染后肉芽状增生伴疼痛1周,怀疑麻风复发皮损。皮肤科检查:右手背部一约7cm×8cm×1cm淡红色至暗红色菜花样乳头样组织增生,呈结节状或疣状突起,生长迅速易破溃并向周围浸润,结节易破溃,形成火山口样溃疡,可见污垢坏死组织和脓样分泌物,伴恶臭。皮损组织病理检查:真皮内可见鳞状细胞团块,抗酸染色(-)。诊断:高分化鳞状细胞癌。
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关键词
鳞状细胞癌
皮肤
高分化
麻风
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职称材料
尿芳香基硫酸酯酶活性检测对肺癌的诊断价值
3
作者
包晓玲
杨磊
《第三军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第22期2490-2491,共2页
目的评价晨尿芳香基硫酸酯酶（arylsulphatase， ARS）活性检测在肺癌诊断中的应用价值。方法采用荧光测定法对98例肺癌患者、80例肺良性疾病及98例健康对照者的晨尿芳香基硫酸酯酶活性进行检测，并运用受试者工作特性（ROC）曲线评价...
目的评价晨尿芳香基硫酸酯酶（arylsulphatase， ARS）活性检测在肺癌诊断中的应用价值。方法采用荧光测定法对98例肺癌患者、80例肺良性疾病及98例健康对照者的晨尿芳香基硫酸酯酶活性进行检测，并运用受试者工作特性（ROC）曲线评价尿芳香基硫酸酯酶对肺癌的诊断效能。结果肺癌组的尿ARS活性为（0.359±0.111）U/L，明显高于肺良性疾病组的（0.214±0.082）U/L和健康对照组的（0.238±0.095）U/L，差异有统计学意义（P〈0.01）；而肺良性疾病组和健康对照组的ARS活性差异无统计学意义（P=0.385）。ROC曲线分析结果显示，曲线下面积AUC为0.805（P〈0.01, 95%CI： 0.743～0.867），最佳诊断界点值为0.295 U/L，此时尿ARS活性诊断肺癌的敏感度和特异度分别为81.1%和66.7%。结论尿ARS活性检测在肺癌诊断中具有很好的临床应用价值。
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关键词
芳香基硫酸酯酶
肺癌
诊断
受试者工作特性曲线
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职称材料
题名
基于图自动编码器和梯度决策树集成的lncRNA-疾病关联预测方法
1
作者
李明强
李然
刘琪
杜晶颐
李慧慧
机构
大连海洋大学信息工程学院
甘肃省
肿瘤
医院
呼吸
肿瘤
内科
出处
《现代电子技术》
北大核心
2025年第12期61-66,共6页
文摘
长链非编码RNA(lncRNA)的异常表达与人类疾病的发生发展密切相关。采用计算方法预测lncRNA与疾病的潜在关联可显著降低生物学实验验证的成本。针对现有机器学习方法易受噪声干扰且预测精度不足的问题,设计一种新型lncRNA-疾病关联预测模型LDA-GADT。首先,通过计算lncRNA和疾病的高斯关联核相似性对lncRNA功能相似性和疾病语义相似性进行补充,从而得到lncRNA和疾病的综合相似度矩阵;然后,使用图自动编码器学习lncRNA-疾病对的特征表示;最后,使用基于梯度的决策树集成算法来预测lncRNA与疾病之间的关联关系。五折交叉验证实验结果表明,在lncRNA Disease数据库上,LDA-GADT模型的AUC值为0.9424,较LDNFSGB、SDLDA、RWSF-BLP和LDAenDL模型分别提升了8.46%、6.5%、1.28%和3.14%;在MNDR数据库上的AUC值为0.982 2,较上述对比模型分别提升了4.76%、2.62%、1.93%和1.14%。此外,通过对肺癌和乳腺癌进行案例分析,进一步验证了所提模型的准确性和有效性。
关键词
lncRNA-疾病关联
关联预测
高斯关联核相似度
图自动编码器
梯度下降
决策树
特征提取
Keywords
lncRNA-disease association
association prediction
Gaussian association kernel similarity
graph autoencoder
gradient descent
decision tree
feature extraction
分类号
TN911.23-34 [电子电信—通信与信息系统]
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职称材料
题名
麻风治愈后高分化皮肤鳞状细胞癌
2
作者
窦莉莉
肖玉强
石津
冯国强
刘喜婷
李树君
机构
甘肃省
中
医院
皮肤科
甘肃省
和政疗养院皮肤科
甘肃省
肿瘤
医院
呼吸
肿瘤
内科
出处
《临床皮肤科杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第4期221-223,共3页
文摘
报告1例麻风治愈后高分化皮肤鳞状细胞癌。患者男,78岁。右手背感染后肉芽状增生伴疼痛1周,怀疑麻风复发皮损。皮肤科检查:右手背部一约7cm×8cm×1cm淡红色至暗红色菜花样乳头样组织增生,呈结节状或疣状突起,生长迅速易破溃并向周围浸润,结节易破溃,形成火山口样溃疡,可见污垢坏死组织和脓样分泌物,伴恶臭。皮损组织病理检查:真皮内可见鳞状细胞团块,抗酸染色(-)。诊断:高分化鳞状细胞癌。
关键词
鳞状细胞癌
皮肤
高分化
麻风
Keywords
squamous cell carcinoma,cutaneous,highly differentiated
leprosy
分类号
R755.01 [医药卫生—皮肤病学与性病学]
R739.5 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
尿芳香基硫酸酯酶活性检测对肺癌的诊断价值
3
作者
包晓玲
杨磊
机构
甘肃省肿瘤医院肿瘤内科
出处
《第三军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第22期2490-2491,共2页
文摘
目的评价晨尿芳香基硫酸酯酶（arylsulphatase， ARS）活性检测在肺癌诊断中的应用价值。方法采用荧光测定法对98例肺癌患者、80例肺良性疾病及98例健康对照者的晨尿芳香基硫酸酯酶活性进行检测，并运用受试者工作特性（ROC）曲线评价尿芳香基硫酸酯酶对肺癌的诊断效能。结果肺癌组的尿ARS活性为（0.359±0.111）U/L，明显高于肺良性疾病组的（0.214±0.082）U/L和健康对照组的（0.238±0.095）U/L，差异有统计学意义（P〈0.01）；而肺良性疾病组和健康对照组的ARS活性差异无统计学意义（P=0.385）。ROC曲线分析结果显示，曲线下面积AUC为0.805（P〈0.01, 95%CI： 0.743～0.867），最佳诊断界点值为0.295 U/L，此时尿ARS活性诊断肺癌的敏感度和特异度分别为81.1%和66.7%。结论尿ARS活性检测在肺癌诊断中具有很好的临床应用价值。
关键词
芳香基硫酸酯酶
肺癌
诊断
受试者工作特性曲线
分类号
R446.12 [医药卫生—诊断学]
R734.2 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于图自动编码器和梯度决策树集成的lncRNA-疾病关联预测方法
李明强
李然
刘琪
杜晶颐
李慧慧
《现代电子技术》
北大核心
2025
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
麻风治愈后高分化皮肤鳞状细胞癌
窦莉莉
肖玉强
石津
冯国强
刘喜婷
李树君
《临床皮肤科杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
尿芳香基硫酸酯酶活性检测对肺癌的诊断价值
包晓玲
杨磊
《第三军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013
0
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职称材料
已选择
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