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牦牛BTG2基因CDS区克隆分析及组织表达研究
1
作者
申金伟
赵雪
+4 位作者
路建卫
扎老
杨树猛
梁春年
成述儒
《西北农林科技大学学报(自然科学版)》
北大核心
2025年第6期20-28,共9页
[目的]克隆牦牛BTG2基因编码区(CDS区),对其进行生物信息学分析和组织表达分析,为后续深入研究牦牛BTG2基因的生物学功能奠定基础。[方法]以美仁牦牛为研究对象,采集其心脏、肝脏、脾脏、肌肉、脂肪和睾丸组织。提取脂肪组织总RNA,反转...
[目的]克隆牦牛BTG2基因编码区(CDS区),对其进行生物信息学分析和组织表达分析,为后续深入研究牦牛BTG2基因的生物学功能奠定基础。[方法]以美仁牦牛为研究对象,采集其心脏、肝脏、脾脏、肌肉、脂肪和睾丸组织。提取脂肪组织总RNA,反转录获得cDNA。PCR克隆牦牛BTG2基因的CDS区,测序后进行生物信息学分析。利用RT-qPCR技术,分析BTG2基因在心脏、肝脏、脾脏、肌肉、脂肪和睾丸组织中的表达水平。[结果]牦牛BTG2基因的CDS区全长453 bp,共编码150个氨基酸;BTG2蛋白的分子式为C748H1190N208O213S8,分子质量为16 761.42 ku,原子总数为2 367个;不稳定性指数为48.51,是不稳定蛋白;理论等电点为9.14;主要分布于细胞核(占56.5%)和线粒体(占26.1%);氨基酸序列的1~108位有1个BTG1域;总平均亲水系数为-0.123,是亲水蛋白;共有15个磷酸化位点;二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主;无跨膜结构且无信号肽区域;与10个蛋白存在互作关系。系统进化分析结果显示,美仁牦牛与野牦牛亲缘关系最近,与间蜂猴亲缘关系最远。RT-qPCR结果显示,BTG2在成年公牦牛的心脏、肝脏、脾脏、肌肉、脂肪和睾丸组织中均有表达,其中在脂肪组织和脾脏组织中表达水平较高,在肌肉和睾丸组织中表达水平较低。[结论]克隆了牦牛BTG2基因,对其进行了生物信息学分析,明确了其组织表达情况。
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关键词
美仁牦牛
BTG2基因
生物信息学分析
组织表达分析
系统进化
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题名
牦牛BTG2基因CDS区克隆分析及组织表达研究
1
作者
申金伟
赵雪
路建卫
扎老
杨树猛
梁春年
成述儒
机构
甘肃
农业大学动物科学技术学院
中国农业科学院兰州
畜牧
与兽药研究所
甘肃省
牦牛繁育工程重点实验室
农业农村部青藏高原畜禽遗传育种重点实验室
甘肃省甘南藏族自治州
合作市
农畜产品质量安全检测检验中心
甘肃省甘南藏族自治州合作市佐盖多玛乡畜牧站
甘肃省甘南藏族自治州
畜牧
工作
站
出处
《西北农林科技大学学报(自然科学版)》
北大核心
2025年第6期20-28,共9页
基金
合作市牦牛种质提升与提质增效项目
甘肃省民生科技专项(21CX6NP219)
+1 种基金
现代肉牛牦牛产业技术体系项目(CARS-37)
中国农业科学院创新工程项目(25-LIHPS-01)。
文摘
[目的]克隆牦牛BTG2基因编码区(CDS区),对其进行生物信息学分析和组织表达分析,为后续深入研究牦牛BTG2基因的生物学功能奠定基础。[方法]以美仁牦牛为研究对象,采集其心脏、肝脏、脾脏、肌肉、脂肪和睾丸组织。提取脂肪组织总RNA,反转录获得cDNA。PCR克隆牦牛BTG2基因的CDS区,测序后进行生物信息学分析。利用RT-qPCR技术,分析BTG2基因在心脏、肝脏、脾脏、肌肉、脂肪和睾丸组织中的表达水平。[结果]牦牛BTG2基因的CDS区全长453 bp,共编码150个氨基酸;BTG2蛋白的分子式为C748H1190N208O213S8,分子质量为16 761.42 ku,原子总数为2 367个;不稳定性指数为48.51,是不稳定蛋白;理论等电点为9.14;主要分布于细胞核(占56.5%)和线粒体(占26.1%);氨基酸序列的1~108位有1个BTG1域;总平均亲水系数为-0.123,是亲水蛋白;共有15个磷酸化位点;二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主;无跨膜结构且无信号肽区域;与10个蛋白存在互作关系。系统进化分析结果显示,美仁牦牛与野牦牛亲缘关系最近,与间蜂猴亲缘关系最远。RT-qPCR结果显示,BTG2在成年公牦牛的心脏、肝脏、脾脏、肌肉、脂肪和睾丸组织中均有表达,其中在脂肪组织和脾脏组织中表达水平较高,在肌肉和睾丸组织中表达水平较低。[结论]克隆了牦牛BTG2基因,对其进行了生物信息学分析,明确了其组织表达情况。
关键词
美仁牦牛
BTG2基因
生物信息学分析
组织表达分析
系统进化
Keywords
Meiren yak
BTG2 gene
bioinformatics analysis
tissue expression analysis
systems evolution
分类号
S823.85 [农业科学—畜牧学]
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作者
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1
牦牛BTG2基因CDS区克隆分析及组织表达研究
申金伟
赵雪
路建卫
扎老
杨树猛
梁春年
成述儒
《西北农林科技大学学报(自然科学版)》
北大核心
2025
0
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