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王不留行药用植物麦蓝菜叶片转录组测序分析
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作者 张超强 尉明杰 +5 位作者 张家银 杨彬 任培荣 景小强 张勇 王恩军 《中兽医医药杂志》 2025年第2期1-7,共7页
为获得王不留行的部分转录组信息特征,本研究基于Illumina 6000平台,对麦蓝菜叶片进行高通量测序,并组装了所有的转录本,原始数据上传NCBI数据库,登录号:PRJNA1149650。去冗余后得到99766条unigenes,在七大数据库中获得功能注释65079条... 为获得王不留行的部分转录组信息特征,本研究基于Illumina 6000平台,对麦蓝菜叶片进行高通量测序,并组装了所有的转录本,原始数据上传NCBI数据库,登录号:PRJNA1149650。去冗余后得到99766条unigenes,在七大数据库中获得功能注释65079条,其中NR数据库60784条(占比93.40%)、SwissProt数据库46761条(占比71.85%)、EggNOG数据库57269条(占比87.99%)、KEGG数据库20073条(占比30.84%)、COG/KOG数据库57269条(占比87.99%)、Pfam数据库55514条(占比85.30%)、GO数据库33791条(占比51.92%)。bHLH、bZIP和MYB等转录因子可能与王不留行黄酮类次生代谢产物合成有关,同时,还从99766条unigenes中检测出26243个位点。转录组数据的获得丰富了麦蓝菜基因数据库,为麦蓝菜遗传图谱构建、SSR标记开发、品种选育及解析王不留行黄酮类化合物次生代谢途径和调控机制研究提供了基础数据。 展开更多
关键词 王不留行 麦蓝菜 转录组 UNIGENE 转录因子 SSR标记
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