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双硫死亡相关lncRNA建立胰腺癌新的预后特征并预测免疫治疗反应
被引量：
2
1
作者
唐明政
李晓凤
+4 位作者
荣耀
吴志航
马国榕
刘松华
蔡辉
《中国医科大学学报》
北大核心
2024年第1期20-26,共7页
目的筛选与双硫死亡相关的长链非编码RNA(lncRNA),研究其在胰腺癌中的免疫景观,为临床实践提供更有效的指导。方法从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中获取胰腺癌组织和癌旁正常组织样本,基于Cox回归和LASSO回归分析鉴定双硫死亡相关lncRNA...
目的筛选与双硫死亡相关的长链非编码RNA(lncRNA),研究其在胰腺癌中的免疫景观,为临床实践提供更有效的指导。方法从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中获取胰腺癌组织和癌旁正常组织样本,基于Cox回归和LASSO回归分析鉴定双硫死亡相关lncRNA。构建风险评分模型,通过综合方法验证其预测性能。构建精确的列线图,预测胰腺癌患者的预后。通过基因本体(GO)、基因集富集分析(GSEA)和免疫分析研究生物学差异。通过肿瘤突变负荷(TMB)估计免疫治疗反应。结果成功鉴定出251个双硫死亡相关lncRNA,筛选出3组lncRNA作为风险评分模型的参考。通路分析结果表明,免疫相关通路与双硫死亡相关lncRNA风险评分模型相关。风险评分与免疫细胞浸润以及ESTIMATE评分显著相关。风险评分较高的患者TMB升高,表明高风险患者表现出更好的免疫检查点阻断反应。结论本研究的发现有助于深入理解双硫死亡相关lncRNA在胰腺癌中的作用,为胰腺癌提供潜在的治疗策略。
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关键词
胰腺癌
长链非编码RNA
双硫死亡
肿瘤突变负荷
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职称材料
基于失巢凋亡相关基因的乳腺癌预后模型构建与验证
2
作者
唐明政
徐京灏
+3 位作者
李晓凤
荣耀
于博
蔡辉
《中国医科大学学报》
CAS
北大核心
2024年第4期315-323,共9页
目的构建乳腺癌(BC)失巢凋亡相关基因(ARGs)预后模型,为临床实践提供更有效的指导。方法采用癌症基因组图谱(TCGA)和基因表达综合数据库(GEO)收集BC患者的转录组和临床数据。将ARGs分为A和B 2个分型,并进行生存分析和通路分析。采用Cox...
目的构建乳腺癌(BC)失巢凋亡相关基因(ARGs)预后模型,为临床实践提供更有效的指导。方法采用癌症基因组图谱(TCGA)和基因表达综合数据库(GEO)收集BC患者的转录组和临床数据。将ARGs分为A和B 2个分型,并进行生存分析和通路分析。采用Cox回归和LASSO回归分析生存预后、免疫微环境和肿瘤微环境的差异。构建ARGs相关的预后模型,并通过实时PCR验证预后相关ARGs在BC细胞中的表达。结果共得到10个与BC不良预后相关的ARGs,且这10个ARGs的风险评分均可作为BC患者的独立预后因素。随后将风险评分与BC临床病理特征相结合,构建列线图。决策曲线分析结果表明,该模型患者可以从临床治疗策略中受益。实时PCR分析结果显示,在BC细胞中YAP1、PIK3R1、BAK1、PHLDA2、EDA2R、CD24、SLC2A1和CDC25C表达水平上调,而SLC39A6和LAMB3表达水平下调。结论ARGs可作为生物标志物用于BC患者风险分层和生存预测,为BC患者个体化和精确治疗提供依据。
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关键词
乳腺癌
失巢凋亡
免疫
预后
肿瘤微环境
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职称材料
题名
双硫死亡相关lncRNA建立胰腺癌新的预后特征并预测免疫治疗反应
被引量：
2
1
作者
唐明政
李晓凤
荣耀
吴志航
马国榕
刘松华
蔡辉
机构
甘肃
中医药大学第一
临床医学
院
甘肃省人民医院普外科临床医学中心
甘肃省人民医院
甘肃省
外科
肿瘤分子诊断与精准
医学
重点实验室
出处
《中国医科大学学报》
北大核心
2024年第1期20-26,共7页
基金
2021年中央引导地方科技发展基金(ZYYDDFFZZJ-1)
甘肃中医药大学2023年度研究生创新创业基金。
文摘
目的筛选与双硫死亡相关的长链非编码RNA(lncRNA),研究其在胰腺癌中的免疫景观,为临床实践提供更有效的指导。方法从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中获取胰腺癌组织和癌旁正常组织样本,基于Cox回归和LASSO回归分析鉴定双硫死亡相关lncRNA。构建风险评分模型,通过综合方法验证其预测性能。构建精确的列线图,预测胰腺癌患者的预后。通过基因本体(GO)、基因集富集分析(GSEA)和免疫分析研究生物学差异。通过肿瘤突变负荷(TMB)估计免疫治疗反应。结果成功鉴定出251个双硫死亡相关lncRNA,筛选出3组lncRNA作为风险评分模型的参考。通路分析结果表明,免疫相关通路与双硫死亡相关lncRNA风险评分模型相关。风险评分与免疫细胞浸润以及ESTIMATE评分显著相关。风险评分较高的患者TMB升高,表明高风险患者表现出更好的免疫检查点阻断反应。结论本研究的发现有助于深入理解双硫死亡相关lncRNA在胰腺癌中的作用,为胰腺癌提供潜在的治疗策略。
关键词
胰腺癌
长链非编码RNA
双硫死亡
肿瘤突变负荷
Keywords
pancreatic cancer
long non-coding RNA
disulfidptosis
tumor mutational burden
分类号
R735 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
基于失巢凋亡相关基因的乳腺癌预后模型构建与验证
2
作者
唐明政
徐京灏
李晓凤
荣耀
于博
蔡辉
机构
甘肃
中医药大学第一
临床医学
院
甘肃省人民医院普外科临床医学中心
甘肃省人民医院
甘肃省
外科
肿瘤分子诊断与精准
医学
重点实验室
出处
《中国医科大学学报》
CAS
北大核心
2024年第4期315-323,共9页
基金
国家自然科学基金(82360498)
甘肃省联合科研基金重大项目(23JRRA1537)
+1 种基金
中央引导地方科技发展基金(ZYYDDFFZZJ-1)
甘肃中医药大学研究生创新创业基金(38号)。
文摘
目的构建乳腺癌(BC)失巢凋亡相关基因(ARGs)预后模型,为临床实践提供更有效的指导。方法采用癌症基因组图谱(TCGA)和基因表达综合数据库(GEO)收集BC患者的转录组和临床数据。将ARGs分为A和B 2个分型,并进行生存分析和通路分析。采用Cox回归和LASSO回归分析生存预后、免疫微环境和肿瘤微环境的差异。构建ARGs相关的预后模型,并通过实时PCR验证预后相关ARGs在BC细胞中的表达。结果共得到10个与BC不良预后相关的ARGs,且这10个ARGs的风险评分均可作为BC患者的独立预后因素。随后将风险评分与BC临床病理特征相结合,构建列线图。决策曲线分析结果表明,该模型患者可以从临床治疗策略中受益。实时PCR分析结果显示,在BC细胞中YAP1、PIK3R1、BAK1、PHLDA2、EDA2R、CD24、SLC2A1和CDC25C表达水平上调,而SLC39A6和LAMB3表达水平下调。结论ARGs可作为生物标志物用于BC患者风险分层和生存预测,为BC患者个体化和精确治疗提供依据。
关键词
乳腺癌
失巢凋亡
免疫
预后
肿瘤微环境
Keywords
breast cancer
anoikis
immunity
prognosis
tumor microenvironment
分类号
R737.9 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
双硫死亡相关lncRNA建立胰腺癌新的预后特征并预测免疫治疗反应
唐明政
李晓凤
荣耀
吴志航
马国榕
刘松华
蔡辉
《中国医科大学学报》
北大核心
2024
2
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
基于失巢凋亡相关基因的乳腺癌预后模型构建与验证
唐明政
徐京灏
李晓凤
荣耀
于博
蔡辉
《中国医科大学学报》
CAS
北大核心
2024
0
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