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转录组和代谢组联合解析灰霉病侵染紫斑牡丹的机制
1
作者
孙燕
冯筱涵
+6 位作者
鲁仪增
宋福荣
程丹丹
吕娟
于春风
吴府胜
高德民
《江苏农业科学》
北大核心
2024年第21期149-162,共14页
以紫斑牡丹受灰霉病胁迫后的第2和第3阶段叶片作为研究材料,利用转录组学和代谢组学联合分析的方法,研究紫斑牡丹受灰霉病胁迫后的基因表达调控与代谢特性。结果显示,在第2和第3阶段,转录组分别获得12 700、22 257个差异基因,上调差异...
以紫斑牡丹受灰霉病胁迫后的第2和第3阶段叶片作为研究材料,利用转录组学和代谢组学联合分析的方法,研究紫斑牡丹受灰霉病胁迫后的基因表达调控与代谢特性。结果显示,在第2和第3阶段,转录组分别获得12 700、22 257个差异基因,上调差异基因明显多于下调差异基因。差异基因GO功能注释主要涉及在细胞、细胞部分和细胞进程。在KEGG代谢通路注释中,差异基因均主要富集在核糖体、碳代谢和氨基酸的生物合成等通路。此外,在第2和第3阶段代谢组分别获得67、136个差异代谢物,包括有机酸类、黄酮类、脂质类和萜类等物质。在KEGG代谢通路注释中,第2阶段差异代谢物主要富集在各种氨基酸的生物合成与代谢通路,第3阶段主要富集在各种次生代谢物的生物合成与代谢通路。此外,联合分析发现,第2、第3阶段的差异基因和差异代谢物都显著富集在丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸代谢通路上。GLT1、GabD、puuE等基因的表达显著上调,促进了谷氨酸、琥珀酸及4-氨基丁酸等抗逆因子的代谢,从而抵抗病害胁迫。另外,AGXT、purA、argH、argG、GOT2、GDH2、GAD、puuE、SSADH、CS、ACO、IDH1、IDH2、OGDH、DLST、LSC1、SDHA、fumC、MDH2等基因的表达显著上调,直接或间接促进柠檬酸循环,提高了能量代谢效率。综上所述,本研究为理解灰霉病胁迫下紫斑牡丹代谢响应途径提供了新的理论依据。
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关键词
紫斑牡丹
转录组
代谢组
灰霉病
差异基因
柠檬酸循环
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职称材料
67份牡丹种质资源表型多样性分析及综合评价
被引量：
10
2
作者
孙燕
冯筱涵
+11 位作者
仝伯强
关凌珊
刘金石
穆艳娟
孙涛
鲁仪增
刘涛
刘鵾
刘瑞杰
程丹丹
于春凤
高德民
《江苏农业科学》
北大核心
2023年第15期130-140,共11页
以67份代表性牡丹种质资源为研究对象,选取表型的24个质量性状和26个数量性状进行描述和测定,采用变异分析、聚类分析、相关性分析、主成分分析和表型性状综合评价方法,结合多样性指数,对牡丹表型性状进行多样性分析及综合评价。67份牡...
以67份代表性牡丹种质资源为研究对象,选取表型的24个质量性状和26个数量性状进行描述和测定,采用变异分析、聚类分析、相关性分析、主成分分析和表型性状综合评价方法,结合多样性指数,对牡丹表型性状进行多样性分析及综合评价。67份牡丹种质资源的表型呈现出变异类型多、变异程度高等特点,质量性状Shannon-weaver指数为0.183~1.860,数量性状变异系数为6.02%~37.41%,单果种子数变异系数(37.41%)最大。当欧氏距离为17.5时,67份种质资源可分为7个类群,其中类群Ⅱ的种质数量最多(37个),初步明确了各类群的主要特征性状,表明牡丹品种在表型性状上具明显差异,而各数量性状间大部分存在显著相关性。前8个主成分累积贡献率达到80.973%,可综合代表牡丹表型数据的大部分信息。针对油用、观赏、综合利用等不同用途进行评价,共筛选出10份最优种质。牡丹种质资源表型多样性高、变异类型丰富,为牡丹品种选育奠定了物质基础,期待筛选出的不同用途牡丹种质可为牡丹的开发利用及新品种选育提供参考。
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关键词
牡丹
种质资源
表型性状
多样性
综合评价
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职称材料
题名
转录组和代谢组联合解析灰霉病侵染紫斑牡丹的机制
1
作者
孙燕
冯筱涵
鲁仪增
宋福荣
程丹丹
吕娟
于春风
吴府胜
高德民
机构
山东中医药大学药学院
山东省林草种质资源中心
齐鲁工业大学(山东省科学院菏泽分院)
济
南市园林和林业科学研究院
甘肃济临牡丹科技产业有限公司
出处
《江苏农业科学》
北大核心
2024年第21期149-162,共14页
基金
鲁甘科技协作项目(编号:YDZX2021103)
山东省重点研发计划(农业良种工程)项目(编号:2020LZGC009)
山东省重点研发计划(编号:2021SFGC1205)。
文摘
以紫斑牡丹受灰霉病胁迫后的第2和第3阶段叶片作为研究材料,利用转录组学和代谢组学联合分析的方法,研究紫斑牡丹受灰霉病胁迫后的基因表达调控与代谢特性。结果显示,在第2和第3阶段,转录组分别获得12 700、22 257个差异基因,上调差异基因明显多于下调差异基因。差异基因GO功能注释主要涉及在细胞、细胞部分和细胞进程。在KEGG代谢通路注释中,差异基因均主要富集在核糖体、碳代谢和氨基酸的生物合成等通路。此外,在第2和第3阶段代谢组分别获得67、136个差异代谢物,包括有机酸类、黄酮类、脂质类和萜类等物质。在KEGG代谢通路注释中,第2阶段差异代谢物主要富集在各种氨基酸的生物合成与代谢通路,第3阶段主要富集在各种次生代谢物的生物合成与代谢通路。此外,联合分析发现,第2、第3阶段的差异基因和差异代谢物都显著富集在丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸代谢通路上。GLT1、GabD、puuE等基因的表达显著上调,促进了谷氨酸、琥珀酸及4-氨基丁酸等抗逆因子的代谢,从而抵抗病害胁迫。另外,AGXT、purA、argH、argG、GOT2、GDH2、GAD、puuE、SSADH、CS、ACO、IDH1、IDH2、OGDH、DLST、LSC1、SDHA、fumC、MDH2等基因的表达显著上调,直接或间接促进柠檬酸循环,提高了能量代谢效率。综上所述,本研究为理解灰霉病胁迫下紫斑牡丹代谢响应途径提供了新的理论依据。
关键词
紫斑牡丹
转录组
代谢组
灰霉病
差异基因
柠檬酸循环
分类号
S436.81 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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题名
67份牡丹种质资源表型多样性分析及综合评价
被引量：
10
2
作者
孙燕
冯筱涵
仝伯强
关凌珊
刘金石
穆艳娟
孙涛
鲁仪增
刘涛
刘鵾
刘瑞杰
程丹丹
于春凤
高德民
机构
山东中医药大学药学院
山东省林草种质资源中心
山东农业大学林学院
北京农学院园林学院
山东农业工程学院农业
科技
学院
齐鲁工业大学(山东省科学院菏泽分院)
甘肃济临牡丹科技产业有限公司
出处
《江苏农业科学》
北大核心
2023年第15期130-140,共11页
基金
鲁甘科技协作项目(编号:YDZX2021103)
山东省重点研发计划(农业良种工程)项目(编号:2020LZGC009)
山东省重点研发计划(编号:2021SFGC1205)。
文摘
以67份代表性牡丹种质资源为研究对象,选取表型的24个质量性状和26个数量性状进行描述和测定,采用变异分析、聚类分析、相关性分析、主成分分析和表型性状综合评价方法,结合多样性指数,对牡丹表型性状进行多样性分析及综合评价。67份牡丹种质资源的表型呈现出变异类型多、变异程度高等特点,质量性状Shannon-weaver指数为0.183~1.860,数量性状变异系数为6.02%~37.41%,单果种子数变异系数(37.41%)最大。当欧氏距离为17.5时,67份种质资源可分为7个类群,其中类群Ⅱ的种质数量最多(37个),初步明确了各类群的主要特征性状,表明牡丹品种在表型性状上具明显差异,而各数量性状间大部分存在显著相关性。前8个主成分累积贡献率达到80.973%,可综合代表牡丹表型数据的大部分信息。针对油用、观赏、综合利用等不同用途进行评价,共筛选出10份最优种质。牡丹种质资源表型多样性高、变异类型丰富,为牡丹品种选育奠定了物质基础,期待筛选出的不同用途牡丹种质可为牡丹的开发利用及新品种选育提供参考。
关键词
牡丹
种质资源
表型性状
多样性
综合评价
分类号
S685.110.2 [农业科学—观赏园艺]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
转录组和代谢组联合解析灰霉病侵染紫斑牡丹的机制
孙燕
冯筱涵
鲁仪增
宋福荣
程丹丹
吕娟
于春风
吴府胜
高德民
《江苏农业科学》
北大核心
2024
0
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职称材料
2
67份牡丹种质资源表型多样性分析及综合评价
孙燕
冯筱涵
仝伯强
关凌珊
刘金石
穆艳娟
孙涛
鲁仪增
刘涛
刘鵾
刘瑞杰
程丹丹
于春凤
高德民
《江苏农业科学》
北大核心
2023
10
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