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一株溶杆菌Lysobacter soli RCu6的转录组水平铜抗性机制研究
1
作者
李富玉
陈帅民
+3 位作者
刘梦帅
陈苗苗
李小方
刘彬彬
《中国生态农业学报（中英文）》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第12期2002-2010,I0001-I0008,共17页
铜是许多细胞酶所必需的微量元素,然而过量的铜通常对细胞有毒。细菌已经进化出许多铜抗性策略,但其分子机制尚不完全清楚。本研究在农田土壤中分离了一株高度抗铜(对铜的抗性达3.2 mmol∙L^(−1))的细菌菌株RCu6,并利用全基因组和转录组...
铜是许多细胞酶所必需的微量元素,然而过量的铜通常对细胞有毒。细菌已经进化出许多铜抗性策略,但其分子机制尚不完全清楚。本研究在农田土壤中分离了一株高度抗铜(对铜的抗性达3.2 mmol∙L^(−1))的细菌菌株RCu6,并利用全基因组和转录组学方法分析研究了其抗铜机制。RCu6菌株的全基因组测序显示该菌株在分类学上属于溶杆菌(Lysobacter soli);与已发现的同种菌株相比,基因组分析显示该菌株具有独特的由多个基因编码的抗铜系统。转录组分析表明在0.8 mmol∙L^(−1)和1.6 mmol∙L^(−1)胁迫下分别有315个和839个基因差异表达;铜稳态、组氨酸代谢、硫代谢和铁硫簇组装途径与RCu6菌的铜抗性相关,表明RCu6抗铜是一个细胞内多系统协同过程。本研究揭示了溶杆菌属菌株铜抗性分子水平的机制,为重金属污染农田土壤修复和利用提供了菌种资源和理论依据。
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关键词
溶杆菌
基因组学
转录组学
铜抗性
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题名
一株溶杆菌Lysobacter soli RCu6的转录组水平铜抗性机制研究
1
作者
李富玉
陈帅民
刘梦帅
陈苗苗
李小方
刘彬彬
机构
中国科学院遗传与发育生物学研究所农业资源研究中心
中国科学院
大学
吉林省农业科学院农业资源与环境研究所
中国农业
大学
资源与环境学院/
植物
-土壤相互作用教育部重点实验室/中国农业
大学
国家农业绿色发展研究院
瓦赫宁根大学植物生态与自然保护组
出处
《中国生态农业学报（中英文）》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第12期2002-2010,I0001-I0008,共17页
基金
国家重点研发计划项目(2021YFF1000403,2018YFD0800300)资助。
文摘
铜是许多细胞酶所必需的微量元素,然而过量的铜通常对细胞有毒。细菌已经进化出许多铜抗性策略,但其分子机制尚不完全清楚。本研究在农田土壤中分离了一株高度抗铜(对铜的抗性达3.2 mmol∙L^(−1))的细菌菌株RCu6,并利用全基因组和转录组学方法分析研究了其抗铜机制。RCu6菌株的全基因组测序显示该菌株在分类学上属于溶杆菌(Lysobacter soli);与已发现的同种菌株相比,基因组分析显示该菌株具有独特的由多个基因编码的抗铜系统。转录组分析表明在0.8 mmol∙L^(−1)和1.6 mmol∙L^(−1)胁迫下分别有315个和839个基因差异表达;铜稳态、组氨酸代谢、硫代谢和铁硫簇组装途径与RCu6菌的铜抗性相关,表明RCu6抗铜是一个细胞内多系统协同过程。本研究揭示了溶杆菌属菌株铜抗性分子水平的机制,为重金属污染农田土壤修复和利用提供了菌种资源和理论依据。
关键词
溶杆菌
基因组学
转录组学
铜抗性
Keywords
Lysobacter soli
Genomics
Transcriptomics
Copper resistance
分类号
Q935 [生物学—微生物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
一株溶杆菌Lysobacter soli RCu6的转录组水平铜抗性机制研究
李富玉
陈帅民
刘梦帅
陈苗苗
李小方
刘彬彬
《中国生态农业学报（中英文）》
CAS
CSCD
北大核心
2022
0
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